Xylanibacter ruminicola: PRU_2551
Help
Entry
PRU_2551 CDS
T01212
Name
(GenBank) TonB dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pru
Xylanibacter ruminicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pru00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pru02000
]
PRU_2551
Transporters [BR:
pru02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PRU_2551
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
NADH_dhqG_C
FtsX_ECD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADE82499
UniProt:
D5EX57
LinkDB
All DBs
Position
3086522..3088621
Genome browser
AA seq
699 aa
AA seq
DB search
MFLGLLLSAMLVVEGPEVTPADTTTARSYKLDEVVVSAFKTNKYELVPASRSALSARQLS
NQQITGLKELTAVIPNFYMPDYGSRASCPVFVRGVGNKSDGTGIGFYVDGMPFYEPLSFD
CDLGDVASVEVLRGPQGTLYGRNAIGGIVNISTRNPLEYQNTRVRLGYGKYNDLRTQISN
YTKVSDKFGFTFGALYHHNDGAFRNSYLNEKVDKMNETEERIGLYYKPSDNWLIRLNSHF
SYSDQGGYPYAPVNVETNTLQDINYNRYSSFRRLISTNGLGITYNGPVVSFNSQTSFQYI
NSKQAIDQDFTVNDKSFVENARHQNMVSQEFTLKSNNDSRYQWVVGAFGMMEHVDRTVDN
FSPSAGSLSHTNYCVPTSSLALYHQSTYNIWQGLSATAGIRFDYEHAKTNYDNLKVKASP
LSDGGFTLVDPSQMSSATGESFESSKDFTQVTPKFTLQYLTTEDNLYYVSVTRGYKPGGF
NKSFSTFDERSYEPEYSWNYEVGASINLLNNLLTLSADLFYIDWRHMQITSTITGVGNIT
TNAGHTDSKGAELNVIVRPVEGLQFTANYGYTYARFLSYVKSATVDYTNNRLPMVPNHTL
SLDANYTINPTGWLDRVMFNVGLRGLGRIYWAEDNLVSQDFYTTLNAKVAFTKGIVTWEV
WGKNLTDTNYMAYGFKSSTGNYAQAGKPLMFGTTIELNF
NT seq
2100 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttttaggattactattatcagcaatgttggtggttgaaggaccagaggttacaccc
gccgacacaaccacagcccgctcgtacaagctcgacgaagtggtggttagtgcgtttaaa
acaaacaaatacgagttggtgcctgcatcgcgttcggctttgtcggctcgtcagctcagt
aatcagcagataacaggacttaaggagttaactgccgttattcccaatttctatatgccc
gactatggttcgagagccagttgccccgtgtttgtacgcggtgtgggtaataagtcggat
ggaacaggtatcggcttttatgtagatggtatgcctttctacgagcccctctcgtttgat
tgcgatctgggcgatgttgcctcggttgaggtgctacgtggtccgcagggtacattgtat
ggtagaaatgccatcggtggtattgtaaacatcagtacccgtaacccattggagtatcag
aacacccgtgttcgtctgggctatggtaaatataacgatttgcgcacgcagatatctaat
tacaccaaggtatcggataagttcggttttacctttggtgcactctatcatcataacgat
ggcgccttccgtaatagctatctgaacgaaaaggtagataagatgaacgagaccgaggag
cgtataggattgtattataagccatctgataattggttgatacgccttaacagccatttt
tcctacagcgatcagggaggttatccctatgccccagtgaatgttgaaaccaatacgttg
caggatatcaactacaaccgttatagctcattccgtcgccttatcagcaccaatggtctg
ggtattacttataatggtcctgtggttagctttaatagccagacatcgttccagtatatc
aactcaaagcaggctatcgatcaggactttactgttaacgacaagtcgtttgtagagaat
gcccgccaccagaatatggtgtcgcaggagtttactctcaagtcgaataacgatagccgt
taccagtgggtggttggtgcctttggcatgatggagcatgtggatcgtacagttgataac
ttctcaccatcagcaggctcgctcagtcataccaactattgtgttccaaccagttcgttg
gccctgtatcaccagagtacctacaacatctggcagggactttcggctacagctggtatc
cgttttgattatgagcatgcaaagaccaactatgataatctaaaagtaaaagcctcgcca
ctatccgatggaggttttacgttggttgatcccagtcagatgtcttcggctacaggcgaa
tctttcgagagcagcaaggattttacacaggtaacacctaagtttacgcttcagtatctt
actaccgaggataacctctactatgtgtcagttactcgtggctataaaccaggtggtttc
aataagtcgttctctacattcgatgagcgttcgtacgagccggaatacagttggaactac
gaggttggcgccagcattaacctgctgaacaatctgcttaccctgagtgccgacctgttc
tatatcgattggcgtcacatgcagattacttctaccattacaggcgtgggtaatatcacc
accaatgctggtcatacagatagcaagggtgctgagttgaatgtaatcgtgcgtcctgtt
gagggcctgcagttcacggctaactatggatatacttatgcccgtttcctctcttatgta
aagagtgccacagtagattatactaataatcgcctgcccatggtgcccaaccacacgcta
agcctcgatgccaactacaccatcaaccccacaggttggttagatcgtgtgatgttcaat
gtaggtttgcgtggcttgggtcgtatctactgggccgaggataatctggtaagtcaggat
ttctataccacactcaacgccaaggtagcctttaccaagggtattgttacctgggaggta
tggggtaagaacctgactgataccaactatatggcttacggctttaagtcatctaccggc
aactatgcccaggcaggcaagccattgatgtttggaaccactatcgagttaaatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
