Candidatus Phytoplasma rubi: RS022_08580
Help
Entry
RS022_08580 CDS
T08734
Name
(GenBank) Heterodimeric efflux ABC transporter, permease/ATP-binding subunit 2
KO
K18888
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
prub
Candidatus Phytoplasma rubi
Pathway
prub02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prub00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
RS022_08580
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
prub02000
]
RS022_08580
Transporters [BR:
prub02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
RS022_08580
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
Gaa1
Zeta_toxin
AAA_22
AAA_24
RsgA_GTPase
AAA_30
MMR_HSR1
Dynamin_N
nSTAND3
DEAD
DUF87
AAA_29
AAA_16
SRP54
FtsK_SpoIIIE
AAA_19
NACHT
AAA_14
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WAN63653
LinkDB
All DBs
Position
complement(696695..698467)
Genome browser
AA seq
590 aa
AA seq
DB search
MQKMSKYLSPFKTKIIISIVLIFLIAAIQCYIPLFEGKQILDYINNKENHKDKQSYQAHI
LFFLSINVILYLLCAIGKFIYNKFLINSIHKGIKNLRQDIYKKINRLPIKFFDQNTVGDV
MNKMTNNVDIISNGLQQTFASIICAFFNIAILLFCMLLVNWRLGFVISLMIPFSLIVIFI
INRKSRHIFIQRFDKTSEYNGFLQEKFNGHKEIILYNQQKNIIKEFKDINQDLSKMIFKS
NFFSSLAIPIINSFTYIILTIVIVMGYYLMLPIDNKGFLFTLGFCTIQLGMFEAFIQYVW
RLGNPINDLSQIFVVIQSTKAAIQKVFDFLYETEEKEDESNCITLDKVEGFVSFSNVSFG
YYKDSPVLKNINLDVYKNQTVAVVGSTGSGKTTLINLLTRFYDIDEGSITIDGVDIRKLQ
KKYLRKILGLVLQDVWLFKGTILENIQYGNESKTKEEVIEVAKQTQIHDFIMAKEEGYQT
IINEESDNLSQGEKQLITITRTLLNNPFIFILDEATSAIDTQMEMIFQKSIQKLCENKTS
FIIAHRLSTIVNADVIVVLKNGVIIEKGKHNELIELKGFYYNLYHSQFKQ
NT seq
1773 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaagatgtctaaatatttaagtccttttaaaacaaaaataataattagtattgtt
ttaatttttttgattgctgcaattcaatgttatattccattatttgaaggaaaacaaatt
ttagactatattaataataaagaaaatcataaggacaaacaatcttatcaagcacatatt
ttgttttttttaagtataaatgttattttatatttattatgtgcaataggtaaatttatt
tataataaatttttgataaattccatccataaaggaattaaaaatttgcgtcaagatatt
tataaaaaaattaatagattacctattaaattttttgatcaaaatactgttggcgatgtt
atgaataaaatgactaataatgtcgatattatttctaatggattacaacaaacttttgct
tctattatttgtgctttttttaatatagctattttattattttgcatgttgttagttaat
tggcgtttaggttttgttatttctttaatgattcctttttctcttattgtgatctttatt
attaacagaaaatctcgtcatatttttattcaaagattcgataaaacatctgaatataat
ggttttttacaagaaaaatttaacggtcataaagaaattattttatataatcaacaaaaa
aatattattaaagaatttaaagatattaatcaagatttatctaaaatgatttttaaatca
aattttttttctagtttagctattcctattattaattcttttacatatattatattaact
attgttattgttatggggtattacttaatgcttcctattgataataaaggttttttattt
actttgggtttttgtacaattcaattagggatgtttgaagcttttattcaatatgtttgg
cgtttaggaaatcctattaatgatttaagtcaaatttttgtcgttattcaatcaactaaa
gccgctatccaaaaagtttttgattttttatatgaaaccgaagagaaagaagatgaatct
aattgtattactttagataaagtagaaggttttgtttctttttcgaatgtttcatttggt
tattataaagattcgcctgttcttaaaaatattaatttagatgtttataaaaatcaaaca
gtagctgttgttggttctactggttcaggaaaaacaactttaatcaatttattaactaga
ttctatgatattgatgaaggttctataacaattgatggagtagatattagaaaattacaa
aaaaaatatttaagaaaaattttaggattagttttacaagatgtttggctttttaaaggt
actattttagaaaatattcaatacggcaacgaaagtaaaacaaaagaagaagttatagaa
gtagcaaaacaaactcaaattcatgattttatcatggctaaagaagaaggttatcaaact
attattaatgaagagtcagataatttatcacaaggtgaaaagcagttaattacaataact
agaactttattaaataacccttttatttttattttagatgaagctacgtcggctattgat
actcaaatggaaatgattttccaaaagtctattcaaaaattatgtgaaaataaaacatct
tttataattgcacatcgtttatccacaattgtaaatgctgatgttattgtagtattaaaa
aacggtgttataattgaaaaaggtaaacataatgaattaattgaattaaaaggattctat
tataacctttatcatagtcaatttaaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
