Providencia rettgeri: RB151_008170
Help
Entry
RB151_008170 CDS
T04571
Symbol
fhaB_1
Name
(GenBank) Filamentous hemagglutinin
KO
K15125
filamentous hemagglutinin
Organism
prg
Providencia rettgeri
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
prg00536
]
RB151_008170 (fhaB_1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
prg00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Microbial pathogens
RB151_008170 (fhaB_1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF637
TPS
Fil_haemagg_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APC10522
LinkDB
All DBs
Position
941305..946599
Genome browser
AA seq
1764 aa
AA seq
DB search
MLNEQLPSRPKRLLSYTIIFLTAVYPLHPAWGAAMTAADKNTQVSQQKNVPIINIATPNG
AGVSHNKFQQFSVDKQGAVLNNATTNVNSQIAGQVKANANLKGNAANLIINEVTGSSRSE
LQGKLEVVGKGANVVIANPNGITCNGCSFVNTPAITLTTGKPILDNKGALSAVEVKKGSV
VIGANGMNAQAQTYADIISRATELNGQIKAKNLTLMQGTNRIDFQKGTVTPIAGEGAKPS
VSIDTKALGGMYVNQVKLVSTEAGVGVNLSNVQTNQNDLTLTVDGKITLAGNIQGKKDIN
VSTKNLQINTNAKVNAIKDITLATNTLTNNGKVIAGKDIRVFADKVSNTGNNALIQAQDN
LWMQKNAKGDLSTLIENKSGTIKTNAGDLVVRTKKLTNTANASPIKTSNINATTNYSEDF
VSSYFGKRQGVVSIISLYPRLENFSYKKWFGKIDLINSDSINVERKQYLGLGNIGTITSG
KNTYINANNLVSDFGKIASKNNVILTGQNASISSFDSGKLDLWYKYDTSNADLGKFADES
EDNGTYDIFYVSEPVDFKLIDKFYSWAPETLNYKTISAGNNVVLDFKNTINLESKLPNTD
KPVAKIVQIGNPSFAITAKNIILNSNNINISSNLQSENDLSIIAGQNINIHNAQLAAKQS
QSLIANNDLNLKQVNLTAKDGTLIARNGSIQYNLNPISAFKGNVLSPPVLNASNSLNIQA
GKNVTFDNVQLAKTNKLSISANDNIIIRRDESNLMKLAASEPAANINALLTKIGNWASSG
EINLTAGKNIEARGIAFNSGKSLSFNAGQDILLGSKSIKDVDNIFKTNRYPELRSQLIAN
GNITLNAARDINLQSANLQSKDKITAISGRDIKLTATAYSAIPNPNEDNQDVRYVTSTLS
GDKGVTLASNGALTAQGSTIKSLGDITLSSGGNVRLESVKTNYRKQSGKRFEELYRQIGT
EINSGKTLTILSEGSILFQASRLVAKGAMDIAAKGGYLYAQAMEETSYFEEYKKKCNRWT
LCITKKEVRKTRSDKTNKVTEFTAGGDINLYAKDDVTLEATKINAGKNAKITSQTGKVNF
KAVKNSQFEQVITNSKGFYITQRNKGYTSDKWVLPALHIGGKLTVDANKGITADVKTKNN
QSLQNALNALGQTEGTKWLAGLKDRKDVQWGLVQDAYDSWDYKSQSLNPVASALIMITVA
AMTSGTASQFAAWAASGSSGTTATVISGAAYSGMTALSTQAAVALAENQGNLSKTLNSLG
KSDVVKSIITQMVISGALNGLDIKMGWTKGNPADAKLPLLSNGDWGKVAQRVAAQSVISS
TVNTTIQGGSFTDNFKTALLSNIGNQINAEGARLIGDNGEILGHTGKLLSHSVVSGVSAE
IAGGDAKGAVVGALAAELAAITLNSKLFEPKYINEQERQLALLQDAIKGNDAKTQFTKVL
GGFAGALITHKPEGAFSAANSAELVYTYNYTEHQLQQIIIENNLDMMAAAKGDKAAAQRV
AARQEAAIFVGFVAAGGYVAVIGGEIVLAASPEILAAAKLGVQGCKAGLVLCINKLAISS
AEVIAPESAISSGAALGAGYKLLASSEDTAKALANTAMNSSKHMLIAGKQDASKLKSLLD
AEKLRVEANKKVIEEINKFSSKNKARDTATMVAAYDIKSGTIIVKGSVGNKIEADMLHKD
TIILLKKKLGGADVGTKTIYCNNIVGGCGEVLAADQLIRQGVKPTDIRISQAYRPRDAHG
FDISEVPPEALVSTCKNCIKVFLE
NT seq
5295 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaatgaacaactgccttcacggcctaagcggttattaagttacaccattattttc
ttaaccgctgtctaccctttgcatcccgcttggggagccgctatgactgcggcagataaa
aacacccaagtcagtcaacaaaagaatgtcccgattattaatattgctacgccgaatggg
gcgggggtatcgcataataaattccaacaatttagtgtcgataaacaaggcgcggtactc
aataacgccaccactaatgtgaattcccaaatcgcagggcaggttaaagccaatgcgaat
ttaaagggaaacgccgccaatctgattatcaacgaagtcactggcagtagccgctctgaa
ttacaaggtaagttggaagtggttggtaaaggggcgaatgtcgtcattgccaacccgaat
gggattacctgtaatggttgtagttttgtgaatacccctgcgatcactttgaccacgggg
aaacccattcttgataacaagggcgcattgtctgcggttgaggtgaaaaaaggtagtgtg
gttatcggggcaaatggcatgaatgcgcaagcgcaaacctatgccgatattattagccgt
gccacagaactgaatgggcaaattaaagccaaaaacctgaccttgatgcaaggtactaac
cgtattgattttcaaaaaggcaccgtgacaccgattgccggtgaaggggcaaaaccgagt
gtctcaatcgatactaaggcgctaggggggatgtatgttaaccaagttaaattggtcagc
acggaggcaggggtgggggttaacctcagcaatgtgcaaactaatcaaaatgacctaacg
ttaactgtcgatggcaaaattacccttgcaggcaatatccaaggtaaaaaagacattaat
gtcagcaccaaaaatctgcaaattaacaccaacgctaaagtgaatgccatcaaggacatc
acattagccaccaacaccctcaccaataatgggaaagttatcgcaggtaaggatatacgt
gtctttgctgacaaagtcagtaatacgggtaataacgcactgattcaggcacaagataat
ctgtggatgcaaaaaaatgccaaaggggatttgagtaccctgattgagaataagtcaggg
acaataaagaccaatgcgggggatttggtggttcggaccaaaaaactgacaaatacggcg
aatgcatctcccataaaaacttctaatatcaatgcaacaactaactatagtgaagatttt
gtctcatcttactttggaaaaaggcaaggtgttgtatcgattatttcactttatcctcga
ttagagaacttctcctataaaaaatggttcgggaaaattgatttaatcaacagtgacagt
attaatgttgagcgaaaacagtatttgggtctaggaaacattgggactataacatcagga
aagaatacctatattaacgcaaataatttagttagtgattttggaaaaattgcttcaaaa
aacaatgtgatattgactgggcaaaatgcatcaatatcctcttttgattcaggaaaatta
gatctttggtataaatacgatacatctaatgcagatttaggaaaatttgcagatgaaagt
gaggataatggaacttatgatattttttatgttagtgagccagtagattttaaattaatc
gataaattttattcttgggcgcctgaaactttaaactataaaacgatatcagctggaaat
aatgttgtccttgattttaaaaatactattaatcttgaaagtaaacttcctaatactgat
aagcccgttgcaaaaatagtacaaatagggaatccttcttttgctattactgccaaaaat
attatcttaaattctaataatataaatatttcctctaacttacagtctgaaaatgatctg
tctattatcgcaggtcaaaacatcaatattcataatgcacagctcgctgcaaaacaatca
caaagcctaattgcgaataatgaccttaatcttaaacaagtcaacttaaccgctaaagac
ggtaccttaattgcgagaaatggcagtattcagtataacttgaatcctatctctgctttt
aaggggaatgtgttatcgcccccggtccttaacgcatcgaactcattaaatatacaagcc
ggtaaaaacgttacatttgataatgtgcagttagccaaaacgaataaactctctatcagt
gccaatgacaatattattattcgtcgcgatgaatccaatttaatgaaactcgcagcttca
gagcctgctgccaatatcaatgcgttactcacaaaaataggaaactgggctagttcgggg
gaaataaacctcaccgcaggtaaaaatattgaagcgcgtggcattgccttcaacagtgga
aaatcactgtcattcaatgcaggacaagatattttattaggctcaaaatctattaaagat
gttgataatatatttaaaaccaatcgctacccagagctgcgctctcaacttattgcgaat
ggtaatattacgttaaatgcggcacgtgatattaacttgcaatccgccaatctccaatca
aaagataaaattactgcaatttcaggccgtgatattaaattaacggctaccgcttattcc
gccattcccaaccccaacgaagacaatcaagatgtacgttatgtgacctcgacactctcc
ggtgataaaggcgtcacactggcctccaatggtgcattgaccgcacaaggtagcacaatt
aaatccctaggtgacatcacactctcaagtgggggaaatgtacgcttagagtctgtcaaa
acgaattatcgaaaacaatcaggtaaacgatttgaagagttatatcgccagataggcact
gaaattaacagcggtaaaaccctgaccattttgtctgaggggagcattcttttccaagcg
tctcgcctcgtcgccaaaggggcaatggatattgcagcaaaaggcggatatctctatgcg
caagcgatggaggaaactagttacttcgaagagtataaaaagaaatgtaatcgatggacg
ctttgtattactaaaaaggaagttagaaaaacacgtagtgataaaaccaataaagtcact
gaatttaccgcaggcggcgatattaatttgtacgccaaagatgatgtgacgttagaagcc
actaaaattaatgcgggcaagaatgccaaaatcaccagccaaacaggcaaggtcaatttt
aaagctgtcaaaaattcgcaatttgaacaggtaattacaaattctaaagggttttatatc
actcaacgcaacaaagggtatacctcagataaatgggttttacctgcattgcatattggt
ggaaaactgactgttgatgcgaataaagggattactgcggatgttaaaaccaaaaataat
caaagcttacaaaatgccctgaatgctctaggtcaaacagaaggcaccaaatggttagcg
ggtctaaaagaccgcaaggatgtgcaatggggattggttcaagatgcgtatgacagttgg
gattataaaagccaaagcttaaatccagtggcgtcagcgttaatcatgataaccgttgcg
gcgatgacgtcaggtacggcatcacagtttgcagcttgggcagcgtctggatctagcgga
actactgcaacagtcatttccggcgcagcctactcaggcatgacagcactttccacacaa
gccgcagtcgcattggctgaaaaccaagggaatctatccaaaactctgaattcattgggc
aaaagcgatgtcgtcaaatcaatcatcacccagatggtgatttcaggagcgctcaatggc
ctagatataaaaatggggtggactaaaggtaatccagcagatgctaaattaccgctatta
agcaatggagattggggtaaagttgcccagcgtgttgcagctcaatcggtaattagctca
acagtgaataccacaatacaaggtggcagttttactgataactttaagactgccttactc
agtaatattggaaatcagattaatgctgagggtgctcgacttattggcgacaatggggag
attctaggccatacaggaaaactattaagtcactctgttgtttcgggtgtaagtgctgaa
attgctggtggagatgcgaaaggtgcagttgttggtgcactagcagcagagttggctgca
ataacattaaacagtaaattgtttgagccaaaatatatcaatgagcaagaaagacaactc
gcattactacaagatgctattaaggggaatgatgccaaaactcaattcactaaagtatta
ggtggatttgcaggggcattaattacccataagccagaaggggctttttctgccgctaat
tctgctgagctggtttatacgtacaattatacagagcatcaactacagcaaataattata
gagaacaatctggatatgatggcagcagctaaaggagataaagctgccgcacaaagagtt
gctgcgcgccaagaagcggcaatatttgttggttttgttgcagcaggtggatatgtcgca
gttattggcggtgaaattgttttagcagcatctcctgaaatattagctgcagcgaaatta
ggggtgcagggatgcaaagcagggctagtgctctgcatcaataaactagccattagttca
gctgaagttattgctccagaatccgctatttctagcggggcagctttaggagcgggttat
aaattattagcaagctcagaggatacggcaaaagcactcgcaaataccgccatgaacagc
tcaaagcatatgctaatagctggaaaacaagatgcgagtaaactaaagtctcttctagac
gctgagaaattacgtgttgaggctaataaaaaagttattgaggaaattaataaattttca
tctaaaaacaaagctagagatacagcaaccatggttgctgcatatgatataaaaagtggc
actatcattgtcaaaggtagcgtaggtaataaaattgaggccgatatgcttcataaagat
acaataattcttctcaagaaaaagttggggggagctgatgttgggactaaaactatttat
tgtaataatattgttgggggatgtggagaggtattagctgctgaccagctaatacgacaa
ggagttaaaccaacagatataaggatttcacaagcatatagacctagagatgctcatgga
tttgatatatcagaagttccgccagaagcgcttgtatctacttgtaaaaattgcatcaaa
gtatttttagaataa
DBGET
integrated database retrieval system