Plasmodium relictum: PRELSG_1123700
Help
Entry
PRELSG_1123700 CDS
T09405
Symbol
ISWI
Name
(RefSeq) SNF2 helicase, putative
Organism
prel
Plasmodium relictum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
PHD
DEAD
Prok-RING_1
PHD_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39737016
NCBI-ProteinID:
XP_028533894
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(933296..941068)
Genome browser
AA seq
2590 aa
AA seq
DB search
MRIRKSWCTLCRENFEEGDECMQCKQCKKKFHRECLQAENLIDNNQLKDIKNYICYHCMN
EENDIPENEERCKICREKSSNLVLLLCDGCPNSYHVTCLGLQSEPTTEKWFCPVCKPEEH
KNLDVRRMRKGFIIDNMNGEHVNSSTCYVCQRHGKLLGCDFCPNSFHPTCLPDLDFDNIS
DQWECPCCKNEDPLLNQGHKRWTKNEIQEIMKKRQRELSFWRSKIIKYRNRFLLAHRKDL
QPFVNPRVFANLTKIFKNDFYNLKNNNGSKKSNKNNNDYDKTNMKKDLDIDSKEFDDYIS
SLEDEANENANNFIESVFLSVYYPNGRKIERRPLVDNVQLKPHQEDGVEWLLKSFLTGGA
ILADEMGLGKTIQTLCFLSYLKCNKIDGPHLIVVPLSTVGNWLREIHRFTPHLTCIKICG
SKNERTHAKEDRLAEKGLYDLYVTTYETVKNEEEFFVETIPKWQCIVLDEAHRIKNQSGA
IRHSMDRVVGNMRLLLTGTPLQNNSAELFTLINFMFPDIFKNSEIIEQAFMNASQNSSNH
KNSNLKNKNSKDEKNIQNTNNSGNSKLNVDIGNIDLKSAIKEEDLKSIRCLLDKIMLRRL
KEQAITLPRKIFHDVWLPLGSLSAHWYKRLLDIRSMVEEKVSVKKLLGLVIKMRIICGHP
KGIVSRPTQMEKLFAFFEEESEEIKEQVKNDAIKLKNISGQEHIESSSKLIFIDKLLCQL
HYENCKYVKNYSTNFEKHKKEVAAYTYHKIQEQNNAQKKKREHSGKFKKIEALENSPLFM
EIYNKGKFDLKPTSEKEDLLKNFMHTVPVDNECPYKKKRCIYDKVKDLFKNTSDSNNKKN
IFFKDDNNENDLSDDRYSCNNINNNMNDNEENKNESDNCMNSSKENERNNLFDDEENNSG
TKKNSRISNDDSDDEEYTKNYESLSNKKNKKKKLISEKNVNSVNYKKNKKGNSNSLFDSN
DENDYEEEDGEDTDDQSEEEDELGDEEYREIDDDANNKKKNNNNNKNEDKKLKGRKIKSS
KNDDKIVSLNENCKMMNIREFFKNEKELSNNSQKKNDKKKMEKYDIKKEESNELKTEELK
KIEENKKLENCYENKRVYEEEEKKIDQKEDQNMNDKYKKEEVKQKQEKEETYDNEEKKIP
IDKNCSNEEKEENNEKMKKGEIRMHKVLIFTQFQLVLDELEEYCKYRCWKYMRLDGSTNK
LIRELDIREFNLSNSIYFIYLISTRAGGLGINLTAANHVIMYDEDWNPFIDLQAIDRAHR
IGQRREVNVWKLMTEWTVEERMAFRREQKLKLDKLVVQTQDDEDLLDNFEEKLSSDEIRK
LMLHGKAAIQNMNVENTNDFSLEFFIERGRRKLPIVNGVDLEKEEKCTIEEEINNINEND
VYIEKDEIADTQNIEDDNAIDIDEVMIDEAEEPEIRHNNTVLTDCSPTYAEGNDQLYLNN
LNKSKTSLSKANTNTNQFASNNLGSDTTLWRSVRERKKPQNMYTPEYWGRKQEVKQIKHE
YRCFICNNTKNYKTIVKDRNGNDIEIDYGDMINCFRCPKTYHKLCEGIKDENVKKTWTCS
WHECCLCFRKSSQCGNLLIHCATCPTSFCYNCFPPDYVRYYVGEEYYHNLRQRGVNFTPQ
NWVCFLCSKCKAVEEQKKRRKMTKEERENEKQLQKELRSQLQDSKQEELEAKKRKRAQQI
ERDKFIIENRKRIDALDQKYETQLRNAYENLFPVNFVKELVNRIEHAKMLKQKGIDEDNK
EVNKKKSTTFLHTKLPHKLLVLCENCKLPCHANYKYPGKCCFPLELDKSYFYANSSFNQS
NKDSNDKKITAKNDASNEIKDKEEKKEEENNNLEKECESNTKEIKNVKEENDNKINEKGD
EQENTNKKSTCSLKIENKKSDEDITLNNSLTYKNSKVISTNDDENKYFKEAADIKNKSDH
SNNQNNSTNENVKCEKEGKQDNNNNNNYYEKEENKENGGENEEDDFNEKKQNKIEKTSSE
EKCKNNSNENIKVNIVINENEIKTENNDNNKITTPNNNDNNSISNSKGKTRRFLRAVCSK
CGTVQLGKLAHFRKHCDKLTEEEKNEYEEKREKLKQLIDLLNRKKIEDEHTEEEYKNMSI
FKFKSLYNYFQDKADDILEECIREMKWDILISSKKKVVKKEKESKKNYNKNEEDKNEDNI
NSNSKSKLTHLLYSQPLTISSDCSETKDIIEIKSDITDEMREIINEEISSFTGKRKKNSK
NTKKVKKKKINDNNIESNVNNLQNENELQNLNLIVNPFHEQLIKDTHNVNFIRESFNDEF
LNKAKEFLRVTKSKLLNNSFSESSDAEILGSSENNKKLNQDDIEKSIIQDYLNKMKNSFT
DSNSYTNKNNFNDNLNELNYTSSCVNDKENMNDYRNDLYKNSYENTNYCICSSKSNSCNK
HPPSNTSKSNEKIEEFNRNSSYSLNDFNTDIYNIDKNIHSEEIEKKLLNLCAKTNLMNKN
DFQNDSKEEKSIIIEDENNFLLNKNEKIFQKSKVSLDDSVDYDIKKITNSSEACGANKVQ
EYILYRRKKNSNSANSSNMNDNIENDNNNNTNDDNLLDNGDNIFQHLNLDDVKNFLKSAE
LNNEKLPEIN
NT seq
7773 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaataagaaaatcatggtgcacattatgtcgtgagaattttgaagaaggagacgag
tgtatgcaatgcaaacaatgtaaaaaaaaatttcatcgagaatgtttacaagcagaaaat
ttaatagataataatcaattaaaagatataaaaaattatatatgctatcattgtatgaat
gaagaaaatgatattccagaaaatgaagaaagatgtaaaatatgtagagaaaagtcgtca
aaccttgttttattactatgcgatggatgtcctaatagttatcatgttacttgtttaggt
ttacagtcagagccaacaacagaaaaatggttttgtcctgtatgtaaacctgaagaacat
aaaaatttagatgttagaaggatgcgaaaaggttttataattgataatatgaatggagag
catgtgaattcatctacatgctatgtttgtcagaggcatggaaaattattaggttgcgat
ttttgccctaattcttttcatccaacatgtttacctgacttagattttgataatatctca
gatcaatgggaatgtccatgttgtaaaaatgaagatcctttattgaatcaaggacataaa
agatggacaaagaatgaaattcaagaaattatgaaaaaaagacaaagggaattaagtttt
tggagatcaaaaattataaaatatagaaatagatttttattagctcatagaaaggatttg
caaccttttgtaaatcctagagtatttgcaaatttaacaaaaatattcaaaaatgatttt
tataatttaaaaaataataatggaagtaagaaatcaaacaaaaataacaacgattacgat
aaaacaaatatgaaaaaagatttagacattgattctaaggaatttgatgattacatatct
tctttagaagatgaagcaaatgaaaatgcaaataactttattgaatcagtatttttaagt
gtttattatcctaatggaagaaaaattgaaagaaggccattagttgataatgtccaatta
aagccacatcaagaagatggtgtggaatggttactaaaatcctttttaacaggaggtgct
attttagcagatgaaatgggtttaggaaaaactatacaaactttatgctttctttcttat
ttaaaatgcaataaaattgatggacctcatttaattgttgttcccctatctactgttgga
aattggttaagagaaatacacagattcacacctcaccttacatgtatcaaaatttgcgga
tcaaaaaatgaaagaacccatgctaaagaagatagattagcagaaaagggattatatgat
ttatatgtaactacttacgaaacagttaaaaatgaagaagagttttttgtagaaacaata
cctaaatggcaatgtatagtattggatgaagctcatagaataaaaaatcaaagtggtgct
attaggcattctatggatagggtggtaggaaatatgcgattattattgacaggtactcct
ttacaaaataattccgctgaactatttactttaattaattttatgtttccagatatattt
aaaaactccgaaataatagagcaagcatttatgaatgcatcacaaaatagcagtaatcat
aagaacagtaatttaaaaaataaaaatagtaaagacgaaaaaaatattcagaatacaaat
aatagtggcaattctaaattaaatgtagacattggcaatatagatttaaagtctgctata
aaagaagaagatttaaaatctatacgttgtttattagataaaattatgttaagaaggcta
aaagaacaagcgattacacttcctagaaaaattttccatgatgtttggttacccttagga
agcttatcagcacattggtataaaagactcttagatattagatctatggtagaggaaaaa
gttagcgtaaaaaaattattaggtttagttataaaaatgagaattatatgtggtcatcca
aaaggaattgttagcagaccaacacagatggaaaagttatttgcattttttgaagaagag
agtgaagaaattaaagagcaagttaaaaatgatgcaataaaattaaaaaatatttcgggg
caagaacatattgaatcttcttcaaaacttatatttatagataaattattgtgtcaatta
cattatgaaaattgtaaatatgttaaaaattattccaccaattttgaaaagcataagaaa
gaggttgctgcttatacctatcacaaaattcaagaacaaaataatgcacaaaaaaaaaaa
agggaacactctggaaaatttaaaaaaattgaagcattagaaaacagtcctttatttatg
gaaatttataataaaggaaaatttgatttaaaaccaacttcagaaaaagaagatttatta
aaaaattttatgcatacagtgcctgttgataatgaatgtccatataaaaagaaaagatgt
atctatgataaagtgaaagatctttttaaaaataccagtgattctaataacaaaaaaaat
atattttttaaagatgataataatgaaaatgatctctcagatgatcgttatagctgtaac
aatataaataataatatgaatgataatgaggaaaataaaaatgaaagtgataattgtatg
aattcttcgaaagaaaatgaaagaaataatttattcgatgatgaagagaataatagtggt
actaaaaaaaatagtagaatctctaatgatgatagtgacgatgaagaatatacaaaaaat
tatgaaagtttatcaaataaaaaaaataaaaagaaaaaacttatttcagagaaaaatgtt
aatagtgtgaattacaaaaaaaataaaaaaggaaatagtaatagtttatttgatagcaac
gatgaaaatgattatgaagaagaagatggagaagataccgatgatcagagtgaagaggaa
gatgaattaggtgacgaagagtatagagaaattgatgatgatgcaaataataaaaaaaaa
aataataataataataaaaatgaagacaaaaaattaaaaggaaggaaaataaaaagtagc
aaaaatgatgataaaatagtttctttaaatgaaaattgtaaaatgatgaatattagagaa
ttttttaaaaatgaaaaggaattatcaaataattctcagaaaaaaaatgataaaaaaaaa
atggaaaaatatgatataaaaaaagaggaatcaaatgaattaaaaacagaagaattaaag
aaaatagaagaaaataagaaattagaaaattgttatgaaaataaaagagtatatgaagaa
gaagaaaaaaaaatagatcaaaaagaagatcaaaatatgaatgacaaatataaaaaagaa
gaagtgaaacaaaaacaagagaaagaagaaacttatgataatgaggaaaaaaagatacca
atcgataaaaattgttctaatgaagaaaaagaagaaaacaatgaaaaaatgaaaaaaggg
gaaataagaatgcataaggtgttaatatttacccaatttcagttagtattagatgaatta
gaagaatattgtaagtatagatgttggaaatacatgagattagatggatccactaataaa
ttaataagagaattagacatacgtgaatttaatttaagtaatagcatatattttatttac
ttaatcagtaccagggctggtggtttaggtattaatttaactgcagctaatcatgttatt
atgtatgatgaagattggaatcctttcattgatttacaagcaattgatagagcacataga
ataggacaaaggagggaagtaaatgtttggaaattgatgactgaatggacagtcgaagaa
agaatggcatttagaagagaacaaaaattaaaattagataaattagttgttcaaacacaa
gatgatgaagacttattagacaattttgaagagaagttatcatctgatgaaataagaaaa
ttaatgttacatggaaaagcagctatacaaaatatgaatgtagaaaatactaatgatttc
tctttagagttttttattgaaagaggacgaagaaaattacctattgtaaatggagtagat
ttagaaaaagaagaaaaatgtaccatagaagaggaaataaacaatataaatgaaaatgat
gtatatatagaaaaagatgaaattgctgatacacaaaatattgaagatgataacgcaatt
gatatagatgaagtcatgatagatgaagcagaagaacctgaaattagacacaataataca
gttttaaccgattgtagtccaacatatgcagaaggaaatgatcagttatatttaaataat
cttaataaatcaaaaacctctctttcaaaggctaacacaaataccaatcaatttgcatca
aataatttgggtagtgatacaacattatggagatccgtaagagaaagaaaaaaaccgcaa
aatatgtatacacctgaatattggggaagaaaacaagaagtaaaacaaataaaacatgaa
tataggtgctttatatgtaataatacaaaaaattacaaaactattgttaaggatagaaac
ggaaatgatatagaaatagattatggagatatgataaattgttttcgttgccctaaaact
tatcataaattatgtgaaggaataaaagatgaaaatgtaaaaaaaacttggacatgcagt
tggcacgaatgctgcttatgttttagaaagtcatcgcaatgtggtaatttattaatacat
tgtgctacttgtcctactagtttttgttataattgttttcctccagattatgtaagatat
tatgttggagaagaatattatcataatttacgtcagagaggagttaattttacaccccag
aattgggtgtgctttttatgctctaaatgcaaagctgtagaagaacaaaagaaaagaaga
aaaatgactaaggaagaaagagaaaatgaaaaacaattacaaaaagaattaagaagtcaa
ctacaagatagtaaacaagaagaattagaagcaaaaaaaagaaaaagagctcagcaaatt
gaaagagataaatttattatagaaaacagaaaaagaatagatgctttggatcagaaatat
gaaactcaactaagaaatgcatatgaaaatttattcccagttaattttgttaaagaatta
gttaatagaatagaacatgcaaaaatgttaaaacaaaagggaattgatgaggataataaa
gaagttaataaaaaaaaatctactacatttttacatacaaaattgccacataaactttta
gttttatgtgaaaactgtaaattaccttgccatgctaattacaaatatccaggcaaatgt
tgtttcccattagagttagataagtcttacttttatgctaattcatcatttaatcaatcc
aataaagatagtaatgacaagaaaataacagcgaaaaacgacgcatctaatgaaattaaa
gataaagaagaaaaaaaagaagaagaaaataataatttagaaaaagaatgtgaaagtaat
acaaaagaaatcaaaaatgtaaaagaagagaatgataataaaataaatgaaaaaggagat
gaacaggaaaatacaaataaaaaatcaacatgcagtttgaaaatagaaaacaaaaaaagt
gacgaagatatcaccttaaataattcattaacttacaaaaatagtaaagttattagtact
aatgatgatgaaaataagtattttaaagaagcagctgatataaaaaataaaagtgatcat
agcaacaatcaaaataattctacaaatgaaaatgtaaaatgcgaaaaagaaggcaaacaa
gacaataataataataataattattatgaaaaagaagaaaataaagaaaatggaggagaa
aatgaagaggatgattttaatgagaaaaaacaaaataaaatagaaaaaactagcagtgag
gagaaatgcaaaaataattcaaatgaaaatattaaagtcaatattgtaataaatgaaaat
gaaataaaaacagaaaacaatgataataataaaataactacacctaataacaatgataat
aattctatatctaattcaaaaggaaaaaccagaagatttttaagagctgtctgctcaaaa
tgtggtactgtacaactaggaaaattagcccactttagaaaacattgtgataagctaaca
gaagaagaaaaaaatgaatatgaagaaaagagagaaaaattaaaacaattaattgatcta
ttgaataggaaaaaaattgaagatgaacatacggaagaagaatataaaaatatgtctatt
tttaaattcaaaagcctatataattattttcaggataaagcagatgatatattagaagaa
tgcattcgagaaatgaaatgggatattttaatatctagtaaaaagaaagtggtaaaaaag
gaaaaggaatcaaaaaaaaattataacaaaaacgaggaggataaaaatgaagataatata
aattctaattcaaaatctaaattaactcaccttttatatagtcaaccattaacaataagc
tctgattgttcagaaacaaaagacatcatagaaataaaaagtgatataacagatgaaatg
agggaaataataaatgaagaaatttcatcatttacaggaaaaagaaaaaaaaattcaaag
aatacaaaaaaagtaaaaaaaaaaaaaataaatgataacaatatagaatcaaatgtaaat
aatttacaaaatgaaaatgagttacaaaacttaaatttaattgtaaatccgtttcatgag
caacttattaaagacactcataatgtaaatttcataagagaatcattcaacgatgaattt
ttaaacaaagctaaagaatttcttagggtaacaaaaagtaaattattaaataactctttc
tctgaaagtagtgatgcagaaatattaggatcttctgaaaataataaaaaattaaatcaa
gatgatatagaaaaatcgattattcaagactatcttaacaaaatgaaaaattcatttact
gatagtaattcatatacaaataaaaataattttaatgataatttaaacgaattaaattat
acaagttcatgcgtaaatgataaagaaaatatgaatgattacagaaatgatttatataaa
aattcatatgaaaatactaattattgcatctgctcaagcaaatctaactcatgtaataag
caccctccttctaatacaagcaaaagtaatgaaaagatagaagagtttaatagaaattca
agttattctttaaatgattttaatactgatatttataatattgataaaaatattcattca
gaagaaatagagaagaagctgttaaatttatgtgcaaaaacaaatttaatgaacaaaaat
gattttcagaatgatagcaaggaagagaaaagtattataatagaagatgaaaataatttt
cttttaaataaaaatgaaaaaatttttcaaaaaagtaaagtttcactagatgatagcgtt
gattatgatattaaaaaaataacaaatagttcagaggcatgtggtgcaaataaagttcaa
gaatatattctgtatagaaggaaaaaaaacagtaatagcgctaattcgagtaatatgaat
gataatattgaaaatgataataacaataatacaaacgatgataatttgttagataatggt
gataatatatttcagcatttaaatttggatgatgtaaaaaattttttaaaaagtgctgaa
ttaaataatgaaaagctacctgaaataaattaa
DBGET
integrated database retrieval system