Plasmodium reichenowi: PRSY57_1363200
Help
Entry
PRSY57_1363200 CDS
T08079
Name
(RefSeq) pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, putative
KO
K12815
pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX38/PRP16 [EC:
5.6.2.6
]
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
Pathway
prei03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prei00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
PRSY57_1363200
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
prei03041
]
PRSY57_1363200
Enzymes [BR:
prei01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.6 RNA 3'-5' helicase
PRSY57_1363200
Spliceosome [BR:
prei03041
]
Complex C
Other components
Step II factors
PRSY57_1363200
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OB_NTP_bind
Helicase_C
HA2_C
DEAD
HA2_N
AAA_22
AAA_19
ATPase
Flavi_DEAD
SRP54
PhoH
T2SSE
AAA_30
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24533201
NCBI-ProteinID:
XP_012765006
UniProt:
A0A151L7W8
LinkDB
All DBs
Position
13:complement(2428891..2432355)
Genome browser
AA seq
1154 aa
AA seq
DB search
MIAKSYVYSDSSSDGNKKNNDKIQTGFLCNEKKNEKTLEFKRRKVNKINKKLSTDDVKSN
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AAKLKSFSEYINLRTNVSCHVHPNSSLYNIGYTPDYVIYQEIVFTTKEYMRNVTTVDPEW
LCELGPLFFYMKNV
NT seq
3465 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gaaatcgtttttaccacaaaagaatatatgagaaatgttacaactgttgatccagaatgg
ttatgtgaattaggccctctctttttttatatgaaaaatgtatag
DBGET
integrated database retrieval system
