Planktothrix rubescens: PCC7821_00793
Help
Entry
PCC7821_00793 CDS
T09709
Symbol
ywqA
Name
(GenBank) putative ATP-dependent helicase YwqA
Organism
prun
Planktothrix rubescens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
DUF3670
Helicase_C
ResIII
DEAD
ERCC3_RAD25_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAD5923213
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(826100..829228)
Genome browser
AA seq
1042 aa
AA seq
DB search
MAILHGSWCMTSKGCFFLWGETWRRVPSESFSSEQIFPYPFALNDTELLTQPLLKNMGLS
NILSQQIIALPTDISESGDLTPIYSATTNIPKSYLYPWQITGISLNPKQAFQFLQSLPLN
TVITSDSDLGEDLRFWSHIARWSLDLLARSKFLPGLIQQSDQTIISQWQPLLDSAIDQAR
LLRFAQQMPRVCRVYQELIAGDSLAINLPLSAQDIIINFLSVMIDQQVRNVAKEVNKKAI
LSLPIWQKWLQSLGEQENTINAELIEIESLETTLKNWTAPLQYSLSEPNLFSTAFHLHPP
TEYNPNWQLEYCLQAIDQPEFIVNSNIVWNHPVDSFNYRGRTIKHPQETLLKGLGLASKL
YPVIETSLQQARPQSCSLNPLQAYQFLKSYAWRFTDSGLGVILPPSLANREGWASRLGLS
IKAETPKLKTNERLGLKSLLNFKWQLSIGGQTMTKAEFDRLVAKESPLVEINGEWVELRE
SDIRSAKIFFSQRKDEMTLSLEDALRLSTGDTQMIEKLPVVNFEAGGKLQELLNTLTNNR
NLEPIPNPKDFKGELRPYQARGAGWLSFLEQWGLGACLADDMGLGKTIEFIAFLLHLKEQ
NSLENPVLLVCPTSVLGNWEREVKKFSPTLNVIVHHGDKRAKGNNFAKVIQDKNLVITSY
PLTFRDQKELQGVTWQGLVLDEAQNIKNPDAKQSKTIKNINASFKIALTGTPVENRLSEL
WSIMDFLNPGYLGQRLFFQRRFAIPIEKYGDTDSLKILRSLVQPFILRRLKTDKDIIQDL
PEKQENIVFCPLTTEQATLYQKIVDDSLAKIDDAEGIQRRGMILALLVKLKQLCNHPVLI
EAKVKNSKKSDIIKTQYSGKLQRLTEMLDEVLAEGDRALIFTQFAEWGKVLQPYLEDYFN
REILFLYGSTSKNKREEMIDRFQNDPQAPPIMILSLKAGGVGLNLTRANHVFHFDRWWNP
AVENQATDRVFRIGQTRNVQVHKFVCTGTLEEKIHDLIESKKALAEQVVSAGEDWLTALD
TDQLRNLLILDRNSIIDEETPL
NT seq
3129 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaattttacatggaagttggtgcatgacgtcgaaggggtgttttttcctctgggga
gaaacctggcggcgagtcccgtcggagtccttttcttcagaacaaatttttccatatccc
tttgctttaaatgatacagaattattgactcaacccttgttaaaaaatatggggttatca
aatattctatcccaacaaattatagcgttaccaacagatatttctgaatctggagacctg
actccgatttattctgctacaactaatattcctaaatcctatctttatccttggcaaatt
acgggaatttctcttaatcctaaacaagcgtttcaatttttacaatccctacccttgaat
accgttataacatctgattccgacctgggggaagatctacgtttttggtcacatattgct
cgttggagtttggatttattagctagatctaaatttttacctggattaattcaacaatct
gatcaaactattatatctcaatggcaaccgcttcttgatagtgctattgatcaagctcga
ttattgcgttttgcccaacaaatgccaagggtttgtcgagtgtatcaggagttaatagca
ggtgatagtttagcgattaatttgcccctatctgctcaggatattattattaatttttta
tcggtaatgattgatcaacaggtgagaaatgtagccaaggaagttaataaaaaagcgatt
ttatcacttccaatttggcagaaatggttacaaagtttgggggaacaggaaaatactatt
aatgccgaattaatagaaatagaatccttagaaaccactttaaaaaattggactgctccc
ctacaatattccttgtctgaacctaatctattttcgacggcttttcatttacatcctccc
acagaatataatcctaattggcaattagaatattgtctacaagctattgatcaacctgaa
tttattgttaattccaatattgtttggaatcatcccgttgactcgtttaattatcgaggg
agaacgattaaacatccccaggaaaccctgttaaaaggcttaggattggcttcaaaatta
tatccggtaattgaaaccagtttacagcaagcacgcccccaaagctgtagtttaaatcct
ttacaagcttatcaattcttgaaaagctatgcttggcgttttactgatagtggtttaggg
gtaatattacctccgagtttagcaaatcgagagggatgggcgagtcgattaggattaagt
attaaagcagaaacgcctaaattaaaaaccaatgaaagattaggattaaaaagtttattg
aactttaaatggcaattatctattggtggtcaaaccatgactaaagcggaatttgatcgc
ttagttgctaaggaaagtccgttagtagaaattaatggggaatgggtggagttacgggaa
tcggatattagatcggcaaagatattttttagtcaaagaaaagatgaaatgactctttct
ttagaagatgcgttaaggttatcaacgggagatactcaaatgattgaaaaattacccgtt
gttaactttgaagcgggaggaaaattacaggaattattgaatactttaaccaataatcgt
aacttagaaccgattccaaatcctaaagattttaaaggggaattacgaccctatcaagct
agaggtgcaggttggttatctttcctagaacaatggggtttaggtgcgtgtttagctgat
gatatgggattgggaaaaaccatagaatttattgcttttttactgcatttaaaagaacaa
aatagtttagaaaatccggttttattggtttgtccaacatcggttttagggaattgggaa
cgggaggttaaaaagtttagtccgaccttaaatgtaatagttcatcatggcgataaacgc
gccaaaggtaataattttgctaaggttattcaagataaaaatttagtgattaccagttat
cccttaaccttccgagatcagaaagaattgcaaggagtaacttggcaaggattggtatta
gatgaagcccaaaatattaaaaatcccgatgctaaacaatcaaaaactattaaaaatatt
aacgcatcgtttaaaatagcattaactggaactccggtagaaaatcgcctatcggaattg
tggtcaattatggattttttaaatccagggtatttaggacaacggctattttttcaacga
cggtttgcaattccgattgaaaaatatggggatacggactctttaaagattttgcgatcg
cttgttcaaccttttattttacgtcggttaaaaaccgataaggatattattcaagattta
cccgaaaaacaggaaaatatagtattttgtcctttaacaactgaacaagcaaccctatat
caaaaaattgtcgatgactccttggcaaaaattgatgatgcggaaggaattcaacgtcga
ggaatgattttagctttattagtgaaacttaaacaactttgcaaccatccggttttaatc
gaagctaaagttaaaaatagtaaaaaatcagatataattaaaacccaatattcgggaaaa
ttacaacgtttgacggaaatgttagatgaggttttagctgaaggagatcgggctttaatt
tttactcaatttgctgaatggggaaaagtattacaaccctatttagaagattatttcaac
cgagaaatattatttttatatggaagtacctcaaaaaataaacgggaagaaatgattgat
cggtttcaaaatgatccccaagctccaccgattatgatattatcgttaaaggctggagga
gtaggtttaaatttaacccgggcgaatcatgtttttcactttgaccgatggtggaatcca
gcagtggaaaatcaagcgacagatcgagtttttagaattggtcaaacccgaaatgtacaa
gtccataaatttgtttgtacaggaactttagaggaaaaaatccatgatttaattgaaagt
aaaaaagcgttggcggaacaggttgttagtgcgggagaagattggttaacagctttagat
accgatcaactcagaaatctattaatattagatcggaactcaattattgatgaagaaacc
ccgttgtag
DBGET
integrated database retrieval system