Candidatus Phytoplasma rubi: RS022_01350
Help
Entry
RS022_01350 CDS
T08734
Name
(GenBank) DNA primase DnaG
KO
K02316
DNA primase [EC:
2.7.7.101
]
Organism
prub
Candidatus Phytoplasma rubi
Pathway
prub03030
DNA replication
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prub00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
RS022_01350
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
prub03032
]
RS022_01350
Enzymes [BR:
prub01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.101 DNA primase DnaG
RS022_01350
DNA replication proteins [BR:
prub03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Initiation Factors
Initiation factors (bacterial)
RS022_01350
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNAG_N
Zn_ribbon_DnaG
Toprim_2
Toprim_4
Toprim
Toprim_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WAN63132
UniProt:
A0ABY7BS07
LinkDB
All DBs
Position
complement(116827..118713)
Genome browser
AA seq
628 aa
AA seq
DB search
MNNVNNNLFEILNKNIPIYDLITKMGIVVKKQGKGFFALCPFHKEKTPSFSVSTEKNIAL
CMSCRKGGSPVKFYSQLKDIPASEAIKQLAKFFNINLPKQKLKYEDPLTSILKSANEFYQ
KALLFILDRKEFSKHPLLKYLFEERKLNKELIQEFGLGYSHKNSRALIKHLVEKLNYKYE
DILKLGLISKKNDSDEYFDFFINRLIFPLTDENGKIIGFCGRSLENKQNKTQFNIPKYLF
NSQFKKENFLYRFFEHQKNIQDKKEVILCEGFFDVIAFYKIGMKNVVANLGTNLNRIQIT
SLKKVTQNVTVALDSDNAGKEAEKKISFLLNKNSFRVKVLNFPSNLDPDEYILSKKNNIS
LLKQKLEERTKDYIFNQIEEFRKQNLRDDQINSNINILLKYHNRDNLEYFQNKINEKYQI
QTNLFSFISMKEINNQLLQSTKDKISLKGIIGSYEKEISLLTELFLNQEYIDLVIEEIYK
YENINADVIDLIRKIKDYYMKYLKEEEKNGINISNFKNVYKEFLNHMLNSKIVYNLLLQV
ENNPIFKQKKRIQSQEYLKDIFIPFKMKDYSTIQQEIKKEIKIIKNKINEKNNNDEDDSP
ETNKLWDELKQKEKQLSNIQQNQFENKI
NT seq
1887 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatgtaaataataatttatttgagatattaaataaaaacatccccatttatgat
ttaattactaaaatgggaatcgttgtgaaaaaacaaggaaaaggtttttttgctttgtgt
ccttttcataaagaaaaaactccttctttttctgtttctactgaaaaaaatatcgcttta
tgtatgagttgtcgtaaaggtggttctccagttaaattttattctcaattaaaagatatt
cctgcatcagaagcgattaaacaattagctaaattttttaatattaatttacctaaacaa
aaattaaaatatgaagatcctttaacttctattttaaaatcagctaatgaattttatcaa
aaagctttgttatttatcttagatagaaaagaattttcaaaacatcctttattaaaatat
ttatttgaagaaagaaaattaaataaagaattaattcaagagttcgggttaggttattct
cataaaaactcaagagctttaattaaacatttagttgaaaaacttaattataaatatgaa
gatattttaaaattaggtttgatttctaaaaaaaatgattcagatgaatattttgatttt
tttattaatcgtttaatatttcctttgaccgatgaaaacggtaaaataattggtttttgc
ggacgttcattagaaaataaacaaaataaaactcaatttaatattcctaaatatttattt
aatagccaatttaaaaaagaaaattttttatatcgtttttttgaacatcaaaaaaatatc
caagataaaaaagaagttattttatgcgaaggtttttttgacgttatcgctttttataaa
atagggatgaaaaatgttgtagctaatttaggaactaatttaaatcgaattcaaattaca
tcattgaaaaaggtaacgcaaaatgttactgtcgctttagattctgataacgcaggaaaa
gaagctgaaaaaaaaatttcttttttgttaaataaaaatagttttagagttaaggtttta
aattttccttctaatttagatcctgatgaatatattttatctaaaaaaaataatataagt
ttattaaaacaaaaattagaagaaagaactaaagattatatttttaatcaaatagaagaa
tttagaaaacaaaatttaagagacgatcaaataaattcgaatattaacattttattaaaa
tatcataatagagacaatttagaatattttcaaaataaaataaatgaaaaatatcaaatt
caaactaatttattttcttttatttctatgaaagaaataaacaaccaattattacaaagc
acaaaggataaaatttctttaaaaggaataattgggagttatgaaaaagaaataagtctt
ttgactgaattatttttaaatcaagaatatattgatttggttatagaagaaatttataaa
tacgaaaatattaatgctgatgttatagatttgattcgtaagattaaagattattatatg
aaatatttaaaagaagaagaaaaaaatggcataaatatttctaattttaaaaatgtttat
aaagaatttttaaatcatatgttaaattctaaaatagtatataatttattattacaagta
gaaaacaatcctatatttaaacaaaaaaaaagaatccaaagccaagaatatttaaaagac
atttttattccttttaaaatgaaagattattcaacgatccaacaagaaattaagaaagaa
ataaagataattaaaaataaaattaatgaaaaaaataataatgatgaagatgatagtcca
gaaacaaataaattatgggatgaattaaaacaaaaagaaaaacaattatcaaatattcaa
caaaatcaatttgaaaataaaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
