Plasmodium reichenowi: PRSY57_1226400
Help
Entry
PRSY57_1226400 CDS
T08079
Name
(RefSeq) DNA helicase 60
KO
K12823
ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2 [EC:
5.6.2.7
]
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
Pathway
prei03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prei00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
PRSY57_1226400
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
prei03041
]
PRSY57_1226400
03009 Ribosome biogenesis [BR:
prei03009
]
PRSY57_1226400
Enzymes [BR:
prei01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
PRSY57_1226400
Spliceosome [BR:
prei03041
]
Complex A
U1 snRNP components
U1 related factors
PRSY57_1226400
Complex B
PRSY57_1226400
Ribosome biogenesis [BR:
prei03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Helicases
PRSY57_1226400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
Helicase_C_2
Cas3-like_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24532319
NCBI-ProteinID:
XP_012764139
UniProt:
A0A151L8T0
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(991008..993254)
Genome browser
AA seq
748 aa
AA seq
DB search
MRRNLLKLTSINCKKNDYVSLSNNFFFIKNRSYKYITVRNKIGRNVFNEKDNCAILNRGQ
TNVVGSKKNICTENKVKQQDGEFYMNQRITDDMDNMDNMDNDMDNDMDNNVDNNVDSNVD
SNVDNNVDNNMDNHINHHTHKNMHDNTSYDNNSFDRYQRKRDEIGENGFVQNRRYENYDK
RKQSKTNYSYDNEYNQGSRNKRNMSYPDRYEELGSNLKDIEWDNVKYKIERQNLYNNNYN
NKCNDQNNSQDNKDSLNNEKTNCLSKEDIQNELKKNNIYINKDGIIHNVINKFSDVCFHE
SILNYLNNKFSEPTAIQKITWPIALSGKDLIGVAETGSGKTLAFVLPCFMHILKHKEIVQ
NNNEQTNQNNNLQQEQEGKKNNHHIINNYNENNDNNENNDNNENNDNNNNNNNNNSYDYD
YDNDINTSERASDTYGLILLPTRELCLQVLDEIKSFEKNLPIKSVAVYGGVPKYYQINNL
KKGADIIVATPGRLLDFLENGIINLLKCIYVVIDEADRLLDMGFEKQLRKIMTQVNKNKQ
LLFLTATWPEQVRKLAYDFCSYDPVKIQIGKNELTANKNIEQNVIISSSIDMKKKLLDWL
KENYENNKILIFCDTKRNCDNLCKELRYHQYNALSIHGDKQQRERDRILNNYKTDRCNIL
VATDVASRGLDIKNISVVINYDIPNTIEDYIHRIGRTGRAGKKGKSILFFSYDYYIPQKL
KFAKELIKLLNKTNQTVPSQLKEIAYSR
NT seq
2247 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaagaaatttactgaagttgacctctataaattgtaagaagaatgactatgtttcc
ctttcgaacaattttttttttataaaaaataggtcatataaatatataactgtaagaaac
aaaataggaagaaatgtatttaatgaaaaggataattgtgccatattgaatcgaggacaa
acaaatgtcgtaggtagcaagaaaaatatatgtaccgaaaataaagttaaacaacaggat
ggagagttttatatgaaccaaagaattacagatgatatggataatatggataatatggat
aatgatatggataatgatatggataataatgtggataataatgtggatagtaatgtggat
agtaatgtggataataatgtggataataatatggataaccatataaatcaccatacacat
aaaaatatgcatgataacacatcgtatgataataattctttcgatagataccaaagaaaa
agagacgaaataggtgaaaacggttttgttcaaaatagaagatatgaaaattatgataaa
cgtaaacaatcgaaaacaaattattcatatgataatgagtataatcagggttcaagaaat
aaaagaaatatgtcttatcctgatagatatgaagaattaggaagtaatttaaaggatatc
gaatgggataatgtgaaatataaaatagaaaggcaaaatttatacaacaacaattataat
aataagtgtaatgatcagaataatagtcaggataataaggatagtttaaataatgagaaa
acaaattgcttaagtaaagaggatatacaaaacgaattaaagaaaaataatatttatatt
aacaaggatggaataatacataatgtcattaacaaattctcagatgtatgttttcatgaa
tccatattaaattatctaaataataaatttagtgaacctacagctattcaaaaaatcacc
tggcctattgctttatcaggaaaagatcttataggtgtagcagaaacgggaagtggaaaa
actctagcttttgttttgccatgttttatgcatatacttaagcataaagaaattgtacaa
aataataatgaacaaacaaatcaaaacaataatttacagcaagaacaggaagggaaaaaa
aataatcatcatataataaataattataatgaaaataatgacaacaacgaaaataatgac
aacaacgaaaataatgacaacaacaacaataataataataataatagttatgattatgat
tatgataatgatataaatacctctgaacgtgctagtgatacttatggactcattttatta
cccactagagaattgtgcttacaagttctagatgaaatcaaatccttcgaaaaaaaccta
ccaatcaaaagtgttgctgtttatggtggagtacccaaatattatcaaataaataattta
aaaaaaggtgctgatattattgttgctacccctggaagacttttagactttttagaaaat
ggtatcatcaaccttttaaaatgtatttatgttgttattgatgaagctgatcgtttactt
gatatgggattcgaaaaacaattaagaaaaattatgacccaagttaataaaaataaacaa
ttgttatttttaactgctacatggcctgaacaagtcaggaaacttgcatatgatttttgt
tcctacgatccagtaaaaattcaaataggaaaaaatgaattgacagcaaataaaaatatt
gagcaaaatgttattataagttcttctattgatatgaagaaaaaattattagattggtta
aaagaaaattatgaaaataataaaatattaatattttgtgataccaaaagaaattgtgat
aatttatgtaaagaattaagatatcatcagtataatgctttatcaattcatggggataag
cagcaaagagaaagagatcgaatattgaataattacaaaacagatcgatgtaatatatta
gtagcaactgatgtagcttcaagaggattagatattaaaaatatttcagttgtaattaat
tatgatatacctaatactatagaagattatatacatagaataggaagaacaggaagagct
ggaaaaaaagggaaatcaattttgttcttttcgtatgattattatataccacaaaaatta
aagtttgcaaaagagttaatcaaattattaaataaaacaaatcaaaccgttccatcacag
ttaaaagaaatagcttattcaagatga
DBGET
integrated database retrieval system
