Plasmodium reichenowi: PRSY57_0107900
Help
Entry
PRSY57_0107900 CDS
T08079
Name
(RefSeq) selenocysteine-specific elongation factor selB- like protein
KO
K03833
selenocysteine-specific elongation factor
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prei00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03012 Translation factors [BR:
prei03012
]
PRSY57_0107900
Translation factors [BR:
prei03012
]
Eukaryotic type
Elongation factors
PRSY57_0107900
Prokaryotic type
PRSY57_0107900
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
GTP_EFTU
eEFSec_4th
GTP_EFTU_D2
MMR_HSR1
PduV-EutP
RsgA_GTPase
GTP_EFTU_D4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24528937
NCBI-ProteinID:
XP_012760851
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(<269615..>272191)
Genome browser
AA seq
858 aa
AA seq
DB search
MININVGVLGHVDSGKTSLCKCLSEVLSTCALDKHKESKERGITIDLGFSSFYIKKKIKK
NYNVNHKREVQTNLPNDQTTDQNEPFLYCKRKEKNDLHNIRYDKTNIEYNEKQNYYDYTN
SKHPSNNIYFYDEEIIQICLVDCPGHHSLLKSIIMGSEITDIILLVIDVNKGIQKQTIEC
LVLCKIINCDIIIVLNKIDLIPLHLREKKINLMKKKIQEAFYKFKSLQSLNYHIVSISAN
VKGKDNKDVEGDPPNLLSDDDKKGVNNLLSDDDKKGGRNLLSDDDKKGGRNLLSDDDKKG
RKNLLSDDDKKGGKNLLSDDDKKGGRNLLSDDDKKDASNLLNNHMNEWNGLNKEHITSYN
KLSQNKSSSDTPLMNKTLNIKEIINVLTNIIKIPEREISTYEDFYFLYDHSFNIKGKGTV
FTGTVIKGKIKINCNVTILPLNETGKVKEIQSFKKNVHEGKKGSRLSLLILNNSIKNIKK
NERGVIVYENSNISYFSMFICKVKQVEFYKKDLNNLEHFICIIGFSSTECYGYFFKKIKN
KYETNTSKKIKYNEISQGDDMFPTSIEDTLNVDRKFDRKGNYLLINKLCYDDTQTENNNN
NNKNSNNKDHGDDNNNNDHGDDNNKNEHSGDINNNDHGDDNNKNDHGDDNNKNEHSDDIN
NNNHHLNDDDDDIYFLVVMKRKIHCFENEKCIFLKNDEHTNCRICLYGEIIEMLDKNCTY
KKDDSFVFNKQPNIYKYEEYKDLKILKEKNKKGNIDKIIDEHTIICKNLFQSSNQVIPYI
DKKIYILKSTYDQKNGNTTNGNTSNILHTGTITKPFAKQGKAIVSFDDDILYLKNDIKSY
IFLLVYYKDVFSKKKVFL
NT seq
2577 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaatattaatgtaggtgttttaggacacgttgactctggcaaaacgagcctctgt
aaatgcctgagcgaagttttaagtacatgcgccctagataaacataaagaaagcaaagaa
agaggcataacgatcgacctcggtttttcttctttctatataaagaaaaaaataaaaaaa
aattataatgtaaatcacaagagggaagtccaaacaaatttaccaaatgatcaaacaact
gatcaaaatgaaccctttttatattgtaaaagaaaagagaaaaatgatttacataatata
agatatgataaaacaaatattgaatataatgaaaaacaaaattattatgactatacaaat
tccaaacatccttctaataatatatacttttatgatgaagaaattattcagatttgttta
gttgattgcccaggacatcattctcttttaaaaagtattattatgggttcagaaattaca
gatatcattttattagttatagatgtaaataaaggaatacaaaaacaaaccatcgagtgt
ctagttttatgtaaaataattaattgtgatattattattgtcttaaataaaatcgatctt
atacctttacatctaagggaaaaaaaaattaatttaatgaagaaaaaaatacaagaagca
ttttataaatttaagtctctacaaagcttgaactaccacattgttagcatatcagcaaat
gtaaaaggtaaagataataaagatgttgaaggggatccaccaaatttattaagtgatgat
gataagaagggtgtgaacaatttattaagtgatgatgataagaagggtgggagaaattta
ttaagtgatgacgataagaagggtgggagaaatttactaagtgatgatgataagaagggt
aggaaaaatttattaagtgatgatgataagaagggtgggaaaaatttattaagcgatgat
gataagaagggtgggagaaatttattaagtgatgatgataagaaggatgcatcaaattta
ttaaataatcatatgaacgaatggaacggattaaataaagaacacattacatcatataac
aaattgtctcaaaacaaatcatcgtcggacacaccattaatgaataaaaccttaaatatt
aaagaaataataaatgttcttactaatattataaagataccagaaagagaaatttcaaca
tatgaagatttttattttttatatgatcattcttttaacattaaagggaaaggaacagta
tttacagggacagtgatcaaaggaaagataaaaataaattgtaatgttactattttacca
ttaaatgaaacagggaaagttaaagaaatacaaagttttaaaaaaaatgtgcatgaaggg
aaaaaaggaagccgattatctcttttaatattaaacaatagtataaaaaatataaaaaaa
aatgaaagaggagttatagtttatgagaactcaaatatatcatatttttcaatgtttata
tgtaaagtcaaacaagtagagttttataaaaaggatctaaataatctagaacattttatt
tgtattattggtttttcttcaacagaatgttatggatatttttttaaaaaaattaaaaac
aaatatgaaacaaatacatctaagaagataaaatataacgaaatctcacaaggggatgat
atgttccctacttcaatagaagatactttaaatgttgacagaaagtttgataggaaagga
aattacttacttataaataaactttgttatgatgacacacaaacggaaaataataacaac
aataataaaaatagtaataataaggatcatggtgatgataataataataatgatcatggt
gatgataataataaaaatgaacatagtggtgatattaataataatgatcatggtgatgat
aataataaaaatgatcatggtgatgataataataaaaatgaacatagtgatgatattaat
aataataatcatcatcttaatgatgatgatgatgatatttattttcttgtagttatgaaa
agaaagattcactgttttgaaaatgagaaatgcatattcctaaagaatgatgaacatacg
aattgtagaatatgcctttatggggaaattatagaaatgctggataagaattgtacatat
aaaaaagacgattctttcgtttttaataaacaaccaaacatatataaatatgaagaatat
aaagatttaaaaatacttaaagaaaaaaacaaaaaaggaaacatcgataaaatcatagat
gaacatactattatatgtaaaaatttatttcaatcatccaaccaggttattccatatata
gataaaaaaatttatattcttaaatcaacatatgatcaaaaaaatggaaatacaacaaat
ggaaatacttctaatatattacatactggtactatcacaaaaccatttgctaaacaagga
aaagctatagtttcttttgatgacgacattttgtatcttaaaaatgacatcaagtcttac
atctttcttttggtatattataaagatgtattttctaaaaagaaggtatttctatag
DBGET
integrated database retrieval system