KEGG   Pieris rapae (cabbage white): 110996720
Entry
110996720         CDS       T05162                                 
Name
(RefSeq) small subunit processome component 20 homolog
  KO
K14772  U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
prap  Pieris rapae (cabbage white)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:prap00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:prap03009]
    110996720
Ribosome biogenesis [BR:prap03009]
 Eukaryotic type
  90S particles
   U3 small nucleolar RNA-associated proteins
    110996720
SSDB
Motif
Pfam: UTP20_N UTP20 UTP20_C HEAT HEAT_EF3_GNC1
Other DBs
NCBI-GeneID: 110996720
NCBI-ProteinID: XP_022120224
LinkDB
Position
8:complement(5393513..5407395)
AA seq 2760 aa
MKSKPVKHKTTNTFRFVPFAERINSIDIRHAALYHIEHSNSQQPGENDTHFHLAIQKWHA
LNLTENFKKFKKEVFGIITVPQLIHRKDDVLDVLEKYLNLEDPLCLQPLLEILVSVAKDL
RNDFYPHFPKFLDILIKLLNTKDAEKLEWTLICLAFLFKILKPYLKKDTGSVVSRIVPLL
SENKPQYINNFAAESFAFVARDIRDKNKFVETLLKYLRNNEDAVAGCGHLLFEIIRGVGN
KFHNCIDTYLPLLLQQLKENIDHQNTLFKILTQTVEDSLQIISHKEFTIFWDNVLKYTEE
ISKEDGNKGLEYILRLSGQVIEHCNGKYLLNPQQYTIMLVKVICEQSSESVLDVCASIGA
LLLLSSNITLSQEHAGILVKVLLPLPFPNILINFVQNVTSYSQFDMHILPHYLNFVIQSD
FDLEAMSTLSKICLTKSPLSKNGLKLFEWVKYPLDFGKGLPVVMEHFRKVLKEDLQNTVE
NPTKLMNVLFCLPHIERLDVDECINMLSELISKLLNILSQYNLEHKHDMKLHCDTTALSI
CARKVMFILAATLECAIHISGCKRINDICDIEALLPIIVPCAADPNYLVALHILDLYLTA
YDYENKLTCTFLSLVDSYLRSNVSSPFHIVRSLTTHIYKLFENIEELSKTVQVASDTEKL
TIFTKCNTVESIKPSIQEYRTQIATLQKMAFNTTQYELAKGTDFHLFSLNYMLGILYMNF
KLLWEPVVEFIAGFGNSLTIDEFWPVFYEALENSFVNAKCNFKVFKYDDEFDGMNEILKD
LFAEYNNIDERPDFSNYRNLMLKIMNNCIHVCEARNRDVVTLFLKFIDEEYRRNSNVLKI
DVEKHDTNQVTETDNQDMEVDVINPDQNADLDIQDDSEQDPVSGKIIFKTLINIMQVLAQ
FKNPRALYKEPVFWELYMEFLKHKNPGLQKYALDCVLNYKNKSVVAYKTNLHNLVDEKKF
KDELAQFKVTKDSDSIHAEDREHVVPIILRILYGKMTSKLGADKKGGGQTRRSLVMRYLS
GCNESELTMFIEMAFTYFKDYMSMQPKEIMLTFSDKIDLKSVTSPGKIHSILNLFDVVRE
YFGGSMNDNLLSHLFKVFYAVCSHLAAILARVDKVHVSYVKVMKHLRVIALSILGKLFEQ
FDRYPWSKDELHVIFNTLIWPLLPRLHIEGIHNPTALLKLFNTWCLNPRYYVLLITCPEN
NEELSPLPEIFKLLLVPKSAPGVVNAILDMVEKLLTLTEDEEEKEIPPLESFSTLEVKCE
MDLNFGSKILIPHLSGILEVMKRRIANSAKSNTVNKRDLLILSRVTEMVTTPEMCDDLLN
LLLPILVKKVCMNMAEENMEHAVTTIINLLGHSTNPQQYIKSIGVLFNKVSLVEVRKLLI
KLLFSMSENSTANKETLTKIADVIREMNAFNKRWIDQPDFDRRLDAYKKIYQMLDANEID
IDLAILIVNNCFYFIRTEKDIGLRDSAGLCLKRILPKLLMKYRSTSEGQFFVRDTVLSLI
STGIRDKKNDVLRNECLTILGELTRECPDADVVLSDLAPLANKEDVEVDFFENSCHLQLH
RRVRALLKFCKVARKMIKCPTPRTLTNFILPLASMYICDDTYSDKNTLIDACIEVISTCC
KLLPWYHYEVILKLYLNKMRFSTEHQKQLTRILTAVLDAFHFDFSKVKNIELPKSLLDGI
KIDKNVKKIEEIKENSEVLEGENISKDITTEDNEEDVRSENGDKEEEHEDIEDNEPEAVT
EAKESNIPAFERVTNVSPSVASRIIKSLSSGLLPQLNRAIGKLTEHEESHKVNRRRTGLV
RQEEDMLRVPVALALVKLLQRLPGDMLKHQLPGIIIKLCSFLKSPLKQVRIAARDIVKKI
MITVGPKYLGVLLEHLTLLLTRGFQVHVLVATIHSVLDALKADFKPGDINENLKYILNVC
INDLFGQLSEEKEIEKLHYKTPEAKPSKKSYVTLMIVSQNITQEGLIKLLLPFKEVLQKH
YSKKVVVKVQDALMHISSGLVTNKFIEIESLFVFLHGIASESIPEFVLTAPKRVLTEAQK
ERILRAKPDCFIIPEIPKRNKESQARHVKTSTKTNAHVLVEFSLNILYIILKREKVPRVD
CKAFVDPLIPLLVDAIQSDHVKVITVALKCIATLWTVRISTPTLEDMVQTIVKTIFSILH
KYATFEISKQNDNYHLVRTAFKAVTVLVRNVKYYTLEADQLRILLLYAEGDCQNDERQAN
SFSLLKAILEAKLVSTELHEVMKAVSKICILSESARSRDDARGIFVTYLTNYSPGKRMEK
YIQFFLSQLNYELQHGRESSLKFLEMIINKLDRVFLTKNSEFIMVSLGACMMNDSSPECR
QMAANCIETLLKRASSTERNKLFQLVLQLFEDTQPIHFELAAQLCIRFVNVESENFKTRI
ETVLSILSGKILLLSNDITEGRFVKVRLDDTGKSDEDKQKEKDHSLIQILNLIDSISMNC
PSSLGDPKFVSEYDDIGQYCQVLLAYPHAWVRLRAAKILGHILNNIDVDAFNGNNERGFI
YCDTEDNIKSLVLDLCAQYTPNVGKDMADQVTEVMFQILKLVHSLPRFRLANKIQKDDLE
IDKIAKVNIRWILFKLRRAINAEVAKAPMCMNIRTAIFTMWLHFIGLVESEDLNKVVDVI
LPPIVREVSTGDAATPASVAKQLAGRLGKKLRRKIGEIEYGKLAADVQTKLNIKRAERKK
ILLQEKVLNPEKAAKRKLQLREKKKQAKRVKLDSIHGKRSKGRKRKAEDIDIEDKLLMEE
NT seq 8283 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaagagcaagccggtgaaacataaaactacaaacacatttcgttttgtaccgtttgcg
gaacgaataaattcaattgatatcagacatgctgctctgtatcacattgaacacagcaat
tcacaacaacctggggagaatgatacacattttcatttggccatacagaagtggcatgca
cttaacttgacagaaaattttaaaaagtttaaaaaggaagtttttggtataatcacagta
ccacaattaattcatagaaaagatgatgttttggatgttctggagaaatatttaaattta
gaagatccattgtgccttcagccattgttagaaattttagtgtcggttgcaaaagattta
agaaatgatttctatccacattttccaaagttccttgatattctcatcaaattacttaat
accaaagatgctgagaaactagaatggacgcttatttgtttggcttttttgtttaaaata
ttaaaaccttatctaaagaaagatactggttctgttgtaagtaggattgtccctctactc
agtgaaaataaaccacaatacatcaacaattttgcagcagaaagttttgcatttgttgcc
agagatattagggataagaacaagtttgttgaaacattactcaagtatttaagaaataat
gaagatgcagttgccggatgtggtcaccttctatttgaaataattagaggagtgggcaat
aaatttcacaattgtattgacacatatctacccctattattacaacagttgaaagaaaat
atagatcatcaaaatactttattcaaaatacttactcaaacagtggaagacagtttacaa
ataatatcacacaaagagtttacaattttttgggataatgtactgaaatatacagaggaa
atttcaaaggaagatggaaataaaggattagaatatatattaagattatctggacaagtt
attgaacattgcaacgggaagtatctactaaatccacaacagtacacaattatgttggtt
aaagttatttgtgaacaatcatctgaatcagttcttgatgtttgtgcttctattggagct
ttattactgctatcttcaaatatcacattatcacaggaacatgcaggcatacttgttaaa
gtattgcttcctttaccatttccaaacattttaataaattttgtgcagaatgttactagt
tactctcaatttgatatgcacattttaccacattacctaaactttgtcatccaatcagac
tttgatcttgaagctatgtcaaccttatcaaaaatatgtttaacaaagtcacctttatcc
aagaatggacttaaactttttgaatgggtgaaatacccgctagattttggaaaagggctt
ccagttgttatggaacacttcaggaaagttctgaaggaagatttgcagaatacggttgag
aatccaactaaactaatgaatgtcctattctgtttaccacacatagaaagattagatgtc
gatgaatgcattaatatgctaagtgagcttatatctaagcttttaaatattttatcccag
tataacttagaacataaacatgatatgaaattgcactgtgatactactgctttatctata
tgtgctagaaaagtcatgttcatattagcagccacattggaatgtgcgattcatatatct
ggttgtaaaagaataaatgatatatgtgatattgaagctttattgccgatcatagtacca
tgtgcggctgatccaaactatcttgttgcattgcatatactagatttatacttaacagca
tatgattatgaaaacaaattgacttgtacttttttgtctttggttgattcatacttgaga
agcaatgtatcttctccgtttcatattgtaagatcgctgactacacacatctacaagtta
ttcgaaaatatagaagaattgagtaagactgtacaagtcgcttcagatactgaaaagtta
actatatttacaaaatgtaacacagttgagtctataaaaccttcgatacaggaatataga
actcagattgccacattacaaaaaatggcttttaataccacccaatatgaacttgccaaa
ggtactgatttccatttattttctttaaattacatgttaggtatattatacatgaatttt
aaattactttgggaaccagtagtcgaattcatagcagggtttggaaattctctgaccatt
gatgaattttggcctgttttttatgaggctctagaaaattcctttgtaaatgccaaatgc
aatttcaaagtatttaaatatgatgacgagtttgatggtatgaatgaaattttaaaagat
ttatttgctgaatacaataatattgatgaaaggcccgatttcagtaactatagaaattta
atgttaaagattatgaataattgtattcatgtatgtgaagcacgcaatagggatgtggtc
acccttttcctcaaatttattgacgaagaatatcgacgtaacagtaatgttctaaaaatt
gatgtcgaaaaacatgatacaaatcaagtaacggaaactgataatcaagatatggaagtt
gatgttattaatcctgaccaaaatgctgatcttgatattcaagatgatagtgaacaagac
cctgtttctggtaaaataatatttaaaacacttattaatatcatgcaagtattggcccag
tttaaaaacccaagagctctctataaggaaccagtcttttgggaactttatatggaattt
ttaaaacataaaaatcctggattacaaaagtatgcactagactgtgttttgaattataaa
aataaaagtgttgttgcgtataaaacaaatctgcacaatttagttgatgaaaagaaattt
aaggacgagctggcacagtttaaagttacgaaagattctgattctattcatgcagaagac
agagaacatgtagtgcctataatacttagaatattgtatggaaaaatgacctccaaacta
ggtgcagacaagaaggggggtggtcaaactagaagatctttagtcatgagatatttaagc
ggttgtaatgaatctgaactaacaatgtttatagaaatggcgttcacatattttaaagat
tacatgtctatgcagcctaaagaaatcatgctgacattttccgataaaattgatctaaaa
tctgtgactagtcctggaaaaattcacagtattttgaatttgtttgacgttgtaagagaa
tactttggtgggagcatgaatgataatttactttctcatctctttaaagtattttatgcg
gtgtgttcgcatttagctgccatcctggcacgagttgacaaagtacatgtcagctatgta
aaagtcatgaaacatctgagagttattgcattgtctatattaggaaaactttttgagcaa
tttgatagatatccttggagtaaagatgagttacacgttatatttaataccttgatctgg
cctttgttgcctcgtcttcatattgaaggtattcacaatccaacagctttgctaaagcta
ttcaatacatggtgtctgaatccccggtattatgttttacttatcacctgccccgaaaat
aatgaagaactgagtcctttacctgaaattttcaagcttttactggttccaaaaagcgct
cctggcgtagttaacgcaattttggatatggttgaaaaattattaactttaaccgaagac
gaagaagaaaaagaaataccacccctagaatctttcagcacattggaagtcaaatgtgaa
atggatttaaattttggaagtaaaatattaattccacatttatctggtatcctggaagtg
atgaagaggcgtatagccaattcggctaaatcgaacacagttaataaaagggacttgcta
atattgtcccgtgttacagaaatggtcacaacacccgaaatgtgtgacgatttgttgaat
ttacttttgcccatactagttaagaaagtttgtatgaatatggctgaagaaaatatggag
cacgctgtgactactattattaatcttttaggtcacagcacaaatcctcagcagtatatt
aaaagtataggcgttctgtttaataaagtcagtttagtagaagttcggaagctcctaatc
aaactgctcttctcaatgtcagagaattcaacagccaacaaagaaactctgacaaaaata
gctgacgttattcgtgaaatgaatgctttcaataagagatggattgaccaacctgatttt
gacagaagattagatgcttataagaaaatatatcaaatgttggacgctaatgagattgat
attgacctcgcgattctcatcgttaacaactgtttctattttatacggacggaaaaagat
ataggattacgtgatagtgccggtctatgtttaaaaaggatacttcctaaattactcatg
aaatacagatccacatctgaaggtcaattcttcgttagagatacggttttatctttgata
tcaactggaattcgggataagaaaaacgatgtactacgaaatgaatgtttgacaatactt
ggggaattgacacgagaatgtcccgatgctgacgtcgttctctccgacttagcaccgtta
gcaaacaaagaagacgttgaggtggacttctttgagaatagctgtcatctacagctacac
agacgcgttagagcgttgctcaagttttgtaaagtcgccagaaagatgattaaatgtcct
actcctaggaccctaactaacttcatactaccactagcatctatgtatatttgtgacgat
acatattcagataaaaacacacttattgatgcttgcatagaagtgatatctacatgttgc
aaattgttaccctggtaccactatgaagttattctgaaactttatttgaataaaatgaga
ttttcgacggaacatcagaagcaattaacacgaatactaacagcagttttagatgctttt
cattttgatttttcgaaagttaaaaatatcgaactaccaaaatcgttattggatggtata
aaaattgacaaaaatgttaagaaaatagaagaaattaaagaaaattcagaagttttagag
ggtgaaaatataagtaaagatataaccacagaagataatgaagaggatgtccgaagtgag
aacggcgataaagaagaagaacatgaggatattgaggataatgaaccggaggctgtaaca
gaagctaaagaatctaatattccagcctttgagagagtgacaaatgtatcaccttccgta
gctagtagaatcattaagtcattatcatctggattactaccccaacttaatcgagcaatt
ggcaagctaacggaacacgaagagtcgcacaaagtgaatcgtcgtcgaacgggcttagtg
agacaagaggaagacatgttacgggtccctgttgcgctcgcacttgttaagttactgcag
cgattgcctggagatatgcttaaacatcaattacctggaatcataattaaactatgctca
ttcctaaaatcgcccctcaagcaagtgagaatcgctgctcgagacattgtaaaaaaaatt
atgataaccgttgggccaaaatacctcggtgtattacttgaacatttgactcttctactg
acgaggggtttccaagttcatgtattagtcgcaacaatccactcggttcttgatgcactt
aaggctgatttcaaacctggtgacatcaacgaaaacctgaagtatatcctcaatgtctgc
atcaacgatcttttcggacagctatccgaagaaaaagaaatagagaaattgcattacaaa
acacctgaagcgaaaccgagcaaaaaaagttatgtgactctcatgattgtttcccaaaat
atcacccaagagggtctgataaaacttctcctgccgtttaaggaggttctgcaaaagcac
tactcaaagaaagtggttgtcaaagtccaagatgctctgatgcatattagcagcggattg
gtgacgaacaaattcattgagatcgaatcacttttcgtattccttcacggcatcgcatcg
gaaagtataccggaattcgtattaaccgcaccaaaaagagtgttgaccgaggctcagaaa
gaaaggattctaagagctaaacccgattgttttataataccagaaattccgaaaaggaac
aaggagtctcaagcgcgtcacgtcaaaacgtctacgaagacgaacgcgcacgttctagtc
gaattcagtttgaatatcctgtacatcatcttaaagcgggagaaggtgccaagggtggat
tgtaaggccttcgtggatcccctcataccactgttggttgatgccattcagagtgaccac
gtgaaagtaataactgtggcgcttaaatgtattgcgaccttatggactgttaggataagt
acgccgactttggaagatatggtgcaaactattgtcaaaacgatcttttcaattcttcac
aaatatgcaacatttgagatcagcaaacagaatgataattatcatctggttaggactgcg
tttaaggcagtaaccgtgctcgtacgtaacgtaaaatattacacattagaagctgaccaa
ctaagaatattgttattatacgctgaaggtgactgtcagaatgacgagagacaggcgaac
tcattttcactgctaaaagcaattttggaagcgaaattagtttcgacagaattgcatgaa
gtaatgaaggcagtgtcgaaaatatgtattttgagcgaatctgcaagatcaagagatgac
gctagaggaatatttgtgacgtatttaacaaattactcgcctgggaaacgaatggagaaa
tatattcagttcttcttgagccaactcaattatgaattgcaacacggtagagagtcatct
ttgaagtttttggaaatgattattaataaactagatagggtatttcttacaaagaatagt
gaattcataatggtatcattaggtgcttgtatgatgaacgatagctcgccggaatgtcgt
caaatggcggccaattgtattgagactttgttaaaacgtgcctcttctacggagagaaat
aaactgttccaactagtattgcagttgtttgaggatacacagccaatacacttcgaacta
gccgctcaactttgcatacgttttgtgaacgttgagagcgaaaacttcaaaactcgtatc
gagacagttctttccatacttagtgggaaaattcttctcctcagcaacgatataactgag
ggtcgcttcgtaaaggtccgattggacgacacgggaaaatcggacgaggacaaacaaaaa
gaaaaagaccatagtctcatacaaatactgaatttaattgactccatatcaatgaattgt
ccctccagtttgggagatccaaaatttgtatccgaatacgatgatattggccaatattgt
caagtattactcgcgtatcctcacgcttgggtcaggcttagggcggcgaaaattttaggc
catattttgaataatatagacgttgatgcttttaatggtaacaatgaaagaggttttata
tattgtgatacggaggataatataaaaagccttgtgttggatttgtgtgcgcagtacacg
cctaatgtcgggaaggatatggctgatcaggtgacagaagtaatgttccaaatactaaaa
ctagtacattcattaccgaggtttaggctagcaaataaaattcaaaaggatgacttagaa
attgacaaaatagctaaagttaatattagatggattttatttaaactgcgaagagcgatc
aatgcagaagtcgctaaggcaccaatgtgtatgaatattaggactgcaatcttcacaatg
tggctccactttattggtctcgtagaaagcgaagatttaaacaaagtggtggatgtaatt
ctgcctcccatagttcgggaagtctccacgggtgatgcggcaacaccggcgtcggttgct
aagcaactggcggggagattggggaagaagttgagacgaaaaattggcgagattgaatat
ggaaaattagctgctgatgtgcaaacaaaattgaacataaaacgagctgagaggaaaaag
atcttattacaagagaaagtattgaatccggaaaaggcagcaaagaggaaacttcagttg
cgtgagaagaaaaagcaagcgaaacgggtaaaattagattccatacacggaaaacggtct
aaaggtagaaaacgtaaggcggaagacatagatattgaagataaattacttatggaggag
taa

DBGET integrated database retrieval system