KEGG   Psychrobacter sp. PRwf-1: PsycPRwf_1167
Entry
PsycPRwf_1167     CDS       T00541                                 
Name
(GenBank) putative outer membrane adhesin like proteiin
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
prw  Psychrobacter sp. PRwf-1
Pathway
prw02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:prw00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    PsycPRwf_1167
SSDB
Motif
Pfam: Big_9 Cadherin_5 Cadherin_4 HemolysinCabind Big_13 Y_Y_Y HCBP_related Dicty_REP
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABQ94116
UniProt: A5WEM5
LinkDB
Position
complement(1424908..1430562)
AA seq 1884 aa
MNQKTQLIINKIDSESKSVILDYGQTGKIVATNNMKISLVDAESGKPITNLKAKKSGDNL
VIANESNEDILTIENYYVVDNVEIGTMTDAGFIEFTPIDSNASVVGTVSETSYTSLVAEM
LNTSVAAESGLLTGISNTALWGGLGAITLGAAALSGGGSSSSGGTRNKHPESKDTAIQAV
EDTVATGKLSSATDVDGDKLTYALADKVANGSVVVNADGSYSYTPNANFNGTDSFTYTIS
DGKGGVITQKASVTVQGVNDAPVSTNTAIKAVEDTAATGKLSPATDVDGDKLTYALADKA
ANGTVTISADGSYKYTPKANFNGSDSFTYTITDGTETITQTATITVESVNDLPVSKDTAI
QAVEDTVATGKLSSATDVDGDKLTYALADKAANGSVVVNADGSYSYTPNKDFFGTDSFTY
TISDGKGGVITQKASVTVQGVNDAPVSTDTAIKAVEDTAATGKLSPATDVDGDKLTYALA
DKAANGTVTISADGSYKYTPKANFNGSDSFTYTITDGTETITQTATITVESVNDLPVSKD
TAIQAVEDTVATGKLSSATDVDGDKLTYALADKVANGSVVVNADGSYSYTPNANFNGTDS
FTYTISDGKGGVITQKASVTVQGVNDAPVSTNTAIKAVEDTVATGKLSPATDVDGDKLTY
ALADKAANGTVVVNADGSYKYTPKANFNGKDSFTYTITDGTETITQTATITVAAVNDLPV
SKDSVIQAVEDTVATGKLSSATDVDGDKLTYALADKAANGSVVVNADGSYSYTPNKDFFG
TDSFTYTISDGKGGVITQKASVTVQGVNDAPVSTDTAIKAVEDTAATGKLSPATDVDGDK
LTYALADKAANGTVVVNADGSYKYTPKANFNGSDSFTYTITDGTETITQTATITVAAVND
LPVSKDTAIKAVEDTVATGKLSPATDVDGDKLTYALADKAANGSVVVNADGSYSYTPNKD
FFGTDSFTYTISDGKGGVITQKASVTVQGVNDAPVSTNTAIKAVEDTAATGKLSPATDVD
GDKLTYALADKAANGTVVVNADGSYKYTPKANFNGKDSFTYTITDGTDTITKTATVTVHG
ISQVYNNELQEVFETSVVSEQQVLVDRQSYNSLFDVITFEITGDNASAVLSFYDPSNVIS
LSGSYELYGSASSSSGSLSVYSSGSPSYSKVLGSNLAPGKYTLYVDAYEYGSTINIDVLQ
YQDVERTEFTGYENVSGNIFADANISVPKDYILQMDGQSLASSEANPIAIETTKGTFELS
ADGSYNYLSKGSELGLDPKKLSEAFNIIVSDTKGNYLGVYRVEVEPDTTPPVPGKLVLSN
FEDTGTSQDDSITQDNTFDLAVQGNEAGSAVEFEYSSDNGKTWSTIFNGSVSNLEDGEYS
FRAKVTDEALNQSLTEVKTITIDTTAPVLVQILNFNTATNTLEVDANIDKATVKAYQLSN
GSQTQLDSVTNIPFKEGNYRIEASDVAGNVTAIDFIMSTASQYFKSTDNIDIVKGSSFND
YIYGGNGDDILVAEEGLDVVYGEAGDDMLIASKGSHILYGGDGNDVLIDEDGRSSLSGGN
GNDTLTAASGSHFLFGDSGNDILTSKGLVGEEYLSNSLFLSGGDGDDILILDGVLSNASA
TFSGGSGNNTFVIDASDLLQDAKVSITSSSMYDSVKGLNILQLQGVGSDDLVLERKGDVV
EISVSGGLITISDQFSEWGGGVDNIYFDNGDVWDRATIESNIKGQWYGTNGDDTFISTGE
YSVLFGLDGNDKLTGGINNDYIYGGNGDDILVAEEGLDVVYGEAGDDMLIASKGSHILYG
GDGNDVLIDEDGRSSLSGGNGNDTLTAASGSHFLFGDSGNDILTSKGLVGEEYLSNSLFL
SGGDGDDILILDGVLSNASATELC
NT seq 5655 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaccaaaaaactcagcttatcattaataaaattgacagcgagtctaagtcggtaatc
ttagattacggacaaacaggaaaaattgttgcaacaaataacatgaaaatatctctcgtt
gatgctgagtctggcaaacccataactaacttaaaagcaaaaaaatcaggtgataattta
gttattgctaatgagagtaatgaagatattttaacgattgagaactattatgttgtagat
aatgttgaaataggcacaatgacggatgcagggttcatagagtttactcctattgatagc
aatgcatcggtagtggggactgtatcagaaacctcatacacatctttggttgctgaaatg
ctaaatacttcagtagcagcggaatccggcctgttgacaggcattagcaataccgcacta
tggggaggacttggggctataactctaggtgcagctgcattaagtggaggcggtagttct
tcgtcaggtggaactcgtaacaaacatccagaatctaaagacacagcaattcaagcagtg
gaagacacggtagcaactggaaagctatcatcagcaactgatgttgatggtgataagtta
acttatgccttagcggacaaagtggccaatggttctgtggtagtaaacgctgatggcagc
tacagttatacaccaaacgctaacttcaatggtacagacagcttcacgtacaccatcagt
gatggcaaaggcggcgtcattactcaaaaagcttctgtcacggttcaaggtgtcaatgat
gcaccggtatcgaccaacaccgctattaaagcggtcgaggataccgctgccacaggtaaa
ctatcaccagcaaccgatgtggatggcgataagctaacctatgcactagcggacaaagca
gccaatggcacagtgactatcagtgctgatggtagctataaatacacaccaaaggccaac
tttaacggcagtgacagcttcacttataccatcactgatggcactgaaactattacccaa
accgcaactattactgttgaatcggttaatgatctaccagtttcaaaagacacagcaatt
caagcagtggaagacacggtagcaactggaaagctatcatcagcaactgatgttgatggt
gataagttaacttatgccttagcggacaaagcggccaatggttctgtggtagtaaacgct
gatggcagctacagctacaccccaaacaaagacttctttggtacagacagcttcacgtac
accatcagcgatggcaaaggcggcgtcattactcaaaaagcttctgtcacggttcaaggt
gtgaatgatgcaccggtatcaaccgacaccgctatcaaagctgttgaggataccgctgcc
acaggtaaactatcaccagcaaccgatgtggatggtgacaagctgacctatgcactagcg
gacaaagcagccaatggcacagtgactatcagtgctgatggtagctataaatacacacca
aaggccaactttaacggcagtgacagcttcacttataccatcactgatggcactgaaact
attacccaaaccgcaactattactgttgaatcggttaatgatctaccagtttcaaaagac
acagcaattcaagcagtggaagacacggtagcaactggaaagctatcatcagcaactgat
gttgatggtgataagttaacttatgccttagcggacaaagtggccaatggttctgtggta
gtaaacgctgatggcagctacagttatacaccaaacgctaacttcaatggtacagacagt
tttacctataccatcagcgatggcaaaggcggcgtcattactcaaaaagcttctgtcacg
gttcaaggtgtcaatgatgcaccggtatcaaccaacaccgctattaaagctgttgaggat
acagtagccacgggcaaactatcaccagcaaccgatgtggatggtgacaagttaacctat
gcactagcagacaaagcagccaatggtacagtggttgtgaatgctgacggtagctataag
tacacaccgaaggctaactttaacggtaaagatagtttcacttataccatcactgacggc
accgaaaccattactcagacagcaactatcactgttgcagcagtaaatgatctaccagtt
tctaaagacagcgtgattcaagcagtggaagacacggtagcaactggaaagctatcatca
gcaactgatgttgatggtgataagttaacttatgccttagcggacaaagcggccaatggt
tctgtggtagtaaacgctgatggcagctacagctacaccccaaacaaagatttctttggt
acagacagcttcacgtacaccatcagtgatggcaaaggcggcgtcattactcaaaaagct
tctgtcacggttcaaggtgtgaatgatgcaccggtatcaaccgacaccgctatcaaagct
gttgaggataccgctgccacaggtaaactatcaccagcaaccgatgtggatggtgacaag
ctgacctatgcactagcggacaaagcagccaatggtacagtggttgtgaatgctgacggt
agctataagtacacaccgaaggccaactttaacggcagtgacagcttcacctataccatc
actgatggcactgaaactattacccaaacagcaactattactgttgctgcggtcaatgac
ttaccagtttcaaaagacacagcaatcaaagcagtggaagatacggtagcaactggaaag
ctatcaccagcaactgatgttgatggtgataagttaacctatgcactagcagacaaagcg
gccaatggttctgtggtagtaaacgctgatggcagctacagctacaccccaaataaagac
ttctttggtacagacagctttacttataccatcagtgatggcaaaggcggcgtcattact
caaaaagcttctgtcacggttcaaggtgtgaatgatgcgcctgtatcaactaacaccgct
atcaaagctgttgaggataccgctgccacaggtaaactatcaccagcaaccgatgtggat
ggtgacaagctgacctatgcactagcggacaaagcagccaatggtacagtggttgtgaat
gctgacggtagctataaatatacaccgaaggctaactttaacggtaaagatagcttcact
tataccatcactgacggcaccgacactattaccaaaacagcgacggttactgtgcatggt
attagccaagtttataataacgaactacaagaggtgttcgaaactagtgttgtctcggaa
caacaggttctggtagatagacagtcatataactcactgttcgatgttatcacattcgaa
ataacgggtgacaatgcaagtgctgttctaagtttttacgatccatctaatgttattagt
ttaagtggtagttatgaactatatggctctgcatctagttcttctggctcgctaagtgtt
tactcttctggctctccttcatacagtaaggtactaggtagtaatttagcaccaggcaaa
tatactttatatgtggatgcttacgaatatggctcaacgatcaatattgatgttctccag
tatcaagatgtagaacgtacagagtttacaggttatgaaaatgtttcaggtaacattttc
gctgatgcgaatatctctgttcctaaggactacatattacaaatggacggccagtcattg
gctagttctgaagccaatccaattgcgatagaaaccacaaaagggacatttgagttatca
gctgatggatcttataactatctatcaaaaggctcagagcttggtttagatccgaaaaag
ctttctgaagcatttaatatcatagtgtcagatactaaaggtaattatcttggtgtctat
cgtgttgaagttgaaccggataccacaccaccagtaccaggcaagttggtgttaagtaac
tttgaagatactggcacatcacaagatgatagtatcactcaagacaatacgtttgatcta
gcggtacaaggtaatgaagcgggtagtgcagtagagtttgaatattcgtcagacaatggt
aaaacttggagtactatatttaatggttcagtgtctaatctagaagatggcgaatatagc
tttagagccaaagttaccgatgaagcacttaatcaaagtctgacggaagttaaaacaata
acgattgatactacggcaccagtactggttcagattttaaattttaatacagcaacaaat
actcttgaggtcgatgccaatatcgacaaagcaacggttaaggcttatcagctatctaat
gggtctcaaacgcagcttgactcagttaccaacattccttttaaagaaggtaactacaga
attgaagcctcagatgtggcaggtaatgtcacagctatagacttcattatgtccacagcc
tctcagtatttcaaatcgaccgataatatagatattgttaaaggatcgagttttaatgac
tacatctatggtggcaatggggatgatattttagtagctgaggaaggtttggatgtagtt
tatggcgaagctggagatgatatgctaatagcatccaaaggctctcatattttatatggt
ggtgatggtaatgatgtgttaatagatgaggatggtagaagtagtttgtcaggtgggaat
ggcaatgacacattaactgcagcaagtggtagccactttttattcggtgacagtggtaac
gatatattaactagtaaagggcttgttggtgaagagtatcttagtaacagtcttttctta
agtggtggtgatggtgatgatatattgatacttgatggagttctatccaacgccagtgca
accttctcaggtgggagtggtaataacacgtttgtaattgatgcttctgacttattacaa
gatgcaaaagtttctattacaagctctagtatgtatgattcggttaaggggttgaatatt
ctgcagttacaaggcgtaggctctgatgacttagtgttggaacgtaaaggtgacgttgtt
gaaatatcagtttctggtggtttaatcacaatatctgaccagttttctgaatggggaggt
ggtgtagataatatttatttcgataatggcgatgtttgggatagagctactattgaaagt
aatataaaaggccaatggtatggcacaaatggcgacgatactttcatctctacaggtgaa
tattcagtattatttggtttagatgggaatgataaattaacaggtggtattaataacgat
tatatctatggtggcaatggggatgatattttagtagctgaggaaggtttggatgtagtt
tatggcgaagctggagatgatatgctaatagcatccaaaggctctcatattttatatggt
ggtgatggtaatgatgtgttaatagatgaggatggtagaagtagtttgtcaggtgggaat
ggcaatgacacattaactgcagcaagtggtagccactttttattcggtgacagtggtaac
gatatattaactagtaaagggcttgttggtgaagagtatcttagtaacagtcttttctta
agtggtggtgatggtgatgatatattgatacttgatggagttctatccaacgccagtgca
actgagctatgctga

DBGET integrated database retrieval system