Pseudoalteromonas sp. APM04: MTP24_02195
Help
Entry
MTP24_02195 CDS
T11363
Name
(GenBank) polysaccharide biosynthesis protein
Organism
psad Pseudoalteromonas sp. APM04
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_2
Epimerase
CoA_binding_3
GDP_Man_Dehyd
RmlD_sub_bind
3Beta_HSD
NAD_binding_4
adh_short
C2185-like_N
KR
CoA_binding
PglD_N
GFO_IDH_MocA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOB73976
LinkDB
All DBs
Position
APM04_1:474470..476425
Genome browser
AA seq
651 aa
AA seq
DB search
MDGFIRSIINAPRAKKRVITLCIDSLFIAAAFWLALIVRLDSFEPLKSANNWLLLAMLIP
VSLLAFINLGLYRAVLRYMNSQALWAIILGTLITTISLVILAFFINVSIPRTMPFIFAWL
CLLTVGGSRILVRALIGKMMTNNKESVIIYGAGSAGRQLATGLNAGPEYFVSAFIDDDVT
KHASVIQGIPVKAFKEIHDLVHKGKASKVLLAIPSASRARRKEVLAQLEPLTIKVLSIPG
MADVVEGKAKLSEFRDVGVEDLLGRDPVTPKPELMTANIANKVVMVTGAGGSIGSELCRQ
IVKIKPTKLVLFERSEIALYSIEKELAEYIARQQLTIELIPIMGSVQRVNRLETVMLTFG
VQTVYHAAAYKHVPLVEHNVVEGVRNNVFGTYYAAKAAVNTKVDTFVLISTDKAVRPTNV
MGATKRMAELVLQGLAQEQGTKHTTRFCMVRFGNVLGSSGSVVPLFRRQIQQGGPITLTH
PDITRYFMTIPEAAQLVIQAGAMGKGGDVFVLDMGDSVKIKDLATKMVRLSGLEIKTEHN
PHGDIEIKCTGLRPGEKLYEELLIGDNVEQTPHERIMTANEVMLPLNELNVFIDALDTAC
HNFEHEKIRQLLLDAPTGFNPTDGICDLVWNAKKGASVETKPQANVVNFNS
NT seq
1956 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatggctttatccgttcaatcataaatgcaccacgtgctaaaaagcgtgtaattact
ctatgtattgattcactttttatagcagccgctttttggttagcgcttattgttaggctt
gatagctttgagcctttaaaaagtgctaataactggttgttgttagcgatgttaatacct
gtcagcttgttggcatttattaatttaggtttataccgcgctgtacttaggtatatgaac
tcgcaagctttgtgggcgattattttaggtacacttattacaactataagtttagtgatt
ctcgcgttttttataaatgtaagtataccgcgaacaatgccatttatttttgcatggctt
tgcttattaactgttggtggctcacgtattttagtgcgcgcacttattggtaaaatgatg
actaacaacaaagagtcggtaatcatttatggtgcgggctctgcagggcgccaacttgct
actggcttaaatgcgggaccggaatactttgtaagtgcctttattgacgacgatgtaaca
aagcatgcttcagtgattcagggtataccagttaaggcttttaaagaaatacatgattta
gtacacaaaggtaaagcatctaaggtactacttgcaatacccagtgcaagccgtgctcgg
cgtaaagaagttcttgctcagcttgagccattaactattaaagtgctttcaattcctggg
atggctgatgttgttgaaggtaaagctaagctttcggaatttagagatgttggtgtagaa
gatttactaggccgcgaccccgtaacaccaaagcctgaattaatgactgcaaatatagct
aataaagtagttatggttacaggtgctggtggttctattggctctgagttatgtaggcaa
atagttaaaataaagccaactaaattagtactttttgagcgtagcgaaatcgccctttat
tcaattgaaaaagagctggctgaatatatagctcggcaacaattaactattgagttaatt
cctattatggggtcggtacaacgggttaaccgccttgaaactgtaatgcttacctttggt
gtgcaaactgtttaccatgcagcggcttataagcatgtgccattggttgagcacaatgta
gtagaaggcgtacgtaataatgtttttggtacctattacgcagccaaagcggctgttaat
actaaggttgatacttttgttttgatttctaccgacaaagcagtgcgcccaacaaatgta
atgggggctactaaacgcatggccgaattagtactacaaggcttagcacaagagcagggc
actaaacatacaacgcgtttttgtatggtacgctttggtaatgtgctaggctcgtcgggc
tcggttgtgccgttatttcgccgtcaaattcaacaaggcggcccaattacattaacgcat
cctgatattactcgttattttatgaccatacccgaagcagcccagcttgttatacaagcg
ggagcaatgggtaaaggtggagacgtatttgtactcgacatgggcgattcagtaaaaata
aaagatctcgctactaaaatggttaggttatcaggccttgaaattaaaaccgagcataac
ccgcatggcgatattgaaataaaatgcacaggtttacgccctggcgaaaagctttacgaa
gagctattaataggcgataacgtagaacaaacaccgcacgagcgtataatgactgcaaac
gaagtaatgctgccactcaatgagcttaatgtatttattgatgctctagatactgcttgt
cataactttgagcatgaaaaaattcgtcagttattacttgatgcacctacaggctttaat
cctactgacggtatttgtgatttagtatggaatgccaaaaaaggggcttcagttgaaacc
aagccacaagctaatgttgttaactttaatagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
