KEGG   Xylanibacter ruminicola: PRU_2708
Entry
PRU_2708          CDS       T01212                                 
Name
(GenBank) putative receptor antigen RagA
  KO
K21573  TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
pru  Xylanibacter ruminicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pru00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pru02000]
    PRU_2708
Transporters [BR:pru02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   PRU_2708
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug CarbopepD_reg_2 CarboxypepD_reg Big_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADE83305
UniProt: D5EXZ5
LinkDB
Position
3312569..3315778
AA seq 1069 aa
MYKRERKVSKTMCSSLLLLSAGAMTFGSPVSVLANSVSQPLTEVTSVQQQKKVIITVVDG
QNEPVVGASVMMMSSKTGVITDINGRCDIDAASGDEIRVSSIGYVAQTIKLGKGGSQRIV
LLEDKQLLDEVVVVGYGTMRKSDLTGSSSTTKGSEILKMQGFNALEGLKGKAAGVNIFNN
TGQPGGEMRVIIRGISTINASSSPLYIVDGVAMTDFQFLNPNDIESIEVLKDASSAAIYG
ARGANGVIMVTTKRGNAGKGAHIKYDGSFSVSSMARKMDVMNASEWMSAFKQGLENANQF
QGMNFDTDLSKIFTDTRYFDSNGNPLYDTDWQDECSRVAVSHNHELSIQRSGENGSSVGA
FLNFTDQQGILLNTYYKRVNAKLAYDDNPTKWLSTGLNLLVNHSWGNHTSDNPYGQGALR
TMIEQLPWLPVQLNGEYVQNNMINTTGILKDKDNPNSGYQTFSPEGVANPVELLERVQVI
QYKTQIFGNAALTFHLAKGLDLRTQLGIDYHNNRSKGYTPFQPHQLIDQGASQGAASAGN
SNSLYWQEETYLTYVNDFGKHHLNAMAGASWQARKYDYFGASDNTFTDDYYGYYNLGSGT
LKPSVGSDYDKWAMNSYFLRLAYNYNNTYMATVTGRYDGSSKFGQNNKYAFFPSVGLGWL
ASNESFLKDIETISKLKLHTSFGMTGNSEIGTYRSLATVSQSTTILGGKMVTVSYLDNMP
NANLKWEKTAQWDLGFELGLFKNRLNFDISYYYKYTSDLLLNRPVPESTGYSSIMDNIGA
VSNHGFDILVTAYPIQTKDFQWTSTLNLGFNKNKVEKLDEGASVDPVSGKRQILTDGFVG
YDMLIREGEALSTFYGYKRAGIYDGHPENWDASTMNIPSIVGEKVTYKQRQILGNGLPDW
TGSFINTFNYKNFDLTLDLQFSMGADIMQEYYHSTLARFLTNGLDRLYEEAWHPVNNPNG
VEQALRLNNFGMGANNQADSDWVCDGSYLRFNLLQLGYTFSGSACRTLGISALRLYANLN
NFWLICSDDYKGYDPDNSTRLGSNNWGANRQFFSYPRPKTFSFGVNVTF
NT seq 3210 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtacaaacgcgaaagaaaagtctcgaagacgatgtgttcttcgctattactactttct
gctggtgcaatgacattcggttctccagtcagtgttctagctaactcagtttcccaaccg
ttgacagaggtaacatctgttcaacagcaaaaaaaggtgatcattaccgtcgttgatggc
cagaatgagccggttgttggcgccagtgtgatgatgatgtcttctaaaacaggtgtcatt
accgatattaacggccggtgcgacatcgatgcagcttctggcgacgagatacgagtgtcg
tctattggctatgttgcccaaaccataaaactcggtaaaggtggctcgcagcgaatcgta
ctcctggaggataaacaactcctggatgaggtggttgtggtaggttatggtacgatgcgt
aagtccgaccttacaggttcgtcttctacgaccaagggctctgaaatcttgaaaatgcag
ggtttcaatgccttggaaggtttaaaaggtaaggctgcgggtgtaaacatctttaataac
accggtcagcctggtggcgagatgcgtgttattatccgtggtatctcaactatcaatgcc
tcttctagtccattgtatatcgtagatggtgttgccatgactgatttccagttcctcaac
cctaatgatatcgagagtatcgaggtgcttaaagatgcctcttcggcggctatctatggt
gcccgtggtgccaatggtgttattatggtaaccaccaaacgtggtaatgccggtaaggga
gcgcacatcaagtatgatggctcgttttcggtaagcagtatggcccgaaagatggatgtc
atgaatgcttctgagtggatgagcgctttcaagcaaggtcttgagaatgctaatcagttc
cagggcatgaactttgataccgacctgtcgaagatattcaccgatacccgttattttgat
agcaatggtaatccgctttatgataccgattggcaggacgagtgttctcgtgtagccgta
tctcataaccatgagctgagtatccaacgctctggcgagaatggctcttcggttggtgca
ttccttaactttaccgatcagcagggtattcttctcaatacttattataagcgtgtaaat
gcaaaactggcctacgatgataacccaactaagtggctttctacaggattgaatctgttg
gtgaaccactcatggggtaatcatacctccgacaatccctatggacagggtgctctgcgc
acgatgattgagcagttgccttggttgcctgtacagcttaatggtgagtatgtacagaat
aacatgattaatacaacaggtatacttaaagataaggataaccccaatagcggttatcag
acattctctcccgagggtgttgccaacccagtagagttgcttgagcgtgtacaggttata
cagtataagactcagatcttcggaaatgctgctcttactttccacctggctaagggattg
gatttgagaacccagttaggtatcgactaccataataaccgcagtaagggatatacacct
ttccaaccacatcagcttatcgaccaaggtgcctctcagggtgcagcttctgcaggtaac
tcaaactcactttattggcaggaagaaacctatcttacttatgtaaacgactttgggaaa
catcatctgaatgccatggctggtgcttcttggcaggcacgcaaatatgattatttcggt
gcttccgacaatacctttaccgacgattactatggctactataacctaggttctggcaca
ttgaagccatctgttggctccgactacgataagtgggccatgaactcatacttcttacgc
ttggcctataactacaataatacctatatggctactgtaacgggtcgttatgatggttct
tctaagtttggtcagaacaacaagtatgctttcttcccatcagtgggcttaggatggtta
gcctcgaacgagagttttttgaaggatattgagaccatcagcaagttaaagcttcatacc
tcatttggtatgacgggtaactctgagattggtacctatcgttctctggctactgtcagt
cagtcaaccactatcttaggtggtaagatggtaaccgtttcttatcttgacaatatgcct
aatgccaacctgaagtgggagaagacagcacagtgggatttaggcttcgaactgggttta
ttcaagaatcgtttgaattttgacatctcttactactataagtacacctctgatctgctc
ttgaatcgtcctgttcccgagtcaacaggttattcttcgattatggacaacattggtgcc
gtatctaaccacggttttgatattctggtaacagcttatcctattcagactaaagacttc
cagtggacctctactttgaacctgggctttaataagaataaggtggagaaactcgatgag
ggtgcttctgttgatccagtcagcggaaaacgtcagattcttacagatggctttgtaggt
tacgatatgcttatccgcgaaggcgaagcgctttctactttctatggttacaagcgcgct
ggtatctacgatggtcaccccgagaactgggatgccagtacgatgaatatcccatctatt
gtaggcgaaaaggttacttataagcagcgtcagattctgggtaatggtctgcctgattgg
acaggttctttcatcaataccttcaactacaagaatttcgaccttacgcttgatcttcag
ttctcaatgggtgcagatattatgcaggagtactatcactctaccttggctcgtttcctt
accaatggtctcgatcgtttatacgaggaggcttggcatccagtaaacaatcccaatggg
gtagagcaggccttgcgtttgaataacttcggtatgggcgccaacaatcaggccgattcc
gactgggtttgtgatggttcttacttgcgttttaatctcttgcaacttggttataccttc
tctggttctgcttgccgaactcttggtatttcagctttgcgcctgtatgctaacctgaac
aacttctggctcatctgctccgacgattataagggttacgatccagataactcaacacgt
ctgggtagtaataactggggtgccaaccgtcagttcttctcttatcctcgtccaaaaacg
ttctcttttggtgttaatgtaactttctaa

DBGET integrated database retrieval system