Plasmodium reichenowi: PRSY57_1222600
Help
Entry
PRSY57_1222600 CDS
T08079
Name
(RefSeq) DNA gyrase subunit A, putative
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prei00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
prei03032
]
PRSY57_1222600
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
prei03400
]
PRSY57_1222600
Enzymes [BR:
prei01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
PRSY57_1222600
DNA replication proteins [BR:
prei03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
PRSY57_1222600
DNA repair and recombination proteins [BR:
prei03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
PRSY57_1222600
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
YmcF-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24532281
NCBI-ProteinID:
XP_012764101
UniProt:
A0A151L8R7
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(<828028..>831744)
Genome browser
AA seq
1238 aa
AA seq
DB search
MSFKFSIVFVLYLLFLLKFNKRFIFLKSEKITSYINTQIPNYCSSPPFFLKKEATNNIKK
CYFIKRKGYRNIGTKNASNVFVLNFKSNRSTYRDNAFSCASLCSEKKERKKVQDPYDLKA
KKKEKTYELNDIKNNEKKKDNIVNASNDVTNDKLDNINNNINESRKLIKGEYYDVEICEI
LSKSFLSYANFLILNRCLCDYRDGLKTVQRRIIWSMYEINKGIDKKGYKKCARIVGEVIG
KYHPHGDKSVYDALVRLAQKHHNNNLLIKGYGNFGSVEYNAAAMRYTEAKISSFCYDILL
DEINDENVEYIKNFDGNEREPKVLCSKIPLLLINGCSGIAVSILSSIPCHNLIDVANCCI
NFLINENIRDDELFHIIKGPDFSTGGIIISKYDILKNIYNSGKGNFEIRSNVFFEYINND
KKVITKHINDLSSIENSDIDKLTKKIIIKNLPPNVKPNELIENIINLLNDKKNEHDNILL
RIRDESEKEDMRIVLELKKHSQIEQIHNFLSYLFKYTNIQISYHCNFVCIGYENTYTQFS
LKSFIKLWCNNRIKFIKKNYEIKNKNLEKQLNIIDLYLIIQNKILDIITFFQKNQNIEQI
QLYLKNNFKLNPEQIKYILSIKLQKLINIKNIDFISQRNKIMHQIKLNDEIINNVQNIKN
LIIQELIYIKNKYGIHNLNKQCIIPSTPKYKYSYINSEYHPNCFKNKQIIDTYNRVSTND
NNINHNNYTHDLRSTDNVTKDKNVVETNLHKNIHISSDISNNIKNSDKNSYVTKNQDSDN
IMPYRNTYIDSLDNNMKDIYNNDEVLILITYGGYIKKIKINEKLKNHSNNIIKLSNVKYI
LKENEEKLNENNKRLKFNDLQKGNEQEKYKDKEQKQNNDIDHNINIQNNDNNNNDNNNND
NNNNNDNNNNDNNNVLLLNEEEYNSYKIKKSILVRNRDKILLTDNYNKAFLLNVYDLHLS
SYDSKGTPINQIIHSSKNITGITKFEENKKYLIVCSENGKMKVINNDVFLKRKKKGIKLF
KNKKNIYFSYCNFNDNCIVGTKNGYIIQFPLSSFKISKKNSLGNKCISLSKNDKVVDLLS
YENNEKNMKNYKIIFVTKNGFGKMINLNELKIQKKKGKGHRIMKFKKSKTRKDNKKDIEK
KQNIAINNKDKDKHKDKDIPSNNDDNNILHNTKVDEFLGFKLYDMNKQNEKDILVMITDH
AVLIRKNMSLLKEKNKKHSSQIYAKMNKINQLVYFDII
NT seq
3717 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgtttaaattttccattgtttttgttctgtatttattatttttattgaaatttaat
aagaggtttatttttttaaaaagtgaaaaaattacaagttatataaatacacaaatcccg
aattattgtagcagccctcctttttttttaaaaaaagaggctacaaataatattaaaaaa
tgttattttataaagagaaaggggtataggaatataggcacaaaaaatgcgtcaaatgtg
tttgttttaaatttcaagagtaatcgttcaacatatagagacaatgcttttagttgtgca
tctttgtgttctgaaaagaaggaaagaaaaaaggtccaagatccttatgatctgaaggcg
aagaagaaagaaaagacatatgaattaaatgatataaaaaataatgaaaaaaaaaaagat
aatatagttaatgcatctaatgatgtaacaaatgataaattggataatataaataataat
ataaatgaaagtcgaaaacttatcaaaggtgaatattatgatgttgaaatttgtgaaata
ttatcaaagagttttttatcttatgcgaattttttaatattaaatagatgtttatgtgat
tatcgtgatggactaaaaactgtacaaaggcgtataatatggagcatgtatgaaataaat
aaaggtattgataaaaaaggatataaaaaatgtgctagaattgttggtgaagttataggt
aaatatcatccacacggtgataagagtgtatatgatgctttagttaggttagctcaaaag
catcataataataatttgttaataaaaggttatggtaattttggttctgttgaatataat
gctgcagctatgagatacactgaagctaaaatatctagtttttgttatgatatattatta
gatgaaataaatgatgaaaatgttgaatacataaagaattttgatgggaatgaaagagaa
cctaaagtcttatgtagtaagattccattattattaataaatggttgttctggtattgct
gtaagtatattaagtagtataccttgtcataatttaattgatgttgcaaattgttgtatt
aattttttaataaatgaaaacattagagatgatgagttatttcatataataaaaggacct
gatttttcaactggtggtattattataagtaaatatgatatattaaagaatatatataat
agtggtaaggggaattttgaaataagaagtaatgtattttttgaatatataaacaatgat
aaaaaagttattacaaaacatattaatgatttatcatctatagaaaattcggatatagat
aaattgacaaaaaaaataattataaaaaatttaccccccaatgtaaaaccaaatgaacta
atagaaaatattattaatttattaaatgataaaaaaaatgaacatgataatatattatta
agaattagagatgaaagtgaaaaagaggatatgagaatagttcttgaattaaaaaagcat
agtcaaattgaacagatacataacttcttatcatatttatttaaatatactaatattcaa
attagttatcattgtaattttgtttgtataggttatgaaaatacgtatacccaattttca
ttaaaatcttttataaaattatggtgtaataatcgtataaaatttattaaaaagaattat
gaaataaaaaataagaatttagaaaaacaattaaatattattgatctatatctaattata
caaaataaaatacttgatattataaccttttttcaaaaaaatcaaaatattgaacaaata
caattatatttaaaaaataatttcaaacttaaccctgaacaaattaaatatatactatct
ataaaattacaaaaattaatcaatattaaaaatatagattttataagtcaaagaaataaa
ataatgcaccaaattaaattaaatgatgaaattataaataatgttcaaaatattaaaaat
cttataatacaagaattaatatatatcaaaaacaaatatggtatccataatttaaacaaa
caatgtataattccatcaacaccaaaatataaatattcatatattaatagtgaatatcat
cctaattgttttaaaaataaacaaatcatagatacatataatagggtatctacaaatgat
aataatataaatcacaacaattatacacatgatcttcgtagtacggataatgtaacaaag
gataaaaatgtagtagaaacaaatttacataaaaatatacatatatctagtgatatatcg
aataatataaaaaatagtgataaaaatagttatgttacaaaaaatcaagatagtgataat
attatgccttatagaaatacatatattgattcattagataataacatgaaagatatttat
aataatgatgaagtgctgattttaattacatatggagggtatattaaaaaaattaaaatt
aatgaaaaattgaaaaatcactcaaacaatataataaaattatcaaatgtgaaatatatt
ttaaaagaaaatgaagaaaaattaaatgaaaataataagcgcctaaaatttaatgattta
caaaaaggaaatgaacaggaaaaatataaggataaggaacaaaaacaaaataatgacatt
gatcataatataaatatacaaaataatgataataataataatgataataataataatgat
aataataataataatgataataataataatgataataataatgtattattattaaatgaa
gaggaatataatagttataaaataaaaaaaagtattcttgtaagaaatagggataaaata
ttattaacagataattataataaagcatttctcttaaatgtttatgatttacatctatcg
tcatatgattctaaaggtacaccaattaatcaaataattcactcatccaaaaatattact
ggtataacaaaatttgaagaaaataaaaaatatttaattgtgtgtagtgaaaatggaaaa
atgaaagttatcaataatgatgtatttctaaaaaggaaaaaaaaaggtatcaagctattt
aaaaataaaaaaaatatttattttagttattgtaattttaatgataattgtatagtagga
accaaaaatgggtatatcatacaattcccattaagtagttttaaaatatcaaagaaaaat
tccttaggaaataaatgtattagcctttcaaaaaatgataaagtagttgatttattatca
tatgaaaataatgaaaaaaacatgaaaaattataaaatcatattcgtaactaaaaatgga
tttggaaaaatgattaatttgaatgaattaaaaattcaaaaaaaaaaaggaaaaggacat
agaatcatgaaatttaaaaaatcgaaaacaagaaaggataacaaaaaggatatagaaaaa
aaacaaaacattgcaattaataataaggataaggataaacataaagataaagatatacca
tcaaataatgatgataataatattttacataatactaaagtggatgaatttttaggtttc
aaattatatgatatgaacaaacaaaatgaaaaagatatacttgttatgattaccgaccat
gctgtacttataagaaaaaatatgtctttattaaaagagaagaataaaaaacactcttct
caaatttatgcaaaaatgaataaaataaatcagttggtttattttgacataatatga
DBGET
integrated database retrieval system