Pseudoalteromonas rubra: AT705_00745
Help
Entry
AT705_00745 CDS
T04179
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
prr
Pseudoalteromonas rubra
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
RHS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALU41573
UniProt:
A0A0U3HF55
LinkDB
All DBs
Position
1:159100..164022
Genome browser
AA seq
1640 aa
AA seq
DB search
MRFERFYNSRVTTQGNLWKRALNGKEYFTYAPEGTVLPTLDGAVDEIEKSAYGYGGVWSH
SYSQHIKVKKSTWSLTVHVKTEDGGSIYVSRHDGGMDTYPERQSINYDQDGYQASRLEYF
HQDETWKLTNKKNNTVEHFNSEGKLTRIDFNDGNQHSVVYDGNSTEVTDSFGNKLTLVKN
DLGQLQYVTMSDGTAVQYEWNGSLLAKAYFPSDAQRQSDMSIDTNAPHRTYHYLAYEPSL
EEFKVGPLSGTYWAEYTALTGITDELGHRYATWGYNSDKSKTYSTLEFARAVSYKQGERF
NPTQVNVESPSSGDVLNISVTTGEDFKSRYTYDGNEQRFMNLTDVHHDRNAIGCELEGFT
GPGTQNVLLGYKKTSTPGRIEGSGYAYSKREYSGGKVVTHDYKKHNIYYAANGPSYPFRQ
STTDLEYVRESIPTVANGGYGTCSGDHEVCAYRLTRFQFSTVDGSLVSTSMAGQKEFNYL
KNGLPQTSYLEDELSYRYDHEPYQVTVKKRQTDYTYTDTVAGLPLKKILTIDGPRTDVED
VTQYSYYETGEAYPGLLKRIVNPAGHTIEITAYENDRPTEVTNPNGSVTSYGYHYRGWLT
SVTEAGDTTRYDYYDNGYLEKVTLPDGSYSKFTYNSANILTQIENNLGEKTVFSNFDAYG
VPRKIEGKDASGSVRSLVSLLTDQLGRVKALTGNDGQNTEFTYHMNGSIDAINELANIVA
NSNGQSENVVNTTGNKYDSLGRLREIAHPDGGVIYLDYDQRDNVTMITDPNEAVTEYTYD
GLDNIIQIKSPDSGTTVYWYDAAGNTTRKLDANGFTTEYTYDVLNRLTGKQFIDSPEQNI
TLNYDETENGKNGIGQLTSVIDSSGTLDYFYDDKGRLIKQVQQTALQTSVTEFEYNKRDQ
ITHITYPSGRIVIYGYDAIGQIESVTTQADAYATPVELAVSIGYLPFGPMQSMELGNTLI
SKVTYDKDLRIEALELKKGNVDVLNQTYTYELNNDIDLISDLVDSTKTQDLAYDKMHQLS
EAVGGYGVFEVDYDLAGNRTTVTKDTQVQTYSYSGSNQIQTITGHNANSFSYDAAGNLMS
DVRRGHIYTFDKQNRLVAITKANSVIAEYAYNGLNQRVAKFASTRNTIYHYDNNGLLIAE
SDNEGVVYREYIYLNGQLLAITDLGDVSWQGYDLNSGAVVAALTASHGGMTLSGASSANS
FYHHELNGDGSIGVNVEDFNAPLKERASVGLMIRGSNAQDAAYASVRLNANSKFIPIAGK
IFVPLFASLPELEVSYREFAGGPVVNETVRLYGRHIKLEKYGAAVNLYNSADGLNWHRVK
SVSVSMSTKSLIGVTQSNLPEDERVALSSIKVTGHAPSSEAYAIGYVHNDHIGMPSVITN
DSGETIWRATHTPFGYSVVDGDVDGDANTTILNVRFPGQYYDAESGLHYNWHRYYDPALG
RYISSDPLGLADGVNIYAYGRNNPVASVDPTGLFLTTLDAACLQNPALCADIVGDIAKTP
GGIAKKANMCQPGGAESFNQALDYGVKGLRAYQKTMSIKAALQVPWRVGNDAFRAYKKTG
SMISAMKAPWRSGRGKVNAVDSGADLVDGYNSAVDLFTGGFTTNPTTINPAKYFVSLYQR
VDSRVPRRFTWYYSSQEKRP
NT seq
4923 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgcgttttgaacggttttataatagtcgtgtgactacacaaggcaacctttggaagaga
gcgcttaacggcaaagagtattttacatatgcgcctgaaggtactgtcctgccaacgctg
gatggtgctgtggatgagatagaaaagtcagcatatggatatggaggcgtatggagccat
tcttattcacaacacatcaaagttaagaaatctacctggagtctgactgtacatgtaaaa
accgaagatggtggttctatttatgtctcgcggcacgacggtgggatggacacatatcct
gagagacaaagtattaattatgatcaagatggctatcaagcaagccggttagagtatttt
caccaagatgaaacctggaagctcacaaacaagaaaaacaatacggtagaacacttcaat
agtgaagggaaacttacccgtatagactttaatgatggcaatcagcactcggttgtgtat
gacggtaattcgacagaggttacagattcatttggaaacaagctcacattggttaaaaat
gacctaggtcagcttcagtacgtgaccatgtcagatggaacggctgttcaatatgagtgg
aatggaagtttgttagcaaaagcgtactttccaagcgacgcgcagcgccaatctgatatg
agcattgatacaaacgccccacatcggacttatcattacttagcttatgaaccgtcatta
gaggaattcaaggttggccctctttctggtacttattgggcggagtatacagcattaacc
ggtatcacggatgaacttggccatcgttatgccacctggggttacaattcggataagagc
aagacgtattcgactctagagttcgctagagcggtttcctataaacagggcgagcgtttc
aatccaacacaagtcaatgttgagtctccatctagcggagacgtattgaatatctcagtt
acgacgggggaagattttaaaagccggtatacctatgatggtaatgagcaacgattcatg
aacttaacggatgttcatcatgacagaaatgccatcggctgtgaactggaggggttcact
ggtccgggaacccaaaatgttctactgggttataaaaaaaccagtacacccggtcgcatt
gaaggcagtggttatgcgtactcaaagagggaatactctggcggtaaagtcgttactcat
gattataaaaaacacaatatctactatgcggcaaatggaccgtcttacccttttcgtcaa
agcacaacagatttggaatacgtaagagagagcattccgacagttgctaatggcggctac
ggaacatgtagtggtgaccatgaagtatgtgcttatagattaaccagatttcaatttagt
actgttgatggcagtttggtctcaacctcaatggccggacaaaaagaattcaattatctg
aaaaatggattgccacaaacgagctatctcgaagatgagctgagctacaggtatgatcat
gaaccttatcaagtcactgtaaaaaaaaggcaaacagattacacctacactgatactgtt
gccggactgccgctgaaaaagatcttgacgatagacggacctagaacagatgtggaggac
gttacccagtattcctattatgagacaggtgaggcgtatccaggcctactaaagcgcata
gtcaatcctgctggtcatacaatagaaattacggcgtatgaaaacgatcgaccaacggaa
gtgacaaaccctaatggctctgtaactagttacggctaccattaccgtggatggcttact
tctgtaactgaagcaggtgatacgactcgttacgattattatgataatgggtatctggaa
aaagtgacattgccagacgggtcttacagtaaattcacatataacagtgcgaatatattg
actcaaattgaaaataatttgggtgaaaagaccgtattcagtaattttgatgcctatggt
gtgcccagaaaaattgaaggcaaagatgcatcgggctcagttcgttcattagttagtttg
ttgacagatcagctcggccgggtcaaggctttgacaggtaatgatggccagaataccgag
tttacctatcatatgaacggtagcattgacgcaatcaatgaactagccaatatcgtggct
aatagcaatggtcaaagtgaaaatgtagtaaatacaactggcaataagtatgattcacta
ggccgcttacgcgaaattgcacaccctgacggtggagtgatttatcttgattacgatcaa
agagacaatgtgacaatgatcacagacccaaatgaggctgtgacagaatacacttatgat
ggccttgataatattattcaaatcaagagcccggattctggcactaccgtatactggtat
gatgcagctggtaatacaactagaaagcttgatgccaacgggtttacaaccgagtacacc
tatgatgttttaaatcgcctgacggggaaacagtttatagactctccagagcagaatatt
acgcttaattacgatgaaacagagaatggtaagaacggtattggccagctgacgagtgtt
attgatagtagtggtacgctggactatttttacgatgacaagggtcgtttgataaagcag
gtacagcaaactgccttgcaaaccagtgtgacagagtttgaatataataaacgtgatcag
atcactcacatcacttaccccagtggccgcattgtgatctatggttatgatgccatcgga
cagatagagtcagtaactacgcaagcagatgcctatgcgacacctgtggagctggcggtg
tcaattggctacctaccatttggacctatgcagtcaatggagctgggcaacactttaatt
agtaaggtaacctacgacaaagacttgagaattgaggcattggagcttaaaaaaggcaat
gtcgatgttctgaaccagacttatacctacgagctcaacaacgacattgatttaatcagt
gatctggttgattctacgaaaacacaggatcttgcatacgataagatgcatcagctgagt
gaagctgtggggggatatggcgtattcgaggtcgattacgatttagcaggtaaccgtacc
acagttaccaaagacacccaggtacaaacttatagctactcaggtagtaatcagattcag
acaatcacgggtcacaatgcgaatagttttagctatgatgcggcgggcaatctgatgagt
gatgtacgtcgaggtcatatctatacatttgacaagcagaatcgactcgttgctattact
aaagctaattcagtgattgctgaatatgcttataatggcctgaatcaacgtgttgcaaag
tttgcgtcaacaaggaacacgatatatcactatgataataatggcctactgatagctgag
tccgataatgaaggggtcgtctatcgtgagtatatctatctaaacggtcagctattggcg
ataacagatctgggtgatgtaagctggcaaggatatgatttgaattccggtgcggttgtg
gctgctttgactgcctcacatggtggaatgaccctttcaggtgccagttcggccaattcg
ttctatcatcatgaattaaatggagatggctccattggcgttaatgttgaagactttaac
gccccgctaaaggaaagggcttccgtgggattgatgattagaggaagtaacgcacaagat
gctgcgtacgcgtctgtgcgtttgaatgcaaactcaaagtttatacctattgcaggtaag
atctttgtgccactctttgcttctttgccagagctggaggtcagctacagagaatttgcc
ggagggcccgttgtcaatgaaaccgtgcgcttgtatggaaggcacatcaagctggaaaag
tacggtgctgcggttaatttgtataattcagcggacggcttaaactggcatcgggtaaag
tccgtgtctgttagcatgagcacgaagtcccttataggggtcactcagagtaatctgccc
gaagatgagcgagttgcactgagtagcattaaggtgacaggacatgctccgagctcggaa
gcctatgcaatcggatatgtacacaatgatcatattgggatgcccagcgtgattacaaat
gatagtggagagaccatctggcgtgcaacgcatactccatttggttactcggtcgttgat
ggagatgttgatggggatgccaatacaacaatactgaatgtacggttcccaggtcagtat
tatgatgcagaatcgggcttgcattacaactggcatcgttattatgaccctgcacttgga
cgatatattagcagcgacccattgggattagctgatggcgtgaatatttatgcgtatggt
aggaataacccggtagcatctgtggacccaacgggcctgttcttaacgactctggatgcg
gcttgtttacagaaccctgccttatgtgcagatattgtaggtgatatcgctaaaacgccg
ggaggtattgctaagaaagctaatatgtgtcaacccggtggtgctgaatcctttaatcaa
gcacttgattatggtgtgaaagggttaagggcctatcaaaaaacaatgtcaattaaggcg
gcattacaggttccatggagggtagggaatgatgcgtttagggcttataaaaagacaggg
tcaatgatatcggcaatgaaggctccatggaggtcaggtcgtggcaaggttaacgctgtt
gatagtggagctgatctggttgatggttacaattcggcggttgatctatttaccggaggg
tttacaaccaaccctacaacgattaaccctgccaaatatttcgtttcactttatcagaga
gtggactcacgcgtaccacgtcgatttacctggtattattcttctcaggaaaaaaggcct
taa
DBGET
integrated database retrieval system
