Psychrobacter sp. PRwf-1: PsycPRwf_1606
Help
Entry
PsycPRwf_1606 CDS
T00541
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF490
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
prw
Psychrobacter sp. PRwf-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
prw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
prw02000
]
PsycPRwf_1606
Transporters [BR:
prw02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PsycPRwf_1606
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
SUS_EPBD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ94547
UniProt:
A5WFV6
LinkDB
All DBs
Position
complement(1977335..1982656)
Genome browser
AA seq
1773 aa
AA seq
DB search
MTTSQTPPPNQEQDPAQRDAARLKYHYPLSFLLKLLALLLVLFLMMCIILYVMAGTERGT
KFILEKIVSETGVKLQYAEGNLRDGMLVKDISMKASEDVDVHFVNTYVKIGWRAMFAREV
HLRDADIESIVIENRKPATGEPFDYRTFELPVDLRFDKAHIKSIIYNQAGKDPIQVTDIS
ASDLKWVDTHLAVDKAALQYSDVVHIANLNGFVDLTGNYPLDLSAQVTVNSLQKIYVDPI
YVDATGSLKRTYGTLRSKYNDSNVKGNFTVQGLDDNAPFDAKLTWDEITLPYAEGQNIKL
QAGLAIASGVLSDIELRINSQLSAKDIPSGRYQARANIIDTKQMHVHQLTAKTPEGDLLA
KGVLDWEDSFTTQALIYSSNYKVRALLPKAAAPYAPERLDGRLAVVYNLKNKDGLMQINA
SLRQRDGEIIKAKVVQGATPKNPRFAAPWYVDANWQHLRRRNVPQVGDIDSPIGKANVQL
RDEHLWVDADAQINKLNAAPAGDYKVKLDKLGDRININAFDYDGVMGDLVGNGSIVLANQ
NNPLTWAINAKTQQLKPKVFNDSLPVSNLVGSINASGKMIDIRRRVNGKLVTGQRHVFTI
NSSDLDSLLTAQVTRTDPATQKTITENRHVAIQGKGDGSVELIAGDLQQFDARFNGQLTT
QGLPQGNLIVDANGTPTNINIKSFSHKGEAGSISAAGNVNLADGIKWDVTANTQNFNFGS
FTPQTEGVVSGSLVTSGQWRDNNTKFGDLRALDVKFDGSIDTPQLPKGRLKLDAFGNAKA
ITIRNLSHVGEAGSINATGNVGLSDGIKWDIKAHTENFNVGFFAPQTEGIVSGDLVTSGQ
WRDNQTKLGDLRAFDVKFGGFIDTPQLPKGRLQLDANGNAQVINIKNLSHVGEAGSLIAK
GSVDVKNGVAWNINAAMEDFNLGYFVKDVPSNITGRISSTGLWKDTVQRINISQMALRGQ
INGEPLLAQGSLNSTLHLPKDMAQYLQVLKAADSNTQLQKVKSVIEALNADNLMVQWGDN
QVVANGDAQNLDAKVNIRNLSQISRDFAGSVIGGLTLVQSAGQALPTIYVDLSGEKLALP
GILLQKGVIKGKIVDFAKSPSNLVILADGLQASGSQFENIYAVFNGTELDHTLTLKAQTS
RANNEVSIAATIKGAFDRKNMGWRGVVGNGEVSTEYVTLAQSQPAQLIASFGGSTPKIQL
AAHCWAATDESGKVCLRENLVASSEQGQVNLAIQQIDTTLFAPFLPKDLSWNAALNGKAV
MEWGKGVKPTINATLYSDNGNIGMIQDGYSDPITLPYKRISLIVRSFEEGLKVRTDIDSG
NGAKGYADVVVDPYKEGKPLSGALVLNEFNLAILKPFFPGMRKLGGNITLAGGLGGTLSS
PVFYGDVNLKDATVAMLDLPVNLTNINAKAKIRGQSATLNGTFMSGEGQGDLSGTIDWQQ
ELQAKIRVTGERLVLTQPPLLFAEVNPDFNIIIKPQQQYVNIVGAVSVPTATIRPPEANQ
EVVTKSEDVVVLDRQLIGNIDEVLAISKPWSINADIGVDLGSNVNFRGFGAVLPLAGAVH
ITQQGQGVMNALGVVQVSRRSTIDAFGQNLELNYAQIRFNGDVTNPRLSIEAAKDIESST
VGVRVKGRVSDPNIVVFNDAGLTQQQAMNALVTGRISNSGATQISEEGFKSEVTNNLAAA
GLSLGLSGTRSLTNTIGDAFGFERLTIDASGTDSDTNVNVTGYITPDLYIRYGVGVFNAQ
SSLSLRYQLTRRIYVEATSALENAVDVVYSFRF
NT seq
5322 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccacttcgcaaaccccgccacctaatcaagagcaagatcctgcccagcgtgatgct
gcgcggctcaaataccactatccgctgtcttttttattaaagctattggcgctgttgttg
gtgctgttcttaatgatgtgcatcattttgtatgtcatggcgggtactgagcgaggcact
aagtttatattagagaagattgtctcagaaactggcgtaaagctgcagtacgctgagggt
aacttgcgcgatggcatgttggtcaaagacatcagcatgaaagcgtctgaagatgttgat
gttcacttcgtaaatacctatgtcaaaattggctggcgcgccatgtttgccagagaagtg
cacctgcgtgatgccgatatcgaatctattgtgatagaaaaccgcaagccagccaccggt
gagccttttgactatagaacctttgagctgcctgtcgacttacgctttgataaagcgcac
atcaagagcatcatttacaatcaagctggcaaagatcctattcaagtgactgatattagt
gcctccgacttaaagtgggtagacacgcatcttgccgtggacaaagccgctttgcagtac
agtgatgtggtgcacattgccaatttaaatggctttgtggatctaacgggcaactatccg
ctagatctgtccgctcaagtgacggtgaatagtttacaaaaaatttatgtggatccgatt
tatgttgatgccacaggcagcttaaagcgtacttatggcaccttacgcagtaaatataat
gacagcaatgtcaaaggtaactttacggttcaaggtttagatgacaatgcccccttcgat
gctaagctgacttgggatgagattaccttgccttatgctgaaggccaaaatattaaatta
caggcaggtttggccatcgcttcaggggtgttatcagatattgagctgcgtattaacagc
caattgtcagctaaggacatcccaagtggtcgctatcaagcacgtgccaatatcatagac
accaaacagatgcatgtccatcagcttaccgctaagacgccagaaggtgacttattggcc
aaaggcgtgcttgactgggaagacagtttcaccacccaagctttaatttacagtagtaat
tataaagtacgtgctttattacccaaagcggcagcaccttacgcacctgagcgcttagat
ggccgattggctgtagtatataatctaaaaaataaagacggcttaatgcaaattaatgcc
agcctgcgtcaacgtgatggcgagattataaaagccaaagtcgtgcaaggcgccacacct
aagaacccaagattcgctgcgccttggtatgtggatgccaattggcaacatttacgccgc
cgtaatgtgcctcaagtgggcgatattgacagtcctattggtaaggccaatgtgcagctg
cgtgatgagcatctgtgggttgatgccgatgcccagattaataaattaaatgccgcacct
gcgggcgattacaaagtcaagctcgataagctgggcgatcgcattaatatcaatgccttt
gattatgatggggtgatgggtgatttggtgggtaatggcagtattgtactggccaaccaa
aacaatccgttaacctgggcgattaatgccaaaacccagcagcttaaaccgaaagtgttt
aatgacagcttaccggtcagcaatcttgtgggtagcatcaatgcatcaggaaaaatgatc
gacatacgtcgccgtgtcaatggcaagctggtgaccggtcagcgccatgtctttaccatc
aattctagtgacttagactcactattaaccgcgcaagttacccgcactgatcctgcaact
caaaaaaccattactgaaaatcgccatgtggccatccaaggcaagggcgatgggtcagta
gagctgattgcaggcgatttgcagcagtttgatgcgcgctttaacggccaacttaccacc
caagggctgcctcaaggcaaccttatcgttgatgccaatggcacacccactaatatcaat
attaaatcttttagtcacaagggtgaggcgggcagcatcagtgctgccggaaatgtcaac
ttagcagatggtattaagtgggatgtaacagccaacactcagaactttaattttggctca
ttcacaccacaaaccgagggcgtcgtctcaggcagtctggtaacctccggtcagtggcga
gataacaacaccaaattcggggatttacgcgcgttagatgtcaagtttgatggctctatt
gatacgccgcaattgcccaaaggtcggcttaagctggatgcttttggtaatgctaaggcc
attaccatcagaaacctaagccatgtgggtgaagcaggcagtatcaatgcgacaggtaat
gtaggcctaagcgatggcattaaatgggatatcaaagcgcataccgagaacttcaatgtt
ggcttttttgcgccgcaaaccgaagggattgtctcaggcgatttggtcacctccggtcaa
tggcgtgataaccagactaagcttggcgacctgcgtgcttttgatgttaaattcggtggc
tttatcgatacgccgcagttgcccaaagggcgcttgcagcttgatgccaatggtaatgct
caggtcattaatattaaaaacctaagccatgtgggcgaagcaggtagcttgattgctaaa
ggtagcgtggatgtcaaaaatggtgtcgcttggaatatcaatgcggcaatggaggacttc
aatttaggctactttgttaaagatgtgcccagcaatattaccggacgcatctctagcact
gggctttggaaagataccgtacagcgtatcaatatcagccagatggcgctacgtggccaa
attaacggtgaaccgttattggcgcaaggcagcttaaatagcaccttgcatttgcccaaa
gatatggctcaatatttacaagtgctcaaagctgccgatagcaatacccagctccaaaaa
gtcaaaagtgtgattgaggcgctcaacgctgataatctcatggtgcagtggggggataac
caagttgttgctaatggcgatgcacaaaacttagatgccaaagtcaatattcgcaactta
agtcaaatcagcagagacttcgccggtagtgtgattggtggattaacccttgtgcagtct
gcaggtcaggcactgcccaccatttatgtggatttgagtggggagaagctggctttaccg
gggatattgttacaaaaaggcgttattaaaggcaagattgtcgatttcgctaagagtccc
agtaatctggtgatccttgccgatggccttcaagcctccggcagtcagtttgaaaatatc
tatgcggtatttaatggtaccgagcttgatcataccttgacgcttaaagcacagaccagt
cgtgccaataatgaggtaagcattgctgccacaataaaaggtgcctttgatcgtaaaaat
atgggctggcgcggtgtggtcggtaacggtgaggtttcaaccgaatacgtgaccttggca
caaagccagccggcacagctgattgcctcatttggcggtagtacacctaagatacaactg
gcagcgcactgctgggctgctaccgatgagtcaggtaaggtgtgtctgcgggagaatttg
gtggcctctagtgaacaaggtcaggtcaatttagccatacagcaaattgacaccacttta
tttgcgccttttttacccaaagatttaagttggaacgccgctttaaatggtaaagcagtg
atggaatggggcaaaggcgttaagcccaccatcaatgccacgttgtactcagacaatggc
aacataggcatgatacaagatggctatagcgaccccattaccttgccttataagcgcata
tcgttaattgtccgctcctttgaggagggcttaaaggtacgtaccgatatcgatagtggt
aatggtgctaaaggttatgcggacgtggtggtagacccgtataaagagggcaagccatta
tcgggtgccttggtattaaacgagtttaatttagcgattttaaaacctttctttccaggc
atgcgtaagcttggcggcaatataacgctggcaggtggtttgggtggtactttatctagc
ccagtcttttatggtgacgtcaacttaaaagatgccacggttgccatgcttgatttgcca
gtgaacctcaccaatattaatgccaaagcaaaaatacgcggccaaagcgccactttaaat
ggcacctttatgagtggtgaaggtcagggcgacttaagcggtaccatagattggcagcaa
gagttacaagctaaaattcgagttaccggtgagcggttggtgcttactcagccgccgtta
ttgttcgctgaggttaatcctgactttaatatcatcattaagccgcagcagcaatacgtt
aatatcgtgggtgcagtctcagtacccacagccaccatcagaccgcctgaggccaaccaa
gaagtggtgaccaaatcagaagatgtggtggtgttagatcgtcagcttatcggcaatatc
gatgaggtactggccatctctaagccgtggtctattaatgctgatataggggtagactta
ggcagcaatgttaacttccgcggctttggtgccgttctaccgctggcaggcgcagtacat
atcacccagcaaggtcaaggggtgatgaatgcgctgggtgtggtgcaggtgagtcgccgt
agtaccattgatgccttcggtcaaaatctcgagcttaactatgcccaaatacgctttaat
ggcgatgtgaccaatccacgcttgagcatcgaggcggcaaaagatatcgagagcagcact
gtgggtgtgcgtgttaagggacgtgtctctgatccaaacattgtggtatttaacgatgcc
ggcttaacgcagcagcaagcaatgaatgcactggtgactggccgtatttcaaactcaggc
gccactcagattagtgaagagggctttaagtcggaggtaaccaataacttagccgccgcc
gggttaagcttaggcttaagcggtacccgtagcctgaccaataccataggcgatgccttt
ggctttgagcgcttgaccatcgatgcttcaggcaccgatagcgacaccaacgttaacgta
accggctatattaccccagacttatatatccgatatggggtaggcgtatttaatgcgcaa
agcagcttgtcgctgcgttatcagttgacgcggcgtatttatgtagaggcgacctccgca
ttagaaaatgcagtggatgtggtgtatagctttaggttttaa
DBGET
integrated database retrieval system