Prochlorococcus sp. MIT 0801: EW15_1920
Help
Entry
EW15_1920 CDS
T03316
Name
(GenBank) putative DNA helicase
Organism
prm
Prochlorococcus sp. MIT 0801
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DSHCT
DEAD
Ski2_cyano_M
ResIII
Helicase_C
DEXQc_Suv3
nSTAND3
AAA_22
nSTAND_NTPase5
IstB_IS21
ATPase_2
DUF6526
ATPase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIQ98012
LinkDB
All DBs
Position
complement(1564124..1566901)
Genome browser
AA seq
925 aa
AA seq
DB search
MNSSERDTSENEILQNNLNPEEIFPFALDEFQLKAIDSLNQGHSVVVSAPTGSGKTLIGE
YAIYRAISHGSKVFYTTPLKALSNQKLRDFRNQFGSNNVGLLTGDLSLNREASILVMTTE
IFRNMLYAAADRNDDPLLDIETVVLDECHYMNDAHRGTVWEESIIHCPKSIQFVALSATV
ANAGQLTDWIEQVHGPTDLISSDLRPVPLEFNFCSAKGLHPLLNDKGTGLHPNCKIWRPI
KSHKKRGRLSKPTQPESPSLGFVISKLAERNMLPAIYFIFSRRGCDKAVKTIANTCLVNQ
EERKLIQDRFEKFIILNSEGLRDDLHIKALFNGIGSHHAGVLPAWKELIEELFQEGLIKV
VFATETLAAGINMPARSTIISTLSKRSDNGHRQLMGSEFLQMAGRAGRRGLDSRGYVVTL
QTRFEGVREAGQLATSPADPLISQFTPSYGMVLNLLQRYDLDKSKELIERSFSRYLASLD
LVEEEEELSRLKEEFKEYKTFSEDIPWSDFERYEKIKSHLKEERRLLKILQKQSAETLSN
ELILALEFANNGTLISLKTSQLRGKVTPAVIIQKIQKGDRQAQLLCLTDENIWILIACKE
VVSLYADLTCLDVSHITTPKISRIGEIHHGDLLSNEIASIISNLAKKNDMRTAQYDLASE
VLSQAKLVKSLEDELLIQPAHRWGDKKKLKKHRRKMDELGIEIHEREEMLYDRSNRHWET
FLSLIKVLNHFGCLDDLNPTEIGRSIGSLRGENELWLGLALMSGHLDELTPTELAGVVQS
IATEVNRPDLWSGFIPSAIADEAFNDLSNIRRELFRVQERFGIEIPILWSSELMGLVEAW
ARGSTWTDLISNTSLDEGDVVRILRRTNDLLSQIPYCEAVSRQLRNNAKAAMKLMDRFPV
CEAEDINQAKEINHELTNPATERHN
NT seq
2778 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattcatcagaaagagatacgtctgaaaacgaaatcctccaaaacaatttaaatcca
gaggagatctttccttttgcattggatgaatttcaacttaaagcaattgattcactcaat
caaggacactctgtagttgtcagtgcccctacaggatcaggaaaaacactaataggtgag
tatgcaatttatagagcgatttctcatggaagtaaggtgttttatacaacgcctttaaaa
gctttatctaaccaaaagctaagagactttagaaatcaatttggttcaaacaatgtgggt
cttttaacaggtgatttaagcctgaatagagaggcttcgattcttgttatgactactgaa
atttttagaaatatgctttatgcagcagcagatagaaatgatgaccctttacttgatata
gaaactgttgttcttgatgaatgccattacatgaatgatgcgcatagagggacagtgtgg
gaggaatcaattattcattgccctaaatcaattcagttcgttgctctatcggcaaccgtt
gccaatgcaggtcaattaactgattggattgagcaagttcatggacctacagatttgata
tctagtgatttaagaccagttcccctggaattcaatttttgtagtgccaaaggacttcat
ccattactcaatgataaaggaactggattacatccaaactgtaaaatttggcgcccaata
aaatcacataagaagagaggacgtttatccaagcctactcaacctgaatctccttcactg
ggctttgtgatatcgaagctggcagaaagaaatatgttacccgccatttatttcatattt
agtcgtcgtggctgtgacaaggctgtgaaaacaatagctaacacttgtttagtcaaccaa
gaagaaagaaaattaattcaagatcgatttgaaaaatttataattttaaattcagaaggt
ttgagagatgatttacacataaaagctttatttaatgggatcggatctcatcatgcagga
gttcttcctgcctggaaggagttgattgaggaattatttcaagaaggattgataaaggtt
gtttttgcaactgaaaccttagctgcaggaatcaatatgccggctagaagtacaattata
tctactttatcgaagagatcagataatggacatcgtcaattaatggggagtgaattcttg
caaatggctggtagggccggaagaagaggccttgactctagaggctatgtagtcacttta
cagactcgattcgaaggggttcgagaagctggtcaattggctacaagcccagccgatcca
cttattagtcaattcacacccagctatggcatggtgctgaatctattacagcgttatgac
ttagataaatcaaaagaattgatagagagaagctttagtagatacttggcgagcttggat
ttagttgaagaagaagaagagttatctagattaaaagaggagtttaaagagtataaaact
ttttcagaagacataccatggtccgattttgagagatatgagaaaataaaaagtcatctc
aaggaagaaagaagattattaaaaatcctgcaaaaacaatcagcagaaaccttatctaat
gaattgatcttagccttagaatttgcaaataatggaaccctcataagtctgaagacatca
caattgcgaggaaaagttacacctgcagtcattattcagaaaattcaaaaaggagataga
caagctcaattgttatgcttaacagatgaaaatatttggatactcattgcttgtaaggaa
gttgttagtctttatgctgatttgacttgcttagacgtatcacatatcacgactcctaaa
attagtagaattggagagatacatcatggtgatttactaagcaatgaaatagcttcaata
atctcgaatttggctaagaaaaatgacatgagaacagctcaatatgatcttgctagtgaa
gttttatctcaagctaaattagttaaatctctggaggatgaattattgatacagccagct
catcgatggggggataagaaaaaattaaagaaacatagacgaaaaatggacgaactgggt
attgaaatacatgaacgtgaggagatgctctacgacaggtcaaatcgtcactgggaaact
ttcttatcactaattaaagtactaaaccacttcggatgcttggacgatttaaaccctaca
gagatcggcaggagtattggatccttaagaggtgaaaatgagttatggttgggcttggct
ttgatgagtggacatcttgatgaactaacaccaacagaattagctggagttgttcagtca
attgcgacagaagtcaatcgccctgatctatggtctggatttattccaagtgcaattgcg
gacgaagcatttaatgatttatcaaatattcgaagagaattgtttagagttcaagaacga
tttggtatagaaatccctatcttatggagttcagagttaatgggcttagtagaagcatgg
gctagaggaagtacttggactgatctaatttcaaatacttcgttagatgagggagatgtt
gtaagaattctaagaaggacaaatgatttactttcacagattccctattgcgaggctgtg
agtagacaacttagaaataatgctaaggcagcgatgaaactaatggatagattcccagtt
tgtgaagctgaagatattaatcaagcaaaagaaataaatcatgaacttactaatccagcg
actgaaagacataattga
DBGET
integrated database retrieval system