Plasmodium reichenowi: PRSY57_1316000
Help
Entry
PRSY57_1316000 CDS
T08079
Name
(RefSeq) U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, putative
KO
K12847
U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
Pathway
prei03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prei00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
PRSY57_1316000
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
prei03041
]
PRSY57_1316000
Spliceosome [BR:
prei03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U4/U6.U5 tri-snRNP specific factors
PRSY57_1316000
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UCH
zf-UBP
zf-UBP_var
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24532738
NCBI-ProteinID:
XP_012764550
LinkDB
All DBs
Position
13:<666742..>668649
Genome browser
AA seq
635 aa
AA seq
DB search
MERKSKKNSKIEKTESASKKKKKKNDDMSEPEEDEKKINEVEDGSLLLKSNKTENNVNNN
DNNNTNYDNQKNNLLYKKRNRVCPYLRTINRNLLDFDFEKLCSISLSNLHVYACLVCGLY
FQGIGKGTHAYTHSLEKNHYVFINLETCKTCCIPEGYEIVDASLNDIKYFLKPTYNKEQV
EHLCYNSVLGKSLDGGDFLPGLVGLNNLKNTDYCNVIIQLICSIIPLRNTLLLYECKENI
AKNIIVVLSDLIKKIYNPRNFKGVVSPHEFLQAVGIESNKNFKIGTKKYPLDFFLWLLNK
IYRHSNKMLKKRKLSTLKKKTGYLKRKLEDNEPVSKEEKKNVHDKEKIYDEMNKSDNTSN
KKKKEKDKWVYSNINIVDYCFDGELLIKTIKEEGNEESQENMELKFNESDNYSKDYLKNI
NEEEVEEEKNKQKNDYQNIYNNTFLNLVKKNKNYLIVKIPFRTLSLKLPNAPVFKSTTES
NIIPQVSIFELLSKFDGETETFLQEHFKIPNTLIISKLPKYLIFTIERFSKNNFFIEKNG
TIVNFVIKNLDMKDYVHEDFLSLNPVTKYNLIANIFHTGTVNQGSYKIHVLNQPTNEWYE
IEDLHVISILPQLVLLPESCIQLYQRQDVKLNGDI
NT seq
1908 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaggaaatctaagaagaattcaaaaattgaaaaaacagaatctgcttcaaaaaag
aaaaagaaaaagaatgatgacatgagtgaaccagaagaagatgaaaaaaaaataaatgag
gtagaagatggttctttattacttaaaagtaataaaacagaaaataatgtaaataataat
gataataataataccaattatgataaccaaaagaataatctattgtataaaaagagaaat
agggtgtgcccatacctacgtaccattaatagaaaccttctggattttgactttgaaaaa
ttatgtagcatcagtttatcaaatttacatgtatatgcttgtttagtatgtggtttatat
tttcaagggataggaaaagggactcatgcttatactcattccttggaaaaaaatcattat
gtatttataaatttagaaacatgtaaaacttgttgcattcctgaaggttatgaaattgta
gatgcttcattaaatgacataaagtattttttaaaacctacatataacaaggagcaagtt
gagcatttatgttataattctgtattaggaaaatcgttagatggtggtgatttcttaccc
ggattagtaggtttaaataatttaaagaacacagattattgtaatgttattatacaatta
atatgctctattatacccttacgtaatactttattattatatgaatgtaaggaaaatata
gcaaaaaatataatagtagtactctctgatttaataaaaaaaatatataaccccagaaat
tttaaaggagttgtttctcctcatgaatttttacaagcagtaggaattgaatcaaataaa
aattttaaaattggtacgaaaaaataccctcttgacttttttttatggttacttaataaa
atttatagacattctaataaaatgttaaaaaaaagaaaattatcaacccttaaaaaaaaa
acaggatacttgaaaagaaaactagaagacaatgagcctgtttcaaaagaagaaaaaaaa
aatgtacatgataaggaaaaaatatatgatgaaatgaacaaatcagataatacaagtaat
aaaaaaaaaaaggagaaagataaatgggtatatagtaatattaatatagtcgattattgt
tttgatggggaattactcattaaaacaataaaagaagaaggaaatgaagaatcacaagaa
aacatggaattaaaatttaacgaatcagataattattcaaaagattatttaaaaaatata
aacgaagaagaagtagaagaagaaaaaaataaacaaaaaaatgattatcaaaatatatat
aataatacctttttaaatcttgtaaaaaaaaataaaaattatttaattgtaaaaattcct
ttccgtacattgtcattaaaactaccaaatgctccagtatttaagagtacaacagaaagt
aatataataccacaagtatctatttttgagctgttatcaaagttcgatggagaaacagaa
acctttctacaagaacattttaaaataccgaatacattaataatatctaaattacccaaa
tatctaatttttactattgaacgtttttcaaagaataatttttttatagaaaaaaatgga
acaatagtaaattttgttattaaaaaccttgatatgaaagattatgtacatgaagatttt
ctaagtctaaatcctgtaactaaatataatttaattgcaaatatttttcatacaggtaca
gtaaatcaaggttcttataaaattcatgtattaaatcaaccaacaaatgaatggtatgaa
attgaagacttgcatgttatatctattttgccgcaattagttttattgcctgaatcatgt
attcagttatatcagcgacaggatgttaaactaaatggggacatataa
DBGET
integrated database retrieval system