Plasmodium relictum: PRELSG_1231700
Help
Entry
PRELSG_1231700 CDS
T09405
Name
(RefSeq) transcription factor IIIb subunit, putative
KO
K15196
transcription factor IIIB 90 kDa subunit
Organism
prel
Plasmodium relictum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prel00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
prel03021
]
PRELSG_1231700
Transcription machinery [BR:
prel03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
Basal transcription factors
TFIIIB
PRELSG_1231700
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TFIIB
BRF1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39737561
NCBI-ProteinID:
XP_028534433
UniProt:
A0A1J1H8Y6
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(1195268..1197617)
Genome browser
AA seq
758 aa
AA seq
DB search
MVGQFIPSSGNKSFILSWGIRESREISLQKGYINIQKIADHLHLSSQHIEAAQRIYLMAL
QRNFTMGRNNSYVAASCLYTICRREKSPVMLIDFSDILQTPVKPLGKTFLKLLRLLHINV
PNIDPSLFLERFAHKLNLKNDIYKVTYTGIKLIQAMTRDWISTGRRPTGLCGAALLISTR
IHGISINSNTIADIVRISNPTIIKRLSEFKNTNTAKIKASEFDKISITDIPSNSIPPCVI
YDNKKKLKNNFIEKNKTLSLCDSEEQENRSKKSICDGEIFSDDIFSQKSNDENNFNINSG
INDDNTSNDNSLFHIEKLSYNNHTEYSTNSIVNDDKEKNEENEKEKKNNNSNDGINLEEI
CNENPKGNDIDNLALKIINTINIENNPNILKNANNNFLINRDEKIDRTTDLENCELKKKK
GEIFMDNFSMKSTTSMCSVNKLSDMESCVSASNFSDNLNELNKAKINDEKNSLINEEIKN
NEKMNTIINNDISINDNVSYISNNNDSNNNITKTIPKNYNNSNLSTTSNCYNETACINLS
NIIENNSSTDDKKIILQQNHLNKEKEIIDSSYCTTLKETVTSELNNIINEVEEYSFLECN
IENKNRNNKKNMNNANISTDFNYFFESNLNSINDQNTTFDGNSDASINQNDETLSDIYDS
EIENMILTEKEKEIKMLIWDDMMKNYLPHICKQLKRQKKRNHEENNNEKKKIRNKKKKVE
DISETQSTGDSVLKALEKSDKNLPNKINYDVLKSLFSS
NT seq
2277 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttggtcaatttattccatcaagtgggaataaatcatttatattatcatggggaata
agagaaagtagagaaatatctttacagaaaggatatataaatattcaaaaaatcgctgat
catttacatttatcaagtcaacatatagaagcagctcaaagaatttatttaatggcatta
cagagaaattttactatgggaagaaataattcttatgttgctgcttcttgcttatacact
atttgtaggagagaaaagtctccagtaatgttaattgattttagtgatattttacaaaca
cctgtaaaacctttaggaaaaacgtttttaaaactattaagattattgcatatcaatgtt
ccaaatattgatccttctctatttttggaaagatttgctcataaacttaatttaaaaaat
gacatttataaagttacatatacaggaatcaagcttattcaagctatgactagagattgg
attagtacaggaagaagacctactggactatgtggtgcagctcttttaatttctactaga
atacatggaatatcaattaattctaatacaattgctgatattgtcaggatttctaatcca
actataattaaaagattgtcagaatttaaaaacacaaatactgctaaaattaaagcttct
gaatttgataaaatttctataacggatattccatcaaatagcattcctccatgtgttatt
tatgacaataaaaaaaaattgaaaaataattttattgaaaaaaataaaaccttatcatta
tgtgatagcgaagaacaagaaaatagaagtaaaaagtcaatatgtgatggagaaattttt
agtgatgatattttttctcaaaaaagtaatgatgaaaataattttaatataaatagtggt
ataaatgatgataacacttctaatgacaatagtttgtttcatattgaaaaattatcatat
aataatcatactgaatattcaactaacagtattgtaaatgatgacaaggaaaaaaacgag
gaaaatgagaaagaaaaaaaaaataataatagtaatgatggaataaatttagaggaaatt
tgcaatgaaaatcctaaaggaaatgatatagacaatttggctttaaaaataattaatact
atcaatatagagaataatccaaacatactaaaaaatgcaaacaataatttcttaataaat
cgtgatgaaaaaatagaccgtactacagatttggaaaattgtgaacttaaaaagaaaaaa
ggagaaatttttatggataatttctctatgaaatctactacttctatgtgtagtgtaaat
aaattatcagacatggaatcatgtgtttctgcatctaacttttcagataacctcaacgaa
ttaaataaagctaaaataaatgacgaaaaaaattcgttaattaatgaagaaataaaaaat
aatgaaaaaatgaacacaatcattaataatgatattagtattaatgataacgtcagttat
attagtaataataatgatagtaataacaatatcactaaaactattcctaaaaattataat
aatagtaatttatctacaacgagcaattgttataacgaaactgcatgcataaatcttagt
aatattattgaaaataatagctctactgatgataaaaaaattattttacaacaaaatcat
ttaaataaagaaaaagaaataatagatagtagttattgtactactttaaaagaaactgta
acttctgaattaaataatatcataaatgaagtagaagaatatagttttttagaatgtaat
attgaaaataaaaatagaaataataaaaaaaatatgaataatgctaatatttcaacagat
tttaattatttttttgaaagtaatttaaattctattaatgatcaaaatactacatttgac
ggaaattcagatgcttccattaaccaaaatgatgaaactttgagtgatatatatgatagc
gaaatagaaaatatgattttaactgaaaaggaaaaggaaataaaaatgttaatatgggat
gacatgatgaaaaattatttaccacatatttgtaaacaattaaaaaggcagaaaaaaaga
aatcatgaagaaaataataatgaaaaaaaaaaaattagaaataaaaaaaagaaagtggaa
gatatttcagaaactcaatcaactggggattccgttttaaaagctcttgaaaaatctgat
aaaaatttgcctaataaaataaattatgatgtattaaaatcccttttttcatcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system