Plasmodium reichenowi: PRSY57_1239100
Help
Entry
PRSY57_1239100 CDS
T08079
Name
(RefSeq) vacuolar protein sorting-associated protein 16, putative
KO
K20180
vacuolar protein sorting-associated protein 16
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
Pathway
prei04148
Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prei00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04148 Efferocytosis
PRSY57_1239100
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
prei04131
]
PRSY57_1239100
Membrane trafficking [BR:
prei04131
]
Endosome - Lysosome transport
Tethering complex
CORVET complex
PRSY57_1239100
Hops complex
PRSY57_1239100
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Vps16_N
Vps16_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24532445
NCBI-ProteinID:
XP_012764263
UniProt:
A0A151L9G8
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(1562005..1565094)
Genome browser
AA seq
1029 aa
AA seq
DB search
MNTNEWSTIDNTHYGKQKISNMLWSNDDILKDNVVCSGYLGLIAVLLNKDKLDNYKKEDN
LKIYTNIGRLISSCRLNYDGLICFGWNKNNELVLLFKDNIVRVYSCFCEKIFVFSLDENI
KNEGISYGSICEDGIIIITEKLNIYVNYGFSGTNCIKYPNVELKGKPFCVSHIDEDQLND
ELNIEQNYFDTKPNNDILRLNIKNYITNTFEKKESTTQNLNSKNNVLIESKENYNIKWEQ
MQHNQMKQQIGARTEKKNATNNINNNDNYYFNNKMHKRILIKTTAYDLNNKTDVDATEKI
KTKEKQNKEKNDKNKKKNKTNSNSNNNNNNNNKELNIHLLITLCNGGFVLVNKYHYKYYD
MDCSHPYINMSISKSGTILAFLADNGIIKIYLINNLNKCIEETVLDNKKTIKQIVWCGDD
CLAVYIPMITPSNYIQHMLFIGGPQNQWIPYQYRHDLFLIGDLYGVKIISKEHFEYISRI
RKSTFNIFSIGSCTPSAMLFYSYEKYKNGNICLDDEIRAFNNNLHIAIEECLNAATHEYD
DNIINLLLKTCLFGKNFMKTNYDSKKYLLCCLFLRICMNVRKPPLDIFITAAELQYITIP
TFVHYLAKRKEYFLAYRICEYAGIKTDNILIEWCKEKIEKSIELTDEQLCSAITEKIGNK
KNMDYSFIAFMAAKCLRPQLATVIIQYEENKKKQIDMLLKLANYRLAIEKAILSKDIELV
YMCIVNILNQEKLNANGEKELNTLLHVLNSNNNMGNMNSNNNMGNLNNNNNNNNNNNNNS
NSNSSSISMHASNCFYVYCKKTKQYNLLKEFYEKNGQHSQAAFVTLDLAFSKKNTEQKKT
WLAYSAGFLTTDQMNSHIKFVHTSIMNNIDLLNYQKELEMKYNKKLVAGYPHKIQGLSLM
KTVEYTLSIGEFLDADNIFKKFKISEPKFWRCKIHTLAKNKYFDELYNFANYRVSPIGMD
YFIECVHEYGSKQLTVKLIEKNKDLNSQYKWYTKLNMKKEAEEVLKQLNSQKITSSIFQT
ITDAISNIR
NT seq
3090 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatacaaatgaatggagcactattgataatacccattatgggaaacaaaaaattagt
aacatgctatggagtaatgatgatatattaaaggataatgtggtgtgttccggatattta
gggttaatcgctgttttattaaataaagacaaattagataattataaaaaagaagataat
ttaaaaatttatacaaatattggtagactcatatcaagttgtcgattaaattatgatggg
ttaatatgttttggatggaataaaaataacgaattagtattattatttaaagataacatt
gtaagagtatattcttgtttttgtgaaaaaatttttgttttctcattagatgaaaatata
aagaatgaaggaatttcatatggtagtatttgtgaagatggtattatcataattactgaa
aaattaaacatatatgtaaattatggatttagtggtaccaactgtattaaatatcctaat
gtggaattaaaaggaaaaccattttgtgtttctcatattgatgaagatcaattaaatgat
gaattaaatattgaacaaaattattttgataccaaacctaataatgatatattacgatta
aatataaaaaattacattacaaatacttttgaaaaaaaagaaagtactacacaaaatttg
aattctaaaaataatgtacttattgaaagtaaagaaaattacaacattaaatgggaacaa
atgcaacacaatcaaatgaagcaacaaattggcgcgcgcacagaaaaaaaaaacgcaaca
aataatattaataataatgacaattattattttaacaataaaatgcataaaagaatttta
attaaaactactgcatatgatttaaataataaaacagatgtggatgcgacagaaaaaata
aaaacaaaagagaaacaaaataaggaaaaaaatgacaaaaataaaaaaaaaaataaaact
aatagtaatagtaataataataataataataataataaagaattaaatatacatctatta
ataacattgtgtaatggtggttttgtgctagttaataaatatcattataaatattatgat
atggattgttcacatccatatataaatatgtctatatcaaaatcaggaacgattttagca
tttttagcagataatggaataataaaaatttatttaattaataatttaaacaaatgtatt
gaagaaacagttctagataataaaaaaacaattaaacaaattgtatggtgtggtgatgat
tgtctagcggtttatatacccatgattaccccttccaattatatacaacatatgttattt
attggtgggcctcaaaatcaatggataccttatcagtatagacatgatttatttttaatt
ggagatttatatggagtgaaaattataagtaaagaacattttgaatatattagtagaatt
aggaaatctacatttaatatttttagtattggaagttgtacaccttctgctatgttattt
tattcttatgaaaaatataaaaatggaaatatatgtctcgatgatgaaattagggcattt
aataataatttacatattgccattgaagaatgcctaaatgccgcaactcatgaatatgat
gataatatcataaacttattattaaaaacatgtttatttggaaaaaactttatgaaaaca
aactatgattcaaaaaaatatttattgtgttgtttatttttaaggatatgtatgaacgtt
agaaaacctccactggatattttcattactgctgcagaacttcaatatattactatacca
acatttgttcattatctagctaaaagaaaagaatattttttagcctaccgaatatgtgaa
tatgctggtattaaaactgataatatattaattgaatggtgtaaagaaaaaatagaaaaa
tcaatcgaattaacagatgaacaattatgtagtgctataacggaaaaaattggaaataaa
aaaaatatggattattcttttattgcgtttatggcagctaaatgtttaagaccacagtta
gctactgtaataatacagtatgaagaaaataaaaagaaacaaattgacatgttacttaaa
ttggctaattatagattagctattgaaaaagctattctttcgaaagatatcgaattggta
tatatgtgcattgttaatattttaaatcaagaaaagttaaatgcaaatggtgaaaaggaa
ttaaacaccttattgcatgtcctgaatagtaataataatatgggtaatatgaatagtaat
aataatatgggtaatttgaataataataataataataataacaataataataataatagt
aatagtaatagtagtagtattagtatgcatgcatcaaattgcttttatgtttattgtaaa
aaaaccaaacaatataatttacttaaagaattttatgaaaaaaatgggcaacattcgcaa
gctgcttttgtaacactcgatttagcattttccaaaaaaaacacagaacagaaaaaaaca
tggctagcatattcagctggttttttaactactgatcaaatgaatagtcatataaaattt
gttcatacctccattatgaacaatattgatttattaaattatcaaaaagaattagaaatg
aagtataataaaaaattagttgcagggtacccacataaaattcagggattatcattaatg
aagacagttgaatatactttatcaataggtgaatttctagatgctgataatattttcaaa
aagtttaaaatttcagaacccaagttttggagatgtaaaatacatacattagctaaaaat
aaatattttgatgaattgtataattttgctaattatagagtatcaccaataggaatggat
tatttcattgaatgtgttcatgaatatggttccaaacaattaactgttaaattgattgaa
aaaaataaagatttaaattcacagtataaatggtatacaaaattaaatatgaaaaaagaa
gctgaggaagtattaaaacaattgaattcgcaaaaaataacaagttctatatttcaaaca
attacggatgccatatcaaacataagataa
DBGET
integrated database retrieval system
