Pseudoalteromonas rubra: AT705_12770
Help
Entry
AT705_12770 CDS
T04179
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
prr
Pseudoalteromonas rubra
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
K319L-like_PKD
LRR_8
LRR_EndoS
LRR_Zer-1
Flg_new_2
FlgH
Lipocalin_3
PKD_4
DUF5707
DUF7055
Hus1
Lipocalin_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALU43738
UniProt:
A0A0U3GFV1
LinkDB
All DBs
Position
1:2946601..2951241
Genome browser
AA seq
1546 aa
AA seq
DB search
MTLLTQGRCIKLSLVTALSLVLAGCGGGSDAPAPVTDKAPDPIPSDKNNPLPTVSIADVG
EQLEQNAFSLTANASDDGSIAGYAWTYSSSLQLTEADTNSATPTYTVPDITQDATITFTV
TVTDDKGATNSASKDVLIKRKVNSVTLNGIVTDQPISNANVVVSAGSAQAEVTASGEGLY
TATLTVDESEVNSLVRVSATGVGAQDVVEFVSVLNSVATLTEQAGEDGILDKEENFGVNI
TNVTTAEYALMTRTGAPLTTDVELDQALLNVDADEKITLASLIKIVVDNDNYSLPEGVSS
TLDLVDDEQTAQAYEDDVNASDPNLIEDTKKEIKEDDDLIDDSVASLNGDFILQAVKNYD
ARPYHVSLNEDGTGSVSAINTVDIESWKQENSTVSITLKQPLHISTWENNHDVSVFINSL
EMTILAENDVFRTVDIVELGSTITAGDMPGTETYERKYTSNLLSKLKTAQPTTEELVGVW
YMDITDADGNTEKDPPQHFEFKADGQIVALDDLDVDEEINWRLDGNTLVIDYQDPEESGT
ITFWFTKKLGAGYQVVTLDTSDVEWPDTEFGLFVKAQPDARWTEETVAGRWHGFIGKEQE
RFYTDQFSTGELYINTFDYAYTWNLAEEGKVFYRNRYWQGDQWVGHCDVAASNCSVEARV
AHRLIAIADDHYYVTRIFERFDREGNPTYFDSSLFIYQYNPTISQTEFLPRNLEHSRTMW
ARDEEAKSWVSVDFGRVEKPTEPGEWHNQLVIGYESYTYTLSDGKLAFTRDEQPHYVELL
DYNAERMQVCVYEASKGCQEASKQDWYYHPTVFEVRTETDGNGYLSPDWQQVVEGHSTIL
NVEPNSGYRLDTIEGCNGELAGYDYMIPAVTESCQVSATFKIRESLAAEAGITDPVLAKC
VDDSDAPDLSSVRQLFCGYQNVVMSTTGLDKLTNLHSLSLTLDLDGALDLSALTQLNYLE
LFNIESVESIVGIDQLTNLRTVRLTMNSPGELNLSLLAQLPQLTELTVHNSDMISSIAGL
DQLTNVQSLSLSVQMDGELDLSVLTQLTRLSIEYSQYQSLVLPEAEQLYALALIQVQLSD
TELAGLNLSRYANLSELNLSGNLLTNFSGDDYPGLTDLTIEGSNIEGQLATLKVDLNAQL
RYLDVSENQLTELDISANSLLERVHIENNRLTQLVTGSHPELTSLGAWSNQLTELTVAGM
PQLVYLDIEYNQLSQLDVSNNPNLDTLWLNFNKLTALDLSKNTQLNKLYASELKQLSHLD
LSQNNLLEVLYLSNNEHWESFTVADLSMLQTLAVNGSPQLYSAITQQSLPALIELDVSDL
PASLVNLADFPMLKTLSWRSGGLTTIDLAQLPELISLDLSDNPLETLDVSQSKRLEWLTL
ENTSLTSLDTGNLSELSWLAISRSQITALDLQQNHKLDNVNADNGALESVTGLEVLENPT
AYLSFYNNPLNMETVTYFTQLREQGYSNLYFNQQYTARMESLGNGGFSLLEITLQFGEVT
YVDLYPDTGFQVGDATGCPGELSGTSFLLGPLVANCTLQVEFVPVQ
NT seq
4641 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacattacttactcaagggcgctgcataaagctttcgcttgtgactgcgttatcactg
gtattagctggatgtggagggggcagtgatgcacctgcacccgttacagataaagcacca
gatccaataccttcagataaaaacaatccgcttccaactgtgagcattgcggatgttgga
gaacagcttgagcagaatgcattttcgctgactgccaatgccagtgatgatggctcgatt
gcgggttatgcctggacgtatagctcttctttacagctcaccgaggcagacacaaactcc
gccactcccacctataccgtgccggacataacgcaagatgccaccatcacgtttactgtt
acagtcaccgatgacaagggggcaactaatagtgccagcaaagacgtgctgataaaacgc
aaagtgaattcagtgacattgaatggcatcgtaacggatcagcccatcagcaatgccaat
gtggtggtcagtgcggggagtgcccaggcagaggtgacggcctctggggaaggcctttac
actgctaccctgactgtagacgagagtgaagtaaacagtctggtacgtgtttctgctact
ggggtgggggcacaggacgtggttgagtttgtctcagtattgaactcagtcgcgacactg
acagagcaagccggtgaagatggtattctcgacaaagaagagaactttggcgttaatatt
accaatgtgaccaccgccgagtatgccctgatgacacggaccggtgcgccgctgacgacc
gatgtcgagctggatcaggcgttgcttaatgtggatgccgacgagaaaatcactttggcg
tctctgatcaagattgtagttgataacgacaactactccttgcctgagggggtgagctcg
accttagatctggttgatgatgagcaaacggcccaggcgtacgaagatgatgtgaatgca
tcggaccctaaccttatcgaagacaccaagaaagagatcaaagaggacgatgacctgatt
gacgactcagttgcctcacttaatggtgacttcattctgcaggcagtgaaaaactatgac
gcacggccttatcatgtcagcctgaatgaagatggaacgggctctgtatcggccattaac
acagttgacattgagagctggaagcaggaaaacagtacagtctcgatcacgctgaaacag
ccgctacacatttccacctgggaaaataatcatgacgtctctgtgttcatcaactcactc
gaaatgaccatattggcagaaaatgacgtattcagaacggtcgatatcgtagaactgggg
tcaacaatcacagccggagatatgccaggcacggaaacgtacgagcggaagtacaccagt
aacctgctgagtaagttgaagacggcgcaacccaccacggaggagttggtgggtgtatgg
tacatggatatcaccgacgccgatggtaatacagaaaaggatcccccacagcactttgag
tttaaagcggatggccaaatcgttgcgctggacgacctggatgttgatgaggagataaac
tggcgtctggacggcaacaccctggtgattgattatcaggatccagaagagtcgggcact
attacattctggtttaccaaaaaactgggggcaggctatcaggtggtgactctggatacc
agtgacgttgagtggccggatactgaatttggattatttgttaaggcacagcctgacgca
cgttggactgaagaaactgtggcagggcgctggcatggctttatcggtaaagagcaggaa
cgcttctatacagatcagttcagcaccggggagttgtacattaatacatttgattatgcg
tacacatggaacctggctgaagaaggaaaagtgttttatcgtaaccgctactggcaaggc
gaccagtgggtcggtcattgtgatgtggctgcaagtaactgctctgtcgaagcgcgtgtt
gcgcaccgtctcattgccattgcggatgaccactactatgtcacacgtatctttgaacgc
tttgaccgcgagggaaatccaacgtactttgattcaagcttgtttatttaccagtacaat
ccaaccatctcacagacagagtttttaccccgaaacctggagcacagtcgcacaatgtgg
gcacgggatgaggaagccaaatcttgggtgtctgtcgatttcggcagagtagaaaagccg
acagagccaggagagtggcataaccaattggtcatcggttatgaaagttatacctacact
ctgagcgatggcaagttggcctttacccgagacgagcagcctcattatgttgagttactg
gattacaatgccgaaagaatgcaggtgtgtgtctatgaggcaagcaaaggctgtcaggaa
gccagcaaacaagactggtactatcaccctactgtatttgaagtacgcactgaaacagac
ggcaacgggtatctgtcaccggactggcagcaagtggttgaaggacacagcaccatatta
aatgtagaacctaactcgggttatagactggatactattgaaggctgtaacggtgagctt
gcggggtatgactacatgatcccagcggtgactgagtcatgtcaggtatccgcgacgttt
aaaatacgggaaagcttagcagctgaagccgggatcaccgatcccgtattagctaaatgt
gttgacgatagtgatgcaccggatctgagctcggtgcgccaattattctgtggctatcag
aatgttgttatgtcaacgacaggactcgataaactgactaatttgcattcactctcccta
acactggatttggacggtgcacttgatctgtctgcactgacacagcttaactacctggag
ttatttaatattgagtccgttgagtccatcgttgggatagatcaactcactaacttgcgg
actgtacgattaacgatgaactcgcccggtgagctgaacttgtctttgctggcgcagttg
ccccagctcactgagctgacagtacataacagtgatatgatcagctcaattgctggatta
gaccagcttaccaatgtgcagtcattgtccttaagcgtgcagatggacggtgaattggac
ttatctgtcctgacgcaactcacgcgtttaagcatcgaatatagtcaatatcagtcactg
gttctgcctgaagccgaacagctctacgccctggcgcttatccaggttcagctgagtgat
actgaacttgccgggctcaatttgtctcgctatgcaaatttaagcgaactgaatttatca
gggaatttactcactaactttagtggagatgattatcctgggttgactgacctgactatt
gaaggcagcaatatcgaggggcagctggcaacacttaaggtggatctcaatgcacagctg
cggtacctggatgtcagtgagaaccagttaacggaactggatatttcagctaactcgtta
ttggaacgcgtgcacattgagaacaaccgcttaactcagctggtgaccggatctcaccct
gagttaacctcactgggggcctggagtaaccaactgacggagttaacggtggcgggtatg
ccgcagcttgtatatctggatattgaatataatcaactttcacagctggatgtgtcgaat
aaccctaatcttgacactttgtggttgaacttcaataaactgactgcactggatttatct
aaaaacacgcagctaaataagttatatgctagtgagttaaagcagctaagtcatttagat
ttgagccagaataatctacttgaggtactctacctctccaataatgagcactgggagagt
tttaccgttgccgatttatctatgcttcaaaccttagcggtaaacggcagtccgcagcta
tatagtgcgatcactcaacaatctttaccggctttaattgagttggatgtcagtgacctg
cctgcttcgttggtcaacctggcagatttcccgatgctgaaaacgcttagctggcgttca
ggcgggttaacaacgatagatttggctcagctcccggaattaatctccctggatttatcg
gataacccgctggaaacacttgatgttagtcagagtaagcgcctggaatggctgactctg
gaaaatacatcactaaccagccttgataccggcaatctgagtgaacttagctggttggca
atttcccgctcacaaataacagcgctggatctgcagcaaaatcacaagttagataatgtg
aatgctgataatggggctctagagtctgtgacgggtctggaagtgctggagaaccctacg
gcatatctgagtttctataataacccgctgaacatggagacagttacttactttactcag
cttcgggagcagggatatagcaatctttattttaatcagcaatatactgccagaatggag
tcattgggtaacggcggatttagcctactcgaaataacgctgcaattcggagaagtgacg
tatgttgacctgtatccggatacgggctttcaggttggcgatgcgaccggttgccccgga
gagttgtcaggaaccagcttcttgctggggccattagtagccaattgcacgctgcaggta
gagtttgtgccagtgcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system