Plasmodium relictum: PRELSG_0933200
Help
Entry
PRELSG_0933200 CDS
T09405
Name
(RefSeq) conserved Plasmodium protein, unknown function
KO
K11491
condensin-2 complex subunit D3
Organism
prel
Plasmodium relictum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prel00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
prel03036
]
PRELSG_0933200
Chromosome and associated proteins [BR:
prel03036
]
Eukaryotic type
Chromosome condensation proteins
Condensin II
PRELSG_0933200
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_TTI1_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39736344
NCBI-ProteinID:
XP_028533233
UniProt:
A0A1J1H5L9
LinkDB
All DBs
Position
9:1171124..1176954
Genome browser
AA seq
1698 aa
AA seq
DB search
MEKIERNKRKLDDTINKDEYETNEKKRKNNKMEKKSINEKMDNSLHIQNNIFIKKIKENK
LQFEKNDNIESIYRKLKSNIISLNVSYIKMEHYDSFIFYEKSKIDFLLPELDTILNSSNI
DILRELCNISFYPIYNETLSKRIMEWLMKDRNRNQNKEYTGNINMSYLFSLNIILTYLIY
KNDDYSNYSCLIYLNILQWMQNEKKGLKFCLFILKGILKRFLFCSFYFNDKKINKSKKTD
NEYELNEEALDVLKSIFVALYNSLEYINISNLVNINDKNCIFELIKFFIELIKRPLIHSV
HILCINYLIKIVKKCYDFRFYYNINVELYDIGPEVNIFVKIVNLIFAKILSIFKDTKNEE
NIYSAEEINNINNLIILFFKNILNSCIRIIIPQVLLNNKLKNNYLLINEKKNNTEKKNKE
EISFEDQIVLNACDPIFSFIEISIINHCDKYEKNMFIDLIKILIKECRKIEKKHNIMEII
CDEFILFIKGDDNKKKEKFLDINYLKVRKINKKRIDSSLSFNLSDEYSSSVYSETEEEEK
NDDEEEVECDKEEDEAENALEKEIEGNELNKKGKENEEEEKEDIEENKRIRKKIKKIKFI
NKIKHKRKCSLIIDNKKYLITYESVMIRYLNLLLKYMNCERYQIRNIILDLFLALIKKKK
TNKNESIFHNLFKLFLERLEDPNMIVKAKALSILVILTNRKYHDNSLIHNFIFNKTKEKI
NMYKIISSNVYSNRSNIRKLTIQYIEAIFETLINKNLNYKIFLIFISNYIYSLSLDSMPS
VRRQVLLTVNNLFINANANTHITKIWLTIIFSAITDIEETVKDEAIGIFLNTFIKPSFNC
SIFNVKEKRIKEVLKKNNLSYFKISEYLDKTEENFVNNNNGFSDSKLINEITNVSNNVTN
VVETKHNNDKNLALNRLMCDDINNSDSINFMKKPSIKEKNKNVKNNIEEYDRNNDGILHL
INIWELYFEKNINNYFLTLLKVMTKYDLLHFNLLIFCLKKKKNNTLEEFINLLNSFIYNL
RYFSIRMWNTFILDFIIELSKHYQNKINIENILFLLSRCYKIYLMNLSVQEDKKNINNFD
NNNKEDNNATNDNINEKGEHLQRIVSIRDMSFSCNFRDELLNDYILNKDDLIDEKNSCSS
GILKNIMLKLFTIIYNLLDNINELSDEFLQKMEYMIFHFNCPLCFIYIILNILIKKKKNV
NDFIEKLKNKIVYFFENIESFSYNNVFCNILITFVFLINHFKKCDTFLTSVCEKLKKIYD
NTRNNDINNIMIKNCIYLTQSVLLIDKGINIKNDLFSNIEKDLKSGNISMSILNNLIILI
YYMVINFGSSCNKFVLILLRFFKHENSFIRYLSFYIISKLISEDYVKFNNQFFFAFLYLL
ADKNELIRKQSLSVFKHILLIYNKTNLINYIIEFIFVLNNFYNFKLGKHLSNIANSFEIK
NKEDRYTIYRFLLENLTNSEKFSLQQKLINEYLIQYVYNYDNYYFSDENLNEKKNIKSIL
PLNDEDNEGSVLQDVLNILCSKLMKIKIKKDFAKLEEKNKNLKIKNVENSVKVLHDLMKN
ILKKNTLPILLSLRAIMLKSKSFFFKYINNLVIYLCLDYKDSLEDLISETHVKNEIISDM
QNFIYVDLIQLHTEQSGIFNKNININFLEFSEKDIKDDNITDNQLVYEKDSSSDYDEVTN
VLHGIHDSDEKSKKKKKA
NT seq
5097 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagaaaatagaaagaaataaaagaaaactagatgatactattaacaaagatgaatat
gaaactaatgaaaaaaaaaggaaaaacaataagatggaaaagaaatcaataaacgaaaaa
atggataatagtttgcacatacaaaataacattttcataaaaaaaataaaggaaaataaa
ttacaatttgagaaaaatgataatattgaaagtatatatagaaaactaaaatcaaacatc
atttcattaaatgtgtcatatatcaaaatggaacattacgattcctttattttttatgaa
aaaagcaaaattgatttcctgttgcctgaattagatacaatactgaattcatcaaatata
gatatattgagggaattgtgtaatatatcattttatccaatatataatgaaacactaagt
aaaaggataatggaatggttaatgaaagatagaaatagaaatcaaaataaagaatatact
ggaaatataaatatgtcctatttatttagtttaaatattattctaacttatttaatttac
aaaaatgatgattattcaaattattcttgcttgatttaccttaatatattacaatggatg
caaaatgaaaaaaaaggtttgaaattttgtctttttatattgaagggaattcttaagaga
tttctattttgttctttttatttcaatgataaaaaaattaataaatccaaaaaaactgat
aatgaatatgaattaaatgaggaagcattagatgttttaaaaagtatatttgttgcatta
tataatagcttagaatatataaatataagcaatttggttaatatcaatgataaaaattgt
atctttgaattaattaaattttttattgaattaattaaaaggcctttaattcattcagtt
catatattatgtattaactacttaataaaaattgtgaaaaagtgttatgattttcgattt
tattataatataaatgtagaattgtacgatattggtccggaagtaaatatttttgttaaa
attgtaaatttaatttttgctaaaattttatctatttttaaagatacaaaaaatgaagaa
aatatatattctgctgaagaaattaataatattaacaatttaattattttattttttaag
aatattctaaatagttgtattagaattattatacctcaagtattactcaataataaatta
aaaaataactatttattaattaatgaaaagaaaaataatacagagaagaaaaataaagaa
gaaataagttttgaagatcaaattgttctaaatgcatgtgatcctatattctcctttata
gaaatatcgataattaatcattgtgataaatatgaaaaaaatatgttcatagatttaatt
aaaatattaattaaagaatgcagaaaaattgaaaaaaaacataatataatggaaatcata
tgcgatgagtttattctatttatcaaaggagatgataataagaaaaaagagaaattttta
gatataaattatttaaaagtaagaaaaattaataagaaaagaattgattcaagtttgtca
tttaatttatcggatgaatatagctcttcagtttactctgagacagaagaagaagaaaaa
aatgatgatgaagaagaagttgaatgtgataaagaagaagatgaagcagaaaatgcatta
gaaaaagaaatagaaggaaatgaattaaacaaaaaaggaaaggaaaatgaagaagaggaa
aaagaagatatagaagaaaataagagaataaggaagaaaataaagaaaataaaattcatt
aataagataaaacataaaagaaagtgcagtttaattattgataacaaaaaatatctaatt
acttatgaatcagttatgattagatatttaaatttattactaaaatacatgaattgtgaa
agatatcaaataagaaatataatacttgatctattcttagctttaattaaaaaaaaaaaa
acaaataaaaatgaatcaatttttcacaatttatttaagttatttttagaaagattagag
gatcctaatatgattgtaaaagcaaaagctctatctattttagtaatcttaactaataga
aaatatcatgacaattcactaatacataattttatatttaataaaactaaggaaaaaata
aatatgtataaaataatatcatcaaatgtatatagtaataggagtaatataagaaaatta
actatacaatatatagaagctatatttgaaacattaataaataaaaatttaaattacaaa
atatttttaatttttatttctaattatatttattcattatcattagattctatgccatct
gtacgcagacaagttttattaacagttaataatttatttataaatgctaatgcaaatact
catataactaaaatatggttaactatcattttttcagctataactgatatagaagaaaca
gtaaaagatgaagctattggtatatttttaaatacatttattaaaccatcttttaattgc
tctatttttaatgtaaaagaaaaaagaattaaagaggttttaaaaaaaaataatttatca
tattttaaaataagcgaatatctagataagacagaagaaaattttgtgaataacaataat
ggtttttctgatagtaaattgatcaatgaaataactaatgtttctaataatgtaacaaat
gttgtagaaacaaaacataataatgacaaaaacttagctttaaataggttaatgtgtgat
gatatcaataatagtgatagcattaattttatgaaaaaaccatcaataaaagagaaaaac
aaaaatgtaaaaaataatatagaagaatatgatagaaataatgatggtattttacattta
ataaacatatgggaattatattttgaaaaaaatataaataattattttcttactctttta
aaagttatgactaaatatgatttactacattttaatcttcttatattttgtttaaaaaaa
aagaaaaataatactcttgaagaatttataaatcttttgaattcttttatttataacctg
agatatttttcaattagaatgtggaatacatttatacttgattttataattgaactatca
aaacattatcaaaataaaataaatattgaaaatattttatttcttttaagtagatgttat
aaaatttatcttatgaatctgagtgtgcaagaagataaaaaaaatataaataattttgac
aataataataaagaagataataatgcaacaaatgataatataaatgaaaagggagagcat
ttacagagaatagtatcgattagagatatgtcatttagttgcaattttagggatgaatta
ttaaatgattatattttaaataaagatgatttaattgatgaaaaaaatagttgttctagt
ggaattttaaaaaatattatgttaaaactatttactataatttacaatttactagataat
atcaacgaattgagtgatgaatttttacagaaaatggaatatatgatttttcatttcaat
tgccccttgtgcttcatttatattattttaaatatattaattaaaaaaaaaaaaaatgta
aatgatttcatagaaaaattaaaaaataaaatagtatatttttttgaaaatatagaatct
ttttcctacaataatgttttttgtaacattttaataacatttgtatttttaataaatcat
tttaaaaaatgtgatacttttttaacttcagtttgtgaaaaattaaaaaaaatttatgac
aatacaagaaataatgatattaataatattatgataaaaaactgtatatatttaacacaa
agtgttttactaattgataaaggcattaatattaaaaatgatttattttcaaacattgaa
aaagatttgaaaagtgggaatatttctatgagtatacttaataatttaattatattaata
tattacatggttattaattttggtagttcatgtaataaatttgtccttattcttttacgt
tttttcaaacatgaaaattcttttattagatatttatctttttatattatatctaaacta
atatcagaagactatgtaaaatttaacaatcaatttttttttgcctttttatatttacta
gctgataagaatgaattaataagaaaacagtcattatcagtttttaagcatattctttta
atatataataagactaacttaataaactacataatagaatttatttttgttttaaataat
ttttataatttcaaattaggcaagcatttaagtaatatagcaaatagttttgaaataaaa
aataaagaagatagatatacaatttatcgttttttattagaaaatttaactaatagtgaa
aaattttcgttgcagcaaaagttaattaatgagtatttaattcagtatgtatacaattat
gataattattatttttctgatgaaaacttaaacgaaaaaaaaaatataaaaagcattctt
cctttaaatgatgaagataatgaaggatctgtcttacaagatgtattaaatatattatgt
tcgaaattaatgaaaataaaaattaaaaaagattttgctaaattagaagaaaaaaataaa
aacctgaaaataaaaaatgtagaaaatagtgtaaaagtattacatgatctcatgaaaaat
attttaaaaaagaatactcttccaatattattatcattgcgtgcaattatgctaaaatct
aaatcctttttttttaaatatataaataacctagtaatttatttgtgcttagattacaaa
gattctttagaagatttaatatctgaaacacatgttaaaaatgaaattataagcgatatg
caaaattttatttatgtagatttaattcagttgcatacagaacaaagtggtatatttaat
aaaaatattaatatcaattttttagaattttcagaaaaagatataaaagatgacaatata
acagataatcaactagtttatgaaaaagatagttcaagtgattatgatgaggttactaat
gttttacatggaatacatgatagtgatgagaaatcaaagaaaaaaaaaaaagcataa
DBGET
integrated database retrieval system