Plasmodium relictum: PRELSG_0819900
Help
Entry
PRELSG_0819900 CDS
T09405
Symbol
RPB1
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, putative
KO
K03006
DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
prel
Plasmodium relictum
Pathway
prel03020
RNA polymerase
prel03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prel00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
PRELSG_0819900 (RPB1)
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
PRELSG_0819900 (RPB1)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
prel03021
]
PRELSG_0819900 (RPB1)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
prel03400
]
PRELSG_0819900 (RPB1)
Enzymes [BR:
prel01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
PRELSG_0819900 (RPB1)
Transcription machinery [BR:
prel03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
RNA polymerase II
Core subunits
PRELSG_0819900 (RPB1)
DNA repair and recombination proteins [BR:
prel03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase II complex
PRELSG_0819900 (RPB1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb1_6
RNA_pol_Rpb1_7
SHOCT-like_DUF2089-C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39735875
NCBI-ProteinID:
XP_028532778
LinkDB
All DBs
Position
8:complement(753765..760370)
Genome browser
AA seq
2201 aa
AA seq
DB search
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NT seq
+upstream
nt +downstream
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DBGET
integrated database retrieval system
