Paenibacillus polymyxa E681: PPE_01344
Help
Entry
PPE_01344 CDS
T01319
Name
(GenBank) type IV secretion protein Rhs
Organism
ppy
Paenibacillus polymyxa E681
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
DUF6531
Lipase_3
Mbeg1-like
UPF0227
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADM69186
LinkDB
All DBs
Position
1439063..1444936
Genome browser
AA seq
1957 aa
AA seq
DB search
MQFRTIRRHIAKIMIIIFIFSTISGIVPPNVFGAGNDSSQYSTDQLAARFGATSSFLSEQ
LRKGYSLNQIYTALYMAEQDHISYEQAVASLFPSEENQSQTVTSDVYNKLSDAPLDNLIS
HSVTDDVYPTDDPAPTNKVTEDVYKTDFLKLNLMANVPQLPPIREEAPVYNKSSFNEAPY
SVGDDKESISTLSGSLSLQNTDLTLPGRNGLGFSLTRQYDTNRAQFFDKGAEIVDNSAAV
QNYYVYFKAMMKPVTKSYKVAYQQKRWVQEDTDGDGNVDVNTYNLQPETKVIGTYTTYEA
ASQAAGQKITYTTPSESRTETDYRRSKSRNDFVSSIKYDHHGFKGTLSQSGSPYVISGSE
SQPASMGAVDSCSFFGMGSYNSQGYYSGSSITNCGNSMYYSSANGFSGTLYAYNTYYSST
CPSYDSSRANSICYVSGTKYYKGSVSKPGYDTREWRQDYSGTVTKPGYTSDIGYSEWTSN
GKGGRTRTAFTMEGSPQIETIVSEGLETAVRRQTALFATIAEAEHYRDLINSSPQTEIPS
DDGNKYYIAADADATVFAEIVAYQPSFIFQNRTYPALEDQLSPLGKGWSWNLPYVETKEG
KQYVHLGDGGSYEIEGDQLKGYDWKGLTFTSDTSVTVNGENSAYVLTSVDGMKKQYFSKD
GQLLQIEDAYHNTIKFNYELNATYKRKLLSKVEDAIGNSIDIQYTATDVTLSKGNRTVVY
HKHTEQGVELLDSVTDAEDRKTTYSYTLAPAKFNLSASHPERQISNPYALLTKVFHPTGA
STLYTYEDQPVKRYIGSNSVNEAYRAVSRVDQITYQNNQTENYNQETIHYNSDMGESYVK
DTSFSTVTDNGSVRSTFNYTKKFISADTPPQYYLDQSVVKAGDSEKSTAYQYGKQVTGKA
YTVPVPTRTSSSTNQNGDVLTTAAEYDDYGNMTSSVDEKGSQTAYTYDDKHRIKTITEPI
DSNSTGVTEYTRNPQGKVTQAIVSKDHSGGELLQKVNYSGIDAYGNTTVQTIANGNKSVT
TTTEYSSGYDHAFPTKQSVEVTNIDGEKSTVTIQSEYDKPTGLITSTLDGKGQKTGYQYD
ALDRVKAVTYPDGKSIRVAYDDLENTVTVTNELGIRTKTRYNALGWNIESGLYEGNDYVI
KSKSAYDANGRLVSSEDALGHLTRYGYDAWSRTTSTAYADGSQAVVEYNDALRQVTQRDG
ELNEQIQIYDKWNRLVQNKEKSAMDGIEKITSKVEYDAVNDQILKQTDANGNETQFSYNA
LGDQTSVTEPNGETTKYTYDMLGNLTRITYPDGQAKVKSYDELGRVIQTKDEENQVEKRY
FDTNGNLSKKTDRNGNVTSFEYDSRNRLKSRVGKDETVSYVYDAAGKRLSMTDQTGTTSY
AYDPYTEQLDTLSYPDGLKLSNQYDSNGNRTEMTGPFGEQVNYTYDPLNRLKTVGNTKDK
PVSEYSYTKNGLLDSTVSTNGYRQQNKYNGIELVELKHTRSDAETNSFQYSYDPGKNITK
RTQNGVEDAFTYDKLNRIATSTENQDAYSYDARGNRLTMETERSPHTKPRENSFDDQNRL
TQVKVDGKLVEYRYNEDGLLTDRIQDGVHTRYYYDGNSAQIIAEATIENGKPVLKANYIR
GLKLDAITYADQSEAYPVYNGHGDIIEIRDSSGALLNQYQYDIWGNEEVKEEKVHNPFRY
SGELWDDTTELQYLRARWYDPDSGRFINEDTYEGKISDPQSLNWYVYVNNNPLKYIDPSG
HIPTAREAAEMAKNVYNVTLSLNDFSRKKLLGNWRLYTILSGSEGLKIGVYSRYKKGTLE
FALVNKGTDTWGDVGNDIQQPIGYSDDMKDSILKSSNFVANHKDSEITMVGHSKGGAEAI
ANAVANNKNAITFNPAVPSLGKYGLSDGNYTARATNYVVTDEILNKTLGEVGTGKTVYLP
TQYEIKWWHSKAYKAWQMVRNHKMDSVINALQEKRYK
NT seq
5874 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgcaatttagaacaataaggcgtcatatagcaaagatcatgattatcatatttattttc
agtacaattagcggcattgttcctccaaatgtgttcggtgcaggaaatgacagttcgcaa
tattcgacggaccaattggctgcccgatttggagccacatcatcttttctttcggaacaa
ttaagaaaagggtattcattaaatcaaatttatacagcgttatatatggctgagcaggat
catataagctatgagcaggcagtagcttcgttatttccctcagaggaaaaccagtcacag
actgtaacaagtgacgtatataataagctatcggatgctccattagataacctgatttct
catagtgttacagatgatgtttatccaacagacgatcctgctcctacgaacaaagtcacc
gaagatgtatataagacggattttctgaaactaaatctcatggctaatgtaccccagctt
ccacctattagagaggaagcgcctgtttacaataaatcttcttttaatgaagcaccttat
tctgttggcgatgataaagaatcgatatccactttatcaggcagcttatcgttacaaaat
acagatttaactttgcccggacgaaacggactgggcttttctttgacgcgtcaatatgat
acgaatcgggctcaattttttgacaaaggtgctgaaattgttgacaacagtgctgctgtg
caaaattattatgtctactttaaggcgatgatgaaacctgtcaccaagtcatacaaggta
gcctatcagcaaaaaagatgggtgcaagaggacacagacggtgatggaaatgttgatgtg
aatacttataatcttcagccggaaaccaaagttataggcacatacacaacttatgaagct
gctagtcaagcggcaggacaaaaaataacctatactacaccttcggagtccagaacagaa
acagattatagaagaagtaaatccagaaatgattttgttagttccataaaatatgaccat
catggatttaaagggactctttctcaaagtggttcaccttatgttatttctgggagcgaa
tctcagcctgcttctatgggtgcagttgattcgtgtagtttttttggtatgggatcttac
aactcacaagggtactattctggtagtagtattacaaattgtggtaattcaatgtattac
tcttctgctaatggatttagtgggacactttatgcctacaatacttattattcttcgact
tgtccaagttatgatagttctagagcaaattctatatgctatgtatcaggaactaaatat
tacaaaggatctgtttcaaaaccagggtatgatacccgagaatggaggcaagattacagc
ggaaccgttactaagcccggttataccagcgatattggttatagcgagtggactagcaat
ggaaaaggcggaaggacaagaacggcctttaccatggaaggctcaccgcaaattgaaacg
attgtttcagaggggctcgaaacggctgttcgtcgacagacagccctgttcgcaacgatt
gctgaggctgagcactatagggatttaattaacagtagtcctcagactgaaattccgagt
gacgatgggaataaatattatattgcagcagatgcggatgctaccgtttttgctgagatt
gtagcctaccaaccttcatttatttttcaaaaccgtacctatcctgcgctagaagatcaa
ttgagccctcttggcaaggggtggtcatggaatttaccttatgtagaaaccaaagaaggc
aagcagtacgtacacttgggggatggtggcagctatgaaattgagggtgaccagcttaaa
ggttacgactggaaaggactgaccttcacttctgacacttcagtaacagttaatggagaa
aattcagcctatgtattaacttctgtggatggaatgaaaaaacaatatttctccaaagat
gggcagttgctgcaaattgaagatgcatatcataacacgataaagttcaattatgaactc
aatgctacttataaacgtaaattgcttagtaaggtagaagatgcaatcggcaactcgatt
gatattcaatatacggctacagacgttactttgtctaaaggaaaccgcacagttgtctac
cataaacatacagaacaaggtgttgaattactggattcagtgacagatgccgaagacaga
aaaaccacatattcctatacattggcacctgccaagtttaatttgagcgcatcacatcca
gaaagacaaatctctaatccatatgctttgttaaccaaagtatttcaccctactggagcc
tctactttgtatacttacgaagatcagccggtaaaacgctatattggctccaattcggta
aacgaggcatatagagcggtctcacgtgtagatcaaatcacctatcaaaataatcaaacg
gaaaactataatcaggaaacgattcattataattccgatatgggtgagagctatgtgaaa
gatacttcattttctactgtaacagacaatggatcagttcgttcgaccttcaattatact
aaaaagtttattagtgcagacacgccaccacagtattacctggatcaatctgtggttaaa
gcaggagattctgaaaagagcacagcttatcaatacggcaagcaggtgacaggcaaagcc
tatacggtacctgttccaacccgtacttcgtccagcactaatcaaaacggagacgttttg
acaactgctgctgaatatgatgattacggtaatatgacaagctcagtggatgaaaaaggt
tcacaaactgcgtatacgtatgacgacaagcataggattaaaaccattacggaaccgatt
gattctaacagcactggagttacagagtacactcgaaacccgcaggggaaagtaacacag
gccatcgtctccaaggatcattccgggggagaattactacaaaaagtaaattattcaggt
attgatgcttacggaaatacaaccgttcagacgattgcgaacggtaacaagtccgtgact
acaaccacggaatacagcagtggctacgaccatgcttttcctacgaaacaaagtgtagag
gttacaaatattgatggagaaaaatctacggtaaccattcagtcagagtatgataagcca
actggtttaatcacttccacgctggatgggaaaggtcagaaaactgggtatcaatatgat
gctcttgatcgagtaaaggctgtaacctatccggacggtaaaagtatccgtgttgcctac
gatgatcttgagaacaccgtaacggttacgaatgagctggggatacgaacaaaaacacgt
tacaatgctttgggttggaatatcgagtcaggactgtatgaaggtaacgactacgtgatt
aagtccaaatcagcttatgacgctaatggcagattagtatccagtgaagatgcgcttggg
cacctgacacgttatggctatgacgcttggagccgtacaacgtcaacagcctacgcggac
ggatcacaagcagtagtcgagtataatgatgctcttcgtcaagtaactcaacgagatggc
gagcttaatgaacaaattcaaatctacgataaatggaatcgtctggtgcaaaacaaagaa
aaatcagcaatggacggtattgagaaaataacttccaaagtagagtatgatgctgtaaac
gatcagattttaaaacagaccgatgcgaatggtaatgagactcagttttcgtataatgcc
ttgggcgatcaaacatctgtaacagaacccaatggcgaaacgacgaagtacacttacgat
atgctgggtaatcttactcggatcacatatccggatggtcaggccaaggtgaagtcgtat
gatgaactgggtagagtgattcaaactaaagatgaggaaaaccaggttgagaagcgttat
tttgataccaacgggaacttatccaagaaaacagaccgcaatgggaacgtcacttcgttt
gaatatgacagccgtaatcggttgaagtcgcgtgtaggtaaagatgagacggtcagctat
gtatacgacgctgcgggcaaacgcctaagcatgacagatcaaacgggtaccacttcctat
gcgtatgatccgtatacagagcaactggacaccttgtcttacccggatggtctaaagctt
tccaatcagtatgattcgaatggaaatcgaactgaaatgacaggaccatttggcgaacaa
gtaaactacacgtatgaccctttgaacagattgaagactgtaggtaatacaaaagataag
cctgtttcggaatattcctacaccaaaaatggattgctggattcaaccgtatctacaaat
ggttatcgccagcaaaacaaatataatgggattgagttagttgaattaaagcacacacga
tctgatgcggaaacgaacagcttccaatatagctacgatccaggtaaaaatatcacgaag
cgtactcaaaatggtgtagaggatgcctttacgtacgataagctgaatcggattgctacc
tccaccgaaaatcaagatgcttattcgtatgatgccagagggaatcgtcttacgatggaa
acggagagatctcctcacacgaagccacgtgagaacagctttgacgatcagaaccgtttg
actcaagtcaaggttgatggaaaactcgtagagtaccgatacaacgaggatggattgctg
acagaccgtatacaggatggtgttcatacccgatactactacgatggaaacagtgcacaa
atcatagcagaagctacgattgaaaatggaaagcctgttttaaaagctaattatattcga
ggtctgaaattagacgctataacctatgcggatcaatcggaagcctatccagtctataat
ggtcacggggatattattgaaataagagattcatctggagccttgctgaatcaatatcag
tatgatatctggggcaatgaagaggtcaaggaagaaaaagtccataatccattccgttac
tctggcgaactgtgggatgatacaacggaattacaatacctgcgagctagatggtatgat
cctgatagtggaagatttatcaatgaggatacgtatgaagggaagataagcgatccgcaa
agcttgaactggtacgtatatgtaaataataatccgttaaagtatattgatccaagtggg
catattcctactgcgagggaagctgctgaaatggcgaaaaatgtttataatgtaacatta
agtcttaatgattttagtagaaaaaaacttttaggtaattggagattatatactattcta
tcaggttcagaaggattaaaaataggcgtgtattctagatacaaaaaaggcacattggaa
ttcgcactagttaataaaggtactgacacatggggagatgtaggtaatgatatccaacaa
ccaataggttactcagatgacatgaaagattcgatactaaaatcttcgaattttgtggct
aatcataaggatagtgaaatcactatggtgggtcattcaaagggaggtgctgaagcaatt
gcaaatgcagttgcaaataataaaaatgccattacatttaatcctgcagtaccttcacta
ggtaaatatggtttaagtgatgggaactatactgcaagagcaacgaattatgtagttacg
gacgaaattttgaacaagactttgggtgaagtaggcactggaaaaacggtttacttacct
acgcagtatgaaattaagtggtggcactctaaagcatataaggcttggcaaatggtcaga
aaccataaaatggactccgtaataaatgctttgcaggagaagaggtataaatga
DBGET
integrated database retrieval system