Plasmodium reichenowi: PRSY57_0903200
Help
Entry
PRSY57_0903200 CDS
T08079
Name
(RefSeq) nucleoporin NUP100/NSP100, putative
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nucleoporin_FG
ATAD3_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24530880
NCBI-ProteinID:
XP_012762725
UniProt:
A0A151LHH0
LinkDB
All DBs
Position
9:complement(151975..158609)
Genome browser
AA seq
2122 aa
AA seq
DB search
MFNQNFNNSNLNKGNFQDSNNLLKNKNMFMQNSSQNNNIFGTFNQNNNANKSLFGNSNLQ
SNIGNTDNSLFGGSKIQQPNNALVNKSIFNLGGSSGTSTGLSGGKSIYDNMNSQSNLNTK
NIFGSTNVSNNTQGNMGGNSLFMNANNQNNLNMKNIFGSSSGLNNQTSNLGNKSIFGGLQ
PSNQTTSSNNIFGNMSSNQTNSSNIFGNLSSTSQNKSNSIFGGLGTSTNQSTGGGLFGNT
GATSQNKTGGIFGGLSSTNQASTSSTSMFGGLSSNQAKPTNSLFGGLSSGATSNTGTQQS
GNLFGSASGIGQSKAVGGIFGNLSSANQASTSSSNMFGGLSSNQAKPTSSLFGGLSSATT
TNTSTQQSGNLFGSATGLGQNKTGGGIFGTLPSANQTSTSSSNMFGGLSTNQAKPTSSLF
GGMSSGTTGITTNTTAQSGNLFGGTGTSQNKTGNLFGALPGANQTSTTSNIFGGLSSAQS
KPTSNIFGTMGTTSATTTAASTSSNIFGSTGGLNQSKPSTGNVFGSLQTMTQPGSTNMFG
TTQGTSQGLTSNNMFSSSTVPGSSQNKFTNMFGTLSGTTGSTPMGTLTTPSSSTTATTGL
TGTGVGGTSGTSNIFGNVSGGSSFGNLSANKNIFGSTGTGMTLSTASTSLSPSVGTSLGQ
NLGGAMTSTLNTNLTTPGFGQSGGSNIFGNLGGTVTSNIGSTTTPTPSSSTLLGSTLTSG
LSTTTDTASKNFLLGDKNALTISPLGGTSTLPTSSTNLTMQTGTGLTSSTPNILINDQPR
VVSNLNLVNELKRDKESNLRSTDNFHGLHDELTITKKKESIFDKIYNDDIDNEEEEEEDE
EGGSSGGLFYNYINLIINDNINNIQKSTLTLLNDHDSLMWDNFKSHIFKNFVDYLVNFKQ
KKNQKMIKGNVLDLDQHEFQILIWLYNVNSTKLNFIPFKSFYYLLLSETNLNYSKVLIGG
SDKKILLDNFIEVNDHYYINSNNDIFKSQLNKYRNSSLHRDEYNSSLDIDSMYKQLLKDI
LNSLLNMNLSITKENIRKNMKTENLKNGNEGKGAGVEIKKKRVDEKKKKKRTRGKKKKKR
VAKYKSEVNEDSYEEENSYESDDNDENVNDNDESIDDNDESVDDNDESVDDNDESVGDND
ESFDNNDESVDDNVENNINTRKMVRIPQFRYENILLNYLFGTLQHLHDKFYKIEISNYVS
KDLNQIDEYFLDAKSNAIFSYCYNNFYKNEMDKENSTIHFFFYLVNIMFRCGNYIGLIQI
IKLEEFIKNLNIDNYLYDFVILLIRILLLIYNKKNTMNIFEDMKVDIDCSDIFKKKIHMS
NIINFFHSIIYLCINNIYAYDLLCILFSDIFCKRGNMYTNRDKKIAMKNIFFYIRKKNGT
INNNTTSSNNNYNNNNNNHHGASIFHSASDDDLLADKNYIKEIRNRYMNYDYNNDKLMMN
GSLRKNRRHPNNSNKDGNIYYNDTINDSSNDDYGEDEADDGYNSRDHDKKNKKKKKPFFF
DMISNMLQKPKTVKEYENDFNNSMDINDEVNKGIYNLRKSTFSKNPNDIYLGVTNRHAFN
FQYCNIETSIWIELCLFLSKNFNIYGSKFIDNFDIIDTDVLYCEEENVSHINDTKCRRER
INKRIEVLFITISNYIINENKEYLYICSKLKVDEVMNNFLINDGKISEKLKGNINKVLKN
NFLLYIKLFYYLLLVGNIYTTIVFLSCISNNVQRILLVLSIFLHNNNIFENHLLNNIKMK
TLQYLKFRNDHNSILDTSHDITDVPNSENKFNLILLSMSNVDLPFDHFVLRNNNINILLK
ITYLLNLKTNISIKLLKSIVQENQDILLHESVIGHINNDGNIFYGKLHDFLFLFKNKIKI
RKDIKCFFLMYYILYKQNVSNNILLKTRQNEMDDEYLYKSRNFKFVHNKNINTLNKISLD
NSLISVHSSILYKISQFYAILAYFANQRKNYIISFICYYILKDEDSAINSLIRIYNDELI
YYFHNNEKEYNYIRKCAFRFFHLAKNMWPSNVKLESIENKSYLILCILFMKKKLFEEAFV
IFSTNLVPDNMLEKLSTADYYNIDLSSNFLMTLKELCTQNYRIDELVSKPALKAIIKFLN
PIKDKLDPQIVESINYLDEINY
NT seq
6369 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcaaccaaaattttaataattctaatttgaataaagggaactttcaagattcaaat
aatttattaaaaaataagaatatgtttatgcaaaattcatcacaaaataataacatattt
ggaacatttaatcaaaataataatgcgaataagagtttatttgggaatagtaatttacaa
tcaaatattggtaatacagataattctctttttggaggttcaaaaattcagcaacctaat
aatgcattagtaaataagagtatatttaatttaggtgggagtagtggtacttcgaccggt
ttaagtggtgggaaaagtatttatgataatatgaatagtcaatcaaatttaaatacaaaa
aatatatttggttctacaaatgtaagtaataatacacaaggaaatatgggtggtaatagt
ttatttatgaatgctaataatcaaaataatttaaatatgaaaaatatatttggatcctcc
tcaggtttaaataatcaaacaagtaatttaggtaataaaagtatatttggaggtttacaa
ccaagtaatcaaacaacatcatcaaataatatttttggtaatatgtcatcgaatcaaact
aattcaagtaatatatttggtaatttatcatcaactagtcaaaataaatcaaatagcata
tttggaggattaggtacttctacgaatcaaagcactggtggtgggcttttcggaaataca
ggggctactagtcaaaataaaactgggggtatttttggtggattatcatcgacaaatcag
gcttcgacaagtagtactagtatgtttggaggtttgtcttctaatcaagccaaacctaca
aacagtttatttggtggattatcaagtggagcaacaagtaatactggtactcaacaatct
ggtaatttatttggaagtgcatcaggaattggtcaaagtaaagccgttggtggtattttc
ggtaacttatcatcagcaaatcaagcttctacaagtagtagtaatatgtttggtggttta
tcttccaatcaagctaaacctacaagtagtttatttggtggattgtctagtgctactacc
acaaatacaagtactcaacagtctggaaatttattcggaagtgctacaggattaggtcaa
aataaaactggtggtggtattttcggtaccttgccatcagcaaaccaaacttcgacaagt
agtagtaatatgtttggaggtttatcgaccaatcaagccaaacctacaagtagtctattt
ggaggaatgtcaagcggcacaacgggaataacaacgaatactactgcacagtcaggtaat
ttgtttggtgggactggaactagtcagaataaaacaggtaatctttttggagcattacca
ggagctaatcaaacatccacaacaagtaatatatttggaggtttatcttctgcacaaagt
aaacctacaagtaacatttttggtactatgggaaccacaagtgcgactacaacagcagca
tcaactagtagtaatatatttggttctactggtggtttgaatcaaagtaaaccatctaca
ggtaatgtttttggatcattacaaacaatgactcaaccaggaagtacaaatatgtttgga
acaacacaaggaacatctcaaggtttaacaagtaataatatgttttcatcaagtactgta
cctggaagtagtcaaaataaatttactaatatgtttggaacgttatctgggactactgga
agtacacccatgggtacattaacaacgcctagtagtagtacaactgcaactactggatta
acgggtacaggtgtagggggtacatctggtacaagtaatatatttggaaatgtatcaggg
ggtagtagttttggtaatttaagtgcaaataagaatatatttggttcaacgggtacaggt
atgacattaagtactgcaagtacaagtttgagtcctagtgtaggtacttccttaggccaa
aatttaggtggcgccatgacatctactttgaatactaatttaactactcctggttttggt
caaagtgggggtagtaacatttttggtaatttaggtggtacagtaactagtaatataggt
agcacaactactcctacccctagcagtagtactttattaggtagtacattaacaagcgga
ttaagcacgactacagatactgcatcaaagaattttttattaggtgataaaaatgctctc
acgattagtccactaggtggaacctcaacattacctacgagtagtactaatttgactatg
caaacaggaacaggtttaacaagtagtacacctaatattttaataaatgatcaaccgaga
gttgtgagcaacctgaatcttgttaatgaattgaagagagataaagaaagtaatttgagg
agtacggataatttccatggtttacatgatgagttaactattacaaaaaagaaagaaagt
atttttgacaagatatataatgatgatatagataatgaagaggaggaagaagaagatgaa
gaaggtggatcaagtggtggattattttataattatataaatttaataattaatgataat
ataaataatattcaaaaaagtacattaaccttattaaatgatcatgattcattaatgtgg
gataattttaaaagtcatatatttaagaattttgttgattatctagtaaattttaaacaa
aaaaaaaatcaaaagatgataaagggtaatgtattagatttagatcaacatgaatttcaa
atattaatttggttatataatgtaaattcaaccaagttgaattttataccttttaaaagt
ttctattatttattactaagtgaaactaatttaaattattctaaagtcttaataggagga
tctgataaaaaaatattattagataattttatagaagttaatgatcattattatattaat
tcaaataatgatatatttaagtcacaattaaataaatatcgaaatagttcattgcataga
gatgaatataatagttctttagatatcgattctatgtataaacagttattaaaagatata
ttgaatagtttattaaatatgaatttgtccataacaaaggaaaatatcagaaagaatatg
aaaacagaaaatttgaaaaatggtaatgagggaaaaggtgcaggggtagaaataaaaaaa
aaaagagttgatgagaaaaaaaaaaaaaaacgaacaagaggaaaaaaaaaaaaaaaaagg
gttgctaaatataaaagtgaagttaatgaggatagttatgaagaagaaaatagttatgaa
agtgatgacaatgatgaaaatgttaatgataatgatgaaagtattgatgataatgatgaa
agtgttgatgataatgatgaaagtgttgatgataatgatgaaagtgttggtgataatgat
gaaagttttgataataatgatgaaagtgttgatgataatgttgaaaataatataaataca
agaaagatggtaagaattccccaatttagatatgaaaatattttactaaattatttattt
ggtacccttcaacatttacatgataaattttataaaatcgagataagcaattatgtttca
aaagatttaaatcaaatagatgaatatttccttgatgcgaaatcgaatgctatattttca
tattgttataataatttttataagaatgagatggataaagagaatagtactattcatttt
tttttttatttagttaatattatgtttcgatgtggtaattacattggtttaatacagata
ataaaacttgaagaatttataaaaaatttgaatattgataattatttatatgattttgta
atattattaataagaatattattattaatttataataaaaagaatacgatgaatattttt
gaagatatgaaagttgatattgattgtagtgatatatttaagaagaaaatccacatgtca
aatataataaatttttttcattcaattatatatttatgtataaataatatatatgcatat
gatttgttatgtatattattttctgatatattttgtaaaagaggaaatatgtatactaat
cgtgataagaaaatagctatgaaaaatatatttttttatattagaaagaagaatggtaca
attaataataatactactagtagtaataataattataataataataataataatcatcat
ggtgcaagtatttttcatagtgcttctgatgacgatttattggctgataagaattatatt
aaagaaataagaaatagatatatgaattatgattataataatgataagttaatgatgaat
ggttcgcttcgtaagaatcgtcgtcatccaaataatagtaataaagatggtaatatatat
tataatgatactataaatgatagtagtaatgatgattatggagaagatgaagctgatgat
ggatataatagtagagatcatgataaaaagaataaaaaaaaaaagaagccattttttttt
gatatgattagtaatatgcttcaaaagcctaaaaccgtaaaagaatatgagaatgatttt
aataatagtatggatataaatgatgaagtgaataaaggaatatataatcttcgcaaaagt
actttttcaaaaaatcctaatgatatttacttaggtgttactaatagacatgcctttaat
tttcaatattgtaatattgaaacaagtatatggatagaattatgtttatttttatcaaag
aattttaatatatatggaagtaaatttatagataattttgatataatagatactgatgtg
ttatattgtgaagaagaaaatgtatcacatataaatgatacaaaatgtcgaagagaacgt
ataaataaaagaattgaagttttatttataactatatcaaattatattattaacgaaaat
aaagaatatttatatatatgttctaaacttaaagtagatgaagttatgaataatttttta
attaatgatggaaaaatatctgaaaaattaaaaggaaatataaataaggtattaaaaaat
aatttcttattatatataaaattattttattatttattattagttggtaatatatataca
actattgtatttttatcttgtatttcaaataatgtacaaagaattttattagtattaagt
atctttttacataataataatatttttgaaaaccatttattaaataatataaaaatgaaa
acattacagtatttaaaatttagaaatgatcacaatagtatattagatacatctcatgat
atcacagatgtacctaattcagaaaacaaatttaatttaatattattaagtatgagtaat
gtggatttaccttttgatcattttgttttacgtaataacaatattaatatattattgaaa
ataacatatttattaaatttaaaaactaatattagtattaaattattaaaaagtattgta
caagaaaatcaggatatattattacatgaaagtgtaattggacatataaataatgatggg
aatatattttatggaaagttgcatgactttttatttttatttaaaaataaaattaaaata
agaaaagatattaaatgttttttcttaatgtattatatattatataaacaaaatgtttca
aataacattttattaaagacaagacaaaatgaaatggatgatgaatatttatataaatca
agaaattttaaatttgtacataataaaaatattaatacattaaataaaatttctttagat
aattctttaataagtgtacattcatctattctttataaaatatcccaattttatgcaatc
ctggcttattttgcaaaccaaaggaaaaattatataatatcgttcatatgttattatatt
ttaaaagatgaagacagtgcaatcaattcattaataagaatatataatgacgagttgata
tattattttcataataatgagaaggagtataattatattcgtaaatgtgcctttagattt
ttccacctcgcaaagaatatgtggccatccaatgtcaaactcgaatctattgagaataag
tcttatctcattttatgcattttatttatgaaaaagaaactgttcgaagaggcctttgtt
attttttcaaccaatttggtacctgataatatgcttgaaaagttgtcaacggctgattat
tataatattgatctctcttcaaattttttaatgacattaaaggaattatgcacacaaaat
tataggattgatgaacttgtgagtaaaccagcattgaaggcaatcattaaatttttaaat
ccaataaaagataaattggatccacaaattgttgaaagtattaattatttggatgaaata
aattattga
DBGET
integrated database retrieval system
