Limnobaculum zhutongyuii: EKN56_00095
Help
Entry
EKN56_00095 CDS
T06157
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
prag
Limnobaculum zhutongyuii
Pathway
prag02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prag00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
EKN56_00095
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_13
Big_6
Big_9
Big_3_5
Cadherin_5
Big_3_2
DUF4625
Big_3_3
Glucodextran_B
bMG3
CshA_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBH94951
UniProt:
A0A411WF85
LinkDB
All DBs
Position
73807..78105
Genome browser
AA seq
1432 aa
AA seq
DB search
MNNNVSLLVNSGSSTSQVMSVNAGRPIKIKIQPGCKYLLKNKTDNYAPENVTLQRNGDDL
YVILEGDSTPAIVIQDYYVSGNNEPILGMAEDGQLYAYMVTNGSSLGEGYQFENGALASA
ALGGRPLGDGAYLFNDTDHDHDLLALWPWFLGVAALGALAAVVFNKDDDSSSPAPAPLPA
SVPGLSGVMDATGSITGPIAYGSSTDEQKPLIYGTGDAGNTITIYDNGNVIGSTTVGADG
NWSFKPAAALGEGDHAITITQTNSSGSTSASSDDFWFTIDITAPQRPLFNDIIDDVGSIQ
GPITNGAVIDDARPEITGSGEAGNTITVFVDGKEFGTTIVDSEGHWSFTPASDFTDGHHQ
ITVTETDKAGNTSPVSPTFDFTVDTIAPAIPTIESAIDDVGTIQGRLSHGGATDDPTPTL
IGKAEINSIVKVYDGSVLLGSAVANGITGEWVFTPAKPISEGEHRFHVTATDKAGNTSQP
SLDFVLTTDYTPPDRSKLAITGVEDQEGATVGNVINNGMTDDARPIISGTGTAGDTIVVY
VKDATGSHEIGQALVDKDGKWNLQPATPLLPGNNQFTAIESDPVGNATTPSDPYSVNLDI
VKPVEPVIVNIVDKVGPITGALQKGAITDDNQPTITGTARAGYTVHVYDGVSLLGSVVAD
SKGVWHLMPEKALADGKHNITATATSPEGDVSKHTGVFTFEVDTKVPAAPESLVINDNTG
QEQGPLNDGDTTDNNTPAISGNTEPGSTVVIYDNGEKIGEVTADPEGNWIFVPDAPLADG
EHDISVTIRDEAGNTNTDGPEISIIIDTSKVLVSITTLIDDVGSVTGSIKPQGTTDDVRP
EVIGQGKVGNLIKVYDGKTLIGTTTVKADGTWSLTPTKDLSEGKHSITATATDLSGNLSN
PTAAFEFTIDISAPAIPVIQSAKDDVGSIQGALSSGSMTDDSTPTLIGKAEKGSIVIVYD
GIILLGSVVADSVTGEWSLTPATPISEGEHKFHATATDAAGNISKPSADFILTTDYTAPD
ISKLVITGVDDRVGDITGNVENGGLTDDTRPVINGTGTAGDTIVVYTKDASGRHEIGSTT
VDANGKWSLIPTSPLLPGQNQFTAMEMDSVGNTTDLSAPYSIKLDVNKLPVPVIVNLLDD
VGPITGPLEKGDVTDDNRPTIVGTAEAGYTIHVYDGITLLGTVVADSYGVWILTPATALV
DGKHNITATATSPTGQVSQPTGAFNFEVDTKAPNAVDPLTIKDNVGEHTGTLINGDTTDD
NTPTFEGKAEANSTITIYDNGNVIGSTTADADGKWSFTPNDALTDGDYAFSTTVTDAAGN
TSAASPDVHIIIDSSAVVVSISKLVDNVGSITGNITPTGVTDDTRPEIIGEGKSGSVIKV
YDNVNTLLGSTTVKSDGSWSFTPTSDLSEGSHSITAIATDKVGNVSQPTSAF
NT seq
4299 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataataatgtcagcttattggttaattcaggaagtagtacctcgcaggtaatgtct
gttaatgccggaagacctatcaaaatcaaaattcagccgggttgtaaatatctgctaaaa
aataaaactgataactatgccccagaaaacgtgactcttcagcgtaacggtgatgatctg
tatgtcattttagaaggtgattctacccccgctatcgttatccaggactattatgtttcc
ggtaataatgaaccaatattaggtatggccgaggatggtcaactttatgcctatatggta
acaaatggttcttcattaggtgaaggttatcagtttgaaaatggtgctctggcatcagcg
gcgcttggtggcaggcctttaggtgatggtgcgtatttatttaatgatacggatcacgat
catgatttactggcgctgtggccctggtttctgggagtagccgcactgggagcattggcg
gccgttgtctttaataaagatgatgacagtagtagccctgcacctgcgccactacccgct
tccgtacctggtcttagtggagtaatggatgcgacaggttctattactggccctattgcc
tatggttcttcaaccgatgaacagaagccgttgatttatggtactggtgatgcgggtaac
actattaccatttatgacaatggaaacgttattggtagtaccactgtgggtgccgatggt
aactggagttttaagcctgcagcggcattaggcgaaggcgatcatgccattaccattact
cagacaaactcttctggttcaaccagcgcctcatctgatgatttttggtttaccattgat
atcactgcaccacaaagaccactgtttaacgatattattgatgatgttggttctattcag
ggaccgattaccaacggcgctgttattgatgatgcccgcccggaaattacaggctcaggg
gaagccggtaatactattaccgtttttgttgatggtaaggagttcggtacaactattgtc
gacagtgaaggtcactggagttttacccccgcttcagatttcaccgatggtcatcatcag
ataacagtaaccgaaacggataaagccggtaataccagtccagtctcaccaacatttgac
tttacggtcgatacgatagcgcctgcgataccaacaattgaatcagcaatcgatgatgtg
ggcactattcaggggcgattaagtcatggtggcgcaaccgatgacccgacaccaaccctg
ataggtaaagccgagataaatagtatcgttaaggtatacgacggttcggtgttgttaggt
tctgcagttgccaatgggataacgggtgaatgggtcttcacaccggcgaagccaatttca
gaaggtgagcaccgcttccatgtgaccgcaaccgataaggcaggcaataccagccagcca
tccttagatttcgtcctgaccactgactacactccaccagatcgcagcaagttggctatt
accggtgtggaagatcaggaaggtgctaccgttggtaatgttatcaataatggtatgacg
gatgatgctcgccccatcattagtggtaccggtactgccggcgacactatcgtcgtgtat
gtaaaagatgccacgggcagtcatgaaattggccaagctctggttgataaagatggcaag
tggaacctacaaccggccaccccattactgccgggtaataatcaatttactgcaatagaa
agcgatcctgtaggtaatgccactacgccaagcgatccatacagcgttaatctggacatc
gttaagccagttgaaccggtcattgttaacattgtggataaggtagggccaattaccgga
gcactgcaaaaaggtgctattaccgatgataaccaaccaactatcaccggtacggccaga
gccggttataccgttcatgtttacgatggtgtatccctgttgggttcagtggtcgcggat
agcaaaggcgtctggcatttaatgccagaaaaagcgctggctgacggcaagcacaatatc
acggctactgcgaccagccctgagggtgacgtcagtaaacacaccggtgtgtttactttt
gaagtggataccaaggtacccgcagcaccagaaagtttggtcatcaatgataatacgggc
caggagcaagggccattaaacgatggcgacaccactgataataacacgcctgccattagt
ggaaataccgagcccggtagtacggttgttatttatgataacggtgaaaagatcggtgaa
gtgacggccgatccggaaggaaactggatatttgttccagatgctcctctggctgatggt
gaacatgatattagcgttacgataagggatgaagccggaaataccaatacggacggtccg
gaaatatcgattattattgataccagtaaggttctggtcagcattactaccttaatcgat
gatgttggttctgttaccggtagtatcaaacctcaggggacaacggatgacgtacgtcct
gaagtgataggccagggtaaagtcggtaacctgattaaggtttatgatggtaaaacgctg
ataggcacaacaacggttaaagccgatggaacctggagtctcactccgacaaaagattta
agcgaaggtaagcacagcattaccgcaacggccactgacctgagcggaaacctcagcaat
ccaaccgcagcatttgaattcacgatagatatttcagctccggcgataccagttattcaa
tcagcaaaagatgacgtgggttcaattcagggtgcgttaagcagcggtagtatgacggat
gactctaccccaaccctgattggtaaagcagaaaaaggcagtattgtcatcgtatatgac
ggcattattctgttgggttcggtggtagcagatagcgtaactggagagtggagtctcact
ccggctacgcccatttcagaaggtgaacacaagtttcacgctaccgcgactgatgcagca
ggcaatatcagtaaaccatcagcagactttattttaaccaccgattacaccgcgccagat
attagcaaactggtaattaccggtgtggacgatcgggttggcgatattaccggtaatgtt
gagaatggcggcttaaccgatgacacccgtccagttatcaatggtaccggtactgctggt
gataccattgtggtgtatacgaaggatgcatccggtcgccatgaaattggcagcacaaca
gtagatgccaacggtaaatggagcctgataccaacgtccccattattgccggggcaaaac
cagtttaccgccatggaaatggattcggtggggaatactaccgatcttagtgcgccttac
agcattaaactggatgttaataaattgccggttccggttattgttaacctactggatgat
gtcggcccaatcactggaccgctggaaaaaggcgatgtcactgatgataatcgaccaacc
atcgtcggtacggccgaagcgggttacaccattcatgtatacgatggcatcaccttatta
ggaacagtagtagccgatagctacggtgtgtggatattgactccggcgacggctctggtt
gatggtaaacacaatatcaccgccacggcgaccagtccgacaggtcaggttagccaacca
accggcgctttcaattttgaagtggatactaaggcgccaaatgcagtagaccctctgact
atcaaagacaatgtaggggagcacaccgggacactgattaacggtgataccacggatgac
aatacgccaacctttgaaggtaaggccgaagcgaatagcaccatcaccatttatgataat
ggcaatgtgattggttcgaccacggcagatgcggacggtaagtggtcgtttacgccaaat
gatgcattgaccgatggtgattatgctttcagcaccacagtgaccgatgccgcaggcaat
accagtgccgcaagtccggatgtgcatatcattattgattccagcgctgttgtggtgagt
atctctaaactggtggataacgtaggcagcatcacgggcaatattacccctactggcgtg
acagacgatacccgtccggaaattattggtgaaggtaaatcaggcagtgtaatcaaggtg
tatgacaacgttaatacgctgctgggttctaccaccgttaaatctgatggaagctggagt
tttaccccaacctctgatttaagcgaaggttcccatagtattactgcgattgctactgac
aaagtaggcaatgtcagtcaaccaacatcagcgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system