Planktothrix rubescens: PCC7821_03775
Help
Entry
PCC7821_03775 CDS
T09709
Symbol
lgrD
Name
(GenBank) Linear gramicidin synthase subunit D
Organism
prun
Planktothrix rubescens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Condensation
AMP-binding
MR_MLE_C
MR_MLE_N
PP-binding
AMP-binding_C
Enolase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAD5970914
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(4126793..4131157)
Genome browser
AA seq
1454 aa
AA seq
DB search
MKIEKIRLYQIKQKLPTFFKTSYGVNTHKNCILISVHSQGLVGWGECVASEHPSYSYETV
KTARHILEDFLIPIVMQSDLETVDDLPDFSSIRGHFMAKAALENALWDLLAKSQNVSLSQ
MIGGVKTKVEIGSSMGIQKDIPTLLDQVATRLQNGYKRIKIKIKPGWDIEPVGAIREYYP
NIQLMVDANSAYTLADTPLFQELDLFNLLMIEQPLAHDDIIDHASLQEIINTPICLDESL
YSVEQARRAIALQAGRIVNMKVGRVGGLRHALEIHDLMETSGWQMWCGGMFETPIGRIVN
LHLATKANFTLANDIDVYSLGNSWLQDESFVRNKQDSTVAVPTGAGIGVEINYETLAQHQ
ISQVNFEQTHYFSHQKTVVSTAKDEDNETQRPVFLPNPTQNLPFRWFGAIHESFEQQVER
VPEKLALVGADITFTYQQLNELSNRIAHYLLEHQLEGKLVVIYASLSPFLVVALLGILKA
GAAFMVLNKLYPVTQLLRYCQLSDPKALICLEVAGELPEALQEIAPKVQLDLPQQLYQAE
EILGQYSITNPNRIITPEQLAYIVFTSGSTGIPNGVVGTHSPVTHFIEWQIRTFGLTKED
RFSNLASIAHDILLRDIFTPLSLGATLYVPNPLDESSISLNLGEWMRVNKISVAHLTPPT
GQLLTITNKPLPDLRYLFFGGDKLPNSLVSQLQKLTVNLSCVNFYGTTETPQAMSYYILS
PQKMTSAIAPIGQGIDDVQILLLDDNNQLVKIGEKGEITVRTPYLSQGYLDNSVLTQQRF
ITNPYTENPGDRIYKTGDIGRYLPNGDVEILGRRDNQVNVRGFRIELDELEGILLKYPFV
KEAAVKLIEEGEKQYLVAYIVGQEGLDLSLLQVYVNERLVNRVKLNIFVQLEAFPLTVNG
KIDRHSLPRPNFSKREYVPPQTETESLLVSLWEDVLREKVGITDNFFELGGDSLMATYIV
LNLAKLSDIHLLPTILFEYPTIEVLGTYIDGLQSNIITYTNNYVTTSVTYAPATYAQERV
MKWLESSAATLPYHLPSVYRLQGTLNIEALQQSFAYLVQRHAALRTRLLWKDDRLFQSIE
PQISIDFQIKQLSDQQTIGDYIIIFLYQTFDLTQEPPVRVALLQIATNEYLVLIVFHHIM
VDGRAKRLLFNELNIVYRDLVLGKEPSLPPLSSQYVDYAYWQRHLPTTLLEQHRAYWLPR
LETVTDTPILPQDYPTPTVRSFKTEQIRQILPLPLSDGLKQLTQKEHTTLFMGYLSCFYL
LLYRYSGNRQLAVVTPNTMRPATNFNGVVGDFTNYLLLQIELGKQPTTFRELLQKVRRIT
SDAYKYQYVPFEQLAREAYPHRDFLPHPLCRIQINMITWEQPFELYELKSERYAHEESGY
ASSMVVNFFDLSFVIRTKLLPVADESEPKTHYMIQLKYQSQLFKKERINQFLADYQALIQ
QVVAHPDMAIVFPE
NT seq
4365 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaattgaaaagatcagactctatcaaatcaaacaaaagttgccaactttttttaaa
accagttatggcgtaaatacccacaaaaattgtattttaatctctgttcatagtcaaggt
ttagtaggttggggggaatgtgtcgcctctgaacatccttcatattcttatgaaacggtg
aaaaccgcaaggcatatcttggaggattttttgattcccattgtgatgcaatctgatctt
gagactgttgatgatttgccagattttagctcaattcgagggcatttcatggcaaaagca
gcccttgaaaatgcgttgtgggatttattggctaaatcacagaatgtctctctttctcag
atgattggtggtgtaaaaactaaagttgagatcggatctagtatggggattcaaaaggat
ataccaactttattggatcaagtagctacaagattgcagaatggctataagcgaatcaaa
attaaaatcaagccgggatgggatattgaacctgtgggagcgattcgagagtattatcca
aatattcaattaatggttgatgctaatagtgcttataccctggcagatactccattattt
caggagttagatttatttaatttgctgatgatagaacagcccttagcacacgacgatatt
attgatcatgcttcgttacaggagatcattaatacgccgatttgtttagatgaaagcctt
tattctgttgaacaagcaaggcgagcgatcgctttacaagccgggcgcattgttaatatg
aaagttggcagagtcggagggttgcgccatgctctggaaattcacgatctgatggagaca
tcgggttggcaaatgtggtgtggaggtatgtttgaaacaccaattgggcggattgtcaac
ctacatttggcgactaaagccaattttaccctagcaaacgatattgacgtttatagtctc
ggcaattcatggcttcaagatgaatcttttgtgcgaaacaaacaagattcaaccgtagct
gtgccaacaggtgcgggtataggagttgagattaattacgaaaccctagctcaacatcaa
atttcccaagtcaattttgagcaaacccactacttctctcatcaaaaaaccgttgtttcg
acagcgaaagacgaagataacgagacacaaagaccagtttttttaccaaatcctacacaa
aatctgccttttcgctggtttggtgcgatacatgagtcttttgagcaacaagtagaaaga
gtacccgaaaaattagcccttgttggtgctgacatcaccttcacctatcaacaattaaac
gaattaagtaatcgaattgcccattaccttctggaacatcaactagagggaaaattagtg
gttatttatgcgtcattgtcaccgtttttggtagttgctttgctaggaatcctcaaagcg
ggtgctgcttttatggttttaaataaactctatcctgtgacacaattattgaggtattgt
caattaagtgacccaaaagcgttgatctgtttggaagttgctggggagttaccagaagcc
ttacaggaaattgcacctaaagtacaacttgatttaccacaacaactttaccaagcagag
gaaattttaggtcagtattcgataacgaatcccaatcggattataactcctgagcaattg
gcttatatcgtttttacatctggctctacaggtatccctaatggcgttgtgggtactcat
agccccgttacccattttattgagtggcaaattcgcacatttggcttgactaaagaggat
cgttttagtaatttagccagtattgcccatgatattttattaagagatatttttactcca
ttatcattaggagcaaccttgtatgtgcccaaccccttggatgaatcctcaatcagttta
aatttaggggaatggatgcgagtcaataaaatatctgttgcccatcttacaccccccaca
ggacaactactcaccattacaaataagcctctacctgatttgcgctatctcttttttggt
ggggacaaattgcccaattccctagtcagtcagttgcaaaaattgacagttaatttgagt
tgcgtcaatttctatgggacaacagaaacacctcaagcgatgagctactatatcctatca
ccgcagaaaatgacatctgcgatcgcgcccataggacaaggtatagatgatgtccaaatt
ttattattagatgacaataatcaattagttaaaatcggtgaaaaaggggaaataactgtc
cgcaccccttatctttcccaaggttatttagataattctgttttaactcagcagcgtttt
attactaatccttacacagaaaatccaggcgatcgcatttacaaaacgggtgatatcggc
cgatatttgcctaatggagatgtggaaattttaggaagacgggataatcaagttaatgtg
cgcgggtttcgcattgagttggatgaacttgaggggattttgttaaaatacccattcgtt
aaagaagcggcggtaaaattgattgaagagggggaaaaacagtatttagtagcctatatt
gtcggtcaagaggggctagatttatcgctgttgcaagtttatgtcaatgaacgcttggta
aaccgagtaaaattgaatatatttgttcagttagaggcttttccgttgaccgtgaacgga
aaaatagaccgtcattccttacccagacctaacttttctaagcgggaatatgtaccgcca
caaaccgaaaccgaatctttattagtcagtttatgggaagatgtattgcgggaaaaagtt
ggtattacagataatttctttgaattggggggagactctctaatggcgacttatattgtc
cttaacctggcaaaattatctgacatccatctattaccgacaatactatttgagtatcct
actattgaggttttagggacttatattgatggattacaaagcaatattattacctatacc
aacaactatgtaacaacttcagtaacttatgctccggcaacttatgcccaagaaagggtg
atgaaatggcttgagtcaagtgcagctacattaccttatcatttaccgtctgtttatcgg
ttgcaaggaacactcaatatagaggcattacaacagagtttcgcttacttagtccaacgt
catgccgcacttcgcacccgacttttgtggaaagatgatcggttgtttcaatctatcgaa
ccacagatatcaattgattttcagattaagcaattgtcagatcaacaaaccattggagat
tatatcattatatttctctatcaaacctttgatcttactcaagaaccacccgtaagagtc
gctttactacaaatagctacaaatgaatatcttgtgttaattgtctttcatcatattatg
gtggatggtcgagctaaacgtttactattcaatgaattgaatatagtgtatcgtgatctg
gtgttgggcaaagaaccatcccttccccctttatcatctcaatatgtcgattatgcttac
tggcaacgtcatctccccactactctattagagcaacatcgtgcttattggttgccccgt
ttagagactgttaccgatactcctatcctaccccaagattatccgactccaacggttcgg
agcttcaaaactgagcaaattcgtcaaattttgcccctaccattgagtgatggcttaaag
cagttgactcaaaaagagcatactaccttatttatgggttatctcagttgcttttatctg
ttgttatatcgttatagtggtaatcgccagttagccgttgttacaccgaatacaatgaga
ccagcgactaattttaacggcgtagttggagatttcactaattacttattattacaaatt
gaattaggaaaacaaccgacaacctttcgagaattgttgcaaaaagtgcgccgtatcaca
tcggatgcttataagtatcaatatgtaccttttgaacagttagcccgcgaagcctatccc
catagagactttcttcctcatcctctttgtcggattcaaattaatatgattacatgggaa
cagccttttgaactttatgagctaaaatcggaacgatacgcccatgaagaatctggctat
gcttcgtcgatggtggtcaacttttttgatctgtcttttgtaattcgcacaaaactattg
ccagtagcagatgaatctgaacccaaaactcactacatgatccagcttaaatatcaatcg
caattattcaaaaaagagcggataaatcaatttttagctgattatcaagctctgatccaa
caagttgtcgcccatcctgacatggctattgtttttcctgagtga
DBGET
integrated database retrieval system
