KEGG   Pedobacter roseus: H9L23_17020
Entry
H9L23_17020       CDS       T06980                                 
Name
(GenBank) tandem-95 repeat protein
Organism
proe  Pedobacter roseus
SSDB
Motif
Pfam: Big_9 Cadherin_5 Cadherin_4 Peptidase_M60 CHU_C DUF7507 CshA_repeat DUF11 F5_F8_type_C M60-like_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: QNN40819
UniProt: A0A7G9QBU4
LinkDB
Position
complement(4165946..4172305)
AA seq 2119 aa
MKKIYLMLLLAFICANVFAQNPVLPVGVTTVRPVAADVMRCIDGDTKTLYESEEYANAMP
DTLSFYFSGASSINEITYTPRNDGLSYGRWQKISVYHNTQADPAVYVADGSFTMANNTAV
KTLNLAAAMVKPFIVRVVVTSAVLNESTCAEINFYSAEVQANQPVADCQNPTAEDFSPLS
DVQVAVASAVANTFHDNSMNLAKSIDGNLTTFYQSKYSTPAFVVSDSNPAVLTYNFTGNN
NIDLIKYIPRTGTTNGNFGRGEIWYATTTNATLTKLMNFDAGLSSSPSSFGFPQRLVNVT
QIVLRVFSGVGNYASCAEMQFFKSNSIGVLTDIFADDLYSSLKPGVSQAQISAITSPFFK
ALAQCLYNRTYQNKFRVQNYKAYIAPSTVASALRVYGFSNFENPTGISFKANTKAVIFVG
SNAAPPVLKVCDFATDYKDPTPSPDSYPLKAGLNVIDILHDGLGYISYYSNVPQADVKIH
IATGEVNGYFDPTTDTDAEWVDYLNNNIYKYLDIKGKYIGLNFNKRALFVNNPQEGKSLI
NAYDKIVEQEYTLQGFFKYNIAPKNHIFARTVPTGVLLGGSPGALFGIYNGIGESYTHPN
KLSAWGTAHEIGHVLQTPRGMEWIGMGETTNNIHSLYNQYVIGKEFPGATRYEGEETDYK
DNKNLVAGRYSKYFANFLTNNNYYEAGELLPPFWQLELYYMFAGASKKLPTLKDRLNGIS
APTTGPDVAYGLADIYQRVRQTSEAGVTDGQHMLNFVKYACDAFQEDLTDFFKEIGFIRP
IDRDVKDYGTRRLTITQSQIDATITEVKAKNYPKPVSPVLRYISARSVNAFKDRLTVVGT
NMVGVTLAGTKLNIDNSKWLNVVAFETYSGTNLIEMAIPGTGDGTNATTKVLYPAGATAV
FAVSYDGSKKQVYPTEVVLSPVLAVAKTGPATLTAGNTASYTIRVTNTGLGNALAATIAD
NVPNSFNNVSWTSAVEGTATIVSGGTGTGNALSIQANIPSGTGNAVVVTVTGILKADATG
NVSNTATAVPVEPGGTAGTSTVTSNISSTVGLNIIKTAPANANAGETINYLVEVGNTGPS
DALGIKITDVVPAQLTNVSWSSSVNGTAIITTGSTGTTNNIMLLANIPAGATNKIRVTII
GTISPTFTGTLTNTAFATPAGSGSATVTGTASTNVNGTVTPGNHAPVVSVENKTGTEDSP
ASGKITASDPDGDPLTFSKASDPAHGAAIVNLDGTYTYTPNPDYNGPDSFTVMVCDGKGG
TVTATINIMISAVNDVPVVNPENKTGQEDSPASGKITASDPDGDPLTFSKVSDPAHGTVI
VNLDGNYTYTPNPDYNGPDSFTVMVSDGKGGTVTATVNISVSAVNDAPVVNPENKTGQED
SPASGKITASDPDGDPLTFSKVTEPAHGTVIINLDGTYIYIPYPDYNGADSFTVMVSDGK
GGTITTTVNIMVSAVNDVPMVTPENKTSQEDSPASGKITASDADGDPLTFSKVTEPAHGT
AIVNLDGTYIYIPYPDYNGADSFTVMVSDGKGGTITTTVSIMVSAVNDAPVVTPENKTSP
EDSPASGKITASDPDGDPLTFSKATDPAHGTAIVNPDGNFTYTPNPDYNGPDSFTVTVSD
GKGGTVTGMVNIIVIAVNDAPVVNPENNTSPEDSPARGKITASDADGDPLIFTKSTDPAH
GKVVVNSDGTYTYTPNLNYNGSDSFTVTVNDGKGGITTITVNITISAVNDAPVATAPAIT
TSQNTPANGNITASDPDGDVLTYTLTTAPAHGTVKLNTDGNYIYTPTIGYTGSDIFTVTV
NDGKNGIATVTIPVTVTLIPAPAITLVKTSVLNGNKVSYTFTIKNTGNVILDAITLTDAK
IGLSNKVITVAGGLAPGTTTSDVEVYTLTQADKDLGTVTNTATVNAKTLSGTTVTDVSGT
AETNNTATVTTFTKSPIAIGDRGETVANAPVVISVLANDDPGNSTFDKLSVEMVSQPKHG
SVQANADGTVTYKPDPGYVGEDTFTYRVKDIQGYYTNAASVSLTIDFMKIKVPNLFTPNG
DGINDTFEIIGLNQYQANELQIVNRSGNEVFHAFGYQNNWTGEGLSENTYYYLLRVKKAD
SEYVEVFKGYITLVRTFKK
NT seq 6360 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaaatttacttaatgctcctgcttgcatttatatgcgccaatgtgtttgcacaa
aatcctgttttaccggtcggggtaaccactgtgcgcccggttgctgccgacgtaatgagg
tgcattgatggggatacaaaaacattgtatgagagtgaagaatatgcaaacgcaatgccc
gataccctgtctttttatttttccggcgcatcaagtatcaatgagatcacttatacaccc
agaaatgatggcttatcatacggacgttggcaaaaaatatccgtttatcacaatacacag
gctgatcctgcagtttatgttgcagatggcagttttacaatggcgaataatactgccgta
aagacgctcaatctggctgctgctatggtaaagcctttcattgtgagagtagtggtaacc
agcgcggttttgaacgagtctacctgtgcagagatcaatttttactctgcagaggttcag
gctaaccaaccagttgctgattgccaaaaccccacggcagaagacttttccccgctgagt
gatgtgcaggttgctgtggccagtgctgttgccaatacattccacgataatagcatgaat
ctggctaaatcgatagatggaaatttaactactttttatcaatctaaatatagcactcct
gcttttgtagtgagcgattcaaacccagcggtactcacttataattttacagggaacaac
aatatcgatctgattaaatatataccccgaacaggaactaccaacggtaattttggacgc
ggagaaatctggtatgcaaccaccaccaatgctacccttaccaaattgatgaattttgat
gccggcctttcatcttccccaagtagtttcggctttccgcaacgcctggtaaatgttacc
caaattgtgttacgcgtattttctggagtgggcaactatgcaagctgcgccgaaatgcag
ttttttaaatcaaacagcattggtgttttaacggatatatttgctgatgatctgtactca
agcctgaaacccggggtatcacaggcacagatcagcgccattacttcgccgttttttaaa
gccctggcacagtgcctgtataacagaacctatcagaacaaatttagggtgcaaaactat
aaagcttacatcgcaccgagtactgtagccagcgcgttaagggtttatggattcagtaat
ttcgaaaatccaacaggtatctcatttaaggcaaataccaaggcggtcatttttgtaggt
tcaaatgctgcacctccggtgcttaaagtctgcgactttgctacagattacaaggatcct
acgcccagtcctgattcctatccgcttaaggccggtttaaatgtgattgacattttgcat
gatggccttggctatatcagttactacagtaatgtgccacaagctgatgttaaaatccat
attgccacaggtgaagtgaatggctattttgatccaactactgatacagatgcagaatgg
gttgactatctaaacaataatatatacaagtaccttgatataaaaggaaaatacattggg
ctaaattttaataagagggctttatttgttaacaacccgcaggaaggcaaatcgctaatc
aatgcctatgataaaattgtagaacaagaatataccttgcagggtttttttaaatataat
atcgcaccaaaaaaccacatttttgccaggaccgtaccaacaggtgttttactgggaggg
tctcccggtgccctatttggaatttataatggaataggcgaatcttacacccatccgaat
aaattgtcagcctggggtaccgcccacgaaattggacatgtgcttcaaacacccaggggt
atggaatggatcggtatgggagaaacaaccaataatatccattcgctttataaccagtat
gttatagggaaggaatttccaggtgctaccagatatgaaggcgaagaaacagattataaa
gacaataaaaatcttgttgctggaagatatagcaagtatttcgccaactttttaaccaat
aataattattacgaggcaggcgaattgttacctcctttttggcaattggaactatattac
atgttcgcaggtgcctcaaaaaaattaccgacacttaaagatcggttaaatggcatctct
gccccaactaccggaccagatgtagcctacggcctggcagatatttaccagagggtaaga
caaaccagcgaagctggtgtaaccgatggtcagcacatgttaaattttgtgaaatatgca
tgtgatgctttccaggaagatttaactgattttttcaaggaaattggcttcatccgacca
atagaccgcgacgttaaggactacggaactcgccggcttaccattacccaatcacaaatt
gatgcaaccataactgaagtaaaggccaaaaattaccctaaaccagtatcgcctgtacta
cgttacatttcggccagaagtgtgaatgcttttaaggataggttaacagttgtaggtaca
aacatggttggggtaacgctggccggaacaaaattgaacatagataattcgaaatggcta
aatgttgtagcttttgaaacctatagcggaactaatctaatagagatggccatccctgga
accggagatggcaccaacgccactaccaaagtgctgtaccccgccggcgctactgccgtg
tttgccgtttcttatgatggcagcaaaaagcaggtttaccccactgaagtggtactttcg
ccagttcttgctgtcgctaaaactggtccggccacattgactgcgggaaatacagctagc
tacactattcgcgtaacgaatactggtctgggtaatgcacttgctgcaaccattgccgat
aatgttcccaacagctttaataatgtaagctggacttcagctgttgagggtacagctact
atagtgagtggcggtaccggaacgggcaatgccttgagtatacaagccaatataccatca
ggaacaggaaatgcagtggtggttacggtaaccggaattttaaaggccgatgctacaggt
aatgttagcaatactgctaccgcggtgccggtagaaccaggtggaactgctggtacatca
acggttacctccaatatatcatcaacagtaggattaaatatcattaaaacagctcccgct
aatgcaaatgcaggagaaacaatcaattatcttgttgaagtgggcaatacggggccgagt
gatgctttaggcataaaaattactgacgtggtgccagcccagctaacaaatgtgagttgg
agttcttcggtaaacggtacagctattattactacaggaagtacaggaactactaataat
attatgctccttgccaatattcctgccggagctacaaataagatcagggttacaataatc
ggaacaatttctccaacctttaccggtacattgacaaacactgcctttgcaacacctgca
ggttcaggttcagccacggttaccggtactgcaagcacgaacgtaaacggaacagtaact
cccggaaaccacgctcctgtagttagcgtagaaaacaaaacaggcactgaggatagccct
gccagtggaaagataacagcaagtgatcctgatggtgatccattgaccttttccaaggcc
tcagatccagcccatggagcggctattgtaaacctggatggcacttatacctatacgcca
aatcctgactataacggacccgacagctttacggtaatggtatgtgatggtaaaggcggc
acagtcaccgctacaataaatattatgataagcgccgtaaacgacgtgccagtggtgaac
ccggaaaataaaactggtcaggaggatagccctgccagtggaaagataacggcaagtgat
cctgatggtgatccattgaccttttctaaggtctcagatccggcccatggaacggttatt
gtaaacctggatggcaactatacttatacgccaaatcctgactataacggacccgatagc
tttacggtaatggtaagtgatggtaaaggcggcacagtcaccgctaccgtaaacatttcg
gtaagcgccgtgaacgatgcgcctgtggtgaacccggaaaataaaactggtcaggaggat
agccctgccagtggaaagataactgcaagtgatcctgatggtgatccattgaccttttct
aaggtcactgaaccggctcatggaacagttattataaacctggacggtacttatatttat
ataccctatcccgactataatggagccgacagctttacagtaatggtaagtgatggtaaa
ggcggcacgatcaccactacggtgaacatcatggtaagcgctgtgaacgatgtgcctatg
gtaaccccggaaaataaaaccagtcaggaggatagcccagccagtggaaagataacagca
agtgatgctgatggtgatccgttaaccttttctaaggtcactgaacctgctcatggaaca
gctattgtaaacctggacggtacttatatttatataccctatcccgactataatggagcc
gacagctttacagtaatggtaagtgatggtaaaggcggcacgatcaccactacggtgagt
attatggtaagcgctgtgaacgatgcgcctgtggtaacccctgaaaataaaaccagcccg
gaagatagccctgccagtggaaagataacagcaagtgatcctgatggtgatccattgacc
ttttccaaggccacagatccggcccacggaacggctattgtaaacccggacggcaacttt
acctatacaccaaatcccgactataacggacccgacagctttacggtcacggtgagtgat
ggcaagggtggcaccgtcaccggtatggtaaacattattgtgattgctgtaaatgatgca
cctgttgtgaatccagagaacaacaccagtccggaggatagtcctgcacgtggtaagata
acagcaagtgatgcagatggcgatccgttaatctttacgaagagcacagaccctgcgcat
ggtaaagtggttgtaaactcagatggaacatatacttatacgccaaacctaaattataat
ggctcagacagttttacggtaacagtaaatgatggcaaaggcggaattaccaccattaca
gtaaatataacgataagtgctgttaatgatgctccggtggcaactgcaccagcaattacc
acttcgcaaaatacgcctgctaacggaaatatcacagccagcgatccagatggcgacgtg
ttaacttacaccttaaccacggcaccagcacatggtacagtaaaattgaacactgatggt
aattatatttacacgccaactattggttatactggcagcgatatttttacagtaacagta
aatgatggtaaaaatggtatagccacggtaacgattccggtaacggtaacattgatccct
gcacccgctattacattagttaaaacttcggttctaaatggaaacaaggtgagctatact
ttcaccattaaaaatacgggcaatgttatccttgatgccattactttaaccgatgctaaa
attggtctaagcaacaaagtaatcacggtagctggaggacttgcccccggcacaactaca
tctgatgttgaagtgtacaccttaactcaggcagataaggatttaggtacggtaaccaat
accgcaaccgtaaatgccaaaacgcttagtggtacaacggtaacagacgtttcaggaaca
gcagaaacaaacaatacggcaacggttaccactttcactaaatcgccaattgctattggt
gatagaggagaaacggtggctaatgcgccagttgtgattagtgtgcttgccaatgatgat
ccaggtaattccacattcgataaactatccgttgaaatggtaagtcagcctaaacatggt
tcggtacaagcaaatgcagacggtaccgtaacctacaagccagatcccggctatgttgga
gaggatacctttacctatcgcgtaaaagatatccaaggttattataccaatgcggcatct
gtttccctgaccatagatttcatgaagatcaaggtccccaatctgttcacaccgaacggt
gatggtattaacgatactttcgagatcataggcctgaaccaatatcaggccaatgaattg
cagatagtaaacagatccggtaacgaagtattccatgcctttggatatcaaaataactgg
actggtgagggattgagcgagaacacctactattatctcctgcgtgtcaaaaaagctgat
agtgagtatgttgaggttttcaagggctacatcacactggttagaacattcaaaaaataa

DBGET integrated database retrieval system