Photinus pyralis (common eastern firefly): 116165799
Help
Entry
116165799 CDS
T07438
Name
(RefSeq) vacuolar protein sorting-associated protein 13 isoform X1
KO
K19525
vacuolar protein sorting-associated protein 13A/C
Organism
ppyr
Photinus pyralis (common eastern firefly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ppyr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ppyr04131
]
116165799
Membrane trafficking [BR:
ppyr04131
]
Endosome - Golgi transport
Rab GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
116165799
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
VPS13_N
VPS13_M
VPS13_VAB
VPS13_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116165799
NCBI-ProteinID:
XP_031336342
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
3256 aa
AA seq
DB search
MVFESVVTDVLNRVLGSYIENLDSKQLNLGIWGGDVVLKDLVLKPSALDDLNLPVQIVYG
RLSQLVLKIPWKNLYTSAVEAKVEGLYLLVVPNQQVKYDQEKDRTEHKKNKEKELQKIED
AKKKEAEKGVKVSNGQVVLINSVFLDKPKPDDSFTEKLTMQIIKNVQVKIENIHLRYEDK
VTHVNHPFAMGVTLSNLSLETTDDTWTPTIVQETVLKFFKVLNLEGLSIYWNCGSSMYQH
LPLVELLSKFRSEIGMKSNLPPNYQYILGPVYASARLRLNPKPDCDTPQFTIPKVHLNLE
MEKLHLGINRSQYRDIIALADSMDRMTKGVPYRKYRPELTSYKSHYKEWWLFAYNAVLDD
VRRRRRNWSWEHMKAHRLMCENYAKLYQQKLTQKKLSSEAQVHLQKYEEELDIFNIVVTR
QKIEVEVARLGKLNAQKEKKSWFSSWWGGGSEGDKSTNSDDIVKKLEEAMTPDEKVRLYQ
AIGYQENSTPLEFPEAYIDNSCTFILRLLEIQVEDDSLASRVLSIELTSVKCRVETRAAA
SALKVAVAVDALSILGVEQDELIPKMVSSVVQPGESGHLLDVLFETNPLDKLCDQRLHVK
AKPIQIVYDAMSINNTVSVFSAPQSSALEQLSVAAGNGLNNFKEMSAVGLQHAIEQHNVI
DLKIDLCAPYILLPYGGKYTGVENLLVANLGHIRIASLERSDTNVSELHAKGQGGERILE
EMITQSYDRFELNFTELQILLVQGDEDWLKLISSTTLTPSHLLCPLNLSLTFHKCLIIDD
PRLPLAKIRCHLPSITLHISDVRLILLLNLVTSIPFPEENIPENKPLMRSSRSHTSSQSL
IKYLDLDEKLAVKPSAVFTPPEIKDLKGDLIQMTSLDAQFIMETLQLVVNHQEDAASPNE
EILNLKICQLEAGYVQQTFNKDIVLKLGSINCGQMRHSTTIPIVNTPLEGEKGSYLIKVN
FIQVNKLSPEFHTKHQSCESRLILNFTKLNVTLHQEGLLALLKFGTDLQTQIEDVTSNAK
GESYEEVGKIRRLSSVAESFVSDLKASKTATNLLNVVKKKKSTVIETIQFKLNANLEELS
LFFATDKSNICSTAINRIFAEVIVKESYTQIIARLGLIAVTDLNEESIHSQILTVTGEEV
ANLQVVMYNSEHKSPDNIDMSVQLSLGCLRFVFLNWFLSNMLNFVNNFQTAKQAIIDASQ
TAAEAASNNVQNAYKNSTRISLSINLQAPVIIIPVDSKSNKALLIDLGYLTILNKFNTLN
VVGDHGENAVLDEMKLKLTNLTIASVILNTAGDIAEKIALLDPVTFTLSIKRNLSSAWYK
SIPDIDLSGKINSITVLLAQTDFKMIMSILDGNLSEGDKQDALPPEPKQDASITRKLGEI
ELTVANKELESDLKVHTTIKFTLTMESFIINLFFKGSQKVGTNLSPTHDPKDALARFSLE
VLSIKGRILSDNSIATSILLVNCLLDDTRKGREGKLTRLMERKADLVYVDQPSSSMSTES
LEPVRSMIDITVQMKANDMFVDVRIFSFTIIISCEYLLKVAEFFTNSLAKDEKQITKPTN
GKHSAIAKPAEVKKEFVGKKKESTDSTITLNLRIEKPDIILVEHMETIDANALILNNEIL
MKVRLYGESKVINGSISDIHLYTCCYNPSKRAETRKSVLLPVSISIAGSTPEGQGLHIEV
CVTNICICVSPSTIELLSRAAASLSSGDVSQSESEVELVDHSDAWNAQKFREEDCWFLKA
EIGEDVLEVLDTGTPESPRQKLSELCIVSIPSVVITIEAGVGNKTLPMLLLNSSFQGNVH
DWSSQLYIDASLTLQMSYYNSMLAVWESLIEPVQVVHENKTVYEPWALRLEVTMNERDDV
PISISEEVEEDEECIQLQPAAMTIDVSSTSNLELTVTKTSIDVLNNLAKAFSSAMMREPI
KGSEITAPYVVKNESGLRVQLHLQNGAFKMYGRNDDLAEVVLEIGASVPLQLTASLEMAK
DLQLTGSLKIENRCLNVEILDLLDCRLELPVVRSDKRYFLLKHRGENNDSWGLVSAVTID
EGVTTVTLRSILQVHNHFHVNVDVYYMTARGNELECISSVEPGSFINIPLNAVYTPTNEL
FFSVPDFSVTNTPFIWKDLKLNVSITKIMHCMPTNEKTNAEPFIIKVIGETQQIYHENTN
RHTMASTCYNIHLHPAVTFRNCLPIKIICSIQNLVEEKVVEPGESLHMPNVNPGCSRIIV
RLPDYLDKEWSCQHDVPTQPPPFTVWQFESYDSACKTTLDLGMHSITKSGSTHMILYCPF
WMLNKTGLTISYRKSKKSEKEASGSPSKPSGDNLNVLHHPATFKGPVLFSFNAKNFFGKK
KASIRIDQGEWCDKFSLDVAGSSGFVACKLNNAIYQIGVHNQLTYNGLTKQVTFTPYYVI
VNNAPFDVECQEFDRPADAWVSISGKSCIPFWPRSEREDKLLKLRVVGTREVSAPFLYTE
THITLLKLHNKFGGVNVDIQITEGGVYINLYSYEPGMAPAVIVNHTKDIMCIWEKETVQL
KRLSPGYMTLYAWENPSGPKVLVWDIGHKKEMEDDLRKDGVGEFSPSDNTQVYWVSFLDG
LQRVLLFTLDKSVAENVQCAKQFEAIQQEINVLIHGLGLSLVNNVTRQEILYAGIASSGI
TWETCKMHTRRWKQLGNRESLAIESAYQSHLNHLQVSGTSSGHVVVDSNTEVDFETGFMF
RPNKRRLRRSFQTGLWLQLKTSPLQLQLHAKINRLQIDNQMQDCIFPVVLAPVPPPKTVA
SDVQKPFAELSIVQRIIKYSQIRQFKYFKVLIQEFHVKVDLGFVNAVVELLQNDAYSETE
EKEQFLQDKKLVDEPLLSLVASKSLQEQKNFYDLLHFSPLKVHVSFSLQAGGGSPQGTPN
FINVLLQGLGVTLTDMQDVVFRLAYFERDYTFLTQKQLISEATTHYVGQAVKQLYVLVLG
LDVLGNPYGLVLGITKGVEDLFYEPFQGAIQGPGEFAEGLVLGVRSLFGHTVGGAAGAVS
RITGALGKGIAALTFDDEYQSKRRDQINKKPATVQEGIARGGKGLVMGIFDGVTGVFTKP
ISGAKEEGIEGFFKGIGKGAVGLVARPTAGVIDFASGSLDAVKRATELGEETNRLRHPRF
IQADGLVQPYKLSDAVGHKLLMDLEKGKYAHTDIYCAHYIIVLKKEVLLITDKRIAYIVH
NDIFGGWQVEWSYTLKEIKPPPMIVSKGVSISTNEQKKKKIFSFGSKDSGKIIIISDPEL
REEVCNKIDEQLRSLG
NT seq
9771 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtttttgaatctgtagtgacagatgttctgaaccgagttcttggaagttacattgaa
aatttagacagcaaacagctcaatctgggaatatggggaggtgacgttgtacttaaggat
ttagtcttaaagccttcggccttggatgacttaaacttacccgtccaaattgtctacgga
cgtttatcacaactggtgttaaaaattccatggaagaatttatatacgtctgcggttgag
gcaaaagttgaaggtctttaccttttagtggttcccaatcaacaagtcaagtatgatcag
gaaaaagatcggacagagcacaagaagaataaagaaaaagagttacagaagattgaagat
gcaaagaagaaggaagcagaaaaaggtgtaaaggtgtcaaatggccaagtggtacttatt
aactcggtgtttttagataaaccgaaacctgacgatagctttactgaaaaacttacaatg
caaataattaaaaatgtacaggttaagattgaaaatattcatttacggtatgaggataaa
gttacgcatgttaatcatccatttgctatgggtgtaacattaagtaatttatcattagaa
acaactgacgacacgtggacacctacaattgtgcaagaaacagtattaaagtttttcaaa
gtcttaaatctcgaaggactatccatttattggaattgtggctcgtcaatgtaccaacat
ctgcctcttgtggaacttttaagcaagtttcggagcgaaattggaatgaaatcaaatcta
ccacccaattaccaatacattttgggacctgtgtatgcatctgctagattacgtcttaat
ccaaaacccgactgtgatacacctcaatttaccataccaaaggttcatcttaatctcgaa
atggaaaaactgcatttaggcattaatagatcgcaatatcgtgatataattgccttggct
gactcaatggatcgaatgacaaaaggggtaccatacagaaaatatcgtccagaattaact
tcttacaaaagtcattacaaggaatggtggctctttgcatataacgcagtgttagatgat
gttcgtagacgaagacgaaattggagctgggagcacatgaaagcacatcgtctcatgtgt
gagaactacgctaaactttatcaacaaaaacttacacaaaaaaagttgtcgtcagaagca
caagtccacctacagaagtacgaagaagaattagatatatttaatatagtagtaacacgt
caaaaaattgaagttgaagttgcaaggttagggaaattaaatgcccaaaaagaaaaaaaa
tcctggtttagtagttggtggggaggtggaagtgagggcgataaaagtacaaattcagat
gatattgtgaaaaaattggaggaggcgatgacacctgatgaaaaagttcgtttgtatcag
gccattggataccaagagaattccacacctttagaatttcccgaagcgtatattgataac
tcctgtacatttatacttcgacttctggaaatccaggttgaagatgacagtcttgcctct
cgggttttgagtattgaattgacaagtgtgaagtgtcgggtcgagactagagctgctgcc
tctgctcttaaagtcgcagttgccgtggatgcactatcaatcttgggtgtagagcaagac
gagctcataccgaaaatggttagttcggtagtgcaacccggtgaaagtggtcatcttttg
gatgtactttttgaaacaaatccacttgataaactatgcgatcaaaggttgcatgtgaaa
gctaaaccaatacaaattgtatacgatgcaatgtctataaataatacagtcagtgtattc
agtgcacctcaatcttcggctttagagcaattgtcggtggcggcaggaaatggtttgaat
aactttaaggaaatgtctgccgttggactgcaacatgccatagagcaacataatgtaatt
gatttaaaaattgatttgtgtgctccttatattctacttccgtatggtggaaaatacaca
ggtgtggaaaatcttctcgtagctaacttgggtcacatacgtatagcttcattggaacgt
tctgacacaaatgtcagcgaattgcatgcaaagggacaaggcggggagcgaatattggag
gaaatgattacccaaagttatgatcgctttgagttgaactttacagaactgcagattctt
ctagtgcaaggagacgaagattggttgaaacttataagttctacaacgcttacaccttca
catctcttatgtcctttaaacttatctttgacatttcataaatgcctcattattgacgat
ccaagattgccacttgcgaaaatccgatgccatttaccctcaattactctccatatttca
gatgtaaggttaattcttcttcttaatttggttacaagcataccgtttccagaggagaat
atacctgaaaacaagcctcttatgagatcatctcgttcacatacgtctagtcaatctcta
ataaaatacctggatctagacgaaaagcttgccgtaaaaccgtcagcagtatttactcca
cccgaaattaaagatcttaaaggagatcttatacaaatgacaagcttagatgctcaattt
ataatggaaacactacagctagtagttaatcaccaagaagacgccgcatctcctaatgag
gaaatactaaaccttaaaatttgccaattagaagccggttatgtacagcaaacatttaat
aaggacattgttttaaaattgggtagtataaattgtggtcaaatgcgtcattcaactaca
attcctattgtaaatacaccattggaaggtgagaaaggttcttatttaattaaagtgaac
tttatacaggtaaataaattgtcgcctgaattccatacaaaacatcagtcgtgtgagtca
cggttaattttaaatttcacaaaattgaatgtgacattgcatcaagaaggtttattggca
cttttgaaatttggaacagacttgcagactcagattgaagatgtgacaagtaatgctaaa
ggtgaatcttatgaagaggtaggaaaaattcgacgactctcttcagtcgctgagagtttt
gtgagtgaccttaaagcttctaaaacagctacaaatctgttaaatgtggttaaaaaaaag
aaaagtactgtaattgagaccatacagtttaaactgaatgcgaatttagaagaactcagt
ttattctttgctactgataagagcaatatctgctctactgccataaatagaatatttgcg
gaagttattgttaaagaatcttatacccaaattattgctcgtttgggccttattgcagtg
actgatttgaatgaagaaagtattcattcacagattttaaccgttactggagaggaagta
gcaaatcttcaagttgtaatgtataatagtgaacataaatcaccggataacattgacatg
tcagttcagttgtctttgggatgtttgcggtttgtgtttcttaattggtttctgtccaat
atgctgaactttgtgaacaatttccaaactgctaaacaagcaataatcgatgcatcacaa
actgctgctgaggctgcctctaataatgttcaaaatgcatacaaaaatagcacacgtatc
agtttgagtatcaatctccaagcgcctgttattataatacctgtagactcgaagagtaac
aaagcattattgattgacctgggctatttaacaattctaaacaaatttaacactcttaat
gtagtaggcgatcatggtgaaaatgcagtcttagatgaaatgaaattgaaattaacaaat
ttaacaattgctagcgtgatattgaatacggctggtgacatcgctgaaaagatagcctta
ctagatccagttactttcactttgtctattaagcgaaacctatcaagtgcctggtataaa
tctataccagacatagatctttcaggaaaaattaattccataacggttttgttggcacaa
actgattttaaaatgataatgagcattttggatggtaatttaagtgaaggcgacaagcaa
gacgctctacctcctgaacctaaacaagacgcatcgattacaagaaaactgggagaaatc
gaattgactgtggctaataaggaacttgagagcgatttgaaagttcacacaactataaaa
tttacattgacaatggaaagttttatcataaacttgtttttcaaaggatcacagaaagtt
ggtaccaacttatctcccacacacgatccaaaagatgcattagcccggttttcattggag
gtattatcaataaaaggtcgtattttatcagataactcaatagcaacctccatacttttg
gtaaattgtttattggatgacacacgtaaaggacgcgaaggaaaacttactcgtttaatg
gaacgtaaagccgatttggtttacgtagaccaacctagtagttctatgtctaccgagtca
ctagagcctgtgcggagtatgattgatattaccgttcaaatgaaagccaatgatatgttt
gttgacgtacgcatatttagcttcaccataattatatcgtgcgagtaccttttaaaagta
gccgaattctttactaattctttggcaaaggacgaaaagcaaatcaccaaaccaacaaat
ggcaaacattcagcaatcgcaaaacctgccgaggtcaagaaagagttcgtcgggaaaaag
aaagagtcaacagactctacgataacacttaatttacgtatagagaagccagatataatt
ctggtagaacatatggaaaccattgatgcaaatgcattgattttaaataatgaaattcta
atgaaagttcgtctgtatggtgaatctaaagtgataaatgggtcaatttccgatattcat
ttatacacttgttgctacaatccctcaaagcgagcggagacgagaaaatcagttttactt
cctgttagtatcagtattgcgggttctacaccggagggtcaaggactgcatattgaagtt
tgtgttacaaatatttgcatttgtgtttcaccatcaacaattgagttattaagtcgagcc
gctgcctcactgtcaagtggtgatgtttcacaatccgaaagtgaggtggaattagtggac
cacagtgatgcttggaatgcacagaaatttagggaagaggattgctggtttttaaaagca
gaaattggtgaagatgtattggaggtgcttgatactggtacaccagagagtccaagacaa
aagctgtccgaattgtgcatcgtgtctataccttcagttgttataactatcgaagctgga
gttggaaataagacacttccaatgttactactgaacagtagttttcagggtaacgttcac
gattggagttcacagttatacattgatgcaagtctaacattacaaatgagttactacaat
agtatgttggcagtttgggagagtcttattgaaccagtacaggtggtgcatgaaaacaaa
acagtttatgaaccttgggctttaagactagaagtgacgatgaatgaacgagatgatgtt
cctattagcatatcggaagaagttgaagaagatgaggaatgcattcaattgcaaccagct
gctatgactatcgatgtttcctctacatctaacttagaactaactgtaacaaagacaagt
attgatgtgttaaacaatttagcgaaagctttttcgtcagccatgatgagagaaccgatc
aaagggagtgagattacagcaccttatgttgtgaaaaatgagtcaggtttacgtgttcag
cttcatctacagaatggtgcgttcaaaatgtacggacgaaacgatgatttggcagaagtt
gtattggagataggtgctagtgttccattgcaattaacggcttcgctagaaatggctaaa
gatttacaattaactggttctcttaaaattgaaaaccgatgtttaaatgtggaaatattg
gatttacttgattgtcggttggagttaccagtggtgagatctgataagcggtatttcttg
ttgaaacatcgaggagaaaataacgatagttggggtcttgtatcggcagtgactatagat
gagggtgttacaacagtgactttaagaagtattcttcaagtgcacaaccattttcatgta
aatgtagacgtttattacatgactgctagaggcaatgaactggaatgcatttcaagtgta
gaaccgggatcctttattaatattccacttaatgctgtttatacaccgacgaatgaacta
tttttctctgttcccgatttttctgtaactaatacaccattcatctggaaagacttgaag
ttaaatgtatcgattacaaaaataatgcactgtatgccaacgaatgagaaaactaacgcc
gaaccatttattattaaagttatcggcgaaacacagcaaatatatcacgaaaatactaat
cgccacacaatggctagtacatgttataacattcacttgcatcctgctgtaacttttaga
aactgtctacctataaaaataatttgttccattcaaaatcttgtagaagaaaaggtcgtg
gaacctggtgagtcactccacatgcctaatgttaatcctggatgttctcgtattattgta
aggttacctgattacttagacaaagagtggtcatgtcagcatgatgtaccaacgcaaccg
cccccatttacagtatggcagtttgagagttatgatagcgcttgtaagactacattagat
cttggaatgcattccatcactaaatcaggatcaacacatatgatactttattgtccattt
tggatgctgaataaaactggattaacaatatcttacaggaaatctaaaaaatcagagaaa
gaagcatcaggaagtccttcaaagccatctggtgacaacttgaatgttcttcatcatccg
gcaacatttaaaggacctgtactattctcttttaatgcaaaaaatttcttcgggaagaag
aaagcctcgatacgaattgatcagggagagtggtgcgataaattttcgctagacgtagca
ggctcctcaggttttgttgcatgtaagctgaataacgccatttaccaaattggagtgcat
aatcaattgacttacaatgggttaactaaacaagttacatttacgccttattatgtcata
gttaataatgctccattcgatgtggaatgtcaggaatttgatcgtccggctgatgcgtgg
gtctctatttccggaaaatcgtgcattccgttttggcctagaagtgaacgagaggataag
cttttgaagttaagggtggttggtactcgtgaagtgtctgctccgtttttgtataccgaa
acgcacatcactcttttaaaattacataacaagtttggaggcgtcaatgtggatatacaa
ataactgagggcggtgtttacattaacttgtatagttacgaacctggaatggcaccagct
gttattgtcaaccacactaaagatattatgtgcatttgggaaaaggagactgtacaattg
aagcggctcagtcctggatatatgactctgtacgcatgggaaaacccttcggggccaaag
gtacttgtctgggacatcggtcataaaaaagagatggaagatgatttgcgtaaagatggc
gttggtgaattttcaccatctgataatactcaagtgtattgggtgtcattcttggacgga
ctgcaacgtgttttgctctttactctggataagtctgtggccgagaatgtacaatgtgcc
aagcaatttgaagcaattcaacaagaaattaatgtattaattcacggtttaggtttatcc
cttgtcaataacgttactcggcaagaaattttatatgctggcattgcaagcagcggtatt
acgtgggaaacatgtaaaatgcacacaaggcgttggaaacagttaggaaatagagagagt
ttggcgattgagagcgcctaccaaagtcatttgaatcacttacaagtttctggcacctcc
tctggacacgtcgtcgttgattcaaacactgaagtcgattttgaaactgggtttatgttt
agaccgaataaacgcagacttcgaagaagttttcagacaggactgtggctgcaacttaaa
acaagtcctcttcagttacaattacatgctaaaattaatcggcttcaaattgacaatcaa
atgcaagactgcatctttcctgttgtattagctccagtaccccctccaaaaactgtggct
agcgatgttcaaaaaccgtttgccgaattgagcattgtgcagcgcatcataaaatatagt
caaattcgtcaattcaaatactttaaagttcttattcaagaatttcacgtaaaagtggat
ttaggatttgtgaatgctgttgtggaacttttacaaaatgatgcctattcggaaactgaa
gagaaggaacaatttctgcaagacaaaaaactagttgacgaacctttactttcacttgtc
gcttcaaaatctctacaggaacaaaaaaacttttacgatttgttgcatttttcaccatta
aaagtacatgttagtttttcattgcaagctggcggtggatctcctcaaggaactccaaat
tttataaatgttctcttgcaaggtctaggcgtgactctcactgatatgcaagatgtcgtt
tttaggctggcctatttcgaacgtgattacactttcttaacacagaaacagcttataagc
gaagctacgactcattacgtcggccaagctgtaaaacagttgtatgtactagtgttaggt
cttgacgtccttggaaatccgtacgggttagtcttgggtataacaaaaggcgttgaagat
ctcttttatgaacccttccagggtgccatacaaggacccggcgaatttgcggaaggattg
gttttaggagtacgtagcttatttggacacacagtggggggagcagctggtgcagtttcg
cgtataaccggcgcgcttggcaaaggaattgctgcacttacttttgacgatgaatatcaa
tctaaacgtcgcgatcaaatcaataaaaaaccagccaccgtgcaagaaggtattgcgcga
gggggtaaaggtttagttatgggaatctttgatggtgttacgggggtgtttacaaaacca
attagtggtgctaaagaagaaggcattgaaggtttctttaaaggtattggaaagggggct
gtaggccttgtagcgcgacccacagctggtgttatcgactttgcaagtggttctttagat
gcagttaaaagagccacagaattgggtgaagaaaccaacagactacgtcatccacgattc
attcaagctgatggtttggtgcagccctataagctttcagatgcagtgggacataaactg
ctaatggacttggaaaaaggaaaatatgcacatactgacatttactgtgcacattacatc
atagttctcaaaaaggaagtgttattgattacagataagcgtatagcgtacatcgttcat
aatgatatatttggaggatggcaagtagaatggtcttacacattaaaagaaattaaacca
ccaccaatgattgtttcgaaaggtgtatccataagcacaaatgaacaaaagaagaagaaa
attttttcatttggttcaaaagattcaggaaaaattataataataagtgatccagagtta
cgcgaagaagtgtgtaacaaaattgacgagcaattaaggagtcttggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
