Polaribacter reichenbachii: BW723_17335
Help
Entry
BW723_17335 CDS
T04692
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
prn
Polaribacter reichenbachii
Pathway
prn02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prn00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
BW723_17335
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
pAdhesive_15
SdrD_B
CarboxypepD_reg
CarbopepD_reg_2
Por_Secre_tail
SpaA
EMC7_beta-sandw
Y_Y_Y
CADH_Y-type_LIR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APZ47951
LinkDB
All DBs
Position
4057661..4067329
Genome browser
AA seq
3222 aa
AA seq
DB search
MKKQITLYQTKKLNPYLNLRRFKNLLVLVILFTSLGFYAQSQNSISDDSQGKMSIRQNAQ
SSAKSNTKFAVEDLSIINSYTNRTGVCSPETSLIITEDSSWGISRSTINNSGVPSFCLSL
NDDAPDVDDIYNTTLTPSTDISFANNNYTTNQILDKVQRTLAVMTHSSYAPSSQPSSLTD
NFHRAIAVTVWHWTNNLDTSNYNYTWTGNSGNTYSVSNLINWVNNGTLQPSEVFWLLPEN
NSNQPEVLLNENTSSDCCPTPPSITTSVSAATSGNNGKITLDSNSGGLYYGISSANAGSY
NGPTTIVTATEIPGSLPSTILSTGASTGGTYIVRVFTNIDGCYTDYTVTIPPNTGQSCTS
VYATYQSDQNNVNGRNNVSGAADGNYAEIHSSNQQLILDFNQIFPAGTEYKITWKKKSGA
SGTAYIDLSESTSSNSGFTNHPTSPSTSSTSFITTTVTSNSAFRYLAFDKGNINNTDYDL
DAVEVSVCVSCDVADNTTTTASITESETKTLTGSPSGGTWSVVSGGGAINGTTYTPDDVN
TNTTVTLRYTIAADGSCAATTDDVTFNVTSLNCDRTSPTAPALDFNIFTLNSLSLQTNET
EGSVATGGDLTVLGNYQVAINNPGTFQVNNTPIGLLVGGKINYQSGNSLQVNSNSYVKIG
NGQGSNVWYTDQNNAYSNIRITPSTNYNSTPRIDLQTNANNLNVSATNNPVFESNLIDFT
SAFQTLQANSITLSQNANNAQLTNANGQSISNTSLPNQIKINLQDGINYLNVTGTDLNNV
DVITFNNAPSASKVLVVNVNASGTFNWDVWNQSAISQQNAPYIIYNFYNATTLNIVGNPT
IVGSVFAPFANINKTVNQSNLEGQVIGLSFNHAGGQVHTANFTPALINCAEVSCDVADNT
TSTTSITEGETKTLSGSPAGGTWSIISGGGSISGNTYTPDDINTDTTVVIRYTIAADGDC
AATTDDVTFTVTPVCDVVADNTTSTASITEDETKTLTGAPNGGTWSIVSGGGTISGTTYT
PDDINTDTTVVIRYTIAADGDCAATTDDVTFTVTPVCNVVADNTTSTASITEDETKTLSG
APAGGTWSIVSGGGTINGTTYTPDNINTNTTIVIRYTIAADGDCAATSDDVTFTVTPVCD
VVADNTTSTASITEDETKTLSGAPAGGTWSIVSGGGTINGTTYTPDNINTNTTIVIRYTI
AADGDCAATSDDVTFTVTPVCNVVADNTTSTASITEDETKTLSGAPAGGTWSIVSGGGSI
SGSTYTPDDINTDTTVVIRYTIAADGDCAATTDDVTFTVTPVCDVVADNNTSTASITEDE
TKTLSGAPAGGTWSIVSGGGTINGTTYTPDNINTNTTIVIRYTIAADGDCAATSDDVTFT
VTPVCDVVADNTTSTASITEDETKTLSGAPVGGTWSIVSGGGTINGSTYTPDDINTDATV
VIRYTIAADGDCAATSDDVTFTVTPVCDVVADNTTSTASITEDETKTLTGAPTGGTWSIV
SGGGSISGTTYTPDDINTDTTVVIRYTIAADGDCAATTDDVTFTVTPVCDVVADNTTSTA
SITENETKTLSGAPAGGTWSIVSGGGSISGTTYTPDDINTDTTVEIRYTIAADGDCAATS
DDVTFTVTPVCDVVADNTTSTASITEDETKTLTGAPTGGTWSIVSGGGSISGTTYTPDDI
NTDTTVVIRYTIAADGDCAATTDDVTFTVTPVCDVVADNTTSTASITENETKTLSGAPAG
GTWSIVSGGGSISGTTYTPDDINTDTTVVIRYTIAADGDCAATTDDVTFTVTPVCDVVAD
NTTSTASITESETKTLSGSPAGGTFSIVSGGGSISGTTYTPDDINTDTTVVIRYTIAADG
DCAATTDDVTFTVTPVCDVVADNTTSTASITEDETKTLSGAPAGGTWSIVSGGGSISGTT
YTPDDINTDTTVVIRYTIAADGDCAATTDDVTFTVTPVCDVVANNTTSNASITEDETKTL
SGAPAGGTWSIVSGGGSISGSTYTPDDINTDTTVVIRYTIAADGDCAATTDDVTFTITSV
CDVVADNTISTASITEDETKTLSGAPVGGTWSIVSGGGSISGTTYTPDDINTDTTVVIRY
TIAADGDCAATSDDVTFTVSPVCNNPVNTVPGTQTISENTVRHSISGISVTDPDSDIAKV
RLTVSNGTLGVIVRVSNNSPVTFNGPGDITITGTERVINSYLRTLVYSPNSGFYGTDILT
MTSMDNCITSLSDIDTIDIIVTQVCETADNTTSTASITEDETKTLSGSPAGGTWSIVSGG
GSITGTTYTPDDINNDTTVVIRYTIAENGSCAATTDDVTFTVTPVCDVVADNTTSTASIT
EDETKTLSGAPTGGTWSIVSGGGSISGTTYTPDDINTDTTVVIRYTIAADGDCAATSDDV
TFTVTPLLGSIGDTVWYDANSDGSLLGENGLQGATVTLDPGTPGDASDDVTTTTDVNGNY
LFDDLDAGDYTVTVDVSTVTGGLPTGVTIADLVQTYDNDGTGSANTSDVTLASGENNLDQ
DFGYVGDNGLGSIGDTVWYDTDGDGIKDASEAGLGGATVTLDPGTPGDASDDVTTITDAN
GNYLFDNLPAGTYTVSVDVSTVTSGIPAGKTPADLVQTYDDDSVGTPNNSTINLAQGEDN
LDQDFAYIVPTGGTSGGNSGGVESESLGDAISKIYVGRKKNSVPTQFVKSSENLFNKAKL
KSKQPYQGKGQTMLDMFPAQLYAGNVANVTSPTDILDYTIADEVLSVDFSLNGETKGVVL
GIKTSDKIYNHTKASCDRLRGAEILNIQKVQIQGYNFLMQGIKQRSGEIEYAISFATAKN
NNDANYTIQTNWYVNNYTKFNDVYNFQVWSTRPADTQKLVADILNNLKTYIPVAQTEVQK
FPETYASKIYRDKGELVVALRSTEEGNTADISMVELYSETANNIKHRYNTVSTEIQQSLR
VDIADGYEYDALIKVEDEVEDAFYHADGNWGLDYDSRYTEIKNYFVWNDFDREYQDDEYT
INRSVELQATSDYDYLTVYKSLLPGTLSADYSEYNYVAFTAKGSGLMELGLLKSSIEDWT
AQYKVMVDLSEEEQTYYVPFDVFTSSATQEKLTAEDLTMLTFTFLPVEANTTELDLEISD
VKFTKIANEDQIIEKIETFENEFMAYPNPSKGNVNLLLFSETDTEATVTLSDVTGKVIYK
GKTQLNAGKNELEYNFKVKTGVMLLQVTSPETDYGTSKIIFR
NT seq
9669 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacaaattactctttatcaaaccaaaaagcttaacccttatcttaatttaagg
cgttttaagaatttattagttcttgtaattttatttacttctttaggtttctatgctcaa
agtcaaaatagtatatccgatgattctcaaggtaaaatgagtatacgtcagaatgcacaa
tcgagcgctaagtcaaatactaaatttgctgtagaagatttatctataattaactcatat
acaaatagaactggtgtatgttctcctgaaacttctttaattattacagaagatagtagt
tggggaatttcgagatctactattaataatagtggtgtcccttctttttgtttaagctta
aatgatgatgctccagatgttgatgatatttataatactaccttaacacctagtacagat
attagttttgctaataataattatacaactaatcaaattttagataaagtacaacgtact
ctggctgtaatgacacattcaagttatgctccaagttcacaaccttcatctcttacagat
aattttcatagagcaattgcagtaacagtttggcattggacaaacaatttagacacaagt
aactataattacacttggactggtaatagtggtaatacttactctgtaagtaacctaata
aactgggtaaacaacggaacattacaaccttctgaggttttttggttattaccagaaaat
aacagtaatcaacctgaagtattattaaacgaaaatacttcttcagactgttgtcctact
cctccttctattactactagtgttagcgctgctacttctggtaataatgggaaaattaca
ttagattcaaattctggcggtttatattatggaataagttcagcaaatgcaggaagctat
aatggaccaacaactattgtaactgccactgaaatcccaggttcattaccatcaacaatt
ttatcaactggcgcatcaactggtggtacatatattgttagagtgtttacaaatatagat
ggttgttatacagattatacagttacaattcctccaaatacagggcaaagttgtacatct
gtttatgcaacatatcaaagtgatcaaaataatgtaaacggaagaaataatgtttcaggt
gctgcagatggtaattatgcagaaatacatagcagtaatcaacaattaattttagatttt
aatcagattttccctgctggaactgaatacaaaattacttggaaaaagaaaagtggagca
agtggaactgcatatattgatttatctgaatctacttcttctaactctggttttacaaat
catccaacctcacctagtacttcatctactagttttataacaactactgtaacatcaaat
tctgcttttagatatttagcttttgataaaggaaatataaacaatacagattacgattta
gatgctgtagaagtaagtgtttgtgttagttgcgatgttgctgataacacaacaacaaca
gcttcaattacagaaagcgaaacaaaaactttaactggttcaccttcaggtggtacttgg
tctgttgtttctggtggtggtgctattaatggcactacatatactccagacgatgtaaat
actaatacaacagtaaccttaagatatacaattgctgctgatggatcttgtgctgcaaca
actgacgatgttacttttaatgtaactagtttaaattgtgataggactagccctacagca
cctgcattagattttaatatttttactttaaacagtttaagtttacaaacaaacgaaaca
gaaggtagcgttgctactggaggagatttaactgttttaggtaactaccaagttgcaatt
aataacccaggtacttttcaagttaacaatactcctattggtttattagttggtggtaaa
ataaattatcaatctggtaattctttacaagtaaatagtaatagctatgttaaaattggt
aatggccaaggatctaatgtttggtatacagatcaaaataacgcatattcaaatataaga
ataacaccaagtactaattacaattctacacctagaattgacttacaaactaacgcgaat
aatttaaatgtttcagctacaaataaccctgtatttgaaagtaatttaatagactttaca
agtgcatttcaaacactacaagccaattctataacattgtctcaaaatgcgaataatgct
caattaactaatgctaatgggcaatctatttctaatacttctttaccaaatcaaataaaa
attaatttacaagatggtattaactatttaaatgttactggtacagatttaaacaatgtt
gatgttattacgtttaacaatgcaccaagtgcttctaaagttttagtagttaacgtaaat
gcatctggaacttttaactgggatgtttggaatcaatctgctatttctcagcaaaatgca
ccttatattatttacaatttttataacgcaacaacgcttaatattgtaggtaacccaacc
attgttggttcagtttttgctccttttgcaaatattaataaaactgttaatcaatctaat
ttagaaggtcaagtaattggtttatcttttaatcatgcaggtggacaagttcacactgct
aatttcacacctgctttaatcaattgtgctgaagtatcttgtgatgtagctgacaatact
acatctacaacttcaatcacagaaggtgaaactaaaacactttcaggttcacctgctggt
ggtacttggtctatcatttctggtggtggttctatctctggtaatacatatactccagat
gatatcaacactgatacaactgttgtaattcgttatacaattgctgcggatggtgactgt
gctgctacaactgatgatgttacttttacagtgactcctgtgtgtgatgtagttgctgat
aatacaacgtctacggcttctatcactgaagatgaaacaaaaactttaactggtgctcca
aatggtggtacttggtctatcgtttctggtggtggtactatttctggaacaacttatacg
cctgatgatatcaatacggatactactgtagtgattcgttatacaattgctgcggatggt
gactgtgctgctacaactgatgatgttacttttacagtgactcctgtttgtaatgtagtt
gctgataatacaacatcaacagcttctataacagaagacgaaactaaaacactttcaggt
gcgcctgctggtggtacttggtcaatcgtgtctggtggtggaactatcaacggaacaact
tatactccagataatatcaacacaaatacaactattgtaattcgttatactattgctgcg
gatggtgactgtgctgcgacttctgatgatgttacgtttacagtaactccagtgtgtgat
gtagttgctgataatacaacatcaacagcttctataacagaagacgaaactaaaacactt
tcaggtgcgcctgctggtggtacttggtcaatcgtgtctggtggtggaactatcaacgga
acaacttatactccagataatatcaacacaaatacaactattgtaattcgttatactatt
gctgcggatggtgattgtgctgcgacttctgatgatgtgacttttacggttactcctgtt
tgtaatgtagttgctgataacactacttctactgcttcaattacagaagacgaaactaaa
acactttcaggtgcgcctgctggtggaacttggtcaatcgtgtctggtggtggttctatt
tcaggttcaacttatactccagatgatatcaacacggatacaactgttgtaattcgttat
acaattgctgcggatggtgactgtgctgctacaactgatgatgttacttttacggttact
ccggtttgtgatgtagttgcggataacaatacgtctactgcttctattacggaagacgaa
actaaaacactttcaggtgcgcctgctggtggtacttggtcaatcgtgtctggtggtgga
actatcaacggaacaacttatactccagataatatcaacacaaatacaactattgtaatt
cgttatactattgctgcggatggtgactgtgctgctacttctgatgatgttacttttaca
gtaactccagtttgtgatgtagttgctgataatacaacatcaacagcttctataacagaa
gacgaaactaaaacactttcaggtgcgcctgttggtggaacttggtcaatcgtgtctggt
ggtggaactattaacggttcaacatatactccagatgatatcaacactgatgctactgtg
gtaattcgttatacaattgctgctgatggggactgtgctgcaacttctgatgatgttacg
tttactgttactcctgtatgtgatgtagttgctgataatacaacatctactgcttctatc
actgaagatgaaacaaaaactttaacaggtgctcctactggtggtacttggtctatcgta
tctggtggtggttctatttctggaacaacttatactccagatgatatcaatactgataca
actgtagtgattcgttatacaattgctgcggatggtgactgtgctgcaaccactgatgat
gttacttttacagtaactccagtttgtgatgtagttgctgataatacaacttctactgct
tcaataacagaaaatgaaactaaaacgctttcaggtgcgcctgctggtggtacttggtca
atcgtatctggtggtggttctatttcaggaacaacatatactccagatgatatcaatact
gatacaactgtagagattcgttatacaatcgctgctgatggggactgtgctgcaacttct
gatgatgttacatttactgttactcctgtatgtgatgtagttgctgataatacaacatct
actgcttctatcactgaagatgaaacaaaaactttaacaggtgctcctactggtggtact
tggtctatcgtatctggtggtggttctatttctggaacaacttatactccagatgatatc
aatactgatacaactgtagtgattcgttatacaattgctgcggatggtgactgtgctgca
accactgatgatgttacttttacagtaactccagtttgtgatgtagttgctgataataca
acttctactgcttcaataacagaaaatgaaactaaaacgctttcaggtgcgcctgctggt
ggtacttggtcaatcgtatctggtggtggttctatttcaggaacaacatatactccagat
gatatcaatactgatacaactgtagtgattcgttatacaattgctgcggatggtgactgt
gctgcaaccactgatgatgttacttttacagtaactccagtttgtgatgtagttgctgat
aatacaacttctactgcttcaattacggaaagtgaaacgaaaactttaagcggttctcct
gctggtggaacgttctctatcgtttctggtggtggttctatttctggaacaacttatact
ccagatgatatcaatactgatactactgtcgtgattcgttatacaattgctgctgatggt
gactgtgctgctacaactgatgatgttacttttacagtaactcctgtttgtgatgtagtt
gcggataatacaacatcaacagcttctataacagaagatgaaacgaaaacactttcaggt
gcgcctgctggaggtacttggtcaatcgtatctggtggtggttctatttctggaacaaca
tatactccagatgatatcaatactgatacaactgttgtaattcgttatacaattgctgcg
gatggtgattgtgctgcgacaactgatgatgttacttttacagtaactcctgtttgtgat
gtagttgcgaataatactacttctaatgcttcaatcacggaagacgaaactaaaacactt
tcaggtgcgcctgctggtggtacttggtcaatcgtgtctggtggtggttctatttcaggt
tcaacttatactccagatgatatcaatacggatacaactgttgtaattcgctatacaatt
gctgcggatggtgactgtgctgctacaactgatgatgttacttttacaataacttctgtt
tgtgatgtagttgctgataacactatttctactgcttcaataacagaagacgaaactaaa
acactttcaggtgcgcctgttggtggaacttggtctatcgtatctggtggtggttctatt
tctggaacaacttatactcctgatgatatcaatactgatactactgtcgtgattcgttat
acaattgctgcggatggtgactgtgctgctacttctgatgatgtaacgtttacggtttct
ccagtttgtaacaacccagtaaatacagtgccaggaactcaaacaatatctgaaaatact
gtaagacatagtattagcggtataagtgttacagaccctgattctgatatcgctaaagta
aggttaacagtatctaatggaactttaggagttattgtaagagttagcaataacagtcct
gttacatttaatggccctggagatattacaattacaggtacagaaagagtaataaattct
tacttaagaaccttagtttatagtccaaattcaggtttttatggtacagacattttaact
atgacatctatggataattgtattacttctttaagtgatattgatacaattgatattata
gttacacaagtttgtgaaactgctgataatacaacatcaacagcttctataacagaagat
gaaactaaaacgctttcaggttcgcctgctggtggtacttggtctatcgtgtctggtggt
ggttctattactggaacaacatatactccagatgatatcaataatgatactactgttgta
attcgttatacaattgctgaaaatggttcttgtgctgcaaccactgatgatgttactttt
acagtaactccagtgtgtgatgtagttgcggataacacaacttctactgcttcaattaca
gaagacgaaactaaaacactttcaggtgctcctactggtggtacttggtctatcgtatct
ggtggtggttctatttctggaacaacatatactccagatgatatcaatactgatacaact
gttgtaattcgttatacaattgctgcggatggtgattgtgctgctacttctgatgatgta
acttttacggttactccattattaggaagtattggtgatactgtttggtatgatgcaaat
agtgatggttctttacttggtgaaaatggtttacaaggagcaactgtaactttagaccca
ggaactcctggagatgcaagtgatgatgtaaccactacaacagatgtaaatggtaactat
ttatttgatgatttggatgcaggagattacacagtaactgtagatgtaagcacagtaact
ggtggtttacctacaggagtaacaattgcagatttagtacaaacttatgataatgacgga
acaggttctgccaatacaagtgatgtaactttagcttctggagaaaataacttagaccaa
gactttggttatgttggtgataatggtttaggttctataggagatacagtttggtatgat
acagatggagatggaattaaagatgcaagcgaagctggtttaggtggtgcaactgtaact
ttagatccaggaactcctggtgatgctagtgatgatgtaactacaattacagatgcaaat
ggtaattatttattcgataatttaccagctggaacttacactgtttctgttgatgttagt
actgtaacttctggtatccctgcaggtaaaactccagctgatttagtacaaacttatgat
gatgatagtgttggtactccaaacaatagtaccattaacttagcacaaggtgaagataac
ttagatcaagattttgcatatatcgtgccaacaggtggaacttctggaggaaactctggt
ggtgttgaatctgaatctttaggtgatgcaatctctaaaatctacgtaggtagaaaaaag
aattctgtaccaactcaatttgtaaaatcaagtgaaaacttatttaacaaagcaaaatta
aaatcaaaacaaccttaccaaggtaaaggacaaacaatgttagatatgttcccagcgcaa
ttatatgctggtaatgtagcaaacgttacttcgcctacagatatcttagattacacaatt
gctgatgaagtattgtctgtagatttctctttaaatggtgaaacaaaaggtgttgtttta
ggaattaaaacttctgataaaatttataatcacactaaagcgtcttgtgatcgtttaaga
ggtgctgagattttaaacattcagaaagtacaaattcaagggtataatttcttaatgcaa
ggtatcaaacaaagaagtggtgagatagaatatgcaatctcttttgcaactgctaagaat
aataacgatgcaaattataccattcaaacgaactggtatgttaacaattatactaagttt
aatgatgtgtataacttccaagtatggtctacaagaccagctgatactcagaagttagtt
gctgatattttaaacaacttaaaaacttatattcctgttgcacaaacagaagtacagaag
tttccagaaacgtatgcttctaaaatttacagagataaaggagaattagttgtagcatta
agaagtacagaagaaggtaatactgcagatatttctatggttgaattgtattctgaaact
gcaaataacatcaaacacagatataatactgtaagtacagaaattcaacagagtttaaga
gttgatattgcagatggttatgagtatgatgctttaattaaagttgaagatgaagttgaa
gatgcattctatcacgcagatggtaactggggattagattatgattctagatacacagaa
atcaagaactactttgtttggaatgattttgatagagaatatcaagatgatgaatataca
atcaacagaagtgtagagttacaagcaacaagtgattatgattacttaacagtatacaaa
tcattattacctggtactttatcagcagattattctgagtacaattatgtagcctttaca
gctaaaggatctggattaatggaattaggtttactaaaatcatcaatcgaagattggaca
gctcaatataaagtaatggtagatttatctgaagaagagcaaacatactatgttcctttt
gatgtatttacatcaagcgcaactcaagaaaaattaactgcagaagatttaacaatgtta
acctttacttttttacctgttgaagcaaacacaactgaattagatttagaaatctctgat
gtgaagtttacgaagattgcaaacgaagatcaaatcatcgaaaaaatcgaaacttttgaa
aatgagtttatggcttaccctaacccatcaaaaggaaatgtaaacttattgttattcagt
gaaactgatacagaagctacagtaactttatctgatgtaacaggtaaagtaatttacaaa
ggtaaaactcagttaaacgctggtaaaaacgaattagagtataactttaaagtaaaaaca
ggcgttatgttattacaagtaacatcaccagaaactgattatggaacatctaaaattatt
tttagatag
DBGET
integrated database retrieval system