KEGG   Planktothrix rubescens: PCC7821_04486
Entry
PCC7821_04486     CDS       T09709                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K09800  translocation and assembly module TamB
Organism
prun  Planktothrix rubescens
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:prun00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:prun02000]
    PCC7821_04486
Transporters [BR:prun02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   PCC7821_04486
SSDB
Motif
Pfam: TamB Bactofilin
Other DBs
NCBI-ProteinID: CAD5979537
LinkDB
Position
I:complement(4967559..4973741)
AA seq 2060 aa
MTNTPNPNSESIVPRRRRLKRILLWGGMGCGVTLLAVGTTASWLIRYRLAPIISNVLEGI
LQRPVDVGPLEGFTLNSIRFGHSSIPVTATDTDRGEATAVEVNFSLLSLFKPKVQLDITI
VNPNIYIEQNSSGNWIDTQLKLDPNPPITLVFRTIGIENAQINLMPYQLLKAKEKPIVIA
VDQIKANLTEDQQSIQANLRGKFAETGTFAIKGDALLETGKINAQIQANSLNLSNLAWFV
ETPGISIKQGKLNTNLNVKLNNYKPSDVRGTLNLDQVKIAVDSLPEPVNLSQAKLRFSGT
KLIIDQLNTTMADLALGLTGSVLTNSNLDLAKTQVDLLANLQPVQVSTLLKTVETIQNQP
VTLPFPVTGELKANLNLKGNLNSPKISGNIGTTQKTLLDRVYFDTIQTDFNILTKLDPNF
KILADPIIEIQNLLIQPSLGGSVTGKGEVKLAGMTALLAPPIKPQPTVDQKTLLKLPPNP
QISQQKTELNPIVKLDFNVNNIPVDAIAKSYGFIPSFPIGNLSANGQISGDLDNLKANSQ
FSLPSTIYPIFGEAQISGNTAKAQIKIAEGNLNIIAQQTNNQIWNAEVIANQLSLTPLVD
LGLLFSTIPNTTKQQIQSIDLTDGQLNLAAKLSANLQDFSLNSLKADSQIQLNFQNSTIK
AIAQLQNGLLQTDFSSDNLSLPRLINIGLPFANLTDAITSQIQSLDISQGTLQIDGSLSG
KIENFSPNNFIGNAKTVINLGKLGGIITANSQLNQGQFQGQFNAQEIQLNPWINLGLPLA
NLPPNLQNQIQTLDFRNSRLNGEGNLTGNLTNFNLNSLIATGLAQVNLGNFGGIINAEGQ
LANNQLTGQVITDQIPLQPLINFGLPLANLQPSLVAEINALNFQGGFLQGLAKFNGNLTN
FSPNNLIAFLDSKVNLGRDGGIVLATGETRQGQWKTTIKGDQIALGRFSQLVESQIPNSL
RQNGLLQQAENMPLLRGLLTTEITGEGNIASFNPNTIQALGQLRLTELPIIKQPFEAIAS
WNGREINIKKAETQGFSTDGLIGVEFQGNGIPQLSNLNLNVRADNFDLQSPLVQSFLTAL
PLEIRTGDSPLVAGIVDFNGKLTGTPSALNLNGNLRLNNFAVRDVTFESILAGTVNIIPN
QKVNIALAGERDKIELALDNQYLPTSFLVKRNDSQLVGNSQGNNLEINLDDFPLQTLSLS
PLAELNIGQLKGIASGKLTVSNLASFDINKIGVIGNIAIQNLILGHIETDLFLGNFSYQN
GIAKLTDAELSKGITQIIINGQANISDILASLSTPQTQNLSTVSNQFEGTIKIPQGSLQD
ILTALKIFNLADLGRGLTPPNYGIATDVKPVPVGLPPTATLFEQLQRLEEIRRILQESLA
EIAAEPLPPLRDLDGKFTGEIAFKGSIQWGINATATIKGQDWNYGRYTADQFLLEANFVD
NVVRVEPIQLLAESALYDFRGQLNLANQQISGQFRGKNIRLEEIEKIVDLPNVDLTGQLN
VRASIGGTLDNPQSSGELTLLEATVNNEPIQEAQSSFSYNNARLRFGGSLLVTETDPINF
RGTLPFQFPFAKVTSESDVVDVRVDIKDQGLAVINLLNPELNWQEGKGLVQLRISGSLQQ
PETGGIKLNLKPEGLFKIQDAVLIARSLEQSIVGLSGTAVFIGDRIQVKDIQGDLQGDKG
TGRIRLSGVLPVSRPLDENDPDLQTPLQLDLEKLTLNLPELYKGNADGAILLTGTLLKPK
LGGEVILSQGKVTLPSEQTATLPTDTTNTTQPPVDVSLNGLKLTLGDNIQVMTPPILNAP
LINFNAKGTIELNGSLASLDDIRPQGTIDLTGGQVNLYTSQLRLDRGYPQRAIFVPSEGL
NPILDVRLVTRVPETLRFVSPPSAFPAEQTEALSPSRFGTVRTIRITAIVRGPASEINDI
IKLQSSPSRSQNELVALLGGSVIQGIQDDSTLVLANIASTGLFGKLQQNVINATGLTEFR
IYPSRVAERGSKGTASALGVGIEVGLDVTDNAYVSLSRVLAADQPFQFNINYRLNDNILL
RGVTNFRNESEVRFEYETRF
NT seq 6183 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgactaatacaccgaatcccaattctgaatcaattgtaccccgccgacgacggttaaag
cggattttgctttggggcggtatgggctgcggagtcaccctgttagccgtggggacaacc
gccagttggctgattcgatatcggttagcccccataattagtaatgtcttagaagggata
ctacaacggccagttgatgttggcccccttgaaggatttaccctaaatagtattcgtttt
ggtcattcgtccattcccgtcacagccacggataccgataggggggaagcgacggcggta
gaggttaatttctctcttttatccttgtttaaacccaaggttcaacttgatattaccata
gttaatcctaatatttatattgaacaaaattcatcgggaaactggattgatactcaactt
aagttagatccaaatcctccaattacattggtttttagaacgattgggattgaaaatgct
caaattaatttaatgccctatcagcttttgaaagccaaagaaaagccgattgtgattgcg
gtggatcaaatcaaagctaatttaaccgaagatcagcagagcattcaagcgaatttaagg
ggtaaatttgcagaaacaggtacttttgccatcaagggagatgctttattagaaacagga
aaaattaatgctcaaattcaagctaatagtttgaatttaagcaatttagcttggtttgta
gaaactcctgggatttcgattaaacagggaaaacttaatacaaatttaaacgttaaatta
aataattataaaccatcagatgttcggggaacgctgaatttagatcaagttaaaattgct
gttgatagtcttcctgaacctgttaatctgagtcaagctaaattacgattttcgggaact
aaattgatcattgatcagttgaatactactatggcagatttggctctaggattaacggga
tcggttttaactaattctaacttagacttagctaaaactcaagttgatttattagcaaat
ttacaaccagttcaagtttccaccctgttaaaaaccgtagaaactattcagaaccaacct
gttacccttccctttccggtgacgggagaattgaaagctaatcttaacttaaaaggaaat
ttaaacagtcctaaaatttcaggaaatatcggcacaactcaaaaaaccttattagatcgc
gtttattttgatacaattcaaacggattttaatatattaactaaacttgatccaaatttt
aagattttagctgatccaattattgagattcaaaacctattaattcaaccttcccttggg
gggtcagtaaccggaaaaggggaagttaaattagcaggaatgaccgcgttattagcaccc
ccaataaaacctcagcctacggttgatcaaaaaactttactaaaattacccccaaatcct
cagatttcacaacaaaaaaccgaacttaatccgattgttaagttagattttaatgttaat
aatattcctgtggatgcgatcgctaaatcctacggatttatccccagttttccgattgga
aacctatcagcaaatggtcaaatttctggagatttagacaacttaaaagctaatagtcaa
ttctccttaccttcaacaatttatccgatttttggggaagctcaaatttcaggaaatacg
gcgaaagcacagattaaaattgctgagggaaatctgaatattattgctcaacaaactaat
aatcaaatttggaatgctgaagtcatagctaatcaactttccttaactcctttagttgat
ttgggtctattattttccacaattcctaatacaactaaacaacaaattcaatctattgat
ttaaccgatggtcagttaaatttagccgccaaattatcagcaaatttgcaagatttttcc
ctgaatagtttaaaagcggatagtcaaattcaacttaattttcagaatagtacaattaag
gcgatcgcccaactccaaaacggactactacaaacggatttttctagcgataatttatcc
ttacctcgattaattaatattggattaccctttgccaacttaactgatgctatcacctcc
caaattcagagtttagatatcagtcaaggaactttacaaattgatggatctctatcaggt
aaaatagagaattttagcccaaataactttatcggaaatgccaaaacagtcattaattta
ggtaaattaggaggaataattaccgccaatagtcaacttaatcaaggacaatttcaagga
caattcaatgctcaagaaatccagttaaatccttggattaatttaggtttacccctcgct
aatttacccccaaacctccagaatcaaattcaaaccttagactttcgtaatagtcgttta
aacggagaaggaaatcttaccggaaatttaactaattttaatcttaatagtctgattgct
acgggattagcacaggttaatttagggaattttggtggaattattaatgcagaaggacaa
ttagcaaataatcaattaacaggtcaagtaatcaccgatcaaattcctctacaaccctta
attaatttcggattacccttagcaaatttacaacctagtttagtagctgaaattaacgcc
ttaaattttcaaggaggattcctacaagggttagcaaaatttaatgggaatctgactaat
ttttcccctaataacttaatagctttcctcgatagtaaggtaaatttaggtcgagacggc
ggtatagttttagcaaccggagaaactcgacaaggacaatggaaaacaaccattaaagga
gatcaaattgctttaggtcgattctctcaattagttgaatctcaaataccaaatagttta
cgtcaaaatggactattacagcaagctgaaaatatgcctttattgcgaggattattaact
actgaaatcaccggagaaggaaatattgcctcctttaatcccaacactatacaggcatta
ggtcaattaagactaacagaattaccgattattaaacaaccttttgaagccattgcaagc
tggaatggtcgagaaattaatattaaaaaagctgaaacccagggattttcaactgatggc
ttaattggagttgaatttcaaggaaatggtattccccaattatctaatttaaacctaaat
gttcgggctgataattttgatttacaatctccattagtgcaaagtttcttaactgcttta
cccttagaaattagaaccggagatagtcctttagtggctggaattgttgattttaatggt
aaattaacggggactccttcggctttaaacctaaacggaaatttaagattaaataacttt
gcagttcgggatgtcacctttgaatccattctagcaggaactgtgaatattattccaaat
caaaaggttaatattgccttagcgggagaaagggataaaatagaattagctttggataat
caatatttaccgacttcctttttagtaaaacggaatgatagtcaattagtcggaaactct
caagggaataatttagagattaatttagacgactttcctctacaaacattaagtttatct
cccttagctgaactaaatattggacaattaaaaggtatagcatcgggaaaattaaccgtc
tctaatttagccagttttgatattaataaaataggggtaatcggaaatattgcgatccag
aacctaattttaggtcatattgaaaccgatttatttttgggaaattttagttatcaaaat
ggtattgctaagttaaccgatgctgaattgagcaaaggcataactcagattataattaat
ggtcaagccaatatttctgatattttagccagtctttccacacctcaaacccagaattta
tccactgtatcgaatcaatttgaaggaacaattaaaatcccccaagggagtttacaggat
attttaaccgccctaaaaatctttaatttagcagatttaggcagaggattaacccctcca
aactatggaatagccaccgatgtaaagcctgttcccgtcggtttaccccccacagctacg
ttatttgaacaattacaacgcctagaagaaattagacgaatattacaagaatccctagca
gaaatcgcggcggaacccttacctcctttacgagatttagacggaaaatttaccggagaa
attgcatttaaaggttcaattcaatggggaattaatgcgacagcaaccatcaaaggtcaa
gattggaattatggcagatataccgccgatcagtttttattagaagcgaattttgtagat
aatgtggtgcgggttgaacccattcaattgcttgctgaatcagcattatatgattttcgc
ggacagttaaatttagccaatcaacaaatatcaggtcagtttcggggtaaaaatatccgc
ttagaagaaattgaaaaaattgtcgatttgccaaatgtggatttaaccggacaattgaat
gttcgggcgagtattgggggaactttagataatccccaatcatcgggggaattaacctta
ttagaagcaacggttaataatgaaccaattcaagaagctcaaagcagttttagttataat
aatgctcgactaagatttggcggaagtttgttagttaccgaaaccgatccaattaatttt
agagggactttaccttttcaattcccctttgcaaaagtaacttctgaaagtgatgtagtt
gatgttagagttgatattaaagatcaaggattagcagtgatcaatttactgaatcctgaa
ttaaattggcaggaaggaaaaggattagttcaattaagaatcagtggtagtttacaacaa
ccggaaactggaggaattaagctcaacctgaaaccagaaggattatttaaaattcaagat
gcagttttaattgctcgcagtttagaacaatcaattgtgggattaagtggaactgctgta
tttatcggcgatcggattcaagttaaagatattcaaggagatttacaaggagataaagga
accggacgtatccgattaagtggggttttacccgtgtctcgtcccttagatgaaaatgac
ccagatctgcaaactcctctacaattagacctggaaaaactaacacttaatttacccgaa
ctctataaaggaaatgctgatggtgctatccttcttacaggaacattattgaaaccaaaa
ttaggaggagaagtcatattaagtcagggaaaagttaccttaccttcggaacaaaccgct
accttacccacagatactacgaatacaactcaacctcctgttgatgtcagtctgaacgga
ttaaaactaactttaggcgacaatattcaagtcatgactcccccgattttaaatgcacct
ttaattaattttaatgcgaaaggaacgattgaattaaatggaagtttagccagtcttgat
gatattcgtcctcaaggaacgattgacttaaccggaggacaagttaatctttataccagt
caattaaggttagatcgaggctatccccaacgggcaatatttgttccttcggagggatta
aatccaattttagatgtccgtttagtcacccgtgttcctgaaactttaaggtttgtttct
cccccttcggcttttccggcggaacaaacggaagccctaagtccttctcgatttggaaca
gtccgaactatccgaattaccgcaattgttcgcggcccagcttcggaaattaatgatatt
attaagctacaaagttctccgtcccgttctcaaaatgaattggtggctttattgggggga
agtgtgattcaaggcattcaagatgatagtacattagtattagcaaatattgccagtacc
ggattatttggtaaactccaacagaatgtgattaacgccacgggattaacggaatttagg
atttatccctcgcgggtagccgaacgaggttctaagggtacagcttccgctttaggagtg
ggaattgaagttggtttagatgtgactgataatgcttatgtgtctttgagtagagtttta
gctgcggatcaaccgtttcaatttaatattaattatcgtcttaatgataatatattgttg
cggggagttacgaattttaggaatgaaagtgaagttcggtttgagtatgaaacgagattt
taa

DBGET integrated database retrieval system