Pedobacter roseus: H9L23_08940
Help
Entry
H9L23_08940 CDS
T06980
Name
(GenBank) PD40 domain-containing protein
Organism
proe
Pedobacter roseus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PD40
DPPIV_N
Peptidase_MA_2
BSP
DUF6055
WD40_WDHD1_1st
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNN44182
UniProt:
A0A7G9QLF7
LinkDB
All DBs
Position
complement(2163863..2167036)
Genome browser
AA seq
1057 aa
AA seq
DB search
MKKGSTLLKRYCSLLLLLILSFSVKAQYFGQNKVRYKTLDFKVLQTPHFEIYYYIKNEKL
LKRFSQDAETWYKMHQEVFRDTFLKKNPIILYNNHPDFQQTTVLNGEIGIGTGGVTEALK
NRVIMPVMELNSQTRHVLGHELVHAFQYHLLLEKDSISLENVGQTPLWMVEGMAEYLSIG
KKDAFTSMWMRDAMLNRDIPSLKDLTNSNKYFPYRYGQAFWTYIGSQYGDTTIVPLFKNT
AKYGYENAIRYTFGYDDKTLSGLWKNSIDAHYKPMLKADSSQIKITGTKIIDNKNAGNMN
VAPALSPDGKYLAFMSEKDLFGIDLFLADAKTGRIIRKLSSQISNGHIDDFNFIESAGAW
SPDSKQFAFSIFSQGKNQMMIINVANGNTVSQTPMAQVQQFGNLTWSPNGKDIAFSGMVE
GQSDIFSYNLDTKAVTQITDDVYSDYAPSYSPDGKKLVFSSDRAAIQANVINAVLPINLA
VYDIASKTVSNLDVFPGANNLNAQFSANSQNIYFLSNRDGFRNLYKYNFADNTVDQLTDY
FTGISGITEFSPAISVSTTDDIVYSYYRYQRYTLYNAKLSSFKAKRIGNREENFDAAILP
PMENIGVNIINSNLNNFDRFEKIVADSMRTVPYRPKFRLDYLANSGVGVSTSRFGTGVSG
GIVGMFSDILGTNQIIANLSVNGEIYDFGGLVGYINQKSRINWGAAISHIPYVSGFRSYG
YEDIPNGDNKTTKAQVDRTDIVRTFEDQFQVFGAYPFSKIHRFELGGAFSHYSYRVDRYS
NYYDANGYYIGSDKSRVANDVAADAIGIPLSSFTLYQLNAGFVGDNSIFGLTGPLDGYRY
RVSGEKYFGTYNFAGVTADLRKYWRAKPVTFAVRSYNTLRIGKDADRLYPMYVGYPYLIR
GYESNSIYKNTSAQSSESFDINQLAGSKIAVFNFEVRLPFTGPKKLAAIPSKLLFSDLNL
FFDAGLAWTNDTKVKFKSEPTYTTETLLDSKGAPVLDTKGNPVTYQATTERVPAMSVGIS
LRVNVFGYFVLEPYYAIPFQRKDVKTGVFGLTFAPGW
NT seq
3174 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaggctctactttattaaagcggtattgttccttattgctgttgcttattctt
tctttttctgttaaagcacaatatttcggtcaaaataaggtgaggtataaaacacttgat
tttaaagttttacaaacaccccatttcgaaatttactattacattaaaaacgagaaactt
ttaaaacgcttttcgcaggatgccgaaacctggtacaaaatgcatcaggaggtttttaga
gatacttttttaaagaaaaatccaattattttatacaataaccatcctgatttccaacaa
acaacggtacttaacggagaaatcggcattggtacaggtggggttaccgaagcgctgaaa
aacagggtaattatgcctgtcatggagttgaacagtcaaaccaggcacgttttaggtcac
gagttggtccatgcctttcaatatcaccttttattagagaaagattcgatcagtttagaa
aatgttggacaaactcccttatggatggttgaagggatggccgaatacctttctattggt
aaaaaagatgccttcacttccatgtggatgcgcgatgccatgttgaatcgtgatattcct
tctctaaaagacttaaccaactccaacaaatactttccttaccgttatggtcaggctttt
tggacttatatcggttcgcaatatggagatactaccattgttccattattcaagaacacc
gcaaaatatggctacgaaaatgccatccgatatacatttggttacgatgataaaacattg
tctggtctttggaaaaactccatcgatgcacattataaaccgatgttaaaagcggatagt
tctcagattaaaattacaggtacgaaaatcatcgataataagaatgcaggaaatatgaat
gttgcccctgcccttagtcctgatggaaaatacctggcttttatgtctgaaaaagatctt
tttggcatcgatctgttccttgcagatgcaaaaacagggcgcatcatcaggaaattaagc
agtcagatatccaatggtcacattgatgattttaactttatcgaatctgccggggcatgg
tcgccggatagtaaacagtttgccttcagtattttcagccagggtaaaaaccagatgatg
atcatcaacgtagccaatggtaatactgtttctcaaacgccaatggcacaggtgcagcaa
tttggtaatttaacctggtctccaaatggaaaagatatcgcattttcgggaatggttgaa
ggacaaagtgatattttctcttacaacctcgataccaaagcagtaacacaaattaccgat
gatgtatattctgattatgcacctagttattctcctgatggtaaaaaactcgtgttttca
tcagatagagctgcaattcaggcaaatgtaatcaatgctgtattacccattaacttagca
gtatacgatattgcctctaaaacagtgagtaatcttgatgtttttccaggagcaaataac
ttaaatgcacaattttctgcaaacagtcagaatatctatttcctgtctaacagagatggt
ttcagaaatttatataaatacaatttcgctgataatacggttgatcagttaaccgattac
tttaccggtatcagtggaattaccgagttttcaccagccatatcggtttccacaaccgat
gatattgtatacagctattaccgttaccagcgttataccttatataatgccaaattgagc
agcttcaaggccaaacgcattggtaatcgtgaagaaaactttgatgccgcaatcctccct
cctatggaaaacataggagtaaatatcatcaattccaacctgaataacttcgaccgattc
gaaaaaatcgtagccgattcgatgagaacagttccatacagaccaaaattcagattagat
tacctggcaaacagcggtgttggcgtttctaccagccgtttcggaacaggtgtttccgga
ggtattgtgggaatgttcagcgatatattaggcaccaatcagattatcgcaaacttatcc
gttaatggagaaatttatgatttcggtggattggtaggatacatcaatcaaaaaagcagg
atcaactggggagcagccatttcgcacatcccgtatgtatcaggattcagatcttatggt
tatgaagatattccaaatggcgataataaaaccaccaaagcacaggtagatagaacagat
atcgtgagaacttttgaagaccagtttcaggtttttggcgcttatccatttagtaaaata
caccgttttgaattgggcggagcattttcgcattacagttaccgtgttgacagatatagc
aattattacgatgcgaacggttattatatcggctcagacaaaagcagggttgctaacgat
gttgctgcagatgcgattggtattccattaagttcatttaccctttatcaattgaatgcc
ggttttgttggtgataattctatttttggcttaacaggccctcttgatggttatagatac
cgtgtaagtggagaaaaatattttggcacttataatttcgcaggtgtaacagccgatctg
cgtaaatattggagagctaagccagtaacttttgccgtgagaagttacaataccttaaga
attggtaaagatgccgacagactttatccgatgtatgtgggttatccttacctcatccgg
ggttacgaatcgaactcgatttataaaaatacgtcagctcaatcatcagaatcatttgac
atcaatcaattggcaggtagtaaaatagctgtcttcaattttgaagtacgcttgccattt
acaggtcctaaaaagttggcagcaattccatctaagttattattttcagatctcaactta
ttctttgatgcaggtttagcctggaccaacgataccaaagtgaagtttaaaagcgagcca
acttacactacagagactttattagatagcaagggcgcaccagttttagataccaaagga
aatcctgttacctatcaggctaccacagaacgtgtaccggcaatgagtgttggtatatcc
ttaagggtaaatgtttttggctactttgtattagaaccttactatgcgatcccttttcaa
agaaaagatgttaaaaccggagtttttggtttaaccttcgctcctgggtggtag
DBGET
integrated database retrieval system