Prevotella sp. oral taxon 299: HMPREF0669_01942 Help Entry HMPREF0669_01942  CDS       T02809                                  Name (GenBank) YD repeat (two copies) Organism pro  Prevotella sp. oral taxon 299 SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  RHS_repeat TEN_YD-shell FG-GAP_3 SpvB FG-GAP RHS Amelogenin Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AGT63928 LinkDB All DBs Position unnamed:171519..176816 Genome browser AA seq 1765 aa AA seqDB search MKKNLLQALLFTVVAGLASTISANASNDSIKIIANQKPILLGRIYDEIHIDPDKPFEPGD PIRPVHPIDPEKPILPIEPGEPIFPNHPDKLIVPIPPTSTSSTYDVGTPKGALSVNNSGA AVYSIDISAPNGGSLTPSIGVSYNSQSGNGLAGFGFNITGLSCITRGCKDLYHDKQIAGT SYGISDALFLNGQRLILKTGTYGYNGSTYTPEGDPYTIVTLHNNINTSACWFSVVCADGK TYQLGNTSNSRLSFVNRKSKECIAAWYINQTTDVHSNLVKYYYITTHYNLRPVRIEYGLN TAKSRGITNLILFRYSALPDSYARPFAIGDRQGKMNVYLSMIITQTNGSVFRTYTFTYNS TSDGTKDKYYRLTQVDLANGAGRKVAPIKINWDYLPSLDIYNTNLDVETNSPSSMIEESA KTFIAVDVNNDGISDIIRLSPGAYVQRYYGGEEREGKTFLFVSLSKKDPYGNVYYQTPKQ FDLNPSYSMDDLNNVIGGIQAMDFDGDGYNDLIIPYYCGDKSNYDERYTIVWGKSLVNGG GFREITSRMVNCDHTPLFTTYDSNGDGRDDLFYLEDRAKDGYYNGAILRYKDRNNLDPTK FQFKLDSDPKKLFVGDYNHDGLTDIIVFYDGGYKIYYNNGGELSSTKYTEYNSKKGTNLG DKHRIVQGDFDGDGITDFAFFQDDWKYGLAINNGDGTFTVNNEAITLSATDQNTYQDNDR FNMVAYDFDHDGKCDFVITKAHYASFYMYEKYDCTKTLFVRSTGTGFELHKEYVTHQEKD AEPNNIFLGDFTGDGDVQYASFGKNLLVDNDKSDDKIHTYRSGYNLVSKGKISSITDGFG LRTFIHYKSATEPSVYTQTDSHSSAYPVNSYTIPVPLVSEVIKGNGVAGSQFIQYQYGDL KLHVAGKGIVGFSSMTTENLTLGTKETTTVDKWDTDKWIPLQTTTTSTVGGNSSKIISYT TIANNINGQNYYAYTSRKSLTDLDGNTSETYTTYDTAKGVPTVEIVKNDGDNMYKKVVYN SYIQKMNQWMPLNVVKSQKHEDDSEVNSSTTTYTYNDKGEVIKVVANDGSTLPLTVNTTY DVYGNVLTSTQTGKGIVANTETNVYDASGRFVVKAYDSVSPRVTTYTYDLFGNVLTENDE TNKSHILTSKHVYDGWGTEISETNSFGITTTKEMGWGSNYDKKYFIRTSSTGKPWVAVWF DNAGHEVLQESVMQNTNAYSLATTYNSKGQKTKIEEKTGKLTLSETFNYDKRGRVTCDVK SSGKSSTFSYGNRSVTETTAGRSYTKVTDAWGNLVKSVDPVTQIDYVYSSTGKPAEITTN GATTYIKYDEVGNKIAVQSPDAGNINYEYAADGKVMKFTDARNITTTYTYDAEGRLASTK AGNTLITNTYGTSGNSINHLVKTTVNDNSVEYTHDELGRVITETRTVSGDGTYQFKYAYN ANNQLVQTTYPGNLVVKYTYDKYGNKTQTTANDKIVYQVDSYDGLETKTSFLNKYTTTVT LDSRGFKSDIVLKNGSTVLDQFKMNYDGATGNLLSRTRNSLSEETFGYDNLDRLVSVKVG TKEMMHIKYAENGNITFKTGIGQYYYDAERPHAVASVDNTDNLISTQACITQFNDLNKIS SLQENDKVMTIDYGPDLERCFSILKQGNMSLRKVTYMGDYEKVVANGVTREYYYLDGDVI VVRQNGTFQTYQSFKDNLGSILSVIDENGSKVFSAEYDAWGKQTVSINTIGLIRGYGGHE ERISLSMHIMQTINWYRLLILVTLL NT seq 5298 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaaaaagaatttacttcaagcactactttttactgtagtagcaggtttggcgagtaca atttctgcgaatgctagtaatgattctatcaaaataatagctaatcaaaaaccaatcctg ctagggcgaatatatgatgaaatccatatagatcctgataaaccatttgaaccaggagac cccattcgacctgttcatcctatcgatcctgaaaagccgatactacctattgaacctgga gagcctatttttcctaatcatcctgataaactaattgtaccaattccaccaacgtctacg tctagtacctatgatgttggtactcctaagggagcacttagtgtaaataattcaggagct gcagtttatagtattgatatatctgcacctaatggtggtagccttaccccttctatcggt gtaagttataatagtcagtcaggtaacggtttggccggttttggttttaacattactggt ttatcatgcattacacgtggttgcaaggatttgtatcatgataagcaaattgctggaact tcgtatggtataagtgatgccctatttctcaatggacaacgcttgatattgaaaacagga acttatggttataatggctctacgtatactcctgaaggcgatccttatacaatagtaacc ctccataataatatcaatacgagtgcatgttggttttctgttgtttgtgctgatggcaag acttatcagttaggtaacacaagcaattcacgtttgtcttttgtaaatagaaagagtaaa gaatgtattgctgcatggtatatcaatcaaactactgatgtacatagtaatttggtaaag tactattatataacaacgcattataaccttcgacctgttcgtatagagtatggtcttaat acagctaagagtcgcggtataaccaatttaattctctttagatacagtgctttgccagat tcgtacgctcgtccatttgctattggcgataggcaaggtaaaatgaatgtttatttgtct atgataataacgcagacgaatggttctgtttttcgcacttatacatttacctataatagt acgtctgacggaaccaaagataagtactatcgccttactcaagtagatttagctaatggg gcaggacgtaaggtagctccaattaaaattaattgggattatttgccttcattggatatt tataatacgaatttagacgtagagacaaattctccttctagcatgatcgaagagagtgcc aaaacgtttattgctgtagatgttaacaatgatggaataagtgatattatccgtttatca cctggtgcttatgtgcagcgctattatggtggtgaggaaagagaagggaagacattcctt tttgtcagtttaagcaagaaagatccttatggtaatgtgtattatcagacgccaaaacaa tttgatttgaatccatcatactctatggatgatttgaataatgttattggtggtattcaa gctatggacttcgatggtgacggttacaatgacttgattattccatattactgtggtgat aagagcaattatgatgaaaggtataccatcgtatggggtaagagtcttgtgaatggtggt ggcttcagggagattaccagtagaatggttaattgtgaccatactccactatttaccact tatgactcaaatggtgatggacgcgatgatttattctatttggaggatcgtgctaaggat ggctattacaatggtgccattcttcgttataaagatcgtaacaatttggatcctacaaaa tttcaattcaaattagatagtgatccaaagaagctttttgtaggtgattacaaccatgat ggtcttactgatatcattgtcttctacgatggaggttataagatttactacaataatggt ggtgaattatcttctacgaaatatacggaatataattcaaagaagggaaccaatcttggt gataagcatcgtattgtacaaggtgacttcgatggtgatggcataactgattttgccttc tttcaagatgactggaaatatggtctggccatcaataatggagatggtacgtttacggtc aataatgaagctattactttaagtgcaacggatcagaatacgtatcaagataatgatcgt tttaatatggtggcctacgattttgatcatgatggtaaatgtgactttgtgattaccaag gctcattacgcatctttttacatgtatgagaaatacgactgtactaaaactctttttgtt agatctacaggtactggattcgaattacacaaggaatatgttacacatcaggaaaaagat gctgaacctaataatatattcttaggcgactttactggtgatggtgatgtacaatatgct tcattcggcaaaaaccttcttgtagataatgataagtctgatgataagattcatacttat cgtagtggttataatttagtaagcaagggcaaaatttcttcaataacagacggttttggt ctgcggacttttattcattataagagtgcaacagaaccatctgtctatactcagactgat tctcattcttctgcttatcctgtaaatagttatactattcctgtaccattggtttctgaa gttattaagggtaatggtgttgccggttcacaattcatacaatatcaatatggcgatttg aagctacatgttgctggtaaaggtatagtaggtttttcttcaatgactactgagaatctt accttaggcactaaggaaacaactacagtagataaatgggatactgacaagtggatacct cttcagacaactaccacgtcaacagttggtggcaattcttcaaagattatttcatataca actattgctaacaatataaatggtcaaaattattatgcatatacttcccgaaaatcattg accgatttggatgggaatacatcagaaacatatactacttatgatactgcaaagggagta cctacggttgaaatcgtcaaaaatgatggcgataatatgtataagaaagtagtttataat agctatatacagaagatgaaccagtggatgcctctgaatgttgttaaatcacaaaaacat gaagatgattctgaagtaaactcttctacaactacatatacttataatgataagggtgag gtaattaaagtagttgctaatgatgggtcaacattacctctcacagtaaatactacgtat gacgtttatggtaatgtcttgacatcaactcagactggtaagggcattgttgccaatacc gagacgaatgtatacgatgcttctggtcgatttgtcgttaaggcatatgatagtgttagt cctcgagtaactacctatacctatgacttgtttggtaatgttcttacagagaatgatgag acgaataagtctcatatcctgacatctaagcatgtttatgatggatggggaacagaaatt agtgagacgaattcttttggtattactactaccaaagaaatgggatggggttctaactat gacaagaagtacttcatcagaacttcttccacaggaaagccatgggttgctgtatggttt gacaatgcagggcatgaagtccttcaggagtctgttatgcagaacactaatgcttactct ctggctactacctacaattctaaaggacagaagactaagattgaagaaaagacaggtaaa ctcactctttcagaaacatttaattatgataaaagaggccgtgttacctgtgatgttaaa agctctggaaaatcctctacgtttagctatggcaatcgtagtgtaactgaaacaaccgct ggtagaagttatacaaaagttaccgatgcatggggtaatcttgtcaaatcagtagatcct gttacacaaatcgactatgtctactcttcaacaggtaagcctgctgagattacaaccaat ggtgccacaacctatatcaaatatgatgaagtaggaaataaaattgcagttcaatcgcca gatgccggcaatatcaactatgagtatgctgccgatggcaaggtgatgaaatttacagat gctcgcaatatcacaaccacttacacgtatgatgccgaaggacgacttgcgtcaaccaag gctggtaatacattaattacgaatacctatggtacatcgggtaattctatcaaccatcta gtaaaaaccacagtaaatgataatagcgtagaatatacccatgacgaattgggccgggta attaccgaaacgcgaacagttagtggtgatggaacgtatcagtttaagtatgcatataat gcaaacaatcaattggtacagactacttatcctggtaaccttgttgtaaaatatacatac gacaagtacggaaataagacccagactacagcaaatgataagattgtatatcaagttgac agttatgatggattagaaaccaaaacatcgttcttaaacaaatatacgacaacggttaca ctcgattctcgaggcttcaagagcgatattgttttgaagaatggcagtactgtcctcgat cagtttaaaatgaattatgatggggcaacaggtaacttgctttcacgtactcgtaattca ctttctgaggaaacatttggctatgataatcttgatcgattggtatctgttaaagttggc accaaagagatgatgcatatcaaatatgccgagaatggtaatattacttttaagactggt ataggtcagtactattatgatgcagagcgtcctcatgcggtagcatcggtagataataca gataatcttatttctacacaggcttgcataactcaatttaatgatctcaacaagatttcg tcacttcaggaaaatgataaggttatgaccattgattatggtccagatcttgaacgttgc tttagtattttgaagcaaggtaatatgagtctgcgtaaagttacctatatgggcgattac gagaaggtcgttgctaatggtgtcactcgcgaatactattatctggatggtgatgtcatt gttgtccgacagaatggaactttccagacatatcagtcatttaaggacaacttaggtagt attttgtctgttattgatgaaaatggcagcaaggtattctcagcagagtatgatgcatgg ggtaaacaaactgtatcaatcaatactatcggccttatcagaggctatggtgggcatgag gaacgtatcagtttaagtatgcatataatgcaaacaatcaattggtacagactacttatc ctggtaaccttgttgtaa

DBGET integrated database retrieval system