Plasmodium relictum: PRELSG_1146200
Help
Entry
PRELSG_1146200 CDS
T09405
Name
(RefSeq) ATP-dependent RNA helicase, putative
KO
K12598
ATP-dependent RNA helicase DOB1 [EC:
5.6.2.6
]
Organism
prel
Plasmodium relictum
Pathway
prel03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prel00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
PRELSG_1146200
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
prel03019
]
PRELSG_1146200
03041 Spliceosome [BR:
prel03041
]
PRELSG_1146200
03009 Ribosome biogenesis [BR:
prel03009
]
PRELSG_1146200
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
prel03016
]
PRELSG_1146200
Enzymes [BR:
prel01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.6 RNA 3'-5' helicase
PRELSG_1146200
Messenger RNA biogenesis [BR:
prel03019
]
Eukaryotic type
mRNA degradation factors
3'-5' decay
TRAMP complex
PRELSG_1146200
Spliceosome [BR:
prel03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U4/U6.U5 tri-snRNP related factors
PRELSG_1146200
Complex C
U4/U6.U5 tri-SnRNP related factors
PRELSG_1146200
Ribosome biogenesis [BR:
prel03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Helicases
PRELSG_1146200
Transfer RNA biogenesis [BR:
prel03016
]
Eukaryotic type
tRNA degradation factors
TRAMP complex
PRELSG_1146200
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DSHCT
DEAD
MTR4_beta-barrel
DEXQc_Suv3
Helicase_C
MTR4-like_stalk
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39737240
NCBI-ProteinID:
XP_028534114
UniProt:
A0A1J1HC25
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(<1761100..>1765055)
Genome browser
AA seq
1291 aa
AA seq
DB search
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RGINNDSMCEILTAATKKLRRGIPFSPSLYL
NT seq
3876 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
