Plasmodium reichenowi: PRSY57_1133100
Help
Entry
PRSY57_1133100 CDS
T08079
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, putative
KO
K03002
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
Pathway
prei03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prei00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
PRSY57_1133100
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
prei03021
]
PRSY57_1133100
Enzymes [BR:
prei01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
PRSY57_1133100
Transcription machinery [BR:
prei03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
RNA polymerase I
Core subunits
PRSY57_1133100
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24531920
NCBI-ProteinID:
XP_012763748
UniProt:
A0A151LCK1
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(1270735..1275420)
Genome browser
AA seq
1516 aa
AA seq
DB search
MAEEVNRNIKRTSELINNNKVDKSFLKNINLQITDGEIKLHLKIIEALYPNMKLKVDKLI
NGSYNIFTKFLVQSHIDDFNSFINVYIKNIAENIPIMEFSPQQNNYSLLNMNKNNSESVK
FFVSDIQIKNPMIKNEKGEYRADYPYLCKLSARTYEGELLIKINRQYKDEIASTTICAGH
IPIMIMSNLCNLSNLNKKELAQKGEDQSLLGGFFVVSGRLKVIRYVIHPKYNTLLLNADN
KIHINCLLNDNTVVINFLTLTRNNSYIYGFRFQNAVCSLPFHLLLMILSPIKKKSYIFNK
IKLGVENENAIKYIELFINSIFLKDTFNEKELFEKYNLSYLGRIAYLRRGIFKYNLNSYE
KKAKDILKYCILPHIKNNSEKFETMCFMFKKLIYSNFKLITPINKDSLENHAVTTCSNLL
ANLLKDQVMNSLCRLYIRYTRSFFKYFETKYNTFKLSVKQIYLRYKMFVLEEMQEDRLNQ
ISLSKSSEDINDSSYQDNNDYKNESKKKLKSIFINEKEKLFKSVDNYFKELYNDNYMFLE
NCKSFSNTSSAILFFFKTGNISSENLHYQQKSGWVISADEINNLRLITNFRAIHRGTFFQ
DVKVLTPRKLLGESWGFICPVHTPDGTPCGLLNHLAQYCHIHNLSSNEAHKLNIKLYLKK
IGINVNLDDTSGIHTIYDDENIPIIVDSIPITYIGEKDFNRTVYKLKYAKNNNLFNLKSY
FEINAYLNEPLIMNSIIINTFPGRLIRPLFNLKTKDIEFISPSYQPYISVAINNEDVKKN
NLARKLLKKKEQVVNSLKIDRTPGSIKQKFLYHQNRENLLWKLKKESKDGSNKYDKHKTD
SKLLKILDQKKNNDSDTNTDNYVSSSEYDTDSDYDYGYDSNSDCDSKSNSNFDAKSDNIS
GSDNNMSTTTYIDSDENINIDMYEQIPQKFEYMELKETSFLSFLASLTPFSDHNQSPRNI
YQCQMLKQTMGIQSLNNVYTFTNKIYRMITPQLPLVVTRDYEFYGVDNFPSGTNAVVAIL
AYTGYDMEDALIINKASADRGIFRTHIYKTEFIDLQKVGESSNFVFGNNIRYLNNNKNNN
KNLAYENKGKFLNKDGLPCVQQKITEGSPLYSYINKGNELTTYESFRNHGEYFVDFVSIG
KNNSNQVAVVKLRSTRQPQVGDKFASRHGQKGVVSRLFPQEDMPFAESGIVPDIIFNPHG
IPSRMTIGMLIESICGKAASLYGKRIDATPFRKYTQQKSFNNPWIDNCGIKGFLEKNDTI
KSDLDTCQKEKDKNKNINNNNNNIKENKYNNSNDSNASIDSDDNTNNCNDKRDEEEKKAN
ITYDEKIDYFAKLLLNKGYDYYGTELLYSGIYGVPLQAHIFIGVIYYQRLRHMAYDKAQV
RRTGPVCNLTHQPLKGKRKHGGIRVGEMERDGIISHGCSFVINERFLMSSDGHECFVCPK
CGLILSPIMQFNTTGKIMKGRSIGGKSKMAVCKSCDVSCKIIFIPYVIRYLLNELICLNV
TIRLNMKSVENVFDMK
NT seq
4551 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagaggaagtaaatagaaatattaaaaggacgtctgaattgattaataataataaa
gtagataaaagttttttaaaaaatatcaacctacaaattacggatggagaaataaagtta
catttaaaaattattgaagccttatatcctaatatgaaattaaaagtcgataaattaata
aatggaagttataatatttttaccaaattcctagtacaatcacatatagatgattttaac
tcctttataaatgtttatataaaaaatattgctgaaaatataccaataatggaattttca
cctcagcaaaataattattctcttttaaatatgaataaaaacaattctgaatctgtaaaa
tttttcgtgagtgatatccaaataaaaaatccaatgataaaaaatgaaaaaggagagtat
agagcagattatccttatttatgtaaactatctgcaagaacatatgaaggagaattatta
ataaaaataaatagacaatacaaagatgaaatagctagtacaacaatatgtgctgggcat
attccaattatgattatgtccaatttatgtaatttaagtaatttaaataaaaaagaatta
gctcaaaaaggagaagatcaaagcttattaggtggtttttttgtagtatctggaagatta
aaagtaataagatatgtaattcatccgaaatataatacattattactaaatgctgataat
aagatacatataaattgcttattaaatgataatactgttgtaattaattttttaacatta
actagaaataattcatatatttatggattcagatttcaaaatgcagtatgttctcttcct
tttcatttattattaatgattttaagtccaataaaaaagaaaagttatatttttaataaa
attaaactaggagtagaaaatgaaaatgccattaaatatatagaactttttattaattct
atatttctaaaagataccttcaatgaaaaagaactttttgaaaaatataatttaagttac
ttaggtaggattgcctatttaagaagaggtatttttaaatataatttaaatagctatgaa
aaaaaagcaaaagatattttaaaatattgtatattaccgcatataaaaaataattctgaa
aaatttgaaactatgtgttttatgtttaaaaaattaatctatagtaatttcaaattaatt
actcctataaataaggattctttagaaaatcatgctgtaactacatgtagtaatttatta
gcaaatttgttgaaagatcaagtaatgaattctttatgtcgtttgtacattagatataca
agatccttttttaagtattttgaaactaaatataacacattcaaattaagtgtaaagcaa
atatatttgagatacaaaatgtttgtattagaggaaatgcaagaagaccgcttaaaccaa
atatctttgagtaaatcatctgaagatatcaatgattctagttatcaagataataacgat
tataagaacgaatcaaagaaaaaactcaaatccattttcataaatgaaaaagaaaaatta
tttaagagcgtcgataattatttcaaagaattatataatgataattatatgtttttagaa
aattgtaaaagtttttcaaatacttcatcagctattttatttttcttcaaaacaggaaat
atctcctcagaaaatttacattatcaacaaaaaagtggttgggtaatatcagcagatgaa
attaataatttaagattaataaccaattttagagccatacacagaggaaccttttttcaa
gatgttaaagtattaactcccagaaaattattaggagaatcatggggtttcatatgccct
gtacatactcctgacggtaccccttgtggtttattaaatcatttggcgcaatattgccat
attcataatttatctagtaatgaagcacataaactcaatataaaattgtatcttaaaaaa
ataggtataaatgtaaatttagatgatactagtggtatacatacaatatatgatgatgaa
aacattccaattattgttgattcaatacccattacatatataggtgaaaaagattttaat
agaacagtctataaattgaaatatgcaaaaaacaataatttgtttaatttaaaatcatat
tttgaaataaatgcttatttaaatgaaccgttaattatgaacagtataataattaataca
tttccaggaagacttatacgacctttatttaatttgaaaacgaaagatattgaatttatt
tcaccatcctatcaaccatatatatctgtagctataaacaacgaagatgtaaaaaaaaat
aatttagctagaaaacttttaaaaaaaaaagaacaagttgttaattcgttgaaaatagat
agaacccctggaagtataaagcagaaatttttatatcatcaaaatagggaaaacttatta
tggaaattaaaaaaggaatcaaaagatggctcaaataaatatgacaaacataaaactgat
agcaaattattaaaaattttagatcagaaaaaaaataacgattcagatacaaatacagat
aattatgttagtagttctgaatatgatacggattcggattatgattatggatatgattct
aattctgattgtgattcaaaatctaactctaattttgatgcaaagtcggataatatatca
ggaagtgataataatatgtcaacaactacatatattgatagtgatgaaaatattaatatt
gatatgtatgaacaaataccacaaaaatttgaatatatggaactaaaagagacatcgttt
ttatcctttcttgcttctttgactcctttttcagatcataatcaaagtccgcgtaatatt
tatcagtgccaaatgttgaaacaaactatggggatacaaagtttaaataatgtatataca
ttcacaaataaaatatatcgaatgataactcctcagttgccattagttgtaacaagagat
tatgaattttatggagtggataattttcctagtggtacgaatgccgtagtggctatatta
gcttacacaggatacgatatggaagatgcattaataataaataaagctagtgcagataga
ggtatatttcgaacacatatatataaaactgaatttattgatttacaaaaagttggagaa
tctagtaattttgtgtttggaaataatataagatatttaaataataataaaaataataat
aagaatttggcttacgaaaataaaggaaaatttttaaataaagatggtttaccttgtgta
caacaaaaaataacagagggtagtccattatattcatatattaataaaggtaatgaatta
actacttatgaatcttttaggaaccatggagaatatttcgtagactttgtaagtatagga
aaaaataattcaaatcaagtagcagttgttaaattaagatcaacaagacaaccacaagtt
ggtgataaatttgcatctagacatggacaaaagggggttgtttctcgattatttcctcaa
gaagatatgccatttgctgaaagtggtatcgttcctgatattatcttcaatcctcatggt
attccatctcgtatgactataggtatgcttatcgagagtatttgtggaaaggctgcatct
ttatatggaaaaagaatagatgctactccatttagaaaatatacgcaacaaaaaagtttt
aacaatccatggattgacaattgtggtatcaaaggtttcttggaaaaaaatgatacaata
aaatctgacttggatacatgtcagaaggaaaaggataaaaataaaaatattaataataat
aataataatataaaagaaaataaatataataactcaaatgatagtaatgcatctattgat
agtgatgataatactaacaactgtaatgataaacgtgatgaagaagaaaaaaaagctaat
ataacttatgatgaaaaaattgattatttcgctaaattgttattaaacaaaggttatgat
tattatggcactgaattgttatatagtggtatatatggggttccattacaggcacatata
tttattggtgtaatttattatcaaaggttaaggcacatggcttatgataaagctcaagtc
agaagaacaggaccagtgtgtaacttaactcaccaacccttgaaaggaaaaagaaaacat
ggtggtataagagttggagaaatggaaagagacggcataatatcacatggttgtagtttt
gtaatcaatgaaagatttttaatgagttctgatggacatgaatgttttgtttgtcctaaa
tgtggacttattttatcaccaattatgcaatttaatacaactggaaaaataatgaaagga
agatctattggtggaaaaagtaaaatggctgtatgcaaatcttgtgatgtttcttgtaaa
attatttttattccgtatgttatacgatatttattaaatgaactcatttgtttaaatgtt
accataaggttgaatatgaaatcagtggaaaatgtttttgacatgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
