Plasmodium relictum: PRELSG_0009500
Help
Entry
PRELSG_0009500 CDS
T09405
Symbol
ERCC4
Name
(RefSeq) DNA repair endonuclease, putative
KO
K10848
DNA excision repair protein ERCC-4 [EC:3.1.-.-]
Organism
prel
Plasmodium relictum
Pathway
prel03420
Nucleotide excision repair
prel03460
Fanconi anemia pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prel00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
PRELSG_0009500 (ERCC4)
03460 Fanconi anemia pathway
PRELSG_0009500 (ERCC4)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
prel03032
]
PRELSG_0009500 (ERCC4)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
prel03400
]
PRELSG_0009500 (ERCC4)
DNA replication proteins [BR:
prel03032
]
Eukaryotic type
DNA Replication Termination Factors
Other termination factors
PRELSG_0009500 (ERCC4)
DNA repair and recombination proteins [BR:
prel03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
Other NER factors
PRELSG_0009500 (ERCC4)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ERCC4
IMS_HHH_1
HHH_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39734012
NCBI-ProteinID:
XP_028531288
UniProt:
A0A1J1GKM9
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1417 aa
AA seq
DB search
MYPLYYEKKIVKKLIQYDALILLADGFNELNILALFIFYYQNKCLWYENYINHKNIFFDL
FKLNIDIINDDNEESKNEERFDKLNDFNKKSENINENLKNDENHNICNQIKNDNNENNLN
NVGNKNKLIFILNVTPKEYSLFLKYQIQLYEEINKFDKLFNNNVKINYLKTEYIRNQKSN
ERIEMYIKRGVYFISSNVLLIDLLTFKIIPEIIDGIFICKNHKLIYNMKEIFIIEIFRKR
NKFGFIKGISNNKKLINSQHISNIARKLFIKKIYCYPRFHKNVHTSLNNKYIQPNIYELN
LDLPDETKKIEENILNLIHYLNLEIKKFHTFDDFDINSLLYSDSAENYIMNYIKSKNLTY
NTKKLLKEIVILVNVLYNLYNYDSLIFYNYLNNLKEADKESIWMYCNEANEISYLSNERK
NNFLKKINMDKEQIEMDNIQNVINKIHSDNRYFHKSYEAKREENEKYKWIYELVYNRDMN
LKEYRKMILKRSYIKKNSIKRKNCNKNYVSNQILNKKIKITKNRHSKYEKELELHLDNKE
KVTEIGKTENSNFNFKIKCENDDSMNKFLNIEKNIFNQKDNINENKEVYACDEVNKEKMF
LIDQKVKKEQNYFNNDSTNSEKEETNKDKKKFHNNNRDDTVNIDKIDYSIVIIVDNFYAQ
KEIYNLLLHKNENNLDFNLFLKCEEKINEYYISDSSLDSLNDSEKSFKSKKKISLGNINY
HIPYKMIKNKTLNLKYIKPKIYILCINKHYDNIYTSEHFINNCYKKIDMINLENQKDFLN
SNDKEKSVGKKEDQKDNLDDSSYQSDTLFEINEYSGNLDFLELFLIKIKPHRIILTDLDL
SIFRNIEIYCARLFRYNVFKLHKEKYFEELIMYEKNNLIYDNFHEDNFPIKKEEKKKKKN
NNNNNYETVRQKERSKGINNFKIIKILSDMCNTIEVFLIFYKNSIFYNKYLNNIKIEKSN
WLNFIENKNNLRFEIDRNIFNKNEELFKKVINSYFLFQKKFKENKKNLMNFNKALCEEFK
KFQEVKIDEQIENKNVLVNTLNSNFISMEEEDIFIENYKNKINKKSEIVTFDEKTIQKIQ
ELLDNFSIDSFNLNFILYSIFNNTKPIIIVDIRELKSDLSYKLYRSKMHIIPYSLLVGDY
ILTKDICVERKTIVDLIQSLNNNRLHNQIYQMSKYYSIYVLLIEFNNKHLFYFSSLNDKY
SIYTKLIIICLQFSKLKILWSPFSLFTVKLFWSLKVNSEQPDIFKSLHIDISLQKNTHEQ
IESYQKQEKKQTENDIEIDSKPEKDEEKKEQERNNIEQIKITGKLVDEHIDKSSDDEDIN
IKAYKYGTINDLFDKNLNKLNKLNNEKVIKKIENVTNWNAIEILKSLPGVTEKNMHLIIN
NVNSLYDLCEKKIEELENYMSKKNAKMLYEFLNTDVS
NT seq
4254 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatcctttatattatgagaaaaagattgtaaaaaaattaatacaatacgatgcatta
atattattagcagatggatttaacgaattaaatattctagcactttttattttttattat
caaaataagtgcttatggtatgagaattatataaatcataaaaatattttctttgattta
tttaaattaaatatagacataataaacgatgataatgaagaaagcaaaaatgaggagcgt
tttgataagcttaatgattttaataaaaagagtgagaatataaacgaaaatttaaaaaat
gatgaaaatcataatatttgtaatcagataaaaaatgataataatgaaaataacttaaat
aatgtaggaaataaaaacaaattgatatttatattaaatgtgacacctaaagaatatagc
ttatttctgaaatatcaaatccagttatatgaagaaattaataaatttgataaattattt
aataataatgttaaaataaattacctaaaaactgaatacataagaaatcaaaaatcaaat
gaaagaattgaaatgtatatcaaaagaggagtatattttatatcatcaaatgtcttatta
atagatttattaacatttaaaataataccagaaattattgatggtattttcatttgtaaa
aatcataaacttatttataatatgaaagaaattttcatcatagaaatatttagaaaaaga
aataaatttggttttattaaaggaataagtaataataaaaaattaataaatagtcaacat
atttcaaatattgccagaaaattattcataaaaaaaatatactgttatccaagatttcat
aaaaatgttcatacttcattaaacaataaatatatacaaccaaatatatatgaattaaat
ttagatttacctgatgaaacaaaaaaaattgaagagaatattttaaatttaattcattat
ttaaatttagaaataaagaaatttcacacatttgatgattttgatataaactccttatta
tactcagatagtgcagaaaactatataatgaattatatcaaaagcaaaaatcttacttat
aatacaaaaaaattacttaaagaaattgtcatattagttaatgtcttatataatttatac
aattatgatagtttgatattttataattatttaaataatttaaaggaagcagataaggaa
tcaatttggatgtattgtaatgaagcaaatgaaatttcttatttatctaacgaaagaaaa
aacaattttttaaaaaaaattaatatggataaggaacaaatagagatggacaatatacaa
aatgtaataaataaaatacatagtgataatagatattttcataaatcatatgaagcaaaa
agggaagaaaatgaaaaatataaatggatatatgaattagtttataatagagatatgaat
ttaaaagaatatagaaaaatgattttaaaaaggagttacataaagaaaaattccattaaa
agaaaaaattgtaataaaaattatgtaagcaatcaaattttaaataaaaaaataaaaata
acaaaaaataggcattctaaatatgaaaaggagttagaactccatttagacaataaagaa
aaagtaactgaaattggaaaaacagaaaattctaacttcaatttcaaaattaagtgtgaa
aatgatgattcaatgaataaatttcttaatattgaaaaaaatatatttaatcaaaaagat
aatataaatgaaaacaaagaagtatatgcatgtgatgaagtaaataaagaaaaaatgttt
ttaatagaccaaaaagtaaagaaggaacaaaattattttaataacgattcaacaaatagc
gaaaaagaagaaacaaacaaagataaaaaaaaatttcataataataatagagatgatact
gttaatatagataaaattgactactcaattgtaataatagttgataatttttatgctcaa
aaagaaatttataatttattattacataaaaatgaaaataatttagatttcaatctcttt
ctaaaatgtgaagaaaaaattaatgaatattatatatccgattcttcattagattcttta
aatgattctgaaaaatctttcaaaagtaaaaaaaaaatttctttaggaaatattaattat
catataccatataaaatgataaaaaataaaacattgaacttaaaatacataaagccaaag
atttatattttatgtattaataagcactatgataacatttacactagtgaacattttatt
aataattgctataaaaaaattgatatgattaatttagaaaatcaaaaagattttttgaat
agtaatgataaagaaaaatctgtaggaaaaaaagaggatcaaaaagataatttagatgat
tcatcttatcaaagtgatacattatttgaaataaatgaatatagtggaaacttagatttt
ttagaattgtttttgataaaaataaaaccgcatagaattattctaacagatcttgatttg
agtatttttcggaatatagaaatttattgtgcacggctgtttcgatataacgtatttaaa
ttgcataaagaaaagtactttgaagaattaattatgtatgaaaaaaataatttaatatat
gacaactttcatgaggataatttcccaattaaaaaagaagaaaaaaaaaaaaaaaaaaat
aataataataataattatgaaacagtgagacaaaaagaaagaagtaaaggaataaataat
tttaaaataataaaaatattaagtgatatgtgcaatacgattgaagtatttttaattttt
tacaaaaatagtatattttataataaatacttaaataatataaaaattgaaaaaagtaat
tggttaaattttattgaaaataaaaataatcttcgttttgaaattgatcgtaatatattt
aacaaaaatgaagaactttttaagaaagttataaattcttattttttatttcaaaaaaaa
tttaaagaaaataagaaaaatttaatgaattttaacaaagcattatgtgaagaattcaaa
aaatttcaagaagttaaaatagatgaacaaatagaaaataaaaatgtattagtaaatact
cttaatagtaattttataagtatggaagaagaagatatttttatagaaaattataaaaat
aagattaataaaaaaagtgaaattgttacttttgatgaaaaaactattcagaaaattcaa
gaattattagataatttctctatagattcttttaatttaaactttatattgtatagtatc
ttcaataatacaaaaccaataattatagtagacatcagagaattgaaatctgatttatca
tataagttatataggagtaaaatgcatattattccttattctttattagttggtgattat
atattaacaaaagacatttgtgttgaaagaaaaactatagtagacttaattcaatcatta
aacaataatagattacacaatcaaatatatcaaatgtcaaagtattattctatatatgta
ttattaatagaatttaacaataaacatttattttatttttcttcattaaatgataaatat
tctatttacactaagttaattattatatgccttcaattttctaaacttaaaattttatgg
agtcctttttctctttttactgttaaacttttttggtcattaaaagtaaattcagaacaa
ccagatatattcaaatcgcttcacattgatatatctttacaaaaaaatacacatgaacaa
attgaaagttatcagaaacaagaaaagaaacaaacagaaaatgatattgaaatagatagc
aaaccagaaaaagatgaagaaaaaaaagaacaagaaagaaataatatagaacaaataaaa
ataactggaaaactggtggatgagcatattgataaaagttctgatgatgaagatataaat
ataaaagcatataaatacggaacaataaatgatttatttgacaaaaatttaaataaatta
aataaattaaacaatgaaaaagtaattaaaaaaatcgaaaatgttactaattggaatgcc
attgaaattttaaaatcacttcctggggttacagaaaaaaatatgcatcttataataaat
aatgttaattcattatatgatttatgtgaaaaaaaaatagaggaactagaaaattatatg
agtaaaaaaaatgcaaaaatgctatatgaatttttaaatacagatgtatcataa
DBGET
integrated database retrieval system