Pyrgilauda ruficollis (rufous-necked snowfinch): 121365387
Help
Entry
121365387 CDS
T07608
Symbol
IGFN1
Name
(RefSeq) immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1 isoform X1
Organism
pruf
Pyrgilauda ruficollis (rufous-necked snowfinch)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
I-set
Ig_3
fn3
Ig_2
ig
Ig_DSCAM-DSCAML_C
THB
Pur_ac_phosph_N
Tissue_fac
Receptor_2B4
C2-set_2
Ig_J_second
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121365387
NCBI-ProteinID:
XP_041345460
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2624 aa
AA seq
DB search
MSSHQTVKIFKKSSIPGVVVTQFVNDVPPGCSTPDFEKKPLTLTLQEGKNAIFRAVVKGV
PAPEVKWSRTRKGMDDPAKYEMSFNSATNEFILQIKSLVQDDSDLYRCCAVNAYGEASCS
AGLRIIQVGFKRKAKYVPVHAADELKKTLLDSRKMLRKRAAAPKPKPLDKEAVWQLLLHA
DRRDYEKICMKYGIADFRGMLRKLQEMRKETESEQDKLIHTLKNFEHIKVNKEGNATFSL
EMELKNSNSNVYLLKDGERLRYGTGDEYRKHCLRRVGRRYYFTVNDVQPEDAGVYQVRVE
DVPVFSTELDAQAIPARFRQPLSDVRCAEAGDAEFQCVLCTPCHQPLWLHKSHPLQASDK
HQISVTPDGLTHKLIVRNVGPSDSGLYTLDAGQGSSSAWLLVEYAKGKRTQDEGEKIERE
TSEWLKETMADNERARKLRRQEQAAAEGRPSFSTSSGVEKSGWSRTGQGSSQGRGQGHSV
DSDDGSQRFLGKEGLRKTHMNGEMGSGQFSGAGLDGDSAANDSSIFGLKGLGGRSGLRAV
HGMDTLSGRAGPGGAVGGAGEWNSVDGRGEGLLGAVNVDMDDGEGLGSQHDKDGNLGDAS
YRAGFGGSGRLGGESSVPDGLDPDSAGVGASVGDLFSRTGPGAGGGGNAAGAGMAGGMRS
HHGKDGHATVGDMNGAGVNREGQTGTPYGKDGLTPHASGQLGQTGRSGSLYGPGRLPGGD
GATPGTGGNSAGEMEALYGPDGQALAAGAGGAGAGGFGSPYGKDGLPVGAGFGGVGAEGL
GAPYGKDGLPIGAGAGGAGGAGGLGSLYGKDGLPARAGDAGVGGFGEALYGPDGQPLGAG
VGGGAGAGRFGIPCGKDGLPVGAGVGGVGVAGVGGFGSPYGKDGLPAGTGAGGAGGFGEA
LYDGRPLGAGVGAGGGGGAGAGGFGFPYGKDGLPAGAGGAGVGGLGEALYGPDGQPIGAG
VGAGAGGFGIPYGKDGLPVGASVGGSGGTGGLGSPYGKDGLPAGASFGGVNAGGFGAPYG
KDGLPAGAGGAGAGEALYGPDGRPLGAGVAGAGFASARGTGAPYGKDGLPAGAGAGISGA
GGVGGPYGKDGLPAGAGAGISGAGGVGGPYGKDGLPAGAGAGISGAGGVGGPYGKDGLPA
GAGAGISGAGGVGGPYGKDGLPAGAGAGISGAGGVGGPYGKDGLPAGAGAGISGAGGVGG
PYGKDGLPAGAGAGISGAGGVGGPYGKDGLPAGAGAGISGAGGVGGPYGKDGLPAGAGAG
GPGAGAFGSPYGKDGLIAGAGEGGVGLGEALYSPDGQPLGAGVAGAGSASARGIGAPYGK
DGLPAGAGAGGSGAAGVGGPYGKDGLPVGAGDGISGSGGVGGPYGKDGLPAGVGGPYGKD
GLPVGAGAGGVGGAGGVGGPYGKDGLPVGAGDGISGSGGVGGPYGKDGLPLGAGVSSAGG
FGGPYGKDGLPLGAGAGGAGGAGGIGGPYGKDGLPVGADVGGIGGERGVGAPYGKDGLPI
GSGGGGGSGGAESPSGKDGLLAGAGVSGAGGIRGPYGKDGLPVATGFGGINAGGPGAPYG
KDGLPTGAGAGVSGAGGVGGPYGKDGLPAGAVAGAAHFPLGGEKAMGSGCGTDATLSRTP
GYAGGAGGEGFSREGSALWGAGSPCGENRGSAVATAGAGGVGRLGGDEWDSVHGKGGVEA
AGGPGGEYGLDAHLGRSLRGETGKGTASDVRGPGNKGSAGDRGSLSGPGGARGEGRDFRQ
LDSLYDTNSAFGEAGSKSHDRSVDGSSSGGFGQGPLSYGQMSGPFGGPPSANQRNQEPDL
DLKANDSLNNTENTAQKRRSVLDDIKVPRCYLNKQLATVRVLKGDPAELSCTVSKDNVTG
TWFKDGLKLTSMDGVVFEKKGLVHKLIINKAEDIHAGKYRFEGGDVKTEASIFVEDPPQV
DKVLLKNLTSVPTVAKAGEGVKLRIPFEGRGPIRAAWLKDRMELGDDTRIRVDKTDTCTT
LSISSCDRRDCGDYKVRLKNDSGVLEINLKLVVIDKPQPPAGPIKIVESSANNITIQWKP
PKDDGGKPVQRYLVERQQVGRNDWETLGETPRSCTSFTTSKVEEEMSYYFRVRAVNAEGA
SDALESGEVKAAGKASPGAPGPPEIISASRDSITISWKAPCKTGTSQIMGYIVQKRKKGT
VTWLPVNNVPVKDKKLKVSSLKKGVQYEFRVAAVNAAGTGQPSDPSEPALARDPTKSPGQ
VQGLKVSSSDSTSVTLTWNKPEVQDGNDVKGYEVEMRPCNSLSWTKCFTLPAESTSCRVQ
GLRAGEKLFLRVRALGDGGPGEASELEACAGAAAAVVSPRLLIDDTVKSFLVIKAGNPIR
VKIPFEGSPEPVVTWLKDGLPLPSRAAVSTEDGSSQLLLRAAELSDSGTYTVELGDGLGK
RETFSFQVQITDIPQPPGAIRLEENVPNTVTVTWDPSASEQWEKNLYYTVLKRESQKGLW
HVLGDLIYNNKFTFTRVVPGRDYYFRVVAKNDLGVSDPSDTVQPWRIWKKKAEFRVKAQK
YRGVNQNQPPRFLVPLKSHVVVTGSECHMSCAVGGHPPPKITWYKDSRDLSRDPNYFCTN
DFGVCSLVVLGVTKQDEGEYMVEASNEVGRAFSKAFLAIKDSSL
NT seq
7875 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcagccatcagacagtaaaaatcttcaagaaatcctctatcccaggagttgttgtc
actcagtttgtgaatgatgttccaccaggatgcagtacacctgattttgagaagaaacca
ctcactctgacactgcaggaaggtaaaaatgccattttcagagctgtggtcaaaggtgtc
ccagctcctgaggtgaaatggtcacgtacacggaaaggaatggatgatcctgccaaatat
gaaatgtccttcaatagtgctacaaatgaattcattctgcagatcaagagcctggttcag
gatgacagtgatttgtatcgctgctgtgctgtcaatgcctacggagaggcctcgtgctct
gctggcctcaggatcatccaagttggttttaagaggaaggcaaaatatgttcctgttcat
gctgctgatgagctcaagaagacactcctggactccaggaagatgctgaggaagagagct
gcagcaccaaaaccaaagcccctggacaaagaagctgtgtggcagctgctgctgcatgca
gataggagagattatgagaaaatctgtatgaaatatggaattgctgacttccgtgggatg
ctgaggaagctgcaggagatgaggaaagaaacagagagtgaacaggacaagttaattcac
actctcaaaaactttgaacacatcaaagtcaacaaggagggaaatgctacgttcagcctg
gagatggagctgaaaaacagcaacagcaacgtttacctgctcaaggacggcgagcggctc
cggtacgggacaggggatgagtacaggaagcactgcctgcgcagagttgggaggaggtac
tacttcactgtcaacgatgtgcagccagaggacgcaggggtgtaccaggtcagggtggag
gacgtccctgtcttctcaactgaactggatgctcaagccatcccggcgcggttccggcag
ccgctctccgacgtgcgctgtgccgaggccggggacgccgagttccagtgtgtgctgtgc
acgccctgccaccagcccctgtggctgcacaaaagccaccccctccaggccagtgacaag
caccagatctctgtgacacctgatggcctgacccacaagctgattgtcaggaacgtgggg
ccctcggacagcggcctgtacacgctcgacgcgggacagggctcctccagcgcctggctc
cttgtggagtatgccaaaggaaagaggacacaggatgaaggagaaaagattgaaagggag
acatctgagtggctgaaagaaacaatggcagacaacgaaagggcgaggaagcttcggcgc
caagaacaagctgctgctgaaggtcgtccttccttttccacatcttctggtgtggagaaa
agtggctggtccagaacaggccaaggcagcagtcaaggcaggggccaaggacactctgtt
gattctgatgatggaagccaaagatttttgggaaaagaagggctacgcaaaacccacatg
aatggagagatggggtctgggcagttttctggagcaggtctagatggagactcagcagcc
aatgacagcagcatctttgggctaaaaggcttagggggcagaagtgggttaagggctgtc
catggcatggacactctgtcaggcagagcaggtccaggtggtgcagtaggaggggcaggt
gaatggaattctgtggatggcagaggtgaaggtttgctgggtgctgttaacgttgacatg
gatgatggagaaggtttgggctctcagcatgacaaggatgggaatttaggtgatgccagt
tacagagctggttttgggggttctgggaggttgggtggtgaaagttctgtgccagatggc
cttgatcctgattcagctggagtgggagccagtgtgggtgatctgttcagcaggactggt
ccaggagctggaggtggggggaatgctgcaggtgctggaatggcaggaggaatgaggtcc
caccatggcaaggatgggcatgccactgtgggtgatatgaatggagcaggtgtaaacaga
gagggacaaacagggactccctatggcaaggatggcctgacacctcatgccagtggtcag
ttagggcagacaggaagatctggctcattatatgggccaggacgccttccaggtggagat
ggggctacacctggtacaggtggcaattctgcaggagaaatggaggctttgtatggtcca
gatggtcaggcactggcagcaggtgctggtggagctggtgcagggggatttgggtctccc
tatggaaaggatggtctcccagttggggctggttttggtggtgttggtgcagagggactt
ggagctccctatgggaaagatggtcttccaattggagcaggtgctggtggggctggtggt
gcagggggacttggatctctctatgggaaggatggtctcccagctagggctggtgatgct
ggtgtaggaggatttggagaggctttgtatggtccagatggtcagccacttggagcaggt
gttggtggtggtgctggtgcagggagatttggaattccctgtggaaaggatggtctccca
gttggagcaggtgttggtggggttggtgtagctggtgtagggggatttggatctccctat
gggaaggatggtctcccagctggaacaggtgctggtggtgcaggaggatttggggaggct
ttgtatgatggtcggccacttggagcgggtgttggtgctggtggtggtggtggtgctggt
gcagggggatttggatttccctatgggaaggatggtctcccagctggagctggtggagct
ggtgtaggaggacttggagaggctttgtatggtccagatggtcagccaattggagcaggt
gttggtgctggtgcagggggatttggaattccctatggaaaggatggtctcccagttgga
gctagtgttggtggttctggtggtacagggggacttggatctccgtatggaaaggatggt
ctcccagctggggctagttttggtggtgttaatgcagggggatttggagctccctatggg
aaggatggtctcccagctggagctggtggagctggtgcaggagaggctttatatggtcca
gatggtcggccacttggagcaggtgttgctggtgctggttttgcaagtgccaggggaact
ggagctccctatggaaaggatggtctcccagctggagcaggtgctggcattagtggagca
gggggtgttgggggtccctatggaaaggatggtctcccagctggagcaggtgctggcatt
agtggagcagggggtgttgggggtccctatggaaaggatggtctcccagctggagcaggt
gctggcattagtggagcagggggtgttgggggtccctatggaaaggatggtctcccagct
ggagcaggtgctggcattagtggagcagggggtgttgggggtccctatggaaaggatggt
ctcccagctggagcaggtgctggcattagtggagcagggggtgttgggggtccctatgga
aaggatggtctcccagctggagcaggtgctggcattagtggagcagggggtgttgggggt
ccctatggaaaggatggtctcccagctggagcaggtgctggcattagtggagcagggggt
gttgggggtccctatggaaaggatggtctcccagctggagcaggtgctggcattagtgga
gcagggggtgttgggggtccctatggaaaggatggtctcccagctggagcaggtgctggt
gggcctggtgcaggggcatttgggtctccctatggaaaggatggtctcatagctggggct
ggtgaaggtggtgtaggacttggagaagctttgtatagtccagatggtcagccacttgga
gcaggtgttgctggtgcaggttctgcaagtgccaggggaattggagctccctatggaaag
gatggtctcccagctggagcaggtgctggtgggagtggtgcagcgggtgttgggggtccc
tatggaaaggatggtctgccagttggagcaggtgatggcattagtggctcagggggtgtt
gggggtccctatggaaaggatggtctgccagcgggtgttgggggtccctatggaaaggat
ggtctgccagttggagcaggtgctggtggggttggtggtgcagggggtgttgggggtcct
tatggaaaggatggtctgccagttggagcaggtgatggcattagtggctcagggggtgtt
gggggtccctatggaaaggatggtctgccacttggagcaggtgttagtagtgcaggaggt
tttgggggtccctatggaaaggatggtctgccacttggagcaggtgctggtggggctggt
ggtgcagggggtattgggggtccctatggaaaggatggtctgccagttggagctgatgtt
ggtgggattggtggtgaaagaggagttggagctccctatggaaaggatggtctgccaatt
gggagtggtggtggtggtggttcagggggagctgagagtccctctggaaaggatggtctc
ctagctggagctggtgttagtggtgcagggggtattaggggtccctatggaaaggatggt
ctgccagttgcaactggttttggtggtattaatgcagggggacctggagctccctatggg
aaggatggtctcccaactggagcaggtgctggtgttagtggtgcagggggagttgggggt
ccctatggaaaggatggtctcccagctggggctgtggcaggagctgctcattttcctctt
ggaggggagaaagcgatgggatctggctgtggcacagatgccacactgagcagaactccg
ggatatgcaggtggagcaggaggagagggtttttccagggaaggctctgcactgtggggt
gcagggtctccctgtggcgagaacagagggtcagctgtagccacggctggtgcaggtgga
gttgggaggttgggaggggatgaatgggattcagtccatggtaaaggaggtgtggaagct
gctggtggaccaggtggtgaatatgggctggatgcacatcttggcagatctttgagaggt
gaaactggaaagggcactgccagtgatgtcagagggccagggaacaaaggttcagctggt
gacagagggtccctgtcaggtccaggaggagccaggggagagggcagagatttcagacag
ttggactccctttatgacacaaattctgcctttggagaggcagggagtaaatcccatgac
agatctgttgacggaagtagttcaggtgggtttggtcaaggtccactgagttatggccag
atgtcaggtccttttggtggacctccttcagcaaaccagagaaaccaggaacctgacctg
gatcttaaagcaaatgattccctgaacaacacggaaaacacagcacaaaagagacggagt
gtcctggatgatatcaaagtcccgcgctgttacctcaacaagcagctggcaaccgtgcga
gtgctgaagggggacccagctgagctgtcctgcactgtcagcaaggacaacgtgacagga
acctggtttaaggatggcctcaagttaacaagtatggatggagttgtctttgaaaagaaa
ggtcttgtccacaaactgatcatcaacaaggctgaagatattcatgctgggaaatacaga
tttgaaggtggagatgtaaaaactgaagcttcaatttttgttgaagatcctccccaggtg
gacaaagttctcctcaagaacttgaccagtgtccccacagtggccaaggccggggaggga
gtgaagctgcggatcccgttcgagggccgggggcccatcagggcggcgtggctgaaggac
aggatggagctgggggatgacaccaggatccgtgtggacaagacagacacctgcaccaca
ctgtccatctccagctgtgacaggagggactgtggggattacaaagtcaggctcaagaac
gacagtggtgtcctggagatcaacctaaagctcgtggtgatagacaagccacagcctcca
gcaggacccatcaaaattgtagaaagctctgccaacaacatcacaatccagtggaagccc
ccaaaggacgatgggggcaaaccagtgcaaaggtacctcgtggagaggcagcaggtgggc
aggaacgactgggagactttgggagaaacccccaggagctgcaccagcttcaccacgagc
aaagtggaggaagagatgagctactacttcagggtgagggccgtgaatgccgagggagcg
agcgatgcgctggagtcaggggaagtgaaggctgctggtaaagcttcccctggtgcccca
ggtccccccgagatcatcagtgccagcagggattccatcaccatatcctggaaagctcct
tgtaaaaccggcacttcccaaattatgggatacattgttcagaaacgcaagaagggcact
gtgacctggctgccagtcaacaacgtgcctgtcaaagacaagaaactgaaggtgagcagc
ctcaagaagggtgtgcagtatgagttccgcgtggcagctgtcaatgctgctggcacagga
cagcccagtgacccctcagagcctgccttggcccgggaccccaccaaatctccaggccaa
gtgcagggccttaaagtgagcagcagtgacagcaccagtgtcaccttgacatggaacaaa
cctgaagtacaagatgggaatgatgtgaaaggctacgaggtggagatgaggccctgtaac
agcctcagctggaccaagtgcttcacgctccctgcggagagcacctcgtgcagggtccag
ggcctgcgggccggggagaagctgttcctgcgcgtcagggccctcggcgacggcggcccc
ggggaggcctcggagctcgaggcgtgtgctggagctgctgctgctgtggtctctcccagg
ttactgatagatgacacagtgaaaagcttcctggttataaaagcagggaatcccatccgg
gtgaagattccctttgagggatctcccgagccggtggtgacctggttaaaggatgggctc
ccccttcccagccgggctgccgtgagcaccgaggatggaagcagccagctgctgctcagg
gcagccgagctcagtgacagcggcacctacactgtggagcttggggatgggctgggcaaa
agggagaccttcagcttccaggttcaaattacagatatccctcagccccctggagccatc
cggctggaggagaatgtgcccaacacagtgacagtgacctgggacccctcagcatctgag
cagtgggagaagaacctgtattacactgtcctgaaacgggaatcccagaagggcctgtgg
catgtgctgggggacctgatctacaacaacaagttcaccttcaccagggtggtcccaggc
agggattattacttcagggttgtggcaaaaaatgacctgggagtcagtgatccatcagat
actgtgcagccctggaggatctggaagaaaaaggctgaatttcgagtgaaagcacagaaa
tacaggggagttaaccagaaccagcccccgaggttcctggtgccccttaagtctcacgtg
gtggtgacgggcagcgagtgtcacatgagctgtgctgttggaggccatcccccaccaaaa
atcacatggtacaaggacagcagagacctctccagagatcccaactacttctgcaccaac
gacttcggggtgtgctccctggtggtgctgggggtcaccaagcaggatgagggggagtac
atggtggaagccagcaatgaagtgggccgtgccttcagcaaagccttcctcgccatcaaa
gactcctccctgtag
DBGET
integrated database retrieval system
