Psychrobacter sp. PRwf-1: PsycPRwf_0939
Help
Entry
PsycPRwf_0939 CDS
T00541
Name
(GenBank) MATE efflux family protein
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
prw
Psychrobacter sp. PRwf-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
prw02000
]
PsycPRwf_0939
Transporters [BR:
prw02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
PsycPRwf_0939
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ93889
UniProt:
A5WDZ8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1122156..1123586)
Genome browser
AA seq
476 aa
AA seq
DB search
MTQDSAAPLNLSYRHIIAIAAPVLIANLAMPLQGAIDVGVVGHFPSSYNLAGLGIASQLW
LLILVSFNFLQYASSGLAAQALGRQASGLATPNELADILYRSLGLALILAALLWVCRPYI
LSLGLDLLGAQPNSSAAAHTYLSVRYYGLVFELMNYAFIGWFAGQGRTNQMMMVQLLISI
INIVLTLSFVYLFDMGLEGVALGTVIGYASGCVTALILAKKSLASISLASISTAASPHKA
LASPPPQDLMLRLKQIYAADKMLSLFSLNKDIFIRTILLTLSFAWITRLSAQQGDLVMAT
NALLLQVLSISAFALDGVAVAAESLSGQAAARKGRDQFITALKRTGVITFLLALSLSIIW
AFVLPYFLSLMTDLPAVYDLAIEYRYVATLLPLMGAGAYWLDGIMFGLTAGSKIRQVAII
VSAIFFPLTYIVYALYGSEHAMLVIWFGVYWLLASRFMVAAIVLWRNQDVLIYNKN
NT seq
1431 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactcaagactcagccgctcccctcaatcttagttatcgtcatatcattgctattgcc
gcccctgtactgattgctaatcttgcaatgccactacaaggcgctattgacgtgggtgtg
gtgggccattttccaagctcttataatttggccggcttaggcattgcctcacagctgtgg
ctacttatcttagtcagctttaattttttgcaatatgcgtcatctggtcttgccgctcaa
gctttgggtcgacaagccagcggattagctacgcccaatgagctggctgatatcttgtac
cgctccttgggtcttgcgctgatattggcggcgctactgtgggtatgtcgaccctatatc
ttgagtctgggccttgacttactcggtgcgcagccaaacagcagtgcagctgctcatacc
tacttaagcgtgcgctactatggccttgtgtttgagctgatgaactacgcttttattggt
tggtttgccggacaaggccgaaccaatcaaatgatgatggtgcagctgcttatttctatc
attaatattgtgctcactttaagctttgtgtatctgtttgatatgggtcttgaaggcgtg
gctttgggcacagtcatcggctatgcatccggctgtgtcaccgcccttattttggccaaa
aaaagcttggcaagtataagcttggcaagcataagtaccgccgcctcgccccacaaagct
ttggcgtcacccccgccccaagacttaatgcttaggctcaaacaaatttatgccgctgat
aaaatgctcagcttgttttctttgaacaaagacatttttatccgcaccattttgcttacc
ttaagttttgcttggatcactcgtctatcggctcagcaaggcgacttggtgatggccact
aatgcactgctgctacaagtacttagtatctccgcttttgcgttagatggggttgctgtg
gcagctgagagcttatcaggacaggcggctgcgcgtaagggtcgtgatcagtttatcact
gcactcaagcgtactggtgtcattacatttctattggccttatcgttaagcatcatttgg
gcgtttgttttgccttattttttaagcctaatgaccgacttgccagcggtatatgacttg
gccatagagtatcgttatgtggccacgttactgccattaatgggcgctggtgcttattgg
ctagatggcatcatgtttggcttaactgcaggatcaaaaatccgtcaagtggccattatc
gtgtcggctatcttctttcctttaacctatatagtgtacgcactttatgggtctgagcat
gccatgctggtcatctggtttggggtttattggttattagcttctcgctttatggtggcc
gctattgtcttatggcgcaaccaagatgtattaatttataataaaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system