Prodigiosinella aquatilis: PCO85_17555
Help
Entry
PCO85_17555 CDS
T09220
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
prod
Prodigiosinella aquatilis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_12
DUF4347
HYDIN_VesB_CFA65-like_Ig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WJV52980
LinkDB
All DBs
Position
complement(3751410..3758606)
Genome browser
AA seq
2398 aa
AA seq
DB search
MLWRNWFVTHPKLNSQTPVNHVMPVSQPLAYMLEPRMLFDGAVAATVADTATTSDAATTA
SDAATATSDTATATSDTDSSGTDTHSTENTPQDSSDQSTASVATSASDNAVATEISTTGH
KEVAFVDTSVEDYETLVAGIDSSVEVVLIDGSEDGLQQIAAWASTHSGYDAIHIFSHGSE
GTLNLGSTLLTSASLESSDVQAELATIGRALTADGDLLLYGCDVAEGSEGQAFITSLSIA
TGADVAASTDATGPLSEGGNWNLESQTGDIETSSIAVDNYDHFLATSATFGFEADTTGVG
TKTVTQTVSGETLTITSTTVSIVDSSTTSGQDISGTVTLSTDYGTALETQLVFSVSGRVF
DFSAITIFNVNTNDTFTFTASNGATYSVLITAGETKTVDLSANTDFQGVSSVTITATDPY
AIDFDDVALSNIQSPGPTITSATYDASTNVLTVTGADMVTGDSIDPTKLTLTGEGGNTYT
LTSSTVTATSATSFSITLNAVDQLNVEGLLNKDGTSSADSTTLNLAAAASWDTSQTTSAD
LTGNGITVSNVQTPTITSSTYDETTGVLTVTGTNMVKQVGANNDVDITKLTFTGEGGATY
TLTSDTSSVEITSATSFTVTLGSTDKASVDALLDQNGTSSSSSTTYNLAAADDWNGTITG
GSIADLTGNGITVSGVNAAPVVSNLNGDSVSFTEGGSTVLLDSGSDSTVTDADSTDFNGG
NVTVSITANGVSGEDVLGIVDQGTGAGQIGLSGSSVLYGGVVIGTYTGGSSGSDLVVTLN
SSATPTAVQALLRTLNYQNTNTSDPSTSTRTVSITVNDGDGGTSNSSSVSVSVVGVNDAP
TVTATGNDPSYNENGSAVDLFSSVTVSTVEAGQTITQLILTVSNLSDGSSEVLVVDGSSI
ALTNGNSGTTATNSMSYSVSVTGSTATVTFGSVAGISSAAATTLVDGMSYRNDSENPTSA
SRVVTLTSVTDNGGTSNSGVDTSSLSLTSTVTVTAINDAPTLSAPASISVDEDVSTAITG
ISFADVDAGSATVTATFAVGSGTLTASSSSGVTVSGSGTATLTMSGSITNINAFIAASNV
TFITASNASSNVTLTVTIDDGGNTGVDPGTSGTSTTEADSTTVTLAVTAVNDAPVNSVPA
SQSTQENTNLVFNSANSNLISISDVDAGSSDMQITLTATHGVLTLSSVSGLTFSTGSGTS
DATMTFTGTLTSINNALNGMVFTPDSAYNGSASVQIVTSDQGASGSGGTLTDTDTVTISV
NPNSAAVSNVSSSSANGDYKIGDTILLTVTFDDTVTVDTSGGTPTLLLETGSTDRQATYL
SGSGSNTLTFTYTVQSGDLSADLDYTSTSALSLNGGTIIDSNSLDATLTLPTVGGASGIS
AQKAIQVDGVRPTATIDMADTALKVGDTSLVTITFSEAVTGFTNADLTVANGSLGSVSSS
DGGVTWTATFTPTASIADASNVITLDNTGVQDAAGNSGSGTTDSANYSIDTQRPTATITL
ADTVLKIGDTSLVTITFSEAVTGFTNADLTVANGTLSSVSSSDGGITWTATFTPTASITD
ATNVITLDNTGVQDVAGNSGSGTTDSANYSIDMVRPTAAIAMADTALKANETSLVTITFS
EAVTGFTNADLTVANGTLSNVASSDGGITWTATFTPTDGIADTTNVITLDNTGIQDTAGN
SGSGTTDSANYSVETIRPTATIVMADTALKIGDTSLVTITFSEAVTGFTNADLTVANGTL
SSVSSSDGGITWTATFTPTASIDDATNVITLDNTGVQDAVGNSGSGTTDSANYSIDMVRP
TAAIAMADTALKVNETSLVTITFSEAVTGFTNADLTVANGTLSNVASSDGGITWTATFTP
TDGITDATNVITLDNTGIQDTAGNSGSGTTDSANYSIETVRPTATIAMADTALKIGDTSL
VTITFSEVVTGFTNADLTVANGTLSNVASSDGGITWTATFTPTDGIADTTNVITLDNTGI
QDTAGNSGSGTTDSANYSVETIRPTATIVMADTALKIGDTSLVTITFSEAVTGFTNADLT
VANGSLSNVASSDGGITWTATFTPTASIDDATNVITLDNSGLQNAAGNSGAGTTDSSNYS
VDTLRPTAAITMANTALKTGETSLVTITFSEAVTGFTNADLTVANGTLGNVESSDGGVTW
TATFTPTASITDTSNVITLDNTGIQDVAGNSGSGTTDSPNYSVNTLSVDLTGDPEFKSSG
GKGESLTNISGVGSQSQLVLINSPTEIGGALDATVPFLATSSLSGTTAGTTSAFAPASQG
GGATQPGNIATIFAGDGVATHESGVVSTRIPSLNQSMGGRSTLSGLFTELPLPDMTPLST
FSQGSWQGVFGSHVTSGSVPVSVFGTPVFSQQLKILDEYDYQRLASLAGALQQVNPSV
NT seq
7197 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatggcgtaattggtttgttactcatccaaaacttaacagtcagactcctgtaaat
catgtaatgccggtttctcagccgctggcttatatgcttgagccacggatgttatttgat
ggggccgtcgccgctaccgttgccgatactgcaacgacgtcggatgctgcgacaacagcg
tcggatgctgcgacagcgacgtcggatactgcgacagcgacgtcggataccgatagctct
ggcaccgatacgcattcaacagaaaacacaccgcaagatagcagtgatcaatcaaccgcc
agtgttgcgaccagtgccagtgataacgcggttgcaacagagatcagcaccactggacac
aaagaagtggcctttgtggatacttccgttgaggactatgaaactctggtggcgggcatc
gattcgagtgtagaagtggtgttgattgatggtagtgaagatggcttgcagcagattgcc
gcctgggcgtcgacacacagcggctatgatgccattcatattttctcgcatggctctgag
ggaacgctaaatctcgggagtacgctgttaaccagcgcgtcgctggagtcgtctgatgtt
caggcggaacttgccacgattggtcgtgcgttgactgctgacggtgatttgctgctttat
ggttgtgatgtggcggaagggagtgagggtcaggcatttatcacctcgctttctattgct
actggcgcggatgtagcggcatcaactgacgcgacggggccgctgtccgaaggcgggaac
tggaatctggaaagccagactggtgatatcgaaaccagcagcatcgccgttgataattat
gaccattttctggctacctcagcgacctttgggtttgaagcggataccactggtgtggga
acgaaaaccgtaacccaaacggtaagcggcgaaacgttaactattacctcgacgacagtc
tcgatagttgatagcagcacgacatccggacaggatattagtggtactgtcactttatca
acggattacggaacggctcttgaaacacagttggtattttctgtgtcgggaagggttttt
gatttctccgctatcactatttttaacgtcaataccaacgataccttcacatttacggcg
tccaatggggcgacatactcggtgcttattaccgccggggaaaccaaaaccgtcgatctc
agtgcgaataccgattttcagggcgtatccagcgtcacaataactgccactgatccctat
gctattgatttcgatgatgtggccttgagcaatatccagtcgccagggcctacgattacg
tccgccacttatgatgccagtaccaatgtgctgacggtgaccggtgccgatatggtcacg
ggcgatagtattgaccctaccaaactgacactgaccggtgaaggcggcaatacctatacg
ttgaccagcagtacagtaacagccaccagcgccaccagtttctctatcaccttgaatgcg
gttgaccaattgaatgtggaagggttactgaataaggacggaacgtcatctgctgacagt
accacgcttaatctggccgccgcagccagttgggataccagccagaccacatcggcggat
ctgacgggaaatggtattactgtcagtaatgttcaaacgccgacaattacttcatcaact
tatgatgaaacaaccggcgtactgacggttaccggtaccaacatggtcaaacaggtcggc
gctaacaatgatgtcgatattacgaagctgactttcaccggggagggcggtgccacttat
acgctcaccagtgataccagcagtgtggaaattaccagtgccacatcgttcaccgtgaca
ttgggttcgaccgacaaagccagtgttgacgccttgctggaccagaacggaacctcttct
agcagtagcactacctataacctggcggcggcggatgactggaacgggacgatcaccggc
ggcagcattgcggatctcaccggcaatggcattaccgtcagtggcgtcaatgccgcacct
gtggtcagtaatcttaacggcgacagtgtaagcttcaccgaaggcggcagcacggtatta
cttgattccggcagcgatagcacggtgaccgatgcggattctacagatttcaacggtggc
aacgttacggtctctatcacagccaatggcgtgagtggcgaagacgtgctggggattgtg
gatcagggcactggagccgggcaaatcggtctgtctggcagtagtgtgttgtatggtgga
gttgtcattgggacttataccggtggcagcagtggcagcgatttggtggtgacgcttaat
agcagcgccacccccacagcggtgcaggcattattgcgtaccttgaattatcagaatacc
aatacctctgatccttcaacgtctacccgtaccgtcagtatcacggtgaatgatggcgac
ggggggaccagtaacagctccagcgtttcggtgagtgtggtgggggtcaatgatgcgccg
actgtcaccgcgaccggtaatgatccatcgtataacgagaatggtagcgcggtggatctg
ttcagttcagtgaccgtcagtaccgtggaagccgggcaaaccattacgcaattaatactt
accgtgagcaacctgagtgatggcagcagtgaagttctggtggtggacggtagcagcatc
gctctcactaacggtaacagcggcaccacggctaccaacagcatgagctatagtgtcagt
gttacgggcagcacggcaaccgtgacattcggtagtgtcgcggggataagcagtgcagcg
gccactaccttggtggatggcatgagttaccgaaacgacagtgaaaatcctactagcgcc
agccgggtggtcacattaaccagcgtgactgataacgggggtaccagtaatagtggtgta
gatacatcatcattgtcattaacgtcaaccgtaactgtgacggcgattaatgatgctccc
acgctttcggctcctgcatcaatcagcgttgacgaggatgtcagtaccgccattaccggg
atcagtttcgcggatgtcgatgctggcagcgctactgtcaccgcgacgtttgccgtcggg
tctggaacactgacggccagtagcagtagtggtgttaccgtgtccggcagcggtacggcg
acgctcacgatgagcgggtcgattaccaatatcaatgcgtttatcgcggccagtaatgtc
acctttatcaccgccagcaacgccagcagtaatgtcacactgacggtgaccattgatgat
ggcggaaacaccggtgttgatccaggcaccagtggtaccagcaccaccgaagcggattcg
acgacagtgacgttggcggttacggcagtgaatgatgcgccggttaactcggtgcctgcg
tctcagagcacgcaggagaataccaacctggtgttcaattcggccaacagtaaccttatc
agtattagtgatgttgatgctggcagtagcgatatgcaaataacgctgactgcgacgcat
ggcgtgctgacattaagcagtgtgagtggcttgacgttcagtaccggttctggcaccagt
gatgccaccatgacgtttaccggaacattgacgtccattaataatgcgcttaatggcatg
gtatttacgccggacagcgcttataacggcagtgcgtctgtacaaatagtgaccagcgat
cagggtgcctccggcagcggcggtacactgactgatacggatactgtcactatttcagtt
aatccgaacagcgctgcggtttccaacgtcagctccagctcggccaacggcgactacaaa
atcggggataccatcctcctgacggtcacattcgatgatacggtgacggtggataccagt
ggcggtacaccgacattattactggaaactggcagcactgatcgtcaggcaacctatctt
tcggggtctggcagcaataccttaacatttacctataccgtccagagtggcgatctgagc
gctgatctggattacaccagtacctcggcgctatcgctgaacggcggcaccatcattgac
agcaatagccttgatgcgaccctgacactgccgacggttggcggcgccagtggtatttcc
gcgcaaaaggccatccaggtggatggtgtgcggcctaccgccacgatagacatggctgac
acggcgttgaaggtaggtgatacctcgctggtgaccattactttctccgaagcagtgact
ggttttaccaatgcggatctgaccgtcgccaatgggtcgctaggcagcgtcagttcgtcc
gatggcggcgtcacctggacggcgaccttcacgccgaccgccagtatcgctgatgccagc
aatgtgatcacgctggataacaccggtgtgcaggatgcggcgggcaatagcggcagcggc
accactgattcggcgaactatagcattgatacccagcgtcctactgccacgatcactctg
gcggatacggtactgaagataggtgacacttctctggtgaccattaccttctccgaagcg
gtgaccggttttaccaacgcggatctgacggtggccaacgggacgcttagtagcgtcagt
tcatctgatggtggtattacctggacggcgacctttacgcctactgccagtatcaccgac
gctaccaatgtgatcacgctggataacaccggcgtgcaggatgtggcgggtaacagtggt
agcggcaccaccgactcggcgaactacagcattgacatggtacgacctaccgctgccatc
gccatggcggatacggcgctgaaagcgaatgaaacgtcactggtgaccattaccttctcc
gaggcggtgaccggttttaccaacgcggatttgaccgtcgccaatgggacgctgagcaac
gtcgcgtcatctgatggcggcatcacctggacggcgacgttcacccctactgatggtatt
gccgatactaccaatgtaatcacgctggataacaccggtattcaggatacggcgggcaac
agcggcagtggcaccaccgactcggcgaactacagcgttgaaacaatacgacccaccgcc
accattgtcatggcggatacggcgctgaagataggagacacctcgctggtgaccattacc
ttctctgaggcggtgaccggttttaccaatgcggatttgacggtggccaatgggacgctg
agcagtgttagctcgtccgatggcggtataacctggacggcgacctttacgccgactgcc
agtatcgatgatgccaccaatgtgatcacgctggataacaccggcgtgcaggatgcggta
ggtaacagcggcagcggcaccaccgattcggcgaactacagcattgatatggtacggcct
accgccgccatcgccatggcggatacggcgctgaaagtgaatgaaacgtcgctggtgacc
attaccttctctgaagcggtgactggctttaccaacgcggatttgacggtggccaatggg
acgctgagcaatgtcgcgtcatccgatggcggtattacctggacggcgacctttacgccc
accgacggcattaccgatgccactaatgtgatcacgctggataacaccggtattcaggat
acagccggtaacagcggcagcggcaccaccgattcggcgaactacagcattgaaacagta
cgacccaccgccaccattgccatggcggatacggcactgaagataggtgacacttctctg
gtgaccattaccttctccgaggtggtgaccggttttaccaacgcggatttgaccgtcgcc
aatgggacgctgagcaacgtcgcatcatctgatggcggcatcacctggacggcgacgttc
acccccactgatggtattgccgatactaccaatgtaatcacgctggataacaccggtatt
caggatacggcgggtaacagcggcagtggcaccaccgactcggcgaactatagcgttgaa
acaatacgacccaccgccaccattgtcatggcggatacggcgctgaagataggagacacc
tcgctggtgaccattaccttctctgaggcggtgaccggttttaccaatgcggatttgacg
gtggccaatggctcgctgagcaacgtcgcatcatctgatggcggcatcacctggacggcg
acctttacgcctactgccagtattgatgatgccaccaatgtgatcacactggataacagt
ggactccagaatgccgccggtaatagtggtgccggtaccactgattcatcaaattacagc
gttgatactctgcgacctaccgctgccatcaccatggcgaataccgcgttgaaaacgggc
gaaacgtcattggtgaccattaccttctccgaggcggtgaccggttttaccaacgcggat
ttgaccgtcgccaatgggacgctgggcaatgtcgagtcatccgatggcggcgtcacctgg
acggcgacctttacgcccactgccagtatcaccgataccagcaatgtgatcacgctggat
aacactggcattcaggatgtggcgggtaacagcggcagcggcaccactgattcgccgaac
tacagcgttaatacccttagtgttgatttgacgggcgatccagaattcaagtcttcaggg
ggcaagggagaatcgctgacgaatatcagtggggttggttcgcaatcacagttggtgttg
attaactcacctaccgagataggtggtgccctggacgcgaccgtgccgttccttgcgaca
tcttcattgagtgggacgacggcgggcactaccagtgcattcgctcctgcgtcccaaggt
ggcggtgcaacccaaccaggcaacattgccaccatatttgccggtgatggcgtggcgact
catgagtcgggcgtggtatcgacccgtattccatcattgaatcaatcaatgggtggccgt
tctaccttgtcggggttattcaccgagcttcccctaccggatatgacaccgctgtctact
ttttcccaaggtagttggcagggtgtatttggttcacacgttacttctggatctgtaccg
gtctctgtgttcgggacaccggtgtttagccagcagttaaaaatcctggatgagtatgac
tatcagcgactggcatcacttgccggggcactgcagcaggttaatccatcggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system