Plasmodium relictum: PRELSG_1452000
Help
Entry
PRELSG_1452000 CDS
T09405
Symbol
XAB2
Name
(RefSeq) pre-mRNA-splicing factor SYF1, putative
KO
K12867
pre-mRNA-splicing factor SYF1
Organism
prel
Plasmodium relictum
Pathway
prel03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prel00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
PRELSG_1452000 (XAB2)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
prel03019
]
PRELSG_1452000 (XAB2)
03041 Spliceosome [BR:
prel03041
]
PRELSG_1452000 (XAB2)
Messenger RNA biogenesis [BR:
prel03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
PRELSG_1452000 (XAB2)
Spliceosome [BR:
prel03041
]
Complex B
Other components
Prp19-related factors
PRELSG_1452000 (XAB2)
Complex C
PRELSG_1452000 (XAB2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_Syf1_CNRKL1_C
HAT_Syf1_M
HAT_Syf1_CNRKL1_N
TPR_2
BUD22
HAT_PRP39_N
CDC45
Mad3_BUB1_I
CobT
TPR_8
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39738952
NCBI-ProteinID:
XP_028535306
UniProt:
A0A1J1HFG1
LinkDB
All DBs
Position
14:complement(2023164..2026400)
Genome browser
AA seq
972 aa
AA seq
DB search
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REFEALHGNEYTFRDMIRIKRSVLNIFSNSCNNIKEIEKNEKSSINGIESTKRKLKEMIE
NEEQIQKKLKNK
NT seq
2919 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system