Plasmodium relictum: PRELSG_0517000
Help
Entry
PRELSG_0517000 CDS
T09405
Symbol
BRR2
Name
(RefSeq) pre-mRNA-splicing helicase BRR2, putative
KO
K12854
pre-mRNA-splicing helicase BRR2 [EC:
5.6.2.6
]
Organism
prel
Plasmodium relictum
Pathway
prel03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prel00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
PRELSG_0517000 (BRR2)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
prel03041
]
PRELSG_0517000 (BRR2)
Enzymes [BR:
prel01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.6 RNA 3'-5' helicase
PRELSG_0517000 (BRR2)
Spliceosome [BR:
prel03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U5 snRNP specific factors
PRELSG_0517000 (BRR2)
Complex C
U5 SnRNP specific factors
PRELSG_0517000 (BRR2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sec63
SNRNP200_wHTH
DEAD
Helicase_PWI
ResIII
BRR2_plug
Helicase_C
NOA36
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39735113
NCBI-ProteinID:
XP_028532021
UniProt:
A0A1J1H6E9
LinkDB
All DBs
Position
5:632672..640474
Genome browser
AA seq
2600 aa
AA seq
DB search
MAEEYEKFKRFEYRMNSNLVLQREGPIPNHNEPTGESESLVGKIKYKMGDKVEYGKPKDL
VSKDDYRRYKRKDNFLDKKSKKIKRSAKEKSVLNINIHDIFLYKPTTKYTEQIYSKILNN
IRNMIGDNTCDIINSACNEIIYILKSDNLNDEEKKQEVENALEVNITDEKFIELNNLSKE
IYDFNKKEENEDIENEEGVAVVFEEDDDYYDLKKRRKDTNEKRDDFSDINELSDYNEEEE
EEDSEEDDDEAMNEEDEDIKDSEEEKIDEEEEKKNKKIYKENKSKDDKENDSDQNAYDDI
EKKKKKKEKEIMYIKKKKNKFENHLSLKNVNKNFDYKNKNMENYDLDTNTIDAHWLQREL
NKIFTDPSLCLEKEKEVLNILKIYDIQECENKLVNILKYENFSIAKLLIKNRWKIYYCTL
LGQAQTEKEENEIMDQMKKTEEGEEILEELKNFKNVKKNKQSEFAKSMRKEADNLFNKKK
YENNKKNSFSEQKVIHDDDEVKDREEDELNPNFYDSEKEDKEDKEMNDYEDDDEDEEDDE
DEEDDEDEEDEKENETSKKLNKKHKYDKLNVKKEKKSKKISDIIPDNFKGKYIDLEKVET
KQRNNDFFNKEVMLPSDSKRIEKKDYDEIIITSIKDNSCNINKKKSNKYNYYTSPDEVKL
ISINELPEWTHEIFTCVNINKLNAIQSKVFDTAFNKYEENMLICAPTGSGKTNIALLCIL
NVINSYRLRSGNIDRKNFKIIYISPMKALVNEQVQSFNLRLKCLNIKVSELTGDVHLSSK
EIDDSQIIVMTPEKFEIISRKWNEKILLQKIKLIIFDEIHLLNEIRGNILESIITRINRY
IDNMLIYDYTAEDNTTFNKEKKSSHDKDDDIIIQKKKIRLVGLSATLPNYEDVGLFLRAD
LRKGVFYFDYSFRPVQLEQYYIGIKEKKGIKKYALMNELTYEKVLEEAGKNQILIFVHSR
KETYRTAKILIDKFMKSDNLSKFLIDKKISTEILLSEKEAIVNDELKEILPFGFGIHHAG
LKRTDRKLVEDLFSDRHLQVLISTSTLAWGINLPAHTVIIKGTSVYNINIGDFDELSPMD
ILQMVGRSGRPQYDKSGKAIIITDHKNLQLYLSLNNEQLYIESTLLSNIVNIINAEIVLR
NIQNFKDAINWFNYTYMYIRMIKNPSLYGVPVSEKYDNQEYLNNKDNYDMLMQKINKRIY
NIIYSSFLILEKYDLIKYNKKLNSVSSTYIGKISSYYYVDYKSIDLYNKKLSKHTNEIDL
LKVFTMSEEFKNIFVREEEKVELSILMEKLPIPVKESINIPFTKINILLQLYLSNITLSG
YIINADLVYIHQNALRIFRSFFEISLKKNSYNLIALTLKFSKMIERRMWSTMTPLRQFGL
LSNELIRIIEKKNISFKNYISMNLNEYITIFKNKKIAKNIYKLVHHFPKIELNAYIQPIN
HKILKVELNITPDFIYNPKYHGYFMLFWVFVFDISNENILHYDLFTLKKNHKSNFLTGKE
EKDMYSDSLDEHLLTFFLPINENPFYIVKVISDKWLECECTINLYLNDLILPSKNFYSTQ
LLDLQPLPINSLKFDLAKRFFLNRNIEYFSPINTQIFSSVYENNGNVIICNSTSKYYLIP
VELAIIKMIKFLFELNSYIKKYIRKEEDLLKIINDKKLTDIIYNNPLEFVKVVYIAPLED
IVLKTYKNWISFKNTFNLKMCILSGDIQVDMKLLQKNNIILCTPDKYDNISKKWRRKKIL
QNVNLYIFDHIELLDTPNGAIMEIVISRIRYISTQLQLNKSQNKGNKMNDNTLSFEELNI
GEDKENFVHNINKLQNLTIDNIYDNIGLNRILCLSSCSLYNCKDFSEWIGCKKNDYFNFL
STVRNIPIEIYLHAVNIMNKQNRYISMQRQVYQNIRKLKKKKNVIIFVTEQKLCKTLALD
LILSAYNDNYHFYSIFQNYETSNKKKENNLGRNSEYMNSNSEFYDAEYNSKKKERNLNIQ
EIVENNMSKIDNSKKYGSKKQNKTKQEMEEESNIESREDIFDYIYDKMLVEFMKKGICYL
HSNMTETERKIVEMLFDKKAIQILIVSYDYIYSLNAYGNNIIILDTIITHFNNKEEDYSI
QNILEMISYAGRQNEDVKSYVYIYTYITKKEYYKNFIYEPLTVESSIEDYLPNFLNNEIV
MSTIENFQDAIDWLTWSFFYRRIKKNPNYYGLKGISNEHISDYLSELIENNMEILSFANC
IHIEEQTMNIKPFNLGIISSFYNIDYHTIQFFNQYILSLRTLKKSKILEIVCLSNIFNDI
LKINTHDIYLCLKIAKSCNIEVTYEFLKLSLNYENFLKNDESNNKENNKSEENKKDQYIN
LINFVSVPTYFTANLKALIILHAHVNRYSIPVNYIEETKNILLKTFKLINSLIDVISSNN
ILNFCLFVMEVSQMLTQSLKNTDESNLYQLPYFDYQLVKKAKDVGIVDVYDLINAEDDKR
DILLKHLSENQKSEIANVCNIFPIIEVQYEIDLNKSYKVNEIAQLNLSIERDLTDDTINF
AHSLFLPFEKEEMWWIVIGIKKMNLLLSIKKVSLLKSVNNIKINFELPDKPNIYDVVIYV
VNDSYIGCDQEYEFQINVEE
NT seq
7803 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagaggaatatgaaaagttcaaaaggtttgaatatcgtatgaattcaaacctagtt
ttacaaagagaaggcccaatacctaatcataatgaacctactggagaaagtgaaagttta
gttgggaaaataaaatataagatgggtgataaggtggaatatggaaaaccaaaagattta
gtaagtaaagatgattatagaagatataaaagaaaagataattttcttgataaaaaaagt
aagaaaataaagagaagtgctaaagaaaaaagtgttctgaatattaatattcatgatatt
tttttatacaaaccaactactaagtacactgaacaaatttatagtaaaattttaaataat
attagaaatatgataggtgataatacatgtgatattattaacagtgcatgtaatgaaata
atatatattttaaaaagtgataatttaaatgatgaagaaaaaaaacaagaagtagaaaat
gcattagaagtgaatataactgacgaaaaatttattgagttaaacaatttatctaaagaa
atatatgattttaataaaaaagaagaaaatgaagatatcgaaaatgaagaaggtgttgct
gttgtttttgaagaagatgatgattattatgacttaaaaaaaagaagaaaagatacaaat
gaaaaaagagatgattttagtgatataaacgaattaagtgactacaatgaagaagaagaa
gaagaagacagtgaagaagatgatgatgaagcgatgaatgaagaagatgaagacataaaa
gatagtgaggaagaaaaaatcgatgaagaagaagaaaaaaaaaataagaaaatatataaa
gaaaataaaagtaaagatgataaagaaaatgatagtgatcaaaatgcttacgatgatata
gaaaaaaaaaaaaagaaaaaagaaaaagaaattatgtatattaaaaaaaaaaaaaataaa
tttgaaaatcatttaagtttaaaaaatgtaaataaaaatttcgattataagaataaaaat
atggaaaattatgatttagataccaatactattgatgctcattggctacagagagaatta
aataaaatatttactgatccatctttatgcttagaaaaagaaaaagaagttttaaatatt
ttaaaaatatatgacatacaagaatgtgaaaataaacttgttaatatattaaaatatgaa
aatttttctattgctaaattattaatcaaaaatagatggaaaatttattattgcacctta
ttaggtcaagcacaaacagaaaaagaagaaaatgaaataatggaccaaatgaaaaaaacg
gaagaaggagaggaaatattagaagaattaaaaaattttaaaaatgttaaaaagaataag
caaagtgaatttgcaaaatcaatgagaaaagaagcagataatttattcaataagaaaaag
tatgaaaataataaaaaaaattctttttcagaacaaaaggtaatacatgatgacgacgaa
gtaaaggatagagaagaagatgaattaaatcctaatttttatgattcagaaaaggaggat
aaagaagataaagaaatgaatgattatgaagatgatgatgaagatgaagaagatgatgaa
gatgaagaagatgatgaagatgaagaagatgagaaagaaaatgaaacatcaaaaaaatta
aataagaaacataaatatgataaattaaatgtaaaaaaagagaagaaaagtaaaaaaatt
tcagatataattcctgataattttaagggaaaatatatagatttggaaaaggtggaaacc
aaacaaagaaataatgatttttttaataaagaagttatgctaccatcagatagtaaaaga
atagaaaagaaagattatgatgaaattataattacgagtataaaggataacagttgtaat
attaataaaaaaaaaagtaataaatataattattacacttcaccggatgaagtaaaattg
atttctattaatgaattacctgaatggactcatgaaatttttacatgcgtaaatattaat
aaattaaatgcaatacaatctaaagtatttgatactgcttttaacaaatatgaagaaaat
atgttaatttgtgcaccaacaggatcaggaaaaactaatattgctttgttatgtatatta
aatgttattaatagctatagattaagaagtggaaacattgatagaaagaattttaaaata
atatatatatctcctatgaaagctttggttaatgaacaagttcaatcttttaatttaaga
ttaaaatgcttaaatataaaagtaagtgaattaacaggagacgtccatttaagtagtaaa
gaaatagatgatagccaaattattgttatgaccccggagaaatttgaaataataagtcgt
aaatggaatgaaaaaatattattgcaaaaaataaaattaattatatttgatgaaattcat
ttacttaatgaaattagaggaaatatattagagagtattataacacgtataaataggtac
atagataatatgttgatttatgactacactgcagaagataatacaacatttaacaaagaa
aagaaaagttctcatgataaggatgatgatataattatacaaaaaaaaaaaattcgttta
gttggcttgtcagcaacattgcctaattatgaagatgtaggattatttttgcgagcagat
ttacgtaagggagttttttattttgattattcttttaggccagtacaactagaacagtac
tatattgggataaaagaaaaaaaaggaataaaaaagtatgcgttaatgaatgagttaaca
tatgaaaaggtattagaagaagcaggaaaaaatcaaatattaattttcgttcatagcaga
aaagaaacttatagaactgcaaaaatattaatagacaaatttatgaaaagtgataatcta
agtaaatttttaattgataaaaaaatatctacggaaattctattatcagaaaaagaagca
atagttaatgatgaattaaaagaaattcttccttttggttttggaatacatcatgcaggt
ttaaaaagaactgatagaaagttagtggaagatttattttctgatagacatttgcaagtg
ttaatttctactagtaccttagcatggggtattaatttacctgcacatacagttattata
aaaggaactagtgtttataatattaacataggagattttgatgaattatctccaatggat
atattacaaatggttggaagatcaggtagacctcagtatgataaaagtggtaaagcaata
attattactgatcataaaaatttacagctatacttatctttaaataatgagcaattatat
attgaatctacattattaagtaatattgtaaatataataaatgcagaaattgttttaaga
aatattcaaaattttaaagatgctattaattggtttaattatacttatatgtacatacgt
atgataaaaaatccttcattatacggtgttccagttagtgaaaaatatgataatcaagaa
tatttaaataataaggataattatgatatgttaatgcaaaaaataaataaaagaatttat
aacattatttattcatcatttttaatattagaaaaatatgatttaataaaatataataaa
aaattaaatagtgtaagcagtacttatataggtaaaatcagtagttactattatgtagat
tataaatcaatagatttatataacaaaaaattaagtaaacatactaatgaaattgattta
ttaaaagtatttacgatgagtgaggaatttaagaatatatttgttcgagaagaagaaaaa
gtggagttatcaatactcatggaaaaattgcctataccagtaaaagaatctattaacatt
ccatttacaaagataaatatacttttacagctatatttatcaaatataactttaagtggt
tatataattaacgcagatctagtatatattcatcaaaatgcattacgtatttttcgttca
ttttttgaaatatccttaaaaaaaaattcatataatttaattgctttaactttaaaattt
tctaagatgattgaaaggagaatgtggagtactatgaccccattaaggcaatttggcttg
ttaagtaatgaattaattcgaattattgaaaaaaaaaatataagtttcaaaaactatatt
tctatgaatttgaatgagtatataacaatttttaaaaataaaaaaattgctaaaaatatc
tataaattagtgcatcattttcctaaaatagaattaaatgcatatatacagccaattaat
cataaaattttaaaagttgaattaaatataacacccgattttatatataaccctaagtat
catggttattttatgttattttgggtatttgtatttgatatttctaatgaaaatatatta
cattatgatttatttactctaaaaaaaaatcataaaagcaattttttaactgggaaagaa
gaaaaagatatgtattctgatagcttggatgaacatttacttacattttttttacctatt
aatgaaaacccattttatattgttaaagttatttcagacaaatggttagaatgtgaatgt
actattaacttatatcttaatgatttaattttgccatcgaagaacttttattctactcag
ttattagatttgcaacctctaccaataaattccttaaaatttgatttagcaaaaagattc
tttttaaatagaaacatagaatattttagtccaatcaacactcaaattttttcatcagta
tacgaaaataatggaaatgtcattatatgcaattctacttcaaaatactatttaatacca
gtagaattggcaattataaaaatgatcaaatttttatttgaattaaatagttatattaaa
aaatatattagaaaagaagaagatttattgaaaataattaatgataaaaagttaacagat
ataatttataataatcctttggagtttgttaaagtagtatatatcgctccacttgaagat
attgttttaaagacatacaaaaattggatttcctttaaaaatacatttaatttgaaaatg
tgtattttaagtggagatattcaagtagatatgaagttattgcaaaaaaataatattatt
ttatgtactccggataaatatgataatatatctaaaaaatggagaagaaaaaaaatttta
caaaatgttaatttatatatttttgatcatattgaattattagatacaccaaatggagct
attatggaaatagtaattagtagaatcagatatatatcaacacaattacaattaaataaa
tctcagaacaaaggtaataaaatgaatgataatacattatcctttgaagaattaaatata
ggagaggataaagaaaactttgttcataatataaataaattacaaaatttaaccatagat
aatatatatgataatataggtttaaacagaattttatgtttgtctagttgttctttatat
aactgcaaagatttctctgaatggattggttgcaaaaaaaatgattattttaactttttg
tcaacagttagaaatatcccaatagaaatatatttacatgcagttaatataatgaataag
caaaatagatatatatctatgcaaagacaagtataccaaaatataagaaaattaaaaaaa
aaaaaaaatgtaattatatttgttacagaacagaagttatgtaaaacattagctttggat
ttaattttatctgcatataacgataattaccatttttactcaatttttcaaaattatgaa
acatcaaataaaaaaaaagaaaataatttgggcagaaatagtgaatatatgaatagtaac
agtgaattttatgatgcagaatataattccaaaaaaaaagaaagaaatttgaatattcaa
gaaatagttgagaataatatgtcaaaaatagataactcaaaaaaatatggtagtaaaaaa
caaaacaaaacaaaacaagaaatggaagaagaatcaaacattgagtcaagggaagatatt
tttgattatatatatgataaaatgctagtagaatttatgaaaaaaggtatatgctattta
catagtaatatgacagaaacagaaagaaaaatagtggagatgttatttgataaaaaggcg
atacaaattttaattgtttcttatgattacatatatagtttaaatgcatatggaaataat
attatcatattagatacaataataactcattttaataataaagaagaggattatagtatt
caaaatatattagaaatgataagttatgctggaaggcaaaatgaagatgtgaaatcatat
gtatatatttatacatatataaccaaaaaggagtattataagaactttatatatgaacct
ttaactgtagaatctagcattgaggattatttacccaattttttaaataatgaaatagta
atgagtactattgaaaactttcaagatgctattgattggctaacatggtcttttttttat
aggagaataaaaaaaaatcccaactactacggtttgaaaggcatatcgaacgagcatata
tctgattatttatctgagttaattgaaaataacatggaaatattatcatttgctaattgt
atacatattgaagaacaaactatgaatataaaaccatttaatttaggtattatatcctct
ttttacaatatagattatcatacaattcaattttttaatcaatatatattgtcattaaga
acattaaaaaaaagtaaaattttggaaatagtatgcctatcgaatattttcaatgatatt
ttgaaaattaacacacatgatatatatctatgcttaaaaatagctaaaagctgtaatatt
gaagttacgtatgagtttttaaaactatctttaaattatgaaaactttttaaaaaatgat
gaaagtaataataaagaaaataataaatcagaagaaaataaaaaagatcaatacattaat
ttaataaattttgtttctgttcctacatatttcacagctaatttaaaagctttaataatt
ttacacgcacatgtaaatagatacagcatacctgtaaactatattgaagaaacaaaaaat
attttattaaaaacatttaaattaattaattcattaattgatgttataagtagtaataat
attttgaatttctgtctttttgtaatggaagtttctcaaatgttgactcaaagtctgaaa
aatactgatgaatctaacttatatcaattaccttattttgattatcagttagtaaaaaaa
gcgaaagatgtaggaatagtggacgtttatgacttaattaatgcagaagatgataaaaga
gatattttattaaagcatttaagtgaaaatcaaaagagtgaaatagctaatgtatgtaac
atctttcctataatagaagttcaatatgaaattgatttgaataaatcgtataaggttaat
gaaattgctcaattaaatttatcaattgaaagagatctaacagatgatacaattaatttc
gctcattctctatttttgccatttgagaaggaagagatgtggtggattgtaataggtatt
aaaaaaatgaatttgcttttatcaattaaaaaagtatctttactaaaatcagttaataac
ataaaaataaatttcgaattacctgataaaccaaatatttatgatgttgtaatttatgta
gtaaatgattcttatattggttgtgatcaagaatatgaatttcaaattaatgtagaggag
taa
DBGET
integrated database retrieval system
