Pedobacter riviphilus: H9N25_15215
Help
Entry
H9N25_15215 CDS
T08657
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
prk
Pedobacter riviphilus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prk00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
prk02000
]
H9N25_15215
Transporters [BR:
prk02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
H9N25_15215
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNR83307
UniProt:
A0ABX6TFA0
LinkDB
All DBs
Position
complement(3732950..3736216)
Genome browser
AA seq
1088 aa
AA seq
DB search
MKKTYLKCLSMLLLCFLTITVFAQKNITGTVKDASGPLPGVSVSVKGTAKVTQTDGSGKF
SISVSPNETLVFTAIGYAKQEISINDQTSINVILKESSNQLDEVNVVTTALGIKRQEKSL
GYAVSTVTAKQLTEAGNTNFASALYGKAAGVKITTAPGGASSAVNVQIRGINSINYNQQP
LYVVDGVMIRNDGQNGAAGANNNNYWDDQRVRGNGILDINPADIESLTVLKGASASALYG
SDAASGVVVITTKKGSKNRGLGVDFNYQGSIDQVAFLPNFQNTYGPGYDRETNVANGATE
EGWIADAGSPSGFRPYFRAYANFGPKMEGQQVRWWDGSIRSYSPQPNNYRDVYQNGYTSN
ANVAISNQTEGVNYRFSASRLDYKGTQPGNTGAKNTFNLNSTIKLAPKLSADVIVSYVNT
ITKNRPYQLGQVLGSFGGFFSRAEDMSLMKERFQTSNGYKYATFDQTARPEPFLFNIRAT
NLLDFYWQQLKNQYDENENRLLSSFTLNYDVAKNLKLRGRIGNDYTSAKTENRQFTEIPT
ALNGNTSTGSYTTTQGQYSVLYGDALLTYSNKIGKDFGLSVSGGYQGRKETYKDLKSNTR
DGLVTENFFALSNSFGVAETSETRKEQLKYAYLGIMNLSYKDFLFAEGTARQEYVSTLPP
GNNQYSYYSVNSGFVFSDLWKLPKFWSYGKLRASYGVVGNAPPIYEANVSYTQTSQQTIN
GSVPTLVPARAYGNLGLMPEKKHEAEFGLETRFLNGRLGLDVSYYDNKIKNQILPLEVSS
TNGAQSQIVNVGEIGNKGFEIALNATPVSGKFRWDTRLNFSTNKSKVNSLKDANSEINFY
SSDQATAKIVARAGEELGNIYIRPRKTDANGNYLISDDGYYVMDNSVYVKAGNIMPKAVG
GFSNTFSYGNFALDVTIDYRFGGKMIAPNLKYMRGAGMLENSMEFRDAANGGLSYTSNGK
TYNDGVVLKGVNQTTGLPNTKVLSAADYYLTTYNWGEGSLTEAEIFDNDYIKMREVVLSY
KIPASFTKKLKISNLRFSLIGRNLFYIHRTLKDLDPEAPLGNKWWSQGVDVGSTAASRNF
GFSLNANF
NT seq
3267 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagacatacttaaagtgcttaagtatgctgttattgtgttttttaacaataaca
gtttttgcacagaagaatattaccggtacggtaaaagacgcgtcaggtcctcttcctggt
gtaagcgtatctgttaaaggaactgcaaaagtaactcaaacagatggcagtggaaaattc
tctatatcagtaagtcctaacgaaactttggtatttactgcaataggttacgctaaacaa
gaaattagcataaacgatcaaacatcaataaatgtaatcttaaaagaaagttctaatcag
cttgatgaagttaacgtagtaacaactgcattggggattaagcgccaggaaaaatctctt
ggttacgcagtaagtacggtaacggctaaacagctaacagaggctggtaacaccaacttt
gcatcggcattatatggtaaagctgcaggtgttaaaattacaacagctccgggtggtgct
agtagtgctgtaaatgttcagattaggggtattaactctattaactacaatcaacaacct
ttatatgtggtggatggggtgatgatcagaaacgatggacaaaatggtgctgctggtgcg
aataacaacaactattgggatgatcaacgtgtacgtggtaatggtatcttggatattaac
cctgcagatatcgaaagtttaaccgtattaaaaggagcaagtgcatctgcgctttatggc
tctgatgcagcaagtggagttgtagtaattacaacaaaaaaaggttcaaagaacagaggt
ttaggagttgattttaactaccaaggttctattgatcaggttgctttcttgcctaatttt
caaaacacttatggcccgggttatgatagagaaactaacgtagcaaacggtgcaactgaa
gaaggctggatcgcagatgcaggttctccaagtggtttcagaccgtatttcagagcttat
gcgaattttggtcctaaaatggaaggccaacaagtaagatggtgggatggttcaattcgt
tcatactctcctcaaccaaataactacagagatgtataccaaaatggatatacttctaat
gcaaacgttgcaatttctaatcagacagaaggcgttaactatcgcttctctgcttctcgt
ttagattataaaggtactcaaccgggaaataccggtgctaaaaatacctttaacttaaat
tctacaattaaacttgcaccaaaattatctgcagatgtgatcgtgagttatgtaaatacc
attaccaaaaacagaccttatcaattaggccaggttttaggttcatttggtgggtttttc
agccgtgcggaagatatgagcttgatgaaagaaagattccaaacgagtaatggttacaaa
tatgctacttttgatcaaactgctcgccctgaaccattccttttcaatatcagagctact
aatttgttggatttctattggcaacaattgaaaaaccaatatgacgaaaatgaaaacaga
ttgttatctagtttcactttaaactatgatgtagctaaaaatttaaaactaagaggtcgt
attggtaatgattataccagtgctaaaacagagaatcgtcaatttactgaaattcctaca
gctttaaacggtaacacaagtacaggttcttatactacaactcagggacaatattcagta
ctttatggagatgcgttattaacttattctaataaaatcggcaaagattttggtttatct
gtaagtggtggttaccaaggtagaaaagagacttacaaagacttaaaatctaataccaga
gatggattagttacagagaacttttttgctttatccaactcatttggcgttgctgaaact
tctgaaacgcgtaaagagcaacttaaatacgcttacttagggattatgaacttaagctat
aaagatttcttatttgcagaaggtacagccagacaagaatatgtttctactcttcctcca
ggaaacaatcaatactcttattattcagtaaacagtggttttgtatttagtgatctttgg
aaattaccaaaattctggagttatggtaaactgagagcttcttatggtgtggtaggtaat
gcccctccaatttatgaagctaatgtttcttatactcaaacttcgcaacaaacgattaac
ggttcagtacctacattagttcctgcaagagcttatggtaacctaggtttaatgccagaa
aagaaacatgaagccgagtttggcttagaaactagattcttaaatggaagattgggtttg
gatgttagttattatgacaacaagatcaaaaaccaaattttaccattggaagtaagttct
acaaatggcgctcaaagtcaaattgtaaacgttggagaaattggtaataagggtttcgag
attgccttaaatgccaccccagtttctgggaaatttagatgggatacgcgtttaaacttt
tcaaccaataaatcaaaagtaaattcattaaaagatgccaattcagagatcaatttctat
tcttcagatcaagctacagctaaaatcgtggccagagctggagaagaattgggtaatatt
tatatccgtcctagaaaaacggatgcgaatggcaattacttaatcagtgatgatggttac
tatgtaatggataactctgtttatgttaaggcaggaaacatcatgccgaaagcagttgga
ggtttctctaatacttttagctatggaaactttgcattagatgttaccatcgactatcgt
ttcggtggtaaaatgattgctcctaatttgaaatacatgcgcggtgcaggtatgttagag
aattcaatggagtttagagatgcggctaacggcggtttaagttatactagtaatggtaaa
acctacaacgatggtgtagttttgaaaggtgtaaatcaaaccactggattgccaaatact
aaggtgctttctgctgctgattattacttaactacatataactggggtgaaggttcatta
accgaagcagagatttttgataacgattacatcaagatgagagaggttgtattgagctat
aaaattccagcttctttcactaaaaaactgaaaatttccaatttaagattttcattgatc
ggacgtaacttgttttacatccacagaactttgaaagatctagatccagaggcaccgctt
ggaaacaaatggtggtcgcaaggtgtagatgtgggctcaacagctgcatctagaaacttt
ggattctcattaaatgcaaatttttag
DBGET
integrated database retrieval system