Pedobacter roseus: H9L23_01815
Help
Entry
H9L23_01815 CDS
T06980
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
proe
Pedobacter roseus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
proe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
proe02000
]
H9L23_01815
Transporters [BR:
proe02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
H9L23_01815
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNN42875
UniProt:
A0A7G9QHQ0
LinkDB
All DBs
Position
complement(412551..415685)
Genome browser
AA seq
1044 aa
AA seq
DB search
MEKSIHRKKIAVRLVVFLAIAIITKNASAQNESTPIINSTLVGSVKDSVSKQPIGNVVLA
IKGTTHAVSSAADGSFSFRTGQKFPYTLIISFIGYQTKEIVVDGSPITILLSEKTSSLND
VVVMGYGTQKKSDVTGSVASVSKTLLAQPSASFDNMLQGGVSGIGVTQNSGQPGGTATVR
IRGGNSISFGNAPLYVIDGFIVYNNNDNANVGSIGTSSNALSTINPSDIESVEVLKDASA
TAIYGSRGANGVIIITTKKGKKGVNNVNYNAYYGTQRVARKLNLLNGSQWAALINDINTS
DGVAKTYTDTQIAAFGTASDWQGSALSSAPIFNQELSVSGGDEKSRYLISGNYFKQDGVI
TNSGYERYSARINYEKDISEKLKVTANFFGSRSIENKLAGSAYNSINFSNAYANLILTAP
IAQIKNADGSYNITNPLNATPTNPLQDIATTTNQNTLNRILGNAAAEYKILKELTLKVTA
GVDILNTNQQYYAPSYTASPAGGSTGYATKGYAALGSGNTLSWLNENTLTYNHTFAEKHF
FNALVGYSTQYENGKSFTTSAQQFPNDLTTFDNLSYAGIANLPNSAAHSSSLNSVLARIN
YSYLHRYNITLSERADGSSKLGKENKWGFFSSVGVSWNVNDEEFFKPLQSVISSLKIRLS
AGQTGNSEIPPYSSLASLAPSNYYLGSKLVTGISPVQIANPDLKWETTTQYNAGLDLGFL
NNRITVTFDAYSKKTTDLLLNVPLPLYTGYASALKNIGSVSNHGIEFSVNTENIKTQDFN
WKSTLIFSANRNKVLNLGENVKSFFPVAPTGQVSPVIVQVGLPVGTFWGYNTNGLLTSAD
LTNGTPLLGGVPQQAGDTKYVDSNQDGIITTADKHSLGSAQPKFTGSLNNTFNYRGIDLS
IFFQGSYGNKVFNLLQQSLERPTLTQNASATLLDRWTPQNQRATVARVTNSPVPQVTDRL
IEDASYLKLKNVSLGYTFKTDWANKIKLKNLRFYVSVQNLFTVTKYTGLDPEVNFYDNDN
TKQGIDFGTYPATRTFLAGLSITL
NT seq
3135 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaatctatccatagaaaaaaaatagccgtcaggctggtggtatttcttgcaatc
gccatcattaccaaaaatgcaagtgcacagaacgaaagtaccccaattatcaattctacc
ttagtaggctcggtaaaagattcggtaagtaaacagcccattggcaatgtggtattagcc
ataaaaggaaccacacatgcagtaagcagcgcggcagatggtagtttttctttccgcacc
ggccaaaaattcccttatacgctcatcatcagctttattggttatcaaaccaaagaaatt
gtggttgacgggagtccgattaccattttattatcagaaaaaacaagcagcctcaacgat
gtcgttgtgatgggttatggtacacagaaaaaaagcgatgttaccggctcagtagcttct
gtttccaaaaccctgctggcacagccttcggcaagtttcgataacatgttgcagggcggt
gtatctggtatcggtgtcactcaaaactcaggtcagccgggtggtaccgcaacggtaagg
atcaggggcggtaattcaatttcttttggcaatgccccactttatgttattgatggtttt
attgtttataataataatgataatgcgaacgtcggctccatcggtaccagttccaatgcc
ttatcaaccattaacccgagcgatatcgaatcggtagaagtgttaaaagatgcatcggcc
accgccatttatggttcgaggggagccaatggtgtcattatcatcaccactaaaaagggt
aaaaaaggagttaacaatgttaattataacgcttattacggtacacaaagggtagccaga
aagctaaatttattaaatggaagccaatgggcagccctgataaacgacataaacaccagc
gacggagtagcaaaaacctatacggatacccagatagcggcctttggaaccgcttcagac
tggcagggttcggcattaagcagcgcaccgatatttaaccaggaactttcggtttctgga
ggagatgaaaaatcgaggtacttaatatccggcaattattttaagcaggatggtgtaatt
accaattcgggttatgaaaggtattcggcaaggatcaattatgagaaagacatttctgaa
aaacttaaggtcacagccaattttttcgggagcaggtctatagaaaacaagctggccggc
agtgcctacaacagcatcaacttcagtaatgcttatgctaatttaatccttaccgctcct
attgcccagattaaaaatgcggatggaagctataatatcactaatcctttaaatgctacg
ccaaccaacccgctccaggatatagcaactaccacaaaccagaataccttgaaccggatt
ttaggcaatgcggctgcagaatataaaatcttaaaagagcttaccttaaaggttactgcc
ggggttgatatcctgaataccaaccagcaatactatgcaccatcttatacggcttcacct
gccggtggatcaaccggatatgccacaaaaggttatgccgctcttggatcaggaaataca
ttaagctggcttaacgaaaataccttaacctataaccatacttttgccgaaaaacacttt
tttaatgcgcttgtaggctacagtacgcaatacgaaaacggaaaatctttcaccacctct
gcgcagcagtttcccaatgatttaaccacctttgataatttatcgtacgcgggtattgcc
aacctgcccaattctgctgcacacagttcgagccttaactcggtattggcacgtatcaat
tattcttacctgcaccgctacaatattactttatccgaaagggccgatggttcttctaaa
ctgggcaaggaaaataaatggggattcttttcttcggtaggggtttcgtggaatgtaaac
gatgaggaatttttcaaaccccttcaaagtgtaatcagcagtctaaaaattcgcctgagc
gccggacaaaccggtaattcggaaataccaccatatagctcccttgcttctttagcgccc
agcaattattacctgggcagcaaactggttaccgggatatctcctgtgcagattgcaaac
cccgacctaaaatgggaaaccaccacgcagtataatgccggtctggatctgggcttttta
aacaaccgcattacggttacttttgatgcctacagtaaaaaaacaaccgatttattgctc
aatgtaccactgcccttgtacacaggttatgccagtgcgttaaaaaatatcgggagtgta
tccaatcatggcattgagttctctgtgaataccgagaacataaaaacacaggattttaac
tggaaaagcacactcatttttagtgctaaccgcaataaagtgctcaacctgggcgaaaat
gtgaaaagctttttcccggtagcgccaacaggacaagtatcgccggtaatcgtacaggtg
gggttgcctgtgggtactttttggggctacaataccaacggacttttaaccagtgccgac
ctgaccaatggcactccacttttgggtggagtaccgcagcaggctggcgatacaaagtat
gtagacagcaaccaggacgggattattaccacggccgacaaacatagcctgggcagtgcc
cagccaaagtttaccggcagtttaaacaatacttttaattataggggtatagatttatcg
atattctttcaaggttcttacggcaataaagtgtttaatttattgcaacaaagtttagag
cggccaacacttacccaaaatgcttcggctacattgttagaccgatggacaccccagaac
cagagggctactgttgcacgcgtaaccaattcgccggtaccccaggtaaccgaccgttta
attgaggatgcctcctacttaaaacttaaaaatgtatcgctgggctacaccttcaaaacc
gactgggcaaataaaatcaaactcaaaaatttaaggttttatgtgtctgtccaaaatttg
ttcaccgttacaaaatacacaggattagatcctgaggtgaatttttacgataacgacaat
accaaacaaggcatcgactttggaacctaccccgccaccagaacctttttggcaggccta
tctattactttataa
DBGET
integrated database retrieval system