Planktothrix rubescens: PCC7821_04486
Help
Entry
PCC7821_04486 CDS
T09709
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
prun
Planktothrix rubescens
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prun00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
prun02000
]
PCC7821_04486
Transporters [BR:
prun02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PCC7821_04486
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Bactofilin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAD5979537
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(4967559..4973741)
Genome browser
AA seq
2060 aa
AA seq
DB search
MTNTPNPNSESIVPRRRRLKRILLWGGMGCGVTLLAVGTTASWLIRYRLAPIISNVLEGI
LQRPVDVGPLEGFTLNSIRFGHSSIPVTATDTDRGEATAVEVNFSLLSLFKPKVQLDITI
VNPNIYIEQNSSGNWIDTQLKLDPNPPITLVFRTIGIENAQINLMPYQLLKAKEKPIVIA
VDQIKANLTEDQQSIQANLRGKFAETGTFAIKGDALLETGKINAQIQANSLNLSNLAWFV
ETPGISIKQGKLNTNLNVKLNNYKPSDVRGTLNLDQVKIAVDSLPEPVNLSQAKLRFSGT
KLIIDQLNTTMADLALGLTGSVLTNSNLDLAKTQVDLLANLQPVQVSTLLKTVETIQNQP
VTLPFPVTGELKANLNLKGNLNSPKISGNIGTTQKTLLDRVYFDTIQTDFNILTKLDPNF
KILADPIIEIQNLLIQPSLGGSVTGKGEVKLAGMTALLAPPIKPQPTVDQKTLLKLPPNP
QISQQKTELNPIVKLDFNVNNIPVDAIAKSYGFIPSFPIGNLSANGQISGDLDNLKANSQ
FSLPSTIYPIFGEAQISGNTAKAQIKIAEGNLNIIAQQTNNQIWNAEVIANQLSLTPLVD
LGLLFSTIPNTTKQQIQSIDLTDGQLNLAAKLSANLQDFSLNSLKADSQIQLNFQNSTIK
AIAQLQNGLLQTDFSSDNLSLPRLINIGLPFANLTDAITSQIQSLDISQGTLQIDGSLSG
KIENFSPNNFIGNAKTVINLGKLGGIITANSQLNQGQFQGQFNAQEIQLNPWINLGLPLA
NLPPNLQNQIQTLDFRNSRLNGEGNLTGNLTNFNLNSLIATGLAQVNLGNFGGIINAEGQ
LANNQLTGQVITDQIPLQPLINFGLPLANLQPSLVAEINALNFQGGFLQGLAKFNGNLTN
FSPNNLIAFLDSKVNLGRDGGIVLATGETRQGQWKTTIKGDQIALGRFSQLVESQIPNSL
RQNGLLQQAENMPLLRGLLTTEITGEGNIASFNPNTIQALGQLRLTELPIIKQPFEAIAS
WNGREINIKKAETQGFSTDGLIGVEFQGNGIPQLSNLNLNVRADNFDLQSPLVQSFLTAL
PLEIRTGDSPLVAGIVDFNGKLTGTPSALNLNGNLRLNNFAVRDVTFESILAGTVNIIPN
QKVNIALAGERDKIELALDNQYLPTSFLVKRNDSQLVGNSQGNNLEINLDDFPLQTLSLS
PLAELNIGQLKGIASGKLTVSNLASFDINKIGVIGNIAIQNLILGHIETDLFLGNFSYQN
GIAKLTDAELSKGITQIIINGQANISDILASLSTPQTQNLSTVSNQFEGTIKIPQGSLQD
ILTALKIFNLADLGRGLTPPNYGIATDVKPVPVGLPPTATLFEQLQRLEEIRRILQESLA
EIAAEPLPPLRDLDGKFTGEIAFKGSIQWGINATATIKGQDWNYGRYTADQFLLEANFVD
NVVRVEPIQLLAESALYDFRGQLNLANQQISGQFRGKNIRLEEIEKIVDLPNVDLTGQLN
VRASIGGTLDNPQSSGELTLLEATVNNEPIQEAQSSFSYNNARLRFGGSLLVTETDPINF
RGTLPFQFPFAKVTSESDVVDVRVDIKDQGLAVINLLNPELNWQEGKGLVQLRISGSLQQ
PETGGIKLNLKPEGLFKIQDAVLIARSLEQSIVGLSGTAVFIGDRIQVKDIQGDLQGDKG
TGRIRLSGVLPVSRPLDENDPDLQTPLQLDLEKLTLNLPELYKGNADGAILLTGTLLKPK
LGGEVILSQGKVTLPSEQTATLPTDTTNTTQPPVDVSLNGLKLTLGDNIQVMTPPILNAP
LINFNAKGTIELNGSLASLDDIRPQGTIDLTGGQVNLYTSQLRLDRGYPQRAIFVPSEGL
NPILDVRLVTRVPETLRFVSPPSAFPAEQTEALSPSRFGTVRTIRITAIVRGPASEINDI
IKLQSSPSRSQNELVALLGGSVIQGIQDDSTLVLANIASTGLFGKLQQNVINATGLTEFR
IYPSRVAERGSKGTASALGVGIEVGLDVTDNAYVSLSRVLAADQPFQFNINYRLNDNILL
RGVTNFRNESEVRFEYETRF
NT seq
6183 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactaatacaccgaatcccaattctgaatcaattgtaccccgccgacgacggttaaag
cggattttgctttggggcggtatgggctgcggagtcaccctgttagccgtggggacaacc
gccagttggctgattcgatatcggttagcccccataattagtaatgtcttagaagggata
ctacaacggccagttgatgttggcccccttgaaggatttaccctaaatagtattcgtttt
ggtcattcgtccattcccgtcacagccacggataccgataggggggaagcgacggcggta
gaggttaatttctctcttttatccttgtttaaacccaaggttcaacttgatattaccata
gttaatcctaatatttatattgaacaaaattcatcgggaaactggattgatactcaactt
aagttagatccaaatcctccaattacattggtttttagaacgattgggattgaaaatgct
caaattaatttaatgccctatcagcttttgaaagccaaagaaaagccgattgtgattgcg
gtggatcaaatcaaagctaatttaaccgaagatcagcagagcattcaagcgaatttaagg
ggtaaatttgcagaaacaggtacttttgccatcaagggagatgctttattagaaacagga
aaaattaatgctcaaattcaagctaatagtttgaatttaagcaatttagcttggtttgta
gaaactcctgggatttcgattaaacagggaaaacttaatacaaatttaaacgttaaatta
aataattataaaccatcagatgttcggggaacgctgaatttagatcaagttaaaattgct
gttgatagtcttcctgaacctgttaatctgagtcaagctaaattacgattttcgggaact
aaattgatcattgatcagttgaatactactatggcagatttggctctaggattaacggga
tcggttttaactaattctaacttagacttagctaaaactcaagttgatttattagcaaat
ttacaaccagttcaagtttccaccctgttaaaaaccgtagaaactattcagaaccaacct
gttacccttccctttccggtgacgggagaattgaaagctaatcttaacttaaaaggaaat
ttaaacagtcctaaaatttcaggaaatatcggcacaactcaaaaaaccttattagatcgc
gtttattttgatacaattcaaacggattttaatatattaactaaacttgatccaaatttt
aagattttagctgatccaattattgagattcaaaacctattaattcaaccttcccttggg
gggtcagtaaccggaaaaggggaagttaaattagcaggaatgaccgcgttattagcaccc
ccaataaaacctcagcctacggttgatcaaaaaactttactaaaattacccccaaatcct
cagatttcacaacaaaaaaccgaacttaatccgattgttaagttagattttaatgttaat
aatattcctgtggatgcgatcgctaaatcctacggatttatccccagttttccgattgga
aacctatcagcaaatggtcaaatttctggagatttagacaacttaaaagctaatagtcaa
ttctccttaccttcaacaatttatccgatttttggggaagctcaaatttcaggaaatacg
gcgaaagcacagattaaaattgctgagggaaatctgaatattattgctcaacaaactaat
aatcaaatttggaatgctgaagtcatagctaatcaactttccttaactcctttagttgat
ttgggtctattattttccacaattcctaatacaactaaacaacaaattcaatctattgat
ttaaccgatggtcagttaaatttagccgccaaattatcagcaaatttgcaagatttttcc
ctgaatagtttaaaagcggatagtcaaattcaacttaattttcagaatagtacaattaag
gcgatcgcccaactccaaaacggactactacaaacggatttttctagcgataatttatcc
ttacctcgattaattaatattggattaccctttgccaacttaactgatgctatcacctcc
caaattcagagtttagatatcagtcaaggaactttacaaattgatggatctctatcaggt
aaaatagagaattttagcccaaataactttatcggaaatgccaaaacagtcattaattta
ggtaaattaggaggaataattaccgccaatagtcaacttaatcaaggacaatttcaagga
caattcaatgctcaagaaatccagttaaatccttggattaatttaggtttacccctcgct
aatttacccccaaacctccagaatcaaattcaaaccttagactttcgtaatagtcgttta
aacggagaaggaaatcttaccggaaatttaactaattttaatcttaatagtctgattgct
acgggattagcacaggttaatttagggaattttggtggaattattaatgcagaaggacaa
ttagcaaataatcaattaacaggtcaagtaatcaccgatcaaattcctctacaaccctta
attaatttcggattacccttagcaaatttacaacctagtttagtagctgaaattaacgcc
ttaaattttcaaggaggattcctacaagggttagcaaaatttaatgggaatctgactaat
ttttcccctaataacttaatagctttcctcgatagtaaggtaaatttaggtcgagacggc
ggtatagttttagcaaccggagaaactcgacaaggacaatggaaaacaaccattaaagga
gatcaaattgctttaggtcgattctctcaattagttgaatctcaaataccaaatagttta
cgtcaaaatggactattacagcaagctgaaaatatgcctttattgcgaggattattaact
actgaaatcaccggagaaggaaatattgcctcctttaatcccaacactatacaggcatta
ggtcaattaagactaacagaattaccgattattaaacaaccttttgaagccattgcaagc
tggaatggtcgagaaattaatattaaaaaagctgaaacccagggattttcaactgatggc
ttaattggagttgaatttcaaggaaatggtattccccaattatctaatttaaacctaaat
gttcgggctgataattttgatttacaatctccattagtgcaaagtttcttaactgcttta
cccttagaaattagaaccggagatagtcctttagtggctggaattgttgattttaatggt
aaattaacggggactccttcggctttaaacctaaacggaaatttaagattaaataacttt
gcagttcgggatgtcacctttgaatccattctagcaggaactgtgaatattattccaaat
caaaaggttaatattgccttagcgggagaaagggataaaatagaattagctttggataat
caatatttaccgacttcctttttagtaaaacggaatgatagtcaattagtcggaaactct
caagggaataatttagagattaatttagacgactttcctctacaaacattaagtttatct
cccttagctgaactaaatattggacaattaaaaggtatagcatcgggaaaattaaccgtc
tctaatttagccagttttgatattaataaaataggggtaatcggaaatattgcgatccag
aacctaattttaggtcatattgaaaccgatttatttttgggaaattttagttatcaaaat
ggtattgctaagttaaccgatgctgaattgagcaaaggcataactcagattataattaat
ggtcaagccaatatttctgatattttagccagtctttccacacctcaaacccagaattta
tccactgtatcgaatcaatttgaaggaacaattaaaatcccccaagggagtttacaggat
attttaaccgccctaaaaatctttaatttagcagatttaggcagaggattaacccctcca
aactatggaatagccaccgatgtaaagcctgttcccgtcggtttaccccccacagctacg
ttatttgaacaattacaacgcctagaagaaattagacgaatattacaagaatccctagca
gaaatcgcggcggaacccttacctcctttacgagatttagacggaaaatttaccggagaa
attgcatttaaaggttcaattcaatggggaattaatgcgacagcaaccatcaaaggtcaa
gattggaattatggcagatataccgccgatcagtttttattagaagcgaattttgtagat
aatgtggtgcgggttgaacccattcaattgcttgctgaatcagcattatatgattttcgc
ggacagttaaatttagccaatcaacaaatatcaggtcagtttcggggtaaaaatatccgc
ttagaagaaattgaaaaaattgtcgatttgccaaatgtggatttaaccggacaattgaat
gttcgggcgagtattgggggaactttagataatccccaatcatcgggggaattaacctta
ttagaagcaacggttaataatgaaccaattcaagaagctcaaagcagttttagttataat
aatgctcgactaagatttggcggaagtttgttagttaccgaaaccgatccaattaatttt
agagggactttaccttttcaattcccctttgcaaaagtaacttctgaaagtgatgtagtt
gatgttagagttgatattaaagatcaaggattagcagtgatcaatttactgaatcctgaa
ttaaattggcaggaaggaaaaggattagttcaattaagaatcagtggtagtttacaacaa
ccggaaactggaggaattaagctcaacctgaaaccagaaggattatttaaaattcaagat
gcagttttaattgctcgcagtttagaacaatcaattgtgggattaagtggaactgctgta
tttatcggcgatcggattcaagttaaagatattcaaggagatttacaaggagataaagga
accggacgtatccgattaagtggggttttacccgtgtctcgtcccttagatgaaaatgac
ccagatctgcaaactcctctacaattagacctggaaaaactaacacttaatttacccgaa
ctctataaaggaaatgctgatggtgctatccttcttacaggaacattattgaaaccaaaa
ttaggaggagaagtcatattaagtcagggaaaagttaccttaccttcggaacaaaccgct
accttacccacagatactacgaatacaactcaacctcctgttgatgtcagtctgaacgga
ttaaaactaactttaggcgacaatattcaagtcatgactcccccgattttaaatgcacct
ttaattaattttaatgcgaaaggaacgattgaattaaatggaagtttagccagtcttgat
gatattcgtcctcaaggaacgattgacttaaccggaggacaagttaatctttataccagt
caattaaggttagatcgaggctatccccaacgggcaatatttgttccttcggagggatta
aatccaattttagatgtccgtttagtcacccgtgttcctgaaactttaaggtttgtttct
cccccttcggcttttccggcggaacaaacggaagccctaagtccttctcgatttggaaca
gtccgaactatccgaattaccgcaattgttcgcggcccagcttcggaaattaatgatatt
attaagctacaaagttctccgtcccgttctcaaaatgaattggtggctttattgggggga
agtgtgattcaaggcattcaagatgatagtacattagtattagcaaatattgccagtacc
ggattatttggtaaactccaacagaatgtgattaacgccacgggattaacggaatttagg
atttatccctcgcgggtagccgaacgaggttctaagggtacagcttccgctttaggagtg
ggaattgaagttggtttagatgtgactgataatgcttatgtgtctttgagtagagtttta
gctgcggatcaaccgtttcaatttaatattaattatcgtcttaatgataatatattgttg
cggggagttacgaattttaggaatgaaagtgaagttcggtttgagtatgaaacgagattt
taa
DBGET
integrated database retrieval system