Paenibacillus riograndensis: PRIO_0364
Help
Entry
PRIO_0364 CDS
T03849
Name
(GenBank) Collagen triple helix repeat-containing protein
Organism
pri
Paenibacillus riograndensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
C1q
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CQR51617
UniProt:
A0A0E4H6H7
LinkDB
All DBs
Position
I:388153..390591
Genome browser
AA seq
812 aa
AA seq
DB search
MSFFSTGPIENNAVSGVRPTQSVTLRIDNRSNSLASTALIEGYYMSGGLRNLYVSQSLNL
APNQVVTNNYFADLDAFEFIITTASPSPADDPVQVSLWGKSSTGQLVTAHRLVSAELLGE
TPGATGATGATGATGATGETGATGVGVTGATGETGATGVTGATGATGETGATGVTGATGA
TGETGATGATGVTGATGETGATGVTGVTGATGETGATGVTGATGATGETGATGATGATGA
TGETGATGVTGVTGVTGVTGATGETGATGATGATGATGETGATGVTGATGATGETGATGA
TGATGATGETGATGATGATGATGETGATGATGVTGATGETGATGATGATGATGETGATGA
TGVTGATGETGATGVTGVTGATGETGATGVTGATGATGETGATGATGATGATGETGATGV
TGVTGVTGATGETGATGVTGATGATGETGATGVTGATGATGETGATGATGATGATGETGA
TGVTGVTGATGETGATGVTGVTGATGETGATGVTGVTGATGETGATGVTGATGETGATGA
TGATGATGETGATGVTGATGATGETGATGVTGTTGATGETGATGVTGATGATGETGATGV
TGVTGATGETGATGATGVTGATGETGATGVTGATGATGETGATGATGATGPNVAAEGFSA
FLPTLSASASTQLAGWTVTSPYYDSTSFDETTGNYTVPVTGRYSFEATINYSTTAAISVA
LGAGVNPAFVIRRTSPTTLDLVNGLFPLLNVNIALVLTLRTILGNGTVTLTGEFDLTAGD
VIGLFYEADGLTVPLDLGGTSSGVVWSVHRFI
NT seq
2439 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagctttttttcaacgggtccaatagaaaataatgcggtcagcggtgtaagacccact
cagtcagtgacgctccgaatcgataaccgcagcaattcactagcttctacggcattaatt
gaaggttactacatgagcgggggtctgcgaaacttgtatgtgagccaatccttgaatttg
gcccctaatcaagtggtgactaacaactactttgctgatctggatgcatttgagtttatt
attacaacggcaagtccaagcccggcagatgatcctgtgcaggtttcattatgggggaag
agcagcacggggcagctggtgacagcccatcggctggtatccgctgaactgctgggagaa
accccaggagcaaccggcgcgaccggggcaacaggagcaacaggcgcaacgggagaaacg
ggggcgactggagtaggagtgaccggcgcgacgggagaaacgggagcgactggagtcaca
ggtgcaacaggtgcgaccggagaaacgggagcgactggagttacaggtgcaacaggtgcg
accggagaaacgggagcgactggagctacaggtgtaacaggagcgaccggggaaacggga
gcgactggggttaccggtgtaacaggtgcgaccggggaaacgggagcgactggggtcaca
ggtgcaacaggagcaaccggggaaacgggagcgactggagctacgggtgcaacaggtgcg
accggggaaacgggagcgactggggttacaggtgtaacaggtgtaacaggtgtaacaggt
gcgaccggggaaaccggagcaactggagctacaggtgcaaccggagcaaccggagaaacg
ggagcgactggagtcacgggtgcaacaggtgcgaccggggaaacgggagcgactggggcc
acaggtgcaacaggtgcgaccggggaaacgggagcgactggggccacaggtgcaacaggt
gcgaccggggaaacgggagcgactggagccacaggtgtgacaggtgcaaccggagaaacg
ggagcgactggagctacaggtgcaacaggtgcgaccggagaaacgggagcgactggagct
acaggtgtaacaggagcgaccggggaaacgggagcgactggggttaccggtgtaacaggt
gcgaccggggaaacgggagcgactggggtcacaggtgcaacaggagcaaccggggaaacg
ggagcgactggagctacgggtgcaacaggtgcgaccggggaaacgggagcgactggggtt
acaggtgtaacaggtgtaacaggtgcgaccggggaaacgggagcgactggagttacaggt
gcaacaggtgcgaccggggaaacgggagcgactggagttaccggtgcaacaggtgcgacg
ggagagaccggagcaactggagctacaggtgcaacaggtgcgaccggggaaacgggagca
actggagttacaggtgtgacaggtgcgaccggagaaacgggagcgactggggtgacaggt
gtgacaggtgcaaccggggaaacgggagcgactggggttacgggtgtgacaggtgcaacc
ggggaaacgggagcgactggggttacaggtgcaacgggagaaactggagcgactggagct
acaggcgcaacaggtgcaaccggggaaacgggagcaactggggtaacaggtgcaacagga
gcaaccggagaaacgggagcgactggggtcacgggtacaacaggcgcaacgggagaaacg
ggagcgactggagttacaggtgcaacaggtgcgaccggagaaacgggagcgactggagtt
acgggtgtaacaggtgcgaccggggaaacgggagcgactggagctacaggtgtaacagga
gcaaccggagaaacgggagcgactggagttacgggtgcaacaggtgcgaccggggaaacg
ggagcgactggggctacaggtgcaacaggcccgaatgttgcggcggaagggttctcggcg
tttctgcctaccctttcggccagtgccagcacccagcttgccggctggacggtgacgtcg
ccgtattacgacagcacctcgtttgacgaaacaacggggaactatacggttccggttacg
ggccggtactcttttgaagcaacgatcaactactctactactgcagcgatttcggttgcg
ttaggtgcgggagttaaccctgcatttgtgatacggagaacttctcctacgactctagat
ttggtaaacggactattccctctgctgaatgtcaacattgcgcttgtattgacccttaga
acgatcttgggcaacgggacagtcaccttgaccggtgagtttgatctgacagcaggtgat
gtgatcggcctcttctatgaggcggatggtttaacggttccgcttgatctggggggcaca
tcttccggcgtggtctggtcagtccacagattcatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
