Prosthecochloris sp. SCSIO W1103: OO005_04130
Help
Entry
OO005_04130 CDS
T09697
Name
(GenBank) VCBS domain-containing protein
Organism
proi
Prosthecochloris sp. SCSIO W1103
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_4
Big_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UZJ38398
UniProt:
A0A9E8EL75
LinkDB
All DBs
Position
873361..880533
Genome browser
AA seq
2390 aa
AA seq
DB search
MVHYTYSLDDNTLDHSVAGNDTVLDSIGITVTDTDGDTSNDTLDIEIVDDVAVAVADTDS
VGEDSSLSASGNVVTDSESNGDNGGDTLGADNAPVDPVTGVAAGSDASSAVSGNVGTSVT
GSYGSVVINADGSYTYTLDNTNPLVQGLSDTESLTDTFVYTISDADGDESTTTLTITING
SDDGTTIEIPDTNGSGGSGDETVYEAGLADGSNPGDSDEVTSSFTITAPDGLGSITVVDG
SGSDVVISESELLASATTNITIDTEYGTLVINGYTPNASTGGGVVHYTYSLDDNTLDHSV
AGNDTVLDSIGITVTDTDGDTSNDTLDIEIVDDVAVAVADTDSVGEDSSLSASGNVVTDS
ESNGDNGGDTLGADNAPVDPVTGVAAGSDASSAVCGNVGTSVTGSYGSVVINADGSYTYT
LDNTNPLVQGLSDTESLTDTFVYTISDADGDESTTTLTITINGSDDGTTIEIPDTNGSGG
SGDETVYEAGLADGSNPGDSDEVTSSFTITAPDGLGSITVVDGSGSDVVISESELLASAT
TNITIDTEYGTLVINGYTPNASTGGGVVHYTYSLDDNTLDHSVAGNDTVLDSIGITVTDT
DGDTSNDTLDIEIVDDVAVAVADTDSVGEDSSLSASGNVVTDSESNGDNGGDTLGADNAP
VDPVTGVAAGSDASSAVSGNVGTSVTGSYGSVVINADGSYTYTLDNTNPLVQGLSDTESL
TDTFVYTISDADGDESTTTLTITINGSDDGTTIEIPDTNGSGGSGDETVYEAGLADGSNP
GDSDEVTSSFTITAPDGLGSITVVDGSGSDVVISESELLASATTNITIDTEYGTLVINGY
TPNASTGGGVVHYTYSLDDNTLDHSVAGNDTVLDSIGITVTDTDGDTSNDTLDIEIVDDV
AVAVADTDSVGEDSSLSASGNVVTDSESNGDNGGDTLGADNAPVDPVTGVAAGSDASSAV
SGNVGTSVTGSYGSVVINADGSYTYTLDNTNPLVQGLSDTESLTDTFVYTISDADGDEST
TTLTITINGSDDGTTIEIPDTNGSGGSGDETVYEAGLADGSNPGDSDEVTSSFTITAPDG
LGSITVVDGSGSDVVISESELLASATTNITIDTEYGTLVINGYTPNASTGGGVVHYTYSL
DDNTLDHSVAGNDTVLDSIGITVTDTDGDTSNDTLDIEIVDDVAVAVADTDSVGEDSSLS
ASGNVVTDSESNGDNGGDTLGADNAPVDPVTGVAAGSDASSAVSGNVGTSVTGSYGSVVI
NADGSYTYTLDNTNPLVQGLSDTESLTDTFVYTISDADGDESTTTLTITINGSDDGTTIE
IPDTNGSGGSGDETVYEAGLADGSNPGDSDEVTSSFTITAPDGLGSITVVDGSGSDVVIS
ESELLASATTNITIDTEYGTLVINGYTPNASTGGGVVHYTYSLDDNTLDHSVAGNDTVLD
SIGITVTDTDGDTSNDTLDIEIVDDVAVAVADTDSVGEDSSLSASGNVVTDSESNGDNGG
DTLGADNAPVDPVTGVAAGSDASSAVSGNVGTSVTGSYGSVVINADGSYTYTLDNTNPLV
QGLSDTESLTDTFVYTISDADGDESTTTLTITINGSDDGTTIEIPDTNGSGGSGDETVYE
AGLADGSNPGDSDEVTSSFTITAPDGLGSITVVDGSGSDVVISESELLASATTNITIDTE
YGTLVINGYTPNASTGGGVVHYTYSLDDNTLDHSVAGNDTVLDSIGITVTDTDGDTSNDT
LDIEIVDDVAVAVADTDSVGEDSSLSASGNVVTDSESNGDNGGDTLGADNAPVDPVTGVA
AGSDASSAVSGNVGTSVTGSYGSVVINADGSYTYTLDNTNPLVQGLSDTESLTDTFVYTI
SDADGDESTTTLTITINGSDDGTTIEIPDTNGSGGSGDETVYEAGLADGSNPGDSDEVTS
SFTITAPDGLGSITVVDGSGSDVVISESELLASATTNITIDTEYGTLVINGYTPNASTGG
GVVHYTYSLDDNTLDHSVAGNDTVLDSIGITVTDTDGDTSNDTLDIEIVDDVAVAVADTD
SVGEDSSLSASGNVVTDSESNGDNGGDTLGADNAPVDPVTGVAAGSDASSAVSGNVGTSV
TGSYGSVVINADGSYTYTLDNTNPLVQGLSDTESLTDTFVYTISDADGDESTTTLTITIN
GSDDGTTIEIPDTNGSGGSGDETVYEAGLADGSNPGDSDEVTSSFTITAPDGLGSITVVD
GSGSDVVISESELLASATTNITIDTEYGTLVINGYTPNASTGGGVVHYTYSLDDNTLDHS
VAGNDTVLDSIGITVTDTDGDTSNDTLDIEIVDDVAVAVADTDSVGEDSSLSASGNVVTD
SESNGDNGGDTLGADNAPVDPVTGVAAGSDASSAVSGNVGTSVTAVTEVL
NT seq
7173 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggtgcactatacctacagtctggacgacaacacgctggatcacagtgttgcgggtaat
gacacggtgctcgacagcatcggtattacggtgacggatacggacggcgacacgtcgaac
gatacgctcgatatcgagattgttgatgacgttgcggttgcggttgccgatacggacagt
gtgggtgaagacagttcgttgagtgcgagcggtaatgtggtgacggatagcgagtcgaac
ggtgataacggtggtgacacgcttggagcggacaacgctcctgtggatccggtgacgggt
gttgctgcgggtagtgacgcgagcagtgcggtgagcggcaatgtcgggacgagtgtgacg
ggtagttacggaagtgttgtgatcaatgcggacggtagttacacgtatacgctggacaac
acgaacccgttggtgcagggtctgtcggatacggaaagtctgacggatacgttcgtgtac
acgatcagcgatgcggatggcgatgagagcacgacgacactgacgataacgatcaacggt
tcggatgacggtacgacgatcgagattcctgacacgaacggttctggcggttcgggtgac
gagacggtgtacgaagcgggtcttgcagacggtagcaaccctggtgacagtgatgaggtg
acgagcagcttcacgatcacggcgccggacggtcttggttcgatcacggtggttgacggt
agtggtagcgatgtggtgatcagcgagtcggaactgttggcaagcgcgacgacgaacatc
acgatcgataccgagtacggtacgctggtgatcaacggttacacgcccaacgcgtcgacg
ggcggcggtgtggtgcactatacctacagtctggacgacaacacgctggatcacagtgtt
gcgggtaatgacacggtgctcgacagcatcggtattacggtgacggatacggacggcgac
acgtcgaacgatacgctcgatatcgagattgttgatgacgttgcggttgcggttgccgat
acggacagtgtgggtgaagacagttcgttgagtgcgagcggtaatgtggtgacggatagc
gagtcgaacggtgataacggtggtgacacgcttggagcggacaacgctcctgtggatccg
gtgacgggtgttgctgcgggtagtgacgcgagcagtgcggtgtgcggcaatgtcgggacg
agtgtgacgggcagttacggaagtgttgtgatcaatgcggacggtagttacacgtatacg
ctggacaacacgaacccgttggtgcagggtctgtcggatacggaaagtctgacggatacg
ttcgtgtacacgatcagcgatgcggatggcgatgagagcacgacgacactgacgataacg
atcaacggttcggatgacggtacgacgatcgagattcctgacacgaacggttctggcggt
tcgggtgacgagacggtgtacgaagcgggtcttgcagacggtagcaaccctggtgacagt
gatgaggtgacgagcagcttcacgatcacggcgccggacggtcttggttcgatcacggtg
gttgacggtagtggtagcgatgtggtgatcagcgagtcggaactgttggcaagcgcgacg
acgaacatcacgatcgataccgagtacggtacgctggtgatcaacggttacacgcccaac
gcgtcgacgggcggcggtgtggtgcactatacctacagtctggacgacaacacgctggat
cacagtgttgcgggtaatgacacggtgctcgacagcatcggtattacggtgacggatacg
gacggcgacacgtcgaacgatacgctcgatatcgagattgttgatgacgttgcggttgcg
gttgccgatacggacagtgtgggtgaagacagttcgttgagtgcgagcggtaatgtggtg
acggatagcgagtcgaacggtgataacggtggtgacacgcttggagcggacaacgctcct
gtggatccggtgacgggtgttgctgcgggtagtgacgcgagcagtgcggtgagcggcaat
gtcgggacgagtgtgacgggcagttacggaagtgttgtgatcaatgcggacggtagttac
acgtatacgctggacaacacgaacccgttggtgcagggtctgtcggatacggaaagtctg
acggatacgttcgtgtacacgatcagcgatgcggatggcgatgagagcacgacgacactg
acgataacgatcaacggttcggatgacggtacgacgatcgagattcctgacacgaacggt
tctggcggttcgggtgacgagacggtgtacgaagcgggtcttgcagacggtagcaaccct
ggtgacagtgatgaggtgacgagcagcttcacgatcacggcgccggacggtcttggttcg
atcacggtggttgacggtagtggtagcgatgtggtgatcagcgagtcggaactgttggca
agcgcgacgacgaacatcacgatcgataccgagtacggtacgctggtgatcaacggttac
acgcccaacgcgtcgacgggcggcggtgtggtgcactatacctacagtctggacgacaac
acgctggatcacagtgttgcgggtaatgacacggtgctcgacagcatcggtattacggtg
acggatacggacggcgacacgtcgaacgatacgctcgatatcgagattgttgatgacgtt
gcggttgcggttgccgatacggacagtgtgggtgaagacagttcgttgagtgcgagcggt
aatgtggtgacggatagcgagtcgaacggtgataacggtggtgacacgcttggagcggac
aacgctcctgtggatccggtgacgggtgttgctgcgggtagtgacgcgagcagtgcggtg
agcggcaatgtcgggacgagtgtgacgggcagttacggaagtgttgtgatcaatgcggac
ggtagttacacgtatacgctggacaacacgaacccgttggtgcagggtctgtcggatacg
gaaagtctgacggatacgttcgtgtacacgatcagcgatgcggatggcgatgagagcacg
acgacactgacgataacgatcaacggttcggatgacggtacgacgatcgagattcctgac
acgaacggttctggcggttcgggtgacgagacggtgtacgaagcgggtcttgcagacggt
agcaaccctggtgacagtgatgaggtgacgagcagcttcacgatcacggcgccggacggt
cttggttcgatcacggtggttgacggtagtggtagcgatgtggtgatcagcgagtcggaa
ctgttggcaagcgcgacgacgaacatcacgatcgataccgagtacggtacgctggtgatc
aacggttacacgcccaacgcgtcgacgggcggcggtgtggtgcactatacctacagtctg
gacgacaacacgctggatcacagtgttgcgggtaatgacacggtgctcgacagcatcggt
attacggtgacggatacggacggcgacacgtcgaacgatacgctcgatatcgagattgtt
gatgacgttgcggttgcggttgccgatacggacagtgtgggtgaagacagttcgttgagt
gcgagcggtaatgtggtgacggatagcgagtcgaacggtgataacggtggtgacacgctt
ggagcggacaacgctcctgtggatccggtgacgggtgttgctgcgggtagtgacgcgagc
agtgcggtgagcggcaatgtcgggacgagtgtgacgggcagttacggaagtgttgtgatc
aatgcggacggtagttacacgtatacgctggacaacacgaacccgttggtgcagggtctg
tcggatacggaaagtctgacggatacgttcgtgtacacgatcagcgatgcggatggcgat
gagagcacgacgacactgacgataacgatcaacggttcggatgacggtacgacgatcgag
attcctgacacgaacggttctggcggttcgggtgacgagacggtgtacgaagcgggtctt
gcagacggtagcaaccctggtgacagtgatgaggtgacgagcagcttcacgatcacggcg
ccggacggtcttggttcgatcacggtggttgacggtagtggtagcgatgtggtgatcagc
gagtcggaactgttggcaagcgcgacgacgaacatcacgatcgataccgagtacggtacg
ctggtgatcaacggttacacgcccaacgcgtcgacgggcggcggtgtggtgcactatacc
tacagtctggacgacaacacgctggatcacagtgttgcgggtaatgacacggtgctcgac
agcatcggtattacggtgacggatacggacggcgacacgtcgaacgatacgctcgatatc
gagattgttgatgacgttgcggttgcggttgccgatacggacagtgtgggtgaagacagt
tcgttgagtgcgagcggtaatgtggtgacggatagcgagtcgaacggtgataacggtggt
gacacgcttggagcggacaacgctcctgtggatccggtgacgggtgttgctgcgggtagt
gacgcgagcagtgcggtgagcggcaatgtcgggacgagtgtgacgggcagttacggaagt
gttgtgatcaatgcggacggtagttacacgtatacgctggacaacacgaacccgttggtg
cagggtctgtcggatacggaaagtctgacggatacgttcgtgtacacgatcagcgatgcg
gatggcgatgagagcacgacgacactgacgataacgatcaacggttcggatgacggtacg
acgatcgagattcctgacacgaacggttctggcggttcgggtgacgagacggtgtacgaa
gcgggtcttgcagacggtagcaaccctggtgacagtgatgaggtgacgagcagcttcacg
atcacggcgccggacggtcttggttcgatcacggtggttgacggtagtggtagcgatgtg
gtgatcagcgagtcggaactgttggcaagcgcgacgacgaacatcacgatcgataccgag
tacggtacgctggtgatcaacggttacacgcccaacgcgtcgacgggcggcggtgtggtg
cactatacctacagtctggacgacaacacgctggatcacagtgttgcgggtaatgacacg
gtgctcgacagcatcggtattacggtgacggatacggacggcgacacgtcgaacgatacg
ctcgatatcgagattgttgatgacgttgcggttgcggttgccgatacggacagtgtgggt
gaagacagttcgttgagtgcgagcggtaatgtggtgacggatagcgagtcgaacggtgat
aacggtggtgacacgcttggagcggacaacgctcctgtggatccggtgacgggtgttgct
gcgggtagtgacgcgagcagtgcggtgagcggcaatgtcgggacgagtgtgacgggcagt
tacggaagtgttgtgatcaatgcggacggtagttacacgtatacgctggacaacacgaac
ccgttggtgcagggtctgtcggatacggaaagtctgacggatacgttcgtgtacacgatc
agcgatgcggatggcgatgagagcacgacgacactgacgataacgatcaacggttcggat
gacggtacgacgatcgagattcctgacacgaacggttctggcggttcgggtgacgagacg
gtgtacgaagcgggtcttgcagacggtagcaaccctggtgacagtgatgaggtgacgagc
agcttcacgatcacggcgccggacggtcttggttcgatcacggtggttgacggtagtggt
agcgatgtggtgatcagcgagtcggaactgttggcaagcgcgacgacgaacatcacgatc
gataccgagtacggtacgctggtgatcaacggttacacgcccaacgcgtcgacgggcggc
ggtgtggtgcactatacctacagtctggacgacaacacgctggatcacagtgttgcgggt
aatgacacggtgctcgacagcatcggtattacggtgacggatacggacggcgacacgtcg
aacgatacgctcgatatcgagattgttgatgacgttgcggttgcggttgccgatacggac
agtgtgggtgaagacagttcgttgagtgcgagcggtaatgtggtgacggatagcgagtcg
aacggtgataacggtggtgacacgcttggagcggacaacgctcctgtggatccggtgacg
ggtgttgctgcgggtagtgacgcgagcagtgcggtgagcggcaatgtcgggacgagtgtg
acgggcagttacggaagtgttgtgatcaatgcggacggtagttacacgtatacgctggac
aacacgaacccgttggtgcagggtctgtcggatacggaaagtctgacggatacgttcgtg
tacacgatcagcgatgcggatggcgatgagagcacgacgacactgacgataacgatcaac
ggttcggatgacggtacgacgatcgagattcctgacacgaacggttctggcggttcgggt
gacgagacggtgtacgaagcgggtcttgcagacggtagcaaccctggtgacagtgatgag
gtgacgagcagcttcacgatcacggcgccggacggtcttggttcgatcacggtggttgac
ggtagtggtagcgatgtggtgatcagcgagtcggaactgttggcaagcgcgacgacgaac
atcacgatcgataccgagtacggtacgctggtgatcaacggttacacgcccaacgcgtcg
acgggcggcggtgtggtgcactatacctacagtctggacgacaacacgctggatcacagt
gttgcgggtaatgacacggtgctcgacagcatcggtattacggtgacggatacggacggc
gacacgtcgaacgatacgctcgatatcgagattgttgatgacgttgcggttgcggttgcc
gatacggacagtgtgggtgaagacagttcgttgagtgcgagcggtaatgtggtgacggat
agcgagtcgaacggtgataacggtggtgacacgcttggagcggacaacgctcctgtggat
ccggtgacgggtgttgctgcgggtagtgacgcgagcagtgcggtgagcggcaatgtcggg
acgagtgtgacggcagttacggaagtgttgtga
DBGET
integrated database retrieval system