Plasmodium reichenowi: PRSY57_1418200
Help
Entry
PRSY57_1418200 CDS
T08079
Name
(RefSeq) DEAD/DEAH box ATP-dependent RNA helicase, putative
KO
K14776
ATP-dependent RNA helicase DDX10/DBP4 [EC:
5.6.2.7
]
Organism
prei
Plasmodium reichenowi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prei00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
prei03009
]
PRSY57_1418200
Enzymes [BR:
prei01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
PRSY57_1418200
Ribosome biogenesis [BR:
prei03009
]
Eukaryotic type
90S particles
Helicases
PRSY57_1418200
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
CTE_SPB4
ATPgrasp_Ter
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24533456
NCBI-ProteinID:
XP_012765248
UniProt:
A0A151L4I2
LinkDB
All DBs
Position
14:complement(<741621..>744376)
Genome browser
AA seq
879 aa
AA seq
DB search
MINNKGKVGKGKRIFNKNYGSISKKKKKRNDKSKKDVSNNKDERLELQKRIDETLGLIVE
ENKRKQYEEKINNDLEKNENVKNILKSDKTNNNTYDEDELKKNKNKKYKNNLTIIDKNVL
TSAEFKTLPISKRTLRALNENNFIYMTNIQYVSLPIVLLNKHIYAQAQTGTGKTLCFCIP
LIEKMYRNSIDNYNKILGGIIITPTRELVFQIFEVLNMLNKYHKLNICCAIGGKNEEKEK
SIFSYANIIVCTTGRLLYHLENNYYCNLDYLSTLIIDEIDKLIDKSFYDNLKNILLYKPK
ENCQICLFSATICKFLNVILNTFHIKDYEYVSINDNDKYIESNNVKQIYIECDIYEKINY
LYTFLFSKKNKKVIVFFSTCKQVRFMYEVFKKIKVGVMKFLQLHGKLKQTSRLNTYHFFS
KKKNFVCLFTTDIACRGLDFSCIDWVIHFDFPDNIETFIHRSGRTGRFTNMGNSLIFLTK
QIDNKKLFLNVLKDNNIFIKEKFLKKQKLFDIKNKIHSLNAAFVDIKHLAKKALIIYLRH
LYIVMKFKDIKKKIQLNELAYSYGLIEFSQDMINELNINDEKEVQVKKKKSRLEKFLEIL
KNKKALKNKQNQEKKEDEKYNNTQDEKEYDYEYDNDNEQGHQIYDETHDNYKCEEKKKKS
VKDISHIDQNQSNEKPFMHSDIQSDQDDLFIQKRVEIKDDTPIMLPTKKRKKRVKVAKTL
SNSILYDDSGNEIKDDNVKFKILVNELNQNEDHDMEQDTHDDDDDNNNNNDRYDQKTYIE
SLKEKIQRDNEKMKISKLRKKKDFIADRKKHEEVSSSTDNTNFSDIQDKSDLEYNESSEG
DNENYNESDDFVKNKRKISEKCDPTDDISDLENKVMMFL
NT seq
2640 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaataataaaggaaaagttggtaaaggtaaaaggattttcaataaaaattatgga
agtatatcaaaaaaaaagaagaagagaaatgataaatcaaaaaaggatgttagtaataat
aaagatgaaagattggagttacaaaaaagaattgatgagactttaggtttgatagtagaa
gaaaataaaagaaaacagtatgaagagaagattaataatgatttagaaaaaaatgagaat
gttaagaatattttaaaaagtgataagacaaataataatacatatgatgaagatgaatta
aaaaaaaataagaataaaaaatataaaaataatttaactattattgataaaaatgtattg
acatctgctgaatttaaaacattaccaattagtaaaagaacattaagagcattaaatgaa
aataattttatatatatgactaatatacaatatgtatctttacctatagttttgttaaat
aaacatatatatgctcaagctcaaaccggaacaggtaaaactttatgtttttgtattcct
ttaattgaaaaaatgtatcgtaatagtattgataattataataaaatattaggagggata
attataacccctactagagaattagtatttcaaatatttgaagttttaaatatgttaaat
aaatatcataaattaaatatatgttgtgcaatcggaggaaaaaatgaagaaaaagaaaaa
tctatctttagctatgcaaatattattgtttgtactacaggaagattattatatcatttg
gaaaataattattattgtaacttggattatttaagtacattaattattgatgaaattgat
aaattaatagataaaagtttttatgataatttaaaaaatatattattatataaacccaaa
gaaaattgtcagatatgtttattttcagctacaatatgcaaatttttaaatgttatatta
aatacatttcatataaaagattatgaatatgtaagtataaatgataatgataaatatata
gaaagtaataatgtaaaacaaatatatattgaatgtgatatatatgaaaaaattaattat
ttgtatacatttctattttctaagaaaaataaaaaagttattgtatttttttctacatgt
aaacaagtaagatttatgtatgaagtctttaaaaaaatcaaagtaggagttatgaaattt
ttacaacttcatgggaaattaaaacaaacatctagattaaatacatatcacttcttttca
aaaaagaaaaattttgtttgtttatttacaacagatattgcttgtagaggattagatttt
tcatgtattgattgggtaattcattttgattttccagataatattgaaacatttattcat
cgttcaggtcgaacaggtagatttactaatatgggtaatagtcttatatttttaacaaaa
caaattgataataaaaaattatttttaaatgttcttaaagataacaatatttttattaaa
gaaaagtttttaaaaaaacagaaattgtttgatataaaaaataaaatacattccttaaat
gctgcttttgttgatattaagcatttagcaaaaaaagcattaatcatatatttgagacat
ttatatattgttatgaaatttaaagatatcaaaaaaaaaattcaattaaacgagttagca
tattcttatggtcttattgaattttctcaggacatgataaacgagcttaacataaatgat
gaaaaggaggtacaagtgaagaaaaaaaaatcaagattagaaaaattcctagaaatctta
aaaaataaaaaagcactaaaaaataaacaaaaccaagaaaaaaaagaagacgaaaaatat
aataatacacaagacgaaaaagaatatgattatgaatatgataatgataatgaacaagga
catcagatatatgatgaaacacatgataattataagtgtgaggaaaaaaaaaaaaaaagt
gtaaaggatataagtcatatagatcaaaatcaatcaaacgaaaaaccgtttatgcattcg
gacattcaaagtgatcaagatgatttgtttattcaaaaaagagttgaaataaaggatgac
acaccaattatgttaccaaccaaaaaaagaaagaaaagagtaaaagtcgctaaaacgtta
agtaatagcatattatatgatgatagtggtaatgaaataaaagatgataatgtgaaattt
aaaatcttggtaaatgaattgaatcaaaatgaagatcatgatatggaacaagatacacat
gatgatgatgatgataataataataacaatgataggtatgatcagaaaacatatattgaa
tctttgaaagaaaaaattcaaagagataatgaaaaaatgaaaattagtaagttaaggaaa
aaaaaagactttattgcagataggaagaaacatgaagaagtttcatcatctacagacaat
acgaattttagcgatattcaagataaaagtgaccttgagtataacgaaagtagtgaagga
gataatgaaaattataatgaaagtgatgattttgttaaaaataagaggaaaataagtgaa
aaatgtgatccaacagatgatatatcagatttggaaaacaaagtaatgatgtttttatga
DBGET
integrated database retrieval system
