Planktothrix rubescens: PCC7821_02966
Help
Entry
PCC7821_02966 CDS
T09709
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
prun
Planktothrix rubescens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHAT
TPS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAD5957922
LinkDB
All DBs
Position
I:3178631..3183946
Genome browser
AA seq
1771 aa
AA seq
DB search
MQPGRFVKLIFISLPLTGFWTVGMGDFPNFLSNNLKISFPINQVLAQSIVPEPNSTNTLT
NSVNNRVDITGGQQSGDGRNLFHSFTQFNVPPGQIANFVSNNSIQNIFSRVVGGQPSLIE
GLIKVTGGNSNLFILNPSGIIFGSEARLDVPGAFTATTATGIGFNSGLFNSLNSNDYNSL
SGEPNSFLFSTSNPGNIVNSGELTVSQGQTLTLIGGNVINTGTLNAPAGQITIAAIEGNN
LVRISQTGYLLNLEIETVTPSLENNESVISPLDLPKLLTGNSQNNQASSVNILSDGSVEL
TNSNTPFSPQGGGALISGFLNTRNTNFNSSSSNLPQVNIIGNNIHLFNSEIDASGVNGGG
IVRIGSNYQENSLLPTASRTLINDQSTIIADGLTDGNGGRIIIGAKDSTEFFGNISAQGF
SNPNTTERLGGFATIFSQNNLNIAGNINLKTTNSIPGNLIINAPEINIGNQDKTQENINL
SQQTLENLALTANVFIEAKNSINIGNLTDNKLNFPATTGTLTFTADADKSGSGNFTINSG
NTLQTSGAAIVITGVNLLTGDIITQGGNLDLTTTNNGGIRTENLSTSANTQGGNITLKSD
RDIITNTLSTRAMGNGTGGNIYLNASNRIQTNSINTSSSSKSGDITFTSLRGDIILEGNS
YSIDATSSEGSGGNILVNTPRTLTTDLIDTRGKETGGNIILNAELKVETKGLRTGTFDHL
EPATGNIEITSDEINFTGGENSIQGQGQIVLQPATVAQDIEIAGQDNNSELTLNLTSRDL
NSLENGFKEIIIGGNQGNGTIFIAGNIAFKDPVIIQSPQGIIASGIPFREQFYTVTGLDN
ASLKLSALENITLGNLLTNGGNISITSESGTIYTEQLSTGNSGSATINLTGTEVNLLGGL
NSVQGSGVLILQPSRNTQAMTLGGTENASSFDMSSRDLETLTNGFSQIRIGRVDSTNTLN
LYGDFTVYDPLNLQAQSIIGTGRITGVDNSSVTLTAGSNILIGDIMTQGGTIQLTSSQGE
IRTGSLQLLSENQRSGNINISALGQIETGEIRAIAQDNSNKNSNVLLNSQDINLISRNGG
IRVNGQIFNSSLVGDSIAIELLANRNITTGDIKAYRGINLNSTTGIIQSGNINSAGIRGG
GNIFIIAGSSINTGRINASSSDGKSGNISLNAGQDIDVVSLRGEGETQGGDIGISTHGLF
RATGIFNSRNQINASISSVGGEKGGSIVIQQGGDHCSTAECGNIPFSVGNPLLNGTAGAI
TDGNLVSLLPTNNSSSNSNQSTGETQTIINQINSELKGTNQETQTSTIPPKTENTTPVLT
DLTSDAVLENTSDISSNPNEPLETPIIPLNTPTIPMDQIASGSVISSLAQIDTFRGIEFS
NYLGSNSNNTTLTDQSIRKTLNEIYKLTGYKTAIIYVSSQSNQLELRLILPDGQPIFKSI
PVPRETVLKTARTFSNQIRSPENLEDTRYKENGKQLYKWLIEPLESQLEAEGINTLVFSM
DTGLRTLPLAALYDGKQFLLERYSLGLIPSLSLTDTRYVNIKNSKVLAMGASNFPHSNQL
PLPAVPMELDLIINHNNWQGKSFLNENFTVDNLTSQRSQNQFSIVHLATHGEFQTGGSDQ
SYIQFWDQKLRLNQLRNLKLNQPPVELLVLSACTTAVGDEKAELGFAGLAVQAGVKSALA
SLWYVSDAGTLGLMNTFYQALSTSPIKAEALRQAQLGMLQGKVRLEQGYLINETGTNTAK
IPLPPEIASRGNVNLSHPFYWAGFTLIGSPW
NT seq
5316 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagcctggacgttttgttaagttaattttcatctccctacctttaactggattttgg
acggtggggatgggtgatttccctaattttttgagtaataatcttaaaattagttttccc
ataaatcaagttttagcccaatcaattgttcccgaacctaatagtacaaataccctgact
aattccgttaataatcgtgtggatattaccggaggtcaacagtcgggagatgggagaaat
ttatttcatagttttacacaatttaatgtgccgccgggtcagattgctaattttgtttct
aataattccattcaaaatatttttagccgtgtcgtgggcggacaaccttccttaattgaa
gggttaattaaagtgaccggaggcaattctaacctatttattttaaatccctctggaatt
atttttgggtcggaagcacgtttagatgttccgggtgcatttaccgccacaaccgctaca
ggtataggatttaattccggtttatttaatagcttaaattctaatgattataatagcctt
tcaggggaacccaatagttttcttttctccacatccaacccgggtaatattgttaattct
ggagaacttacggtttcccaaggacaaaccttaaccttaattgggggaaacgttattaat
accggaacattgaatgcacccgcaggacaaattaccattgcagctattgaaggaaataat
ttagttagaattagtcaaaccggatatttactcaacttagaaattgaaaccgttaccccc
agtcttgagaataatgaatccgtaattagtcccctagacttacccaaattattgacagga
aattcacaaaataatcaagcctctagtgttaatattttatccgatggaagcgtagaatta
actaattctaatacaccattttctcctcaaggcgggggggctttaatttctggttttttg
aataccagaaataccaattttaactcatcttcatcaaatcttcctcaagttaatattatt
ggcaataatattcatttatttaattcggaaattgatgcttctggtgtgaatggaggcgga
atcgtccgaattggaagtaattatcaagaaaatagtcttttgcccacggcttcccgcaca
ttaattaatgatcaatctacgattatagccgatggcttaaccgatggaaatgggggacga
ataattattggagccaaagattcaaccgaattttttgggaatattagtgcccaaggattt
tctaatcctaacacaactgaaagattgggaggatttgccactatttttagtcaaaataat
ctaaatatagctggaaatattaacctaaaaacaactaattcaattcctgggaatttaata
attaatgcaccggaaataaacatcggtaatcaagataaaacccaagaaaatattaaccta
tcccagcaaactttagaaaatcttgccctaacagcaaatgtatttatagaagcaaaaaat
agtattaatattggcaacctaactgacaataaattaaactttccggctaccactggaacc
ttaacttttaccgccgatgcagataaatctgggagtggtaattttactataaattcagga
aatactctccagacttccggcgctgcaattgtaattaccggggtgaatttactcacggga
gatattattacccaagggggaaatttagacctaacaacaaccaataatggggggattcgg
actgaaaacctatcgacttctgcgaatacccaaggcgggaatataacccttaaaagcgac
cgagatattattactaataccctctcaacccgcgcgatgggaaatggcactggaggtaat
atatatcttaacgcatcaaaccgcattcaaactaacagtattaatacctctagtagtagt
aaatcgggagatattaccttcacaagtttacggggagatattattttagagggaaattct
tatagtattgatgcgacttctagtgaaggttcgggggggaatattttagttaatactcct
cgaactttaacaacagatttaattgatacaagaggcaaagaaaccggaggaaatattatt
ctgaatgctgagttaaaagttgaaactaaaggactacgaaccggaacatttgatcattta
gaacccgccacaggaaatattgaaattaccagtgatgaaattaatttcaccgggggtgaa
aactcaattcaaggtcaaggtcaaattgtcttacaacccgcaacggtggctcaagatatt
gaaatcgcaggtcaagacaataactcggaactcacattaaatttaacctctcgtgattta
aacagtttagaaaatggatttaaagaaattattatcggaggaaatcaaggaaacggaact
atttttatcgctggaaatattgcattcaaagatcccgttatcatccaatctccccaaggt
ataattgctagtggaataccatttcgagaacaattttataccgttactggtttagataat
gccagtttaaaactatcggcattagaaaatattaccttgggcaacctactcacaaacggt
ggtaatatttcgattaccagtgaatctggaactatttatactgaacagttatcaacggga
aattctggctctgctacaattaatttaaccggaacagaagtaaatttattaggaggacta
aattctgttcagggttcaggagttctaattttacaacctagtcggaacacccaagctatg
acattagggggaacagaaaatgcctctagttttgatatgagtagtcgggatttagaaacc
ttaacgaatggatttagtcaaattagaattggccgagtagatagtacaaataccttaaat
ttatacggagattttacggtttatgatccgcttaatttacaagcacaatctattattgga
actggtcgaattacgggagttgataatagctcagtcaccttaaccgccggatcaaatatt
ttaattggagatattatgacccaagggggaaccattcaactcaccagttctcaaggagaa
attcggacaggatctttacaattattatcagaaaatcaaagaagtggcaatattaatata
tcggcattaggtcagattgaaacgggagaaattcgtgctattgcccaggataatagcaat
aaaaatagtaatgttttattaaatagtcaagatattaatttaatcagtcgaaatggggga
atcagagtcaacggtcagatttttaattcatccttagtgggcgactccatcgctattgaa
ttattagcaaatagaaacatcaccaccggagatattaaagcctatcgaggaattaatttg
aatagtacgacgggaataatacagtcaggaaacataaattcagccggaattagaggggga
ggaaatatttttatcattgcaggttctagcattaatactggacgaattaacgctagttct
tccgatggaaaaagtggcaatatttcattaaatgctggtcaagatattgatgtagtttcc
ctgcggggggaaggagaaactcaaggcggcgatattggaatttcaactcatggattattt
agagccacgggaatttttaatagtcgtaatcaaatcaacgccagtatttccagcgtagga
ggagaaaaaggtggttcgattgttattcaacaaggaggcgaccattgtagcactgctgaa
tgtggtaatattcctttttccgtgggaaatccccttttaaatgggacggctggagcaatt
actgatggcaatttggtgagtcttttacctactaataattcttcctcaaattctaatcaa
tcaaccggagaaacccagactattattaatcaaattaattccgaattaaaagggacgaat
caagaaacccaaacctcaaccataccccctaaaaccgagaataccacacctgttttaacc
gatttaacatcggatgctgtactagaaaatacctcggatatttcatctaatcccaacgaa
cccttagaaacccctattattcccctcaatactcccaccattccaatggatcaaattgct
tccggttccgtgatttcctccttggctcaaattgatacatttcgaggaattgaattttct
aactatttaggttcaaactcaaataatacaacccttacggatcaaagtattcgtaaaacc
ttaaatgaaatctataaattaaccggatataaaaccgccattatctatgtatccagtcaa
tcgaatcaattagaattaaggttgattttacccgatggacaaccgatatttaaaagtatt
ccagttccgcgagaaacggtattaaaaaccgctagaactttttctaatcaaattcgttcg
cccgaaaatttagaagatacccgctataaagaaaatggcaaacaattatataaatggtta
attgaacctctggaaagccaattagaagccgagggaattaataccctagtcttttcaatg
gatacgggattaagaaccctacccttagccgccttatatgatgggaaacaatttttatta
gaacgctatagtttaggactaattcctagtttaagtttaacagatactcgctatgttaat
attaaaaactctaaagtattagcaatgggagcctctaattttccccattcaaatcaactc
cctctacccgcagtcccgatggaattagacttaattattaatcataacaattggcaagga
aaatcatttttgaacgagaattttaccgttgacaatcttacatctcagcgcagtcaaaat
caattttcaattgtgcatttagccacccatggagaatttcaaaccggagggtctgaccaa
tcttatattcaattttgggatcaaaaattacggttaaatcaactcagaaacctcaagtta
aatcaaccccctgtagaattattggttttgagtgcttgtacaacagccgtaggggatgaa
aaagcggaattagggtttgcagggttagcggttcaagccggggttaaatcggctttagct
agtttatggtatgttagtgatgcgggaactttagggttaatgaataccttttatcaagcc
ctatcaaccagtccgattaaagcagaagccctacgacaagctcaactcggaatgttacag
ggaaaagttcgtttagaacagggttatttaatcaatgaaactggaactaataccgctaaa
attccccttcctccagaaattgcttcccggggaaatgttaatttatctcatcctttttat
tgggcgggttttactttaattggtagtccttggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
