Planktothrix rubescens: PCC7821_03534
Help
Entry
PCC7821_03534 CDS
T09709
Symbol
lgrB
Name
(GenBank) Linear gramicidin synthase subunit B
Organism
prun
Planktothrix rubescens
Motif
Pfam:
Condensation
AMP-binding
Thioesterase
TubC_N
PP-binding
AMP-binding_C
Mbeg1-like
Abhydrolase_6
Abhydrolase_1
Hydrolase_4
DUF1694
Abhydrolase_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAD5967082
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(3800059..3804321)
Genome browser
AA seq
1420 aa
AA seq
DB search
MKVVEFLSYLKSLDIKLWIEEEKLRYQAPKGAMTTEIKAAIAAQKTDILDFLKAAQIPTN
TVELEIIPVSRDQDLPLSFAQQRLWFLHQLSPDSHSYNLLEALRLEGTLNLFALEQSLSE
LIRRHEVLRTTFPMLEGQPIQRIAPSSPVSLPLQDLQDLSTEKQTECLREMAIALSLKPF
DLAGEPLAQFTLFKLSSQEYVLLLKMHHIIYDGWSLSIFFGELSQLYAAFVQGLPSPLAE
LSIQYADFSVWQRQWLTGEVLERQLNYWRGQLTDAPTILELPTDYPRPPIPSFRGDGAVF
RLDRGLTQRLKQLSQESGTTLFMTLLAAFFVLISRYSGQLDVLVGSPIANRNSSAIEKLM
GFFANTLALRGDLSGNPSFLALLERVKQTTLSAYAHQDLPFEMLVERLQLDRDLSRNPLV
QVMFSLQNTPQSEGSLSGLKIENLPLPIDTKARFDLEVNFWEVSDSLDAVWCYSTDLFTA
GTITQMGQHFQNLLTAIAANPSLGIFELPMLSDAERHQLLVSRNETQTDYPQDKCIHQLF
EEQVKHNPDSVAVVFEGQQLTYSELNSRANQLAHYLKSLGLETDELVAICIERSLEMIVG
LLGILKAGGAYVPIDPDYPKERISFMLQDTQVKILLTQESLLASLPNQEAIVVCLDKDWE
QINQANQENFNSAVSADNLAYVIYTSGSTGTPKGVVVTHQAVNRLVLNTNYIQFTTDDCV
VQASNIAFDAATFEIWGALLNGAKIIILPKSVLLSPQEFALSLKENQISVLFLTTALFNQ
LANLVPQAFSGLRCLLFGGEAVEPKWVQEVRSKGAPQRLLHVYGPTENTTFSSWYLVENL
PATATTIPIGKAIANTQIYLLDKNLQPVPIGVVGELHIGGAGLARGYLNRPELTQEKFIP
NPFSNYPDSRLYKTGDLARYLPDGNIEYIGRIDNQVKIRGFRIELGEIEAVIGQNGDVQS
ACVIVREDNPGEKRLVAYIVPKSGVTMTSEDLRQFLTHKLPGYMVPSAFVMLEFLPLTAN
GKIDRRALKAPSNTSDSDRFIEARSQLELSLVQIWSKVLKIDKIGVRDNFFDLGGHSLLA
PYLTTQIKEQFGKEIALTALFQNPTIEQLATIIQTDSDNSSESCLVPIQPNGSKPPFFCV
PGAGGRPFYFYHLGRYLGKDQPFYSFENDLYQQFGAITQIEAIASIYIQAMQDLQPQGPY
FLGGHSYGGNVVFEMAQQLVKQGQKVALLAIIDSSAPTYKDKQMLLDYINWDHARWLAEV
SKGIEIYLDKTVDISYETLQSLTVEEQLKYVLNFFKMANMLPPNAKTTQLENIVQAYKTS
CLCLVDYLPKQIYPNKITILRANEDLPDDPNRELVAECSEDLSLGWSEFSSEAVDIHYVL
GNHITIMAEPHVQVLAEQLKVCINAKYSNPHSADRGQIFH
NT seq
4263 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaagtagttgaatttttatcttatttgaagagtttagatattaaactgtggattgaa
gaagaaaaactccgttatcaagctcccaagggggccatgacgacggaaattaaagcggcg
atcgcggctcaaaaaactgacattctggactttttaaaagcagcacaaatccctactaat
actgttgagttagagattattcctgtgtcacgggatcaggatttacccctctcttttgct
caacagcgactctggtttctacaccaactttctcccgatagtcattcctataatctgttg
gaagctctacggttagaaggaaccctcaatctgtttgctttagaacaaagtctcagtgaa
ctgattcgccgtcacgaagttttaagaaccacttttccgatgttagaagggcaacccatt
cagcgcattgctccctcttcccccgtcagtttacccctccaagatttacaggatttatca
acagaaaaacaaacagagtgtctgcgggaaatggcgatcgccctctccttaaaacccttc
gatctagcgggggaaccgttggcacaatttaccttgtttaaactgagttcccaggagtat
gtattactgttgaagatgcaccatattatttacgatggttggtctttgagcatctttttt
ggtgaattgtctcaactttatgcggcctttgtccagggtttgccttcccctctcgctgaa
ttatcgatccagtatgccgatttttctgtctggcaacgtcaatggctcacaggtgaagtc
ttggagcgtcaacttaattactggcgaggacagttgacagatgcgccgactatcttagaa
ctgccgacggattatccccgtccccccattcctagtttccgaggtgatggggcggttttt
cgactagatcgaggcttaacccaacgtctcaaacagttgagccaagagtcagggacaacc
ctatttatgactttactggcggctttttttgttctaatttctcgttatagtggtcaatta
gatgtgttggtgggttctccgatcgctaatcggaatagttccgcgatcgagaaattgatg
ggcttttttgctaatactttggctttaaggggcgatctatcaggaaatcccagttttctg
gcgttattagaaagagtaaagcaaacgaccctatcagcctatgctcatcaagatttgccc
tttgaaatgttagtagaaaggttgcaattagaccgcgatttaagccgtaatcctttggta
caagtgatgttttctctgcaaaatacgccccaatcggaaggcagtttgtcgggcttaaaa
atagagaatttgcccttaccgattgatactaaagctcgatttgatttagaagtcaatttt
tgggaagtttctgatagtttagatgcggtttggtgctatagcacggatttgtttactgct
ggcactattacccaaatggggcaacattttcaaaatctcttaaccgcgatcgccgctaat
cccagcctgggaatttttgaattaccgatgttgagtgatgcagaacgtcatcaattgttg
gtatcccggaacgaaactcaaacagattatccccaggataaatgtattcatcaattattt
gaagaacaggtaaaacacaaccccgactctgtagcagtagtttttgaaggtcaacaatta
acctattcagaattaaatagtcgtgctaatcaattagcccattacctaaaatctttaggg
ttagaaactgacgagctagtggcgatttgtatagaacgttctttagaaatgattgtggga
ttgttggggatattaaaagcaggaggtgcttatgttcccattgacccagattatcccaag
gaacgcattagcttcatgctccaagacactcaggttaaaatactgttaactcaggaatct
ttgcttgcttctcttccaaatcaggaggcgattgtcgtctgtttagacaaagattgggaa
caaattaatcaagcaaatcaagagaattttaatagcgcggtttctgcggataatttggct
tatgtgatttatacttctggttctacgggaactcccaagggggttgtcgtaactcatcaa
gcagttaatcgcctggtattaaataccaattacatccagttcactactgatgattgcgtt
gttcaagcgtctaatattgcttttgatgcagctacttttgaaatttggggagctttgctt
aacggagctaagattattattctccctaaatcagttttgctctcaccccaagagtttgcc
ctaagtttaaaggaaaaccagattagtgtcttatttttaacgacagccctattcaatcag
ttagccaatttagttccgcaagcttttagtggcttacgatgcttactgtttgggggcgaa
gcagttgagccaaaatgggtacaagaggtacggtcgaaaggtgcgccgcaacggttgctt
catgtctatgggccaacggaaaatacgacgttttcttcttggtatttagtggagaactta
cccgctacagcgacaactattcccattggtaaggcgatcgccaatacccaaatctatttg
ctagataaaaacctgcaacccgttcccattggtgtagtaggagaattacatattggtggt
gcaggattagccagaggttatcttaaccgtcccgaattaacccaagagaaatttattcct
aatccttttagtaattacccagattctcgtctttataaaacgggagatttagctcgttat
ttgcctgatggtaatattgaatatatcgggcggattgacaatcaagtaaaaattcgcggt
tttcgcattgaattgggggaaattgaggctgtaatcggtcaaaatggagatgtacagtcg
gcttgtgtgattgttcgtgaagacaatccaggagagaagcggttagttgcctacattgtg
ccaaagtcaggggtgacaatgacaagcgaagatttgcgtcagttcctgacccataaattg
cctggttacatggttccgagtgcctttgtgatgctggaatttttgcccttaaccgctaac
ggaaaaattgatcgccgtgcgttaaaggctcctagtaacaccagtgattcagacagattc
attgaagcgcgtagtcagctagaattaagcctagtacaaatctggtcaaaagttttaaaa
attgacaaaattggcgttcgggataacttttttgaccttggtggtcactcccttttggct
ccctatttaacgacccaaattaaggaacagtttggcaaagaaattgccttaacagcactg
tttcaaaaccccactattgaacaattagcaaccattatccaaaccgattcagataactct
agtgagtcttgtttagtccccattcaacccaatggttccaagccgcctttcttctgtgtt
ccaggggcgggaggacgacccttttatttttaccatctaggacgttatttaggaaaagat
cagcctttttatagttttgaaaatgatctctatcaacagtttggagcaattactcagatt
gaggcgatcgctagtatttatattcaagccatgcaagatttacagccccaagggccttac
tttttagggggacattcctatgggggaaatgtggtttttgaaatggctcaacagttagtt
aagcagggtcaaaaagtggcattactagccataattgattcctcagccccaacttataaa
gataagcaaatgttgcttgattatattaattgggatcatgcgagatggttagcggaagtg
agcaaaggtatagaaatttatttagataaaactgtagatatttcctatgaaacccttcaa
tcgttgaccgtagaggaacaattaaaatacgttttaaacttttttaaaatggcgaatatg
cttcctcctaatgcgaaaactacacaacttgaaaatattgtacaagcctataaaactagc
tgtttatgtctagttgattatctccctaaacaaatttatcccaacaaaattacgattcta
cgcgctaacgaagatttacccgatgatcccaatcgtgagttagttgctgagtgttccgag
gatttatccctcggctggagtgagttttcttcggaagcagtggatattcattatgtgtta
ggtaatcatatcacaattatggcggaaccccatgttcaagtgttagccgaacagttaaaa
gtttgcatcaatgccaaatattcaaacccacattccgcagataggggtcaaattttccac
taa
DBGET
integrated database retrieval system
