KEGG   Polaribacter reichenbachii: BW723_16575
Entry
BW723_16575       CDS       T04692                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
  KO
K02337  DNA polymerase III subunit alpha [EC:2.7.7.7]
Organism
prn  Polaribacter reichenbachii
Pathway
prn03030  DNA replication
prn03430  Mismatch repair
prn03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:prn00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    BW723_16575
   03430 Mismatch repair
    BW723_16575
   03440 Homologous recombination
    BW723_16575
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:prn03032]
    BW723_16575
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:prn03400]
    BW723_16575
Enzymes [BR:prn01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     BW723_16575
DNA replication proteins [BR:prn03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     BW723_16575
DNA repair and recombination proteins [BR:prn03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     BW723_16575
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha DNA_pol3_finger HHH_6 PHP
Other DBs
NCBI-ProteinID: APZ47812
UniProt: A0A1B8TRI0
LinkDB
Position
complement(3885004..3887961)
AA seq 985 aa
MYLNCHTYYSLRFGTFSEIELLQLAEENNINCIALTDINNTSACLNFVQQSKKFNIKPVI
GVDFRNGNSQQFVALAKNNIGFQNINSYLSSFLESKTKIPDQPKFLENVYIIYPFEKALE
MHLTSLAENEFIGVSIAEINKLKFSYLKKFSDKIVIQQQVTIRNKRDFNAHRLLRAIDKN
TLLSKLSTYEQCLTTDTMHSLKELKIFFKEFPNIIKNTTTLLQQCKIQFGFDITRENQNL
QLYYNSFKEDCNKLQQLCNNNINKRYKNATPQVYARLEKELKVIIDLKFVSFFLINYDIV
QYANRNNFFHVGRGSGANSIVAYIIGITDVDPIELDLYFERFINPFRASPPDFDIDFSWK
DRNAVTQYIFNRFDNVALLATYVTFKYKAVVRELGKVFGLPKEEIDKLSKGKLQTDIDDI
AKLVLKYGKLIEGFPNYVSVHSAGILILDKPIHFYSATNLPPKGFSTVQFDMNIADDVGI
FKFDILGQRGLAKIKDALEIIKENNPNHPKINITDIERFKKDKNINNLLKTGGAIGAYYV
ESPAMRGLMQKLQTQDYLGLVAASSIIRPGVSSSGMKDEFIKRQRYPEKRKEAHPILLQI
MPETYGVMVYQEDVMKVANQFADLTLGEADVLRRGMSGKYRSLSEFKAVEDKFIANCRNK
GFKDDLIFEVWNQIKSFAGYAFAKGHSASYAVESYQSLFLKCYYPIEFMVAVLNNGGGFY
SAEHYIHEAKMRGAIVELPCINKSDHANAVKGITIYLGFGYLKNLENLLIQNILTERQLN
GLFSSLDDFIDRISISIEQLSILIRINAFRFTNKPKTELLWQATFKVNATKKQQVHQQVK
LFRLQHQKFTIPKLSSHWLESVYDEIELLGFTIQNYFSLVTEKYYKHINANQMIDYSDKN
VLLYGKLVTTRYNKTSQGKLMRLSTFIDIEGNYFDAVHFTNVVHQYPINGMGVYACYGKI
TNRFGFCSMNVIKSKKMSIAIDPRN
NT seq 2958 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtatctaaattgtcatacatattattcattacgttttggtacgttctcagaaattgag
ttgttacaattagctgaagagaacaatattaattgtattgctctaacagatataaataat
acttctgcttgtttaaactttgtacaacagtcaaaaaagtttaatataaaaccagttatt
ggtgtagatttcagaaatggtaacagtcagcaatttgttgcattggctaaaaacaatatt
ggttttcagaatattaatagttatttgtcttcttttttagaatcgaaaactaagatccca
gatcaaccaaagtttttagaaaatgtttatatcatatatccttttgaaaaagcactggaa
atgcatttaacttctttagctgaaaatgaatttataggtgtttctattgcagaaattaac
aagcttaaattttcttatttaaaaaagttttcagataaaatagtaattcaacagcaagtt
accattcgtaataaaagagattttaatgcgcatcgtttgttgcgtgccatagataaaaat
actttattaagtaagctttctacttatgaacaatgtttaacaacagatacaatgcattct
ttaaaagaattgaaaatattttttaaagaatttcctaatatcattaaaaacacaacaaca
cttttgcaacaatgtaaaattcaatttggatttgatataacacgtgaaaatcagaattta
caattgtattacaacagttttaaagaagattgcaataagctacaacaactttgcaacaac
aacattaataaaagatataagaatgcaacaccacaagtttatgctcgcttagaaaaagaa
ttaaaagttataatagatttaaaatttgtttctttttttttaatcaattatgatattgta
caatatgcgaatagaaataatttctttcacgttggtagaggaagtggagcgaatagtatt
gtggcttatattattggtattacagatgtagatcctattgaattggatttatatttcgaa
cgttttatcaatccttttagagcttctccaccagattttgatattgatttttcttggaaa
gatagaaatgctgttactcaatacatttttaatcgttttgataatgttgcacttttagcc
acctacgtaacttttaaatacaaagctgttgttcgagaattaggtaaggtttttggttta
cctaaagaagaaattgataagttgagcaaaggcaaattacaaacagatatagatgatatt
gctaaactggttttaaaatacggaaaactaattgaaggtttccctaattatgtaagcgta
cattctgcaggaatcttaatcttagataaacctattcatttttattctgctactaattta
cctccaaaaggtttctctactgttcaatttgatatgaatattgctgatgatgtaggtatt
tttaaatttgatattttaggacaacgtggattagcaaaaatcaaagatgctttagagatt
attaaagagaataatcctaaccaccccaaaattaacattacagatattgagcgttttaag
aaagataaaaatatcaataaccttttaaaaactggtggtgcaattggtgcttattatgta
gaatctcctgcaatgcgtggtttaatgcaaaaattacaaactcaagattatttaggtttg
gttgctgcaagttctattattagaccaggagtttctagttctggtatgaaagatgaattt
attaaaaggcaacgttatccagaaaaaagaaaagaagcgcatcctattttattacaaatt
atgccagaaacttatggagtaatggtttatcaagaagatgtaatgaaagtagctaatcaa
tttgcagatttaactttaggggaagctgatgttttacgaagaggaatgagtggtaaatat
aggtcgctgtcagaatttaaagcggttgaagataaatttatagcaaattgtagaaataaa
ggttttaaagatgatttaatttttgaagtttggaatcaaattaaaagttttgctggctat
gcatttgcaaaagggcattctgcttcttatgcagtagaaagctatcaaagtttattttta
aaatgctattacccaattgaatttatggttgctgttttaaataatggaggtggtttttat
tctgctgaacattatattcacgaagcaaaaatgcgaggtgcaattgtagaattaccttgt
ataaataagagtgatcacgctaatgctgtaaaaggtataaccatctatttaggttttgga
tatttaaaaaacttagaaaatttattaattcaaaatattttaactgaacgtcagttaaat
ggtttgttttcttctttagatgattttattgatcgcatatcaatttcaatagaacagctt
tctatcttaattcggattaatgcttttcgttttaccaataaacccaaaacagaattactt
tggcaagctacctttaaagtgaatgcaacaaaaaaacaacaagtacatcaacaagtaaag
ttattccgtttgcaacatcaaaagtttacgattcctaaattaagttctcattggctagag
agtgtttatgatgaaatagaattgttaggatttacaattcagaattatttttctttggtt
acagaaaaatattacaaacatattaatgcaaatcaaatgattgattattctgataaaaac
gtattgctatatggcaaattagttactaccagatacaataaaacttcacaaggaaaatta
atgcgtttaagcacctttattgatattgaaggtaattattttgatgcagtccactttact
aatgttgtgcatcaatacccaataaacggaatgggggtttatgcttgttatggtaaaatt
acaaatcgatttggcttttgtagtatgaacgttattaaatctaaaaaaatgagtattgca
attgatcccagaaattga

DBGET integrated database retrieval system