Plasmodium reichenowi: PRSY57_0604400
Help
Entry
PRSY57_0604400 CDS
T08079
Name
(RefSeq) DNA repair protein RAD50, putative
KO
K10866
DNA repair protein RAD50 [EC:3.6.-.-]
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
Pathway
prei03440
Homologous recombination
prei03450
Non-homologous end-joining
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prei00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
PRSY57_0604400
03450 Non-homologous end-joining
PRSY57_0604400
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
prei03032
]
PRSY57_0604400
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
prei03400
]
PRSY57_0604400
DNA replication proteins [BR:
prei03032
]
Eukaryotic type
DNA Replication Termination Factors
MRN complex
PRSY57_0604400
DNA repair and recombination proteins [BR:
prei03400
]
Eukaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
MRN(MRX) complex
PRSY57_0604400
BRCA1-C complex
PRSY57_0604400
NHEJ (non-homologous end-joining)
MRX complex
PRSY57_0604400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_23
SMC_N
AAA_21
SbcC_Walker_B
AAA_29
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24529999
NCBI-ProteinID:
XP_019970656
UniProt:
A0A151LNY0
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(165905..172546)
Genome browser
AA seq
2213 aa
AA seq
DB search
MTTLEKIGIQGIRSYSDEDVEILEFATPITIIYGNNGSGKSTIIECLKVSCTGDFPPNAE
KGKSFLHDPLISNKMNIRGKIDVLLNNYNNKRIGISRSYNLFYSKDKNKKVKHTFRALDN
NIIIKKEKGDDLIITNKCVDINNHIPKLMGVSKALLENVIFCHHDENLWPFSESIKIKKK
FDELFGDDHFSKILEELLKCKKYLNDLLKRKEFDLIHIKEKFEKKKNIYIEIEKNEKEIQ
SAQICIQLDVEEIEENTIILNNLIKKKNLLYKLIGNIDSYFLLYSKFKVDAEAYKDLKEV
YEENYTELLHFQEVFNNDINKCQICIQKVKQDIHNLQHEKDTCMFNYNESNKYDDNYELS
KKQLNEYIIKRDDIINKLKDIFFYNDQIFFSNYKANSSADIIKHSAINEGHQKEKLNEKL
KKKFKKHDSIFIKEHLLKEYENLLNMYDIHKEDMALYNHDVMLSYKNEEHIPSSARLIEE
LYLICQNKVQDKASNKSDDNKNKWDDNKNKWDDNKNKWDDNKNKWGDNKNKWDDNKNKWD
DNKNKWDDNKNKWDNNKNNFDDNKNNFDDNKNNLDDNKNNLDDNKNNFDDNKFSEIPNVS
NILSNVPYLKKKHEKKINSIRYVLKRYISHIKRNKYIKRNVIYKIKNYKKRLLKIEKKIT
LLDIYKNKLNKLKSNEFIYEQNLKKIEKLNQLKCLYDNLTTLDDEMDTYNIQKENNYYEE
QIEKNMKQINYIHKLKIWIHTFCNIIRNYNIFYEFIQRCKKIHANCVLFFDILFSLVQVI
KTNFYKIVDMLKERDMDFYYYIERGMEKKIINVEKNKSVEKNISVEKNKSVEKNKSVEKN
TSVEKNISVEKNTSVEKNTSVEKNTSVEKNTSVEKKKITKLKSNIEIEESVEKIKDNNIN
ECDVNVDTLNKTNSIHHVNNRKINSKPLVCMNTHFQRKRENEKINDYTCKLKKQKTHLDI
SILKNRKYLDILLNIINIYIDKYENKINNVKNLIISLKEKVLEISKKLNNINNNINEYKN
YLLNFKNMLKEKKYKDVKDFVNYLEAINNQIKIKKKNLWMLNGKEDLMNEFKNHLKSDEE
NNSDNHKKVGVEKKKKCIFCKSTISQNNKDMEQIEMYIEEQKRDMLKKIQESEKDINILK
NKKEENIILLNYYYYYIKHMHTYTNDSNEMVVRLKEELLSVQESIEKYNIKIKNIHRKFQ
LVQKFKETCVHLINIQKDILDVEKYIKDESIKIKWNFQEMQNKINDNMKNNKMSNNMITP
DNMITPDNMITPDNMITRNNMNTCDHSFVEKLYHAIENLDISIEVKESNLLKNIKEFVKN
FAKYNNKDIINIFYNKMCTTNVNGSNSYIPYNEMINVDLYEQYNYQNNYEDSFKYNLYKI
NNANYICKLLSPHQKVNLKXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXKKTDDDGYDDEI
FPCDNIEYDEQFYEDDHHHSYNKSKSLIENYRSPCKIKEESVKEPNMCSIKHIYDNVSSN
DDILKNDKTVLLNKVNSSYLSFVLNIGTSFYRNEEIKENNKNDINETYDNTNKMCDGTNK
MCDGTNKMCDDTNKICDDTNKICDDTNKKFHNTNKRYDNINQNTYGTFLKCSHFLHDLPS
IILNNKHFEKMYGNFLSCLNVEEYTRKEQIKMIEKMKVVIKDRRAYVIKKSKVLEKTINI
DKRIRDLIKKMDIYILYYKEKKKKIIDEKIHAKDLLIEQRDTQLKYIKKCIRNNKKSIFL
EKRNYYLKMNMIYILIKKLKHTEEEIAKKEKYLKDVKEKLNNNEIIKNQVICIDKKINEK
KEHILCLEKEKINIEKMLHNIIMNTNMKKMYEQFLEHHQTFILSLNQLKGSFFLYEGKNI
KNSNIYKLEYKDEINGDKKKENDNNVSSNNNSIINNDNRNKKNMYNDEENGINYINDIVK
KLEENYNSNTNIYNFINKTFDITECLKNRLKDIIKIEEDDLNEQIEKYTKSITALKIKEA
EMNGKICLRKEYLEKLKEDIKSETLINIDKEYKKKIIEIFVYKNLIKDLQNFHFSFDQAI
IKFHSLKMQEINLSIKNLWRRVYNSADIDYIYIKSDIQTEPTDKSSQRRSYNYRVVMVKD
NCELDMKGRCSSGQKVLSSIIIRLALAESFSIKCGILALDEPTTNLDKANSRNLASLLAN
IVELRKNSSSFQLILITHDNYFVDILSQYGLTNCFYKIKKNNLGYSKIERVHT
NT seq
6642 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactacgcttgaaaagattggaatccaaggtattagaagttatagtgatgaagatgta
gagattctggagtttgcaactcctattacgataatatatggaaacaatggtagtggtaaa
tcgacaataattgaatgtcttaaggtgagttgtacaggtgactttccaccgaacgccgag
aaagggaaatcgtttttacatgacccgctaatatctaataagatgaatataagagggaag
atcgatgtacttttaaataattataataataagcgtattggtatatctcgttcttataat
ttattttattcaaaagataaaaataagaaagtgaaacatacatttagagctttagataat
aatataattattaaaaaagagaaaggtgatgatttaattattacaaataagtgtgtagat
attaataatcatatacctaaattaatgggagtatctaaagctttattagaaaatgtaatt
ttttgtcatcatgatgagaatctgtggccttttagtgaatccataaaaataaaaaaaaaa
ttcgatgaattatttggagatgatcatttttctaaaatattagaagaattattaaaatgt
aagaaatatttgaatgatttattaaaaagaaaggaatttgatttaatacatataaaagaa
aagtttgagaaaaaaaaaaatatatatatcgaaatagaaaaaaatgaaaaggaaatacaa
agtgctcaaatatgtatacaattagatgtagaagagatagaagaaaatacaattatttta
aataatttaataaaaaaaaaaaatcttttatataaactaataggaaatatagattcttat
tttttattatattccaaatttaaagtagatgcagaagcatataaagaccttaaagaagta
tatgaagaaaactatacagaattattacatttccaagaggtttttaataatgatattaat
aaatgtcaaatatgtatacagaaggtaaaacaagatatacacaatttacagcatgaaaaa
gatacttgtatgtttaattataatgaatccaacaaatatgatgataattatgagctttcc
aaaaaacaactcaatgaatatataataaaaagagatgatataataaataagttaaaggat
atatttttttataatgatcaaatttttttttctaattataaggctaactcatcagcggat
attattaaacatagtgcaataaatgaaggacaccaaaaggaaaaattaaatgaaaagtta
aaaaagaaatttaaaaaacatgacagcatatttattaaagagcatttattaaaagaatat
gagaacttattaaatatgtatgatattcataaggaagacatggcattgtataatcatgat
gttatgttatcttataagaatgaggagcacattccctcaagtgcaaggttaatagaagaa
ttatatttaatatgccaaaataaagttcaagataaagcgtctaataaaagtgatgataat
aagaacaaatgggatgacaataagaacaaatgggatgataataagaacaaatgggatgat
aataagaacaaatggggtgataataagaacaaatgggatgataataagaacaaatgggat
gataataagaacaaatgggatgataataagaacaaatgggataacaataaaaataatttt
gatgacaataaaaataattttgatgacaataaaaataatttggatgacaataaaaataat
ttggatgacaataaaaataattttgatgataacaaatttagtgaaattccaaatgtatca
aatatattatcgaacgttccatatttaaaaaagaaacatgagaaaaaaataaattccata
agatatgttttaaaaagatatatatcacacataaaaaggaataaatatataaaaagaaat
gtaatatataaaataaaaaattataaaaaaagattgttgaagatagaaaagaaaataaca
ttattagatatatataaaaataaattaaataaattaaagtctaatgaatttatatatgaa
caaaatttaaaaaagatagaaaaattaaaccaactaaaatgtttatatgataatctaacc
actcttgatgatgaaatggatacatataatattcaaaaagaaaataattattatgaagaa
caaatagaaaaaaatatgaaacaaattaattatatacataaattaaaaatatggatacat
accttttgtaatatcataaggaattataatattttctatgaatttatacagcggtgtaaa
aaaatacatgcaaattgtgtactcttttttgatatcctcttttctttggtgcaggttata
aaaacaaatttttacaaaattgtagatatgctgaaagaaagggatatggatttttattat
tacattgagaggggcatggaaaaaaaaataataaatgtagaaaaaaataaaagtgtagaa
aaaaatataagtgtagaaaaaaataaaagtgtagaaaaaaataaaagtgtagaaaaaaat
acaagtgtagaaaaaaatataagtgtagaaaaaaatacaagtgtagaaaaaaatacaagt
gtagaaaaaaatacaagtgtagaaaaaaatacaagtgttgaaaaaaaaaaaataaccaaa
ttgaagagtaacatagaaatagaagaaagtgtagaaaagataaaggataataatataaat
gaatgtgacgtaaatgtagatacattaaacaaaacaaatagtatccatcatgtgaataat
agaaaaattaatagtaagcctttagtttgtatgaatacacatttccaaaggaaaagagaa
aatgaaaaaataaatgattatacatgtaaattaaagaaacagaaaacacatttagatata
tccattttaaaaaataggaagtacttagatatattgctaaatattataaatatatatata
gataaatatgagaataagataaataatgtaaaaaatcttattatatcattaaaagaaaag
gttttagaaatatctaaaaaattaaataatattaataataatataaatgaatataaaaat
tacttattaaattttaagaatatgcttaaagaaaaaaaatataaagatgttaaagatttt
gttaattatttagaagctattaataatcaaataaaaataaaaaaaaagaatttatggatg
ttaaatggtaaagaagatctcatgaatgaatttaagaaccatctaaaatcagatgaagaa
aataatagtgataatcataaaaaagtaggtgtagagaaaaaaaaaaaatgtatattttgt
aaaagtaccatatctcaaaataataaagatatggaacaaatcgaaatgtatatagaagaa
caaaaaagagacatgttaaaaaaaattcaagaatctgaaaaagatattaatatattaaaa
aataaaaaagaagaaaatattattttattaaattattattattattatataaaacatatg
catacatatacgaatgattcaaatgaaatggtagtaagattaaaagaagaactcttatct
gttcaagagagtattgaaaaatataatataaaaataaaaaatattcatagaaaatttcaa
ctagtacaaaaatttaaagaaacgtgtgtgcatctaattaatattcaaaaggatatatta
gatgtggaaaaatatataaaagatgaatcgataaaaataaaatggaattttcaagaaatg
caaaataaaataaatgataacatgaagaataataaaatgagcaataatatgatcacacct
gataatatgatcacacctgataatatgatcacacctgataatatgatcacacgtaataat
atgaacacttgtgatcattcatttgtagaaaaattatatcacgcgatagaaaatttagat
atttccatagaagtaaaggaatctaatttattaaaaaatattaaagaatttgttaaaaat
tttgcaaaatataataacaaagatatcataaatattttttataataaaatgtgtacaaca
aatgtaaatggttctaattcatatattccttataatgaaatgattaatgtagatttatat
gaacaatataattaccaaaataattatgaagatagttttaaatataatttatataaaatt
aataatgctaattatatctgtaaattgctttcaccacatcaaaaggttaatctaaaannn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaaaaaacagatgatgatggatatgatgatgaaata
tttccctgtgataatatagaatatgacgaacaattttatgaagatgatcatcatcattct
tataataaaagtaaaagtttaattgaaaattatagaagtccttgtaaaattaaagaagaa
agtgtaaaagaacctaacatgtgtagtataaaacatatatatgataatgtatcgagcaat
gatgatatattaaagaatgacaaaacggttcttcttaataaagttaatagttcttatctt
tcattcgtattaaatattggaacgtccttttacagaaatgaagaaataaaagaaaataat
aaaaatgatataaatgaaacgtatgataatacaaacaaaatgtgtgatggtacaaacaaa
atgtgtgatggtacaaacaaaatgtgtgatgatacaaacaaaatatgtgatgatacaaac
aaaatatgtgatgatacaaacaaaaagttccataatacaaacaaacggtacgataatata
aatcaaaatacttatggaacatttttgaagtgttctcactttttacatgatttaccttca
atcatactaaataataaacactttgaaaaaatgtatggtaactttttatcatgtctaaat
gtagaagaatatacaagaaaagaacagatcaagatgattgaaaaaatgaaagttgtcata
aaggataggagagcttatgtaataaaaaaaagcaaagtattagaaaagactataaatata
gataaaagaattagagacctaataaaaaaaatggatatttacattttatattataaagaa
aaaaaaaaaaaaatcatagatgaaaaaatacatgcaaaggatttattaattgaacaacgg
gatactcaattaaaatacataaaaaaatgtattagaaataataagaaaagtatattttta
gaaaagagaaattattatttaaaaatgaatatgatatatattttgataaaaaaattaaaa
catacagaagaagaaatagcaaagaaagaaaaatatttaaaagatgtgaaagaaaaatta
aataataatgaaataattaaaaatcaagtaatttgtattgataaaaaaattaatgaaaaa
aaagaacatatattatgtttagaaaaagaaaaaatcaatatagaaaaaatgttacataat
attattatgaatacaaatatgaagaaaatgtatgaacaattcttggaacatcatcagaca
tttatattatctttgaatcagttgaagggatctttttttttatacgaagggaaaaatata
aaaaatagtaatatctataaattggaatataaggatgaaataaatggagataaaaaaaaa
gaaaatgataataatgtatcttcaaataataactctataataaataatgataataggaat
aagaagaatatgtataatgatgaagagaatggaataaattacattaatgatattgtaaaa
aagcttgaagagaattataacagtaatactaacatatataattttattaataaaactttt
gatattacagaatgtctaaaaaatagattaaaggatattataaaaatagaagaagatgat
ttaaatgaacaaatcgaaaagtatactaaatcaataacagccttaaaaattaaagaagct
gaaatgaatggaaaaatatgtttaagaaaagaatatttagaaaaattaaaagaagatata
aaatctgaaacattaattaatatagataaagaatataagaaaaaaatcattgaaattttt
gtatacaaaaatttaatcaaagatttacaaaatttccatttctcatttgatcaagctatt
attaaattccattcattaaaaatgcaagaaattaatttatctattaaaaatttatggaga
agagtatataatagtgcagatatagattatatatatattaaatccgatatacaaactgaa
ccaacagataaatctagtcaaagaagatcttataattatcgagttgttatggttaaagat
aattgcgaacttgatatgaaaggtagatgttcatctggtcaaaaagtcttatcatctatt
attataagattagctctagctgaatcattttctattaaatgtggtatcttagcattagat
gaacctactacaaatctagataaagcaaattcaagaaatttagctagtctacttgcaaat
attgtagaactaagaaaaaacagctcatcatttcaacttatacttataacacatgataat
tattttgttgatatcctatcacaatatgggctaaccaactgtttctataaaattaaaaag
aacaacctagggtattcaaaaattgaaagagttcatacttga
DBGET
integrated database retrieval system
